如果是在Windows平台下，那么应该首先检查R包安装路径是否有问题（使用.libPaths()函数查看），尽量不要安装到".RLibrary"之类的无版本依赖的文件夹中。...而如果是linux平台下或者包安装路径并没有“.RLibrary”之类的文件夹， 那么注意R包的安装或者载入过程中是否出现如下warnning或error： Error in completeSublasses...Tips: 由于一些编译型R包可能也在安装时载入R，为避免可能的编译错误，建议将这所code的输出隐藏，比如我的Rprofile.site文件中是添加的如下代码： suppressWarnings(library...(1) install.packages 在R中，使用install.packages(pkgs = "tar.gz文件路径", repos = NULL)即可。...pkgs参数传递的就是是刚才重新压缩的R源码压缩文件，注意repos = NULL不可省略。 (2) R CMD INSTALL 在命令行或者shell下，也可以使用R CMD INSTALL安装。
目前已经给大多数共享服务器的公共R包库中的seurat4升级到了seurat5。...2解决办法 我们先登录网页版Rstudio 用.libPaths()函数查看一下我们目前载入R包的路径 最初Rb包路径 其中第一个是自己家目录下的（拥有读写权限），第二三个是服务器公共的，普通用户是没有...而我们日常调用的Seurat5就装在第二个路径下，因此我们可以把.libPaths() 中的2的路径删掉，不使用服务器提供的公共R包库/home/data/refdir/Rlib 。...其实这个是可以不用修改的，默认路径就可以，只要你知道自己的R包装在了哪里。...这时候在R中敲.libPaths()还是原先的R包路径，点击session Restar R重启R 然后就是我们更改后的.libPaths了 我们下载的包会默认装在第一个路径下面， 我们先下载 Seurat5
因为我们可以为R 读取包的路径设置多个，接下来我还做了一些其他设定： 增加一个机械硬盘中的目录，专门给那些大的R 包准备，比如基因组数据等等； 增加一个固态下的目录，并同步到坚果云等同步盘中，文件名设置为操作系统...-R版本的格式，专门存放那些经常使用且内容并不太大的R 包，比如哈德雷老哥全家套等等。...Rprofile，设置如下： # 更改一下R 的安装顺序 .libPaths(c("E:/Program Files/Microsoft/R Open/R-4.0.2/library",..."C:/Users/lenovo/Documents/R/win-library/4.0", "D:/Big-R-Lirary", "R-4-WIN")) 这里设置就代表我们默认安装的路径已经变成了...这里需要借助参数lib： install.packages(pacman, lib = "xxx") 这时候你就可以将路径指向其他目录了： 机械硬盘中的目录，专门给那些大的R 包准备 固态下的目录，并同步到坚果云等同步盘中
(LANG="en") # 更换默认语言为英文 二、查看 R 所消耗内存大小 可以使用 memory.size() #获取内存大小，不过该函数值只是和 windows 系统。...memory.size() #获取内存大小 三、查看某个数据集内存大小 object.size(mtcars) object.size(mtcars)/1024 四、代码中换行 默认回车是运行代码...，在 Rstudio 中有自动补齐，比如定义一个函数，直接自动补齐了{}，回车就运行了，可以使用 shift+enter #换行 五、释放内存 R 有一套自己的内存回收机制，因此，即使删除了变量...memory.size() rm(list=ls()) gc() memory.size() 六、利用函数修改镜像 如果不设置 R 镜像，每次安装 R 包时都会弹出选择框，可以在安装之前通过函数进行设置...chooseCRANmirror(ind = 18) 七、为 R 添加额外扩展包加载路径 默认 R 包的加载目录在.libPaths()目录中，当然可以为其添加更多的路径。
【SQL数据库使用中问题解决】——在sql使用过程中，发现数据类型无法更改 博主：命运之光 专栏：MySQL 分享一篇今天在数据库上机时遇到的小问题，问题和解决方案都在下方 问题描述 在sql...使用过程中，发现数据类型无法更改 解决方法(两步) 以下为解决方式： 第一步 第二步 结语 解决成功，祝各位好运(●’◡’●)
