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R语言】因子临床分组的应用

前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R的因子(factor) 今天我们来结合具体的例子给大家讲解一下因子临床分组的应用。 我们还是以TCGA数据的CHOL(胆管癌)这套数据为例。...关于这套临床数据的下载可以参考 ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) 前面我们也给大家介绍过一些处理临床数据的小技巧 ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验,复现临床paper...*","stage I/II",stage) #转换成因子 stage=factor(stage) stage 可以得到下面这个两分组的因子 方法二、直接使用factor函数 #删除组织病理学分期末尾的...】R的因子(factor) ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验,复现临床paper ☞R生成临床信息统计表 ☞玩转TCGA临床信息...☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 ☞肿瘤TNM分期 ☞R替换函数gsub

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R里面根据shp文件进行点的抠图

[toc] R根据shapefile进行点的抠取 当我们有一个图层文件时候,然后再放些采样点在该图层上,发现,某些采样点落在地图的外面,如下图所示。...如果用Arcgis操作,很容易把外围的点抹去,保留图层内的点,那么如果在R里面,实现该操作呢。 image.png 本篇文章,主要介绍R实现根据shp文件进行地图点的抠取。...数据准备 首先我们利用广西,云南为案例,随机生成一些散的点。...然后将点的df_point转成SpatialPointsDataFrame格式;同样云南地图也转成SpatialPointsDataFrame格式(这里是用sf读取,如果用SpatialPointsDataFrame...#### 根据shp文件进行抠图 library(rgdal) spg = df_point # 1)point change to SpatialPixelsDataFrame coordinates

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Excel如何根据值求出其的坐标

使用excel的过程,我们知道,根据一个坐标我们很容易直接找到当前坐标的值,但是如果知道一个坐标里的值,反过来求该点的坐标的话,据我所知,excel没有提供现成的函数供使用,所以需要自己用VBA编写函数使用...(代码来自互联网) Excel,ALT+F11打开VBA编辑环境,左边的“工程”处添加一个模块 把下列代码复制进去,然后关闭编辑器 Public Function iSeek(iRng As Range...Else iSeek = iAdd End Function 然后即可在excel的表格编辑器中使用函数iSeek了,从以上的代码可以看出,iSeek函数带三个参数,其中第一个和第二个参数制定搜索的范围...,第三个参数指定搜索的内容,例如 iSeek(A1:P200,20),即可在A1与P200围成的二维数据表搜索值“20“了。

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Python如何使用BeautifulSoup进行页面解析

网络数据时代,各种网页数据扑面而来,网页包含了丰富的信息,从文本到图像,从链接到表格,我们需要一种有效的方式来提取和解析这些数据。...这些问题可能包括从网页中提取标题、链接、图片等内容,或者分析页面的表格数据等。网页的结构复杂多样,包含了大量的HTML标签和属性。手动解析网页是一项繁琐且容易出错的任务。...Python,我们可以使用BeautifulSoup库来解析网页。BeautifulSoup提供了简单而强大的API,使得解析网页变得轻松而高效。首先,我们需要安装BeautifulSoup库。...可以使用pip命令来安装pip install beautifulsoup4接下来,我们可以使用以下代码示例来演示如何在Python中使用BeautifulSoup进行页面解析:from bs4 import...)# 提取所有具有特定id属性的p元素p_elements = soup.select("p#my-id")# 获取特定元素的文本内容element_text = element.get_text()实际应用

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JS 如何使用 Ajax 来进行请求

本教程,我们将学习如何使用 JS 进行AJAX调用。 1.AJAX 术语AJAX 表示 异步的 JavaScript 和 XML。 AJAX JS 中用于发出异步网络请求来获取资源。...来自服务器的响应存储responseText变量,该变量使用JSON.parse()转换为JavaScript 对象。...如果存在网络错误,则将拒绝,这会在.catch()块处理。 如果来自服务器的响应带有任何状态码(如200、404、500),则promise将被解析。响应对象可以.then()块处理。...将响应代码(例如404、500)视为可以catch()块处理的错误,因此我们无需显式处理这些错误。...它提供了与IE11等旧浏览器的向后兼容性 它将响应作为JSON对象返回,因此我们无需进行任何解析 4.1 示例:GET // chrome控制台中引入脚本的方法 var script = document.createElement

