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图机器学习无处不在! 用 Transformer 可缓解 GNN 限制

图(或网络)的项目称为节点(或顶点),由边(或链接)来进行连接。例如在社交网络中,节点是用户,边是用户彼此间的连接;在分子中,节点是原子,边缘是它们的分子键。...一个有类型节点或类型边的图被称为异质图,举个例子,在引文网络的项目可以是论文或作者,有类型节点,而 XML 图中的关系有类型边;它不能仅仅通过其拓扑结构来表示,还需要额外的信息 图也可以是有向的(例如追随者网络...图注:左边是一个小图,黄色表示节点,橙色表示边;中心图片上的邻接矩阵,列和行按节点字母顺序排列:节点 A 的行(第一行)可以看到其连接到 E 和 C;右边图片打乱邻接矩阵(列不再按字母顺序排序),其仍为图形的有效表示...,即 A 仍连接到 E 和 C 2 通过 ML 的图形表示 使用机器学习处理图的常规过程,是首先为项目生成有意义的表示,其中,节点、边或完整图取决于具体任务需求,为目标任务训练预测器。...该架构使用节点特征作为注意力中的查询/键/值,并在注意力机制中将它们的表示与中心性、空间和边缘编码相结合。

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独家 | 使用Spark进行大规模图形挖掘(附链接)

Raghavan,Usha Nandini,RékaAlbert和Soundar Kumara“在大型网络中检测社区结构的近线性时间算法。”...在我将所有href链接都移出html内容之后, 我在域之间画出了边,而不是完整的URL。...环是将节点连接到自身的边,对于我的目标没有用。如果medium.com/foobar链接到同一域,例如medium.com/placeholderpage,则不会绘制任何的边。...vertices包含每个节点的id,以及该节点的name(表示域)。 edges包含我的有向边,从源域src到源链接到的域dst。...我描述的数据清洗过程将图压缩成更少,更有意义的边。 LPA发现了4,700多个社区。但是这些社区中有一半以上仅包含一个或两个节点。 在规模范围的另一端,最大的社区是3500多个不同的网站!

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    图机器学习无处不在,用 Transformer 可缓解 GNN 限制

    图(或网络)的项目称为节点(或顶点),由边(或链接)来进行连接。例如在社交网络中,节点是用户,边是用户彼此间的连接;在分子中,节点是原子,边缘是它们的分子键。...一个有类型节点或类型边的图被称为异质图,举个例子,在引文网络的项目可以是论文或作者,有类型节点,而 XML 图中的关系有类型边;它不能仅仅通过其拓扑结构来表示,还需要额外的信息 图也可以是有向的(例如追随者网络...图注:左边是一个小图,黄色表示节点,橙色表示边;中心图片上的邻接矩阵,列和行按节点字母顺序排列:节点 A 的行(第一行)可以看到其连接到 E 和 C;右边图片打乱邻接矩阵(列不再按字母顺序排序),其仍为图形的有效表示...,即 A 仍连接到 E 和 C 2 通过 ML 的图形表示 使用机器学习处理图的常规过程,是首先为项目生成有意义的表示,其中,节点、边或完整图取决于具体任务需求,为目标任务训练预测器。...该架构使用节点特征作为注意力中的查询/键/值,并在注意力机制中将它们的表示与中心性、空间和边缘编码相结合。

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    GraphX 在图数据库 Nebula Graph 的图计算实践

    模块度 模块度公式 模块度 Q 的物理意义:社区内节点的连边数与随机情况下的边数之差,定义函数如下: [graphx-01.png] 其中 A_{ij}:节点 i 和节点 j 之间边的权重 K_i :所有与节点...(即社区 c 内边权重和 + 社区 c 与其他社区连边的权重和) 求解模块度变化 在 Louvain 算法中不需要求每个社区具体的模块度,只需要比较社区中加入某个节点之后的模块度变化,所以需要求解 △Q...将节点 i 分配到某一社区中,社区的模块度变化为: [graphx-13.png] 其中 k_{i,in}: 社区内所有节点与节点 i 连边权重之和(对应新社区的实际内部权重和乘以 2,因为 k_{i,...[Louvain 社区算法] 第一阶段遍历图中节点加入到其所属社区中,得到中间的图,形成四个社区; 第二节点对社区内的节点进行合并成一个超级节点,社区节点有自连边,其权重为社区内部所有节点间相连的边的权重之和的...注:社区内的权重为所有内部结点之间边权重的两倍,因为 Kin 的概念是社区内所有节点与节点 i 的连边和,在计算某一社区的 Kin 时,实际上每条边都被其两端的顶点计算了一次,一共被计算了两次。