Windows （建议在 windows 下使用 R） 点进来可以看到这个页面，再点击 base 和 Rtools 这两处链接，分别会跳进 R 的 基本 和 工具 下载页面 2. download...安装 ---- 四、R 安装 双击之前下载好的可执行文件 R-X.X.X-xxx.exe 选择安装时使用的语言，确定 下一步 选择非中文安装路径，路径不建议有空格（如果用安装在中文路径下可能会出现问题...点击 安装 安装中 … 安装完成，点击 完成 ---- 七、java 的环境配置 为什么要配置java环境变量？...修改配置文件 在你 R 的安装路径下找到 Rprofile.site 配置全局环境变量的文件（我是默认安装的，一般可以在C盘的 Program Files 文件夹下找到该配置文件），以记事本的方式打开，...简单命令 命令 + enter ==> 执行 查看 R 包安装的位置 .libPaths() 查看已安装的 R包 installed.packages() 查看可安装 R包 available.packages
在使用 R 的过程中，肯定需要使用到 R 的包，因此，需要掌握 R 包的管理，包括包的查找，安装，加载，升级，取消加载，删除，查看帮助文档等等操作。...2.1 R 包默认安装到以下目录 R 包的默认安装路径与登录账号是否为管理员有关，如果登录的为管理员账号，则默认安装到 R 安装目录下。...在使用 bioconda 管理 R 包之前，首先需要知道 R 包在 bioconda 中名字为名字为 r-base，一些 Bioconductor 包的名字为 bioconductor-前缀。...这样就可以使用 conda 命令安装和管理R 包了。bioconda 安装的 R 包，安装路径在下面目录下。..." [2] "/ifs1/Software/biosoft/R-4.1.1/library" new 选项会去掉之前默认的，可以通过在函数中增加一个向量增加多个目录。
误以为自己有基础于是点进“第一章”的链接就出不来了……只能说 R 博大精深，道不阻但长 ~本节课思维导图笔记（待补充）：图片一些小事：1.改默认存放路径——应该改成功了吧将程序包安装入‘C:/Users..."C:/Program Files/R/R-4.2.0/library" # 看到什么东西装到C盘了就心头一紧，于是查了一下怎么改默认保存路径，如下> file.edit('~/.Rprofile...> .libPaths()[1] "D:/xclRproject/packages" "C:/Program Files/R/R-4.2.0/library"#然后安装R包显示的就是这样了...↓将程序包安装入‘D:/xclRproject/packages’(因为‘lib’没有被指定)#耶耶耶2.涉及到输路径的时候记得注意一下是左斜扛还是右斜杠（R里是 / )，以及路径两端要加引号（吃过亏的客户端...）3.长命令可以 tab 键自动补全，短命令还是记住了用起来比较快；快捷使用之前运行过的命令可以按↑4.Rstudio里会自动补齐括号，忽略补齐的后括号直接enter也能运行命令（懒人的发现）5.分享一个可读性挺强的教程
R语言版本 4.1.2 RStudio版本 2021.09.2+382 报错原因 个人猜测 在我当前Windows中，R语言的Home目录默认设置为C:/User/(Username)/Documents...R语言的安装目录要求较为苛刻，安装路径上的各个文件夹命名 建议仅使用字母和数字（或者仅使用ASCII 字符） 避免使用特殊字符 中文汉字 空格 等其他符号，同时这也是一个好的给文件夹命名的习惯（对很多国外的软件比较友好...，我把他切换到了英文，报错信息会少很多, 但未能解决问题，所以切记不要有中文路径（换语言不是必须的，切换成非中文路径的文件夹即可） 更换工作目录 点击Tools，在默认的General的Basic里面点击...Defalut working directory 点击Browse 更改默认的工作目录 依然无效，因为这个是工作目录 不是报错显示的目录 作为R语言初学者我不知道如何形容报错的这个目录 但是我会换...来自贴吧的方法 此贴九楼 点击Tools，选择Global Option，到Code中的 Saving 更改Line ending conversion 变成 Platform Native ，Defalut
多个路径 在[[59-R工具指南17-R包安装路径的更换与设定]] 我们知道.libPath 可以获得或设置安装包的目录。...那很容易啊，我们把新版本装在A，旧版本在B不就好了： .libPaths() myPaths <- .libPaths() new <- c('/home/data/xx/R/seurat4') myPaths...第一个方法是直接在Rprofile 中贴一下你的代码： # file.edit(~/.Rprofile) .libPaths() myPaths <- .libPaths() new <- c('/...比如区分R4.1_seurat3 和R4.1_seurat4，可以参见：[[112-R工具指南21-使用conda帮你在服务器上装R包]] 我们既可以通过conda 解决复杂包服务器安装所需的环境，也可以利用其特性天然地隔离不同项目版本所需的包...还有一个就是我个人电脑，比如mac 中使用Rswitch 管理R 版本，而R 包我则是区分多个R 包目录，按照访问顺序如下： base R 和重要R 包； 数据库类型的非常占用空间的R 包； 某版本R