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EMQX Kubernetes 如何进行优雅升级

背景为了降低 EMQX Kubernetes 上的部署、运维成本,我们将一些日常运维能力进行总结、抽象并整合到代码,以 EMQX Kubernetes Operator 的方式帮助用户实现 EMQX...升级完成后,各节点间的负载不均衡(如上图:emqx-ee-0 升级过程,客户端可能会进行重连,此时由于 emqx-ee-0 还未就绪,因此可能连接到 emqx-ee-1 或者 emqx-ee-2,升级完成后...因此我们需制定一种方案来规避以上几个问题,保障升级过程的平滑稳定。问题解决目标升级过程实现连接数可控迁移(可根据服务端处理能力设置相应的迁移速率)。升级过程减少连接断开的次数(一次断连)。...将旧节点从 service 摘出,此时旧节点不再接收新的连接请求。通过 EMQX 节点疏散功能,逐个对节点上的连接进行可控迁移,直至连接全部完成迁移,再对节点进行销毁。...操作流程节点疏散是 EMQX Enterprise 4.4.12 开始支持的新特性,EMQX Kubernetes Operator 2.1 版本对该能力进行适配,如需使用该能力,请将 EMQX

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Kubernetes如何针对Namespace进行资源限制?

用过K8S的都知道,默认情况下,K8S不会对Pod进行CPU和内存限制,这就意味着这个未被限制的Pod可以随心所欲的使用节点上的CPU和内存,如果某个Pod发生内存泄漏那么将是一个非常糟糕的事情。...总结,LimitRange可以实现的功能: 限制namespace每个pod或container的最小和最大资源用量。 限制namespace每个PVC的资源请求范围。...创建LimitRange之后,LimitRange会在它所属namespace范围内生效。...常用的场景如下(来自《Kubernetes权威指南》) 集群的每个节点都有2GB内存,集群管理员不希望任何Pod申请超过2GB的内存:因为整个集群中都没有任何节点能满足超过2GB内存的请求。...上面指定了requests,LimitRange自动给我们加上了defaultLimits,你也可以试一下全都不加或者加一个,道理是一样的。

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golang 如何对 epoll 进行封装的?

大家好,是飞哥! 协程没有流行以前,传统的网络编程,同步阻塞是性能低下的代名词,一次切换就得是 3 us 左右的 CPU 开销。...... } 在这个示例服务程序,先是使用 net.Listen 来监听了本地的 9008 这个端口。然后调用 Accept 进行接收连接处理。...如果接收到了连接请求,通过go process 来启动一个协程进行处理。连接的处理展示了读写操作(Read 和 Write)。...因为每一次同步的 Accept、Read、Write 都会导致你当前的线程被阻塞掉,会浪费大量的 CPU 进行线程上下文的切换。 但是 golang 这样的代码运行性能却是非常的不错,为啥呢?...根据网络就绪 fd 拿到 pollDesc。 netpollready ,将对应的协程推入可运行队列等待调度执行。

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Linux如何使用`wc`命令进行字符统计?

Linux系统,wc是一个非常有用的命令行工具,用于统计文件的字符、单词和行数。wc命令可以帮助我们快速了解文件的基本信息,包括字符数、单词数和行数等。...本文将详细介绍Linux中使用wc命令进行字符统计的方法和示例。...如果不指定文件名,则wc命令会从标准输入读取数据进行统计。2. 统计字符数要统计文件的字符数,可以使用-c选项。...下面是一个示例:wc -c -w -l filename.txt这将输出文件filename.txt的字符数、单词数和行数,每个信息占一列。可以根据需要组合不同的选项来统计所需的信息。6....结论Linux系统,wc命令是一个非常有用的工具,可以帮助我们快速统计文件的字符数、单词数和行数。本文详细介绍了使用wc命令进行字符统计的基本语法和常用选项。

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Keras如何对超参数进行调优?

认真完成本教程后,您将掌握以下技能: 如何调整训练的epoch数量并解释调整后的结果。 如何调整单次训练的batch size并解释调整后的结果。 如何调整神经元的数量并解释调整后的结果。...测试数据集上的时间步长每次挪动一个单位.每次挪动后模型对下一个单位时长的销量进行预测,然后取出真实的销量同时对下一个单位时长的销量进行预测。...对销量数据进行合适的缩放。具体来说,为了让数据的输入范围与LSTM模型的激励函数输出范围相匹配,需要将销量值缩放至-1~1的范围当中。...从曲线变化可以看出与之前相比RMSE的下降速度更快,epochs=1000时显得更加稳定。考虑到训练集中很小的变化都可能导致网络权值的较大变化,测试集中RMSE的变化范围可能会更大。...总结 通过本教程,你应当可以了解到时间序列预测问题中,如何系统地对LSTM网络的参数进行探究并调优。 具体来说,通过本文希望你可以掌握以下技能: 如何设计评估模型配置的系统测试套件。

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如何R语言机器学习建立集成模型?