    2.6K30

    ai学习记录

    标准:可读性,易读性 1.要选好基准字体(横竖粗细相等,不带装饰的字体) 2.创建轮廓/转曲(Ctrl+shift+O) 3.字体设计时结合文字的意思进行图形化处理; 4.能简则简,能连则连; Shift...ctrl+g 图形编组 ctrl+shift+g 取消编组 shift+` 曲率工具 1)在画面单击确定弧长,移动鼠标确定弧度,再单击继续绘制,按ESC键取消绘制,用此工具可直接拖动节点编辑; 2...剪刀(c):在图形边框上单击,可裁剪图形路径。 比例缩放工具(s)、旋转(r)、镜像(o)、倾斜工具: 1)按住图形拖动等比缩放; 2)按住alt,单击定位中心点,并弹出设置框。...整形工具:可以直接在图形上添加节点,拖动图形节点或路径线可更改形状(需要调出方向手柄才能变形) 以下工具:按住alt可水平垂直更改。双击此工具可更改参数。...宽度工具(shift+w):增加描边的宽度可在一条描边上多次使用宽度工具。 变形工具(shift+r):在图形上任意拖动即可变形。 旋转扭曲工具:在图形上拖动或按住自动旋转图形 。

    2.7K20

    请解释一下图形存储数据库的工作原理,并提供一个使用图形存储数据库的实际应用场景。

    图形数据模型由节点(vertex)和边(edge)组成,节点表示实体或对象,边表示节点之间的关系。 存储结构:图形存储数据库使用特定的数据结构来存储图形数据。...邻接表将每个节点的邻居节点列表存储在一个数据结构中,而邻接矩阵则使用矩阵表示节点之间的关系。 索引:为了加速图形查询操作,图形存储数据库通常会使用索引结构来快速定位节点和边。...常见的索引结构包括节点索引、边索引和全文索引。节点索引可以根据节点属性快速定位节点,边索引可以根据边的关系快速定位边,而全文索引可以根据文本内容快速定位相关节点或边。...下面是一个使用图形存储数据库的示例代码: from py2neo import Graph # 连接到图形数据库 graph = Graph("bolt://localhost:7687", auth...在社交网络、推荐系统和知识图谱等需要处理大规模图形数据的场景中,图形存储数据库可以发挥重要作用。

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    R语言混合图形模型MGM的网络可预测性分析|附代码数据

    p=18279 最近我们被客户要求撰写关于混合图形模型MGM的研究报告,包括一些图形和统计输出。网络模型已经成为抽象复杂系统,是深入了解许多科学领域中观测变量之间的关系模式的流行方法。...可预测性有趣,有几个原因:它给我们提供了一个关于边的实用性的想法:如果节点A连接到许多其他节点,但是这些仅说明(假设)其方差的1%,那么边的连接会是怎样的?...估计网络模型我们估计了混合图形模型,其中我们将所有变量都视为连续高斯变量。...作为可预测性的度量,我们选择解释的方差的比例:0表示当前节点根本没有被节点中的其他节点解释,1表示完美的预测。我们在估算之前将所有变量中心化,以消除截距的影响。....在R语言中使用航空公司复杂网络对疫情进行建模5.python隶属关系图模型 基于模型的网络中密集重叠社区检测6.使用Python和SAS Viya分析社交网络7.关联网络分析:已迁离北京外来人口的数据画像