在R中，你可以使用.libPaths()函数来查看R包的安装路径。这个函数会返回一个字符串向量，其中包含了所有R包的安装路径。...默认情况下，第一个路径是你的个人R库的路径，其他的路径则是系统级别的R库路径。 如果你想要查看特定R包的安装路径，你可以使用find.package()函数。...使用环境变量：如果你的脚本需要敏感的信息，如数据库密码，你可以将这些信息存储在环境变量中，然后在你的脚本中使用Sys.getenv()函数来访问它们。这样，你可以避免将敏感信息硬编码到你的脚本中。...管理包：使用.libPaths()函数可以查看或设置R包的安装路径。你可以使用install.packages()函数的lib参数来控制包的安装位置。...例如，你可以使用options(stringsAsFactors = FALSE)来改变R默认将字符串转换为因子的行为。
一般现在电脑是 64 位的，如果你确定是这样，在安装时有关于 32 位的选项都可以不勾选。 涉及到添加环境变量或路径之类的，勾选添加即可。 以上没提到的，一路点下一步。...注意，R 和 RStudio 可以单独安装，但 RStudio 只有在 R 安装好了以后才能正常使用。...配置 Windows R 默认使用用户文档目录作为家目录（等同于 Linux 中的 ~），使用系统指定的临时目录作为临时目录，使用安装路径下的 R版本/library 目录作为 R 包存储目录。...具体操作 在安装好 R 和 RStudio 后，打开 RStudio，在 R 控制台键入： file.edit("~/.Rprofile") 在启动 RStudio 时，RStudio 会首先执行里面的...每次都会输出你包的存储路径和 R 的临时路径，方便提醒自己。 这样以后升级 R，只要重装下 R-base 就可以了，R 包还在那里，最多再在控制台来一句： p_update()
https://www.jianshu.com/p/d09ee5e6a94f 鉴于之前在笔记本上使用Rstudio Desktop可以自由切换R版本，于是本人想尝试服务器上Rstudio Server配置不同的...R包安装失败通常是Linux的库文件缺失，自行搜索安装必备的系统库文件 ，安装走一波： （以后遇到报错，缺啥补啥，网上搜攻略，总有一款可以解决问题） ——根据报错信息搜debug方案也是学生信必备的技能之一...界面里面双R版本及包的安装路径配置完毕！！！...通过在shell里面切换/etc/rstudio/rserver.conf文件中rsession-which-r所指定的R的位置就可以调用不同版本的R，注意需要在shell里面对rstudio-server...3.3 R4中R包的安装和调用 有些R包需要调用很多动态库和一些依赖包，在R中安装经常报错，很伤脑细胞，还打击学习生信的积极性，经常让人累觉不爱，所幸现在conda越来越万能，所以遇到不省心的R包可以尝试
")packageVersion("Seurat")Resources里面是不同的目录，R包放在了library中。...因此在Resources中创建一个新的文件夹，用于存放Seruat V4.可以在终端中也确认一下“ /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.4-arm64/...Resources/library”是原始路径，保存着seruat5版本的包括其他R包的信息；当创建完新的路径之后需要重新设置一下，要注意“.libPaths(c("/Library/Frameworks.../R.framework/Versions/4.4-arm64/Resources/seurat4", .libPaths()))”这句代码，这句代码的含义是先进行前面的路径的R包调取，如果前者的R包不存在...，那就会其他路径的调取R包。
在单细胞数据分析时，常常用到Seurat(https://satijalab.org/seurat/install.html)这个R语言包。...Seurat 分析流程基本涵盖了单细胞分析中的所有常见分析方法，包括filtering，tSNE，UMAP降维及可视化等，还有一个重量级功能就是矫正不同实验之间的批次效应。...安装3x 先查看当前的library ： > .libPaths() [1] "D:/R-3.5.1/library" 我把新版本的seurat（3x）装在这个路径下，这个很好装，因为托管在了CRAN...install.package里面指定安装的路径，也可以通过.libPaths()去修改默认的安装路径。...，所以要改变安装路径。