另外,为了向您提供有关集合建模的实践经验,我们将使用R对hackathon问题进行集成。 1.什么是集成? 通常,集成是一种组合两种或多种类似或不同类型算法的技术,称为基础学习者。...堆叠:堆叠多层机器时,学习模型彼此叠加,每个模型将其预测传递给上面层的模型,顶层模型根据模型下面的模型输出做出决策。...4.R实施集合的实用指南 #让我们看一下数据集数据的结构 'data.frame':614 obs。...我们可以使用线性回归来制作线性公式,用于回归问题中进行预测,以便在分类问题的情况下将底层模型预测映射到结果或逻辑回归。 同一个例子,让我们尝试将逻辑回归和GBM应用为顶层模型。...步骤2需要注意的一件非常重要的事情是,您应始终对训练数据进行包预测,否则基础层模型的重要性将仅取决于基础层模型可以如何调用训练数据。

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VMware如何进行虚拟机的克隆

实际工作之中,我们时常会用到分布式集群,那么就需要设计主从客户机,如果我们一个一个的去创建虚拟机也未尝不可,但是安装一个系统就得5-10分钟左右,而克隆作为一个复制虚拟机的利器应运而生,相对于逐个安装虚拟机系统来说...那么如何在VMware上克隆虚拟机呢?详情如下。 本文以之前安装过的master虚拟机为例进行克隆,具体教程如下。...4、这一步选择克隆源,选择第一项“虚拟机的当前状态(C)”,如下图所示,然后选择“下一步”。 ? 5、弹出“克隆类型”的界面,如下图所示。这里选择“创建完整克隆(F)”,尔后选择“下一步”。...6、之后为克隆的虚拟机进行命名和指定安装位置。这里将该克隆机命名为slave1,位置放在主克隆机的同一目录下,如下图所示。设置好之后,点击“完成”按钮即可。 ?...VMware中进行虚拟机的克隆步骤很简单,很容易掌握,掌握了虚拟机克隆,在后期部署集群的时候,便可以提高效率。

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【数据业务】几招教你如何R获取数据进行分析

【IT168 编译】本文是《R编程语言》中一个系列的第二部分。第一部分,我们探索如何使用R语言进行数据可视化。第二部分将探讨如何R语言中获取数据并进行分析。  ...这样一来,R语言就有了用武之地。使用R语言进行编程,开发者可以用一个脚本快速绘制统计出适合自己的分析。下面,让我们看看R编程的一些特性和用法。...用R语言进行数据处理的不同方法:   R可以从以下几个方面读取数据:   ·电子数据表   ·Excel表   ·数据库   ·图片   ·文本文件   ·其他特殊格式 导入数据   不论是本地数据还是网上数据...对于这个session,已经创建了textsample.txtfile文件,它可以R会话读取。...  可以使用显示R的数据集的命令data()将可用数据集置入R

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如何使用Linux命令和工具Linux系统根据日期过滤日志文件?

本文中,我们将详细介绍如何使用Linux命令和工具Linux系统根据日期过滤日志文件。图片什么是日志文件?计算机系统,日志文件用于记录系统、应用程序和服务的运行状态和事件。...Linux系统,常见的日志文件存储/var/log目录下。使用日期过滤日志文件的方法方法一:使用grep命令和日期模式grep命令是一种强大的文本搜索工具,它可以用于文件查找匹配的文本行。...它支持高级过滤功能,包括根据日期和时间范围过滤日志。如果你想使用rsyslog进行日期过滤,你需要编辑/etc/rsyslog.conf文件并添加相应的过滤规则。.../path/to/logfile表示日志文件的路径,你可以根据实际情况进行修改。...根据实际需求选择适合的方法,并根据你的环境进行相应的调整。掌握这些方法将使你能够更有效地管理和分析日志文件,提高系统的可靠性和安全性。

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聊聊集群环境本地缓存如何进行同步

今天就借这个话题,来聊聊集群环境本地缓存如何进行同步 02 前置知识 kafka消费topic-partitions模式分为subscribe模式和assign模式。...不过我们可以根据kafka提供的消费模式进行定制,从而使kafka也具备广播能力 03 集群本地同步方案 方案一:利用MQ广播能力 因为读者项目是使用kafka,且项目是使用spring-kafka,我们也就以此为例...此时Spring EL 表达式就派上用场了,我们通过 Spring EL 表达式,每个消费者分组的名字上配合 UUID 生成其后缀。...不过该方式的缺点很明显,因为是手动指定分区,当该分区有问题,也挺麻烦的 方案二:通过定时器触发 该方案主要基于读者目前的同步方案进行改造,改造后如下图 核心就是根据读者业务的特性,因为他是定时每天晚上同步爬取...最后读者选择该方案 04 总结 本文主要阐述集群环境本地缓存如何进行同步,之前还有读者问我说,使用了多级缓存,数据一致性要如何保证?

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