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    图数据库的一些概览

    在属性图中,每个节点和边都可以有多个属性,这些属性是描述节点或边的属性的键值对。在 RDF 图中,节点和边表示为 URI(统一资源标识符),实体之间的关系使用三元组(主语、谓语、宾语)表示。...节点之间的边可以表示不同类型的关系。例如,“已观看”边可以将用户节点连接到电影节点,评级属性表示用户对电影的评级。 通过使用图数据库,我们可以轻松地查询图来为特定用户提出建议。...创建图数据库 完成图形模型后,在图形数据库软件中创建一个新的数据库实例。根据软件的不同,您可以使用命令行或 GUI 创建新的数据库实例。 定义架构 在向图数据库添加节点和边之前,定义架构。...大多数图形数据库软件都支持动态模式更新。(我知道我说过“这是一个无模式结构”,但最好定义一个概览结构) 添加节点和边 节点代表图数据库中的实体,边代表实体之间的关系。...,然后在删除节点本身之前分离连接到该节点的所有关系。

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    GNN入门必看!Google Research教你如何从毛坯开始搭建sota 图神经网络

    另一种看待图像的方式是有规则结构的图像,其中每个像素代表一个节点,并通过边缘连接到相邻的像素。每个非边界像素恰好有8个相邻节点,并且存储在每个节点上的信息是表示像素 RGB 值的三维向量。...对于文本来说,可以将索引与每个字符、单词或标记相关联,并将文表示为一个有向图,其中每个字符或索引都是一个节点,并通过一条边连接到后面的节点。...GNN采用“图形输入,图形输出”架构,这意味着这些模型类型接受图作为输入,将信息加载到其节点、边和全局上下文,并逐步转换这些embedding,而不更改输入图形的连通性。...实际情况可能更复杂,例如图形中的信息可能存储在边中,而且节点中没有信息,但仍然需要对节点进行预测。所以就需要一种从边收集信息并将其提供给节点进行预测的方法。 可以通过Pooling来实现这一点。...这个问题的一个解决方案是使用图(U)的全局表示,它有时被称为主节点或上下文向量。该全局上下文向量连接到网络中的所有其他节点和边,并可以作为它们之间传递信息的桥梁,为整个图形建立表示。

    1.1K20

    【精选】Jupyter Notebooks里的TensorFlow图可视化

    首先,我们查看图中所有节点的名称。 结果有三个节点。 一个是每一个变量,另一个用于添加操作。 占位符变量节点有一个名称,因为我们在调用tf.placeholder时明确命名它们。...接下来,我们可以看看图中的边。 每个GraphDef节点都有一个输入字段,指定具有边缘的节点。 让我们来看看: 我们可以看到,有两个边,每个变量一个。 我们可以直接将其直接提供给GraphViz。...现在让我们将它打包成一个函数,并尝试在更复杂的表达式上使用它。 我们将建立另一个图,计算公式为π* r2的圆的面积。...TensorBoard允许我们轻松地将的方程组分成有效范围,然后在结果图中将其视觉分离。 但是在这样做之前,让我们尝试用TensorBoard来显示我们之前的图形。...以下是结果图形,展示了整个网络的紧凑视图(左)以及展开其中一个节点时的外观(右)。

    1.8K70

    NetworkX绘图,更上一层

    公众号:尤而小屋 编辑:Peter 作者:Peter 大家好,我是Peter~ 本文给大家带来Networkx绘图的进阶方法,包含: 自定义图形边缘色、图形中心点、节点颜色、图形布局 绘制带有权重的图...在自我网络图中,一个节点代表自我,其他节点代表与自我有直接联系的人(也被称之为分身),边则表示这些联系。...# m表示每次添加新节点时,新节点连接到的已存在节点的数量;n-网络中总节点数;seed是随机种子 m, n, seed = 3, 1000, 20532 G = nx.barabasi_albert_graph...在随机几何图中,节点是根据一定的几何过程(通常是泊松点过程)随机分布在空间中的,而图中的边则对应于这些节点之间的无线连接。...几何距离依赖性:节点间的连接(即图的边)通常基于它们之间的欧几里得距离,只有当两个节点的距离小于某个阈值时,它们之间才存在一条边。 连通性分析:随机几何图常用于分析无线通信网络的连通性和覆盖范围。