R中的命令行界面（后台）在哪? 就在大家经常忽略的地方：写着terminal！ 问题来源 昨天我们发现需要更新BioManager至3.18的话，就需要更新600多个r包。R包安装失败怎么办？...解决办法 在命令行中实现BiocManager::install(version = "3.18")，即在R的命令行界面之外安装Bioconductor版本或R包，可以通过调用R脚本执行。...代码实现 第一步 创建一个R脚本（比如命名为install_bioconductor.R），并包含以下内容： #如果指定想要的r包安装路径#####安装archr包##别处复制.libPaths(c(...在命令行（比如终端、命令提示符或PowerShell）中，切换到包含你的R脚本的目录，然后运行： nohup Rscript install_bioconductor.R >myout.log 2>&...1 & 这是一条在Linux/Unix系统下的命令，用于在后台运行一个命令并将输出重定向到一个文件中。
在爱奇艺组件化探索之原理篇文中有介绍相关动态化知识，因此本文不再赘述。 在ApplicationInfo中，增加splites apk相关字段。...split apks资源路径（LoadedApk#mSplitResDirs）也会被增加至Resources中。...在创建dynamic_feature时，有两个选项是默认勾选的，当然我们也可以更改其状态。 ? Enable on-demand: 是否支持按需下载模式。...在示例中，每当我们需要启动dynamic feature模块时，都要判断该模块是否安装。...兼容性问题 OS版本不高于6.0 当app运行设备版本不高于6.0时，需要使用SplitCompat库才能立即访问下载模块代码和资源。
类似linux 中的配置文件，R的配置文件编辑后，也会在启动R 时生效。...环境时分别执行： 进入R image.png 退出R image.png 除此之外，你还可以将常用的几个R 包配置在启动文件中，这样可以减少每次脚本中的重复调用。...R 提供了代码可以获取这几个目录： # 当前工作目录 getwd() # 用户家目录 ~ # 可以直接使用相对路径获取 path.expand("~") # 也可以获得全路径 # R 安装目录 R.home...dir.exists(.CUSTOM_LIB)){ dir.create(.CUSTOM_LIB) } .libPaths(c(.CUSTOM_LIB, .libPaths())) message...("Using library: ", .libPaths()[1]) if(dirname(tempdir()) !
写在前面 有时候各位使用R的用户不知道会不会有这样的感觉，visual studio和Rstudio由于负载过重，在打开或者加载R script时会出现加载过慢的情况，但对于很多数据工作者来说，variable...的配置 Path中添加R的执行文件的路径，当然也可以选择radian.exe的路径（该路径存在于python的scripts文件夹中）。...2 在文件中找到Rprofile.site文件，编辑脚本，插入以下这段代码 ▶ source(file.path(if (.Platform$OS.type == "windows") file.path.../R/etc路径中 ? 3 勾选vscode-R中的Enable R session watcher ? 4 勾选Bracket Paste与Always Use Active Terminal ?...中运行的话，则会出现R session watcher不启用的状况，data和plot的review窗口则会自动调用自身gui所带的review窗口，以在windows中选择radian.exe路径为例
RStudio Server是网页版的RStudio，部署在服务器上后，能够在从Web浏览器访问的Linux服务器上运行RStudio,可随时随地完成R语言的工作,并且能很方便的完成R项目的部署调试。...，所以如果需要对应的R语言版本的话，使用wget下载下来然后安装编译即可。...使用初衷：根本原因是更新了本地的R和Rstudio版本，详情请见R和Rstudio版本更新，然后我的R包没有同步更新，所以就无了。...批量加载需要的R包 因为咱们的服务器是已经安装了很多的R包，所以我们可以指定一下R包的临时路径，然后方便加载需要的R包 #将服务器中的R包路径设置为临时的路径 .libPaths(c(.libPaths...(),"/home/data/refdir/Rlib")) #确定目前的R包路径 .libPaths() [1] "/home/data/t100430/R/x86_64-pc-linux-gnu-library
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