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    图自监督学习综述

    属性图与非属性图是相反的概念,它是指节点和边与它们自己的特征(即属性)相关联的图。具体来说,节点和边的特征矩阵分别表示为和。在比较常见的场景中,只有节点具有特征,因此本文用来简称节点特征矩阵。...具体来说,在每个时间步长t, 动态特征矩阵记为。除了特征之外,节点和边的类型是分类法的另一个维度。对于具有多种节点或边类型的图,本文称其为异构图,否则,它是同构图。...异质图也有一些特殊的类型: 二部图是具有两种节点和一种边的异质图,而复图是具有一种节点和多种边的异质图。本文还简单介绍了图神经网络模型,其广泛应用于图形分析任务。...还有学者预测图中未标记的节点和预定义的群集的距离,其节点表示在训练中对全局定位更加敏感。 4.2.2 基于分类的方法(C-APP) 与R-APP相比,基于分类的方法通常依赖于构造伪标签来促进模型训练。...4.3.1 基于上下文的方法(C-SSC) C-SSC方法的主要思想是在嵌入空间中将上下文节点表示相近。上下文节点在图结构中通常在空间中相邻。

    1.2K50

    5大必知的图算法,附Python代码实现

    在关系型数据库中,我们无法在不同的行(用户)之间使用这种关系,但在图形数据库中,这样做是相当简单的。在这篇文章中将为大家介绍一些重要的图算法,以及Python 的代码实现。...假设使用相同信用卡的客户 ID 存在连边(edges),或者将该条件替换为相同的住址,或者相同的电话等。...(最小生成树最初就是为此发明的) 最小生成树可用于求解旅行商问题的近似解 聚类——首先构造最小生成树,然后使用类间距离和类内距离来设定阈值,从而破坏最小生成树中的某些连边,最终完成聚类的目的 图像分割—...—首先在图形上构建最小生成树,其中像素是节点,像素之间的距离基于某种相似性度量(例如颜色,强度等),然后进行图的分割。...如果用户 A 跟随用户 B,则在用户之间创建连边;如果用户推文或者转发推文,则在用户和推文之间建立连边。

    3.4K11

    Quant进阶:用『最少』的数学,学『最全』的图神经网络

    不同的节点有不同的度(连接到其他节点的数量),并且分布在各个地方。图中没有固定的结构,但是这种不固定的结构为图增加了价值。...例如,原子之间的化学键,我们可以把下面的分子想象成一个图形,其中原子是节点,键是边。虽然原子节点本身有各自的特征向量,但边可以有不同的边特征,以编码不同类型的键(单键、双键、三键)。...所有以上三个过程整合到一起,可以用下式表示(使用加法进行消息的聚合): 如果边也有特征,用 表示边的特征,那么在第 层,我们可以使用一个简单的MLP层来更这一层边的表征: 邻接矩阵(Adjacency...比如 ,表示节点2与节点1,3和4相连。所以当 与 相乘时,第2和5列就会忽略。...参考论文中将事件分为两种类型:节点级事件和交互事件。节点级事件涉及一个孤立的节点(例如用户更新他们的个人简介),而交互事件涉及两个可能连接或不连接的节点(例如:用户a转发/关注用户B)。

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    图神经网络(GNN)和神经网络的关系

    在深度学习背景下使用图语言有助于将两个世界结合,并为研究奠定了基础。 2.1 通过图进行消息交换 本文定义了神经网络图G=(V,E),其中V为节点集,E为边集。假设节点v具有特征向量xv。...假设进行R轮消息交换,则节点v的第r轮消息交换可描述为 其中u,v是图G中的节点,N(v)是节点v的邻域,包含自边。x(v)是输入节点特征,x(v+1)是输出节点特征。...在CNN中,层宽度(特征通道数)会变化,因此需要将节点特征从标量x(r)i推广到向量x(r)i,由MLP的输入x(r)的某些维度组成,并将消息函数fi(·)从标量乘法推广到矩阵乘法: 其中,W(r)ij...平均路径长度是测量任意一对节点之间的平均最短路径距离;聚类系数则是测量给定节点的邻居中的节点之间的边的比例,并平均到所有节点上。附录中还有其他图形度量可供分析。...生成器首先创建环形图,然后随机选择节点并连接到最近相邻节点,最后以概率p随机重新连接边。WS-flex在聚类系数和平均路径长度空间内平滑采样,对3942个图进行实验,如图1(c)。

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    首届LoG上的 GNN 教程,98页ppt&代码

    图神经网络(GNN)已被证明在处理与图相关的任务方面取得了有竞争力的结果,如节点和图分类、链接预测以及各种领域中的节点和图聚类。尽管结果很有希望,但据报道GNN存在过度平滑、过度挤压和不足。...文献中提出了图重连和图池化作为解决这些限制的解决方案。图重连包括修改(编辑和/或重新加权)图的边,以便针对特定任务(如图/节点分类或链接预测)优化信息流。...许多图重连方法依赖于边采样策略:首先,根据相关函数为边分配新的权重,然后根据新的权重对它们进行重新采样,以保留最相关的边(即那些具有较大权重的边)。...本教程提供了文献中提出的基于扩散、曲率或谱概念的图重连的最相关技术的概述。它将解释它们的关系,并将介绍最相关的最先进的技术及其在不同领域的应用。...本教程的主要目标是教授图形重连的基础知识及其当前的挑战。我们将激发对数学上合理的图重连方法的需求,作为解决gnn的主要限制的解决方案:欠延伸、过度平滑和过度挤压。

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    使用Python和SAS Viya分析社交网络|附代码数据

    这个社交网络有194个节点和273个边,分别代表药物使用者和这些使用者之间的联系。...as colors #程序包包括用于颜色范围的程序 import matplotlib.cm as cmx import networkx as nx #呈现网络图 现在已经加载了库,我们可以发连接到...在更复杂的情况下,可能还需要在分析网络结构时考虑使用其他维度。 ...---- 最受欢迎的见解 1.采用spss-modeler的web复杂网络对所有腧穴进行分析 2.用R语言和python进行社交网络中的社区检测 3.R语言文本挖掘NASA数据网络分析,tf-idf和主题建模...4.在R语言中使用航空公司复杂网络对疫情进行建模 5.python隶属关系图模型 基于模型的网络中密集重叠社区检测 6.使用Python和SAS Viya分析社交网络 7.关联网络分析:已迁离北京外来人口的数据画像

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    快速初步了解Neo4j与使用

    m 这是我们刚刚更新的图表的一部分: 在大多数情况下,我们希望将新数据连接到现有结构。...当然,这只列出了他在Forrest Gump中作为Forrest的角色,因为这是我们添加的所有数据。 现在我们知道足够的新节点连接到现有的和可能结合起来MATCH,并CREATE以结构连接到图表。...附加结构 要使用新信息扩展图形,我们首先匹配现有连接点,然后使用关系将新创建的节点附加到它们。...特别是在大型图形上,扫描大量标记节点以获得特定属性可能是昂贵的。您可以通过创建支持索引或约束来减轻其中的一些,我们将在稍后讨论。...image.png 我们可以看到neo4j中将几个有关联的对象进行了联系,并从箭头方向表示相应的关系,此时我们已经通过neo4j建了一个表的数据了.

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    R语言混合图形模型MGM的网络可预测性分析

    可预测性有趣,有几个原因: 它给我们提供了一个关于边的实用性的想法:如果节点A连接到许多其他节点,但是这些仅说明(假设)其方差的1%,那么边的连接会是怎样的?...它告诉我们网络的不同部分在多大程度上是由网络中的其他因素决定的 在此博文中,我们使用R-估计网络模型并计算地震灾民数据集上的创伤后应激障碍(PTSD)症状。...估计网络模型 我们估计了混合图形模型,其中我们将所有变量都视为连续高斯变量。...作为可预测性的度量,我们选择解释的方差的比例:0表示当前节点根本没有被节点中的其他节点解释,1表示完美的预测。我们在估算之前将所有变量中心化,以消除截距的影响。...(R2)的百分比。

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