如果你在安装和使用Seurat (v5) and SeuratObject (v5) 过程中，出现了一些关于Matrix package的问题，可以看看本文。...我使用的是macOS, x86_641) SueratObject v5.0.0是基于Matrix 1.6-1 package的，所以我在CRAN官网：https://cran.r-project.org.../web/packages/Matrix/index.html 下载了安装包, 官网有两个1.6-1 版本。...: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)(我暂时没有理会这样的报错，我当时也不知道解决的办法。)...所以我得回到2)的位置，考虑一下compilation的问题Error: compilation failed for package "Matrix"通过搜索，我发现R包有时候是需要编译器的 (这里我不知道描述的是否准确
当你到了我这个年纪（破罐子破摔），你就会知道，「如果有包安装不上，那就不安装了」。...头脑风暴 我有一个设想： 用root权限，新建一个环境R4.1，然后在里面安装R4.1 在R4.1中安装那几个包 将Rstudio的R版本设置为新建环境的R4.1 我的顾虑： 不确定我用root新建的环境...用'q()'退出R. > 可以看到，R4.1.0安装成功。 5....，结果发现报错，类似这样： 显示上面的包都安装失败，那我就分开安装，然后都安装成功了，最后这两个包也安装成功了。...Rstudio画图报错：version ZLIB_1.2.9 not found 其实，在R终端下，载入上面的软件包没问题，但是在Rstudio中载入就出错： > library(clusterProfiler
当你到了我这个年纪（破罐子破摔），你就会知道，「如果有包安装不上，那就不安装了」。...头脑风暴 我有一个设想： 用root权限，新建一个环境R4.1，然后在里面安装R4.1 在R4.1中安装那几个包 将Rstudio的R版本设置为新建环境的R4.1 我的顾虑： 不确定我用root新建的环境...用'q()'退出R. > 可以看到，R4.1.0安装成功。 5....显示上面的包都安装失败，那我就分开安装，然后都安装成功了，最后这两个包也安装成功了。 胜利的喜悦： ? 8....Rstudio画图报错：version ZLIB_1.2.9 not found 其实，在R终端下，载入上面的软件包没问题，但是在Rstudio中载入就出错： > library(clusterProfiler
MacOS 上安装 R 包 install.packages("data.table") 后面提示是否安装需要编译的版本: Do you want to install from sources the...y/n 选择了 y 之后，报错 clang: error: unsupported option '-fopenmp' 网上找到的解决方法是： 安装 clang-omp brew install clang-omp...'-fopenmp' 发现，执行的是 clang，而不是 clang-omp，所以在命令行执行 ln -s /usr/local/opt/llvm/bin/clang /usr/local/bin/clang...-6.0: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation) 最后解决方法： mkdir ~/.R cd...` 保存，再重新在 R 中安装：install.packages("ddalpha") 即可。
，且没有error，就继续点run 我这个r包biomanager 一直安不上 从这个日志来看，应该是你已经安装成功了呀，没有error就不用管 15号那天的最后一部分内容，二进制文件安装，源代码安装...跳过就好，你一行行run之后，最后面library代码运行没有error就好了 网络是国外的 那就重启一下Rstudio，然后跳过前面option 的代码 老师这个包我装不上，把包下下来本地装也装不上...我看二代测序的原理，测的好像都是dna扩增，dna测序，但是实际上是不是rna转为dna再测序的 是rna反转录为cdna再测序，因为rna不稳定不能进pcr仪加热 请问一下，这里DESeq2安装为什么出错呀...），如果中止命令或者强行退出r，再次重新library(eoffice)又会出现第一次的报错，请问该怎么办呢 管理员方式打开rstudio 这是因为电脑上M1 Pro的cpu么 没有安装 X11，OS...老师，我在R4的环境中安装R包之后library，发现有个error，该怎么处理呢 缺啥补啥就好，如果用conda安装的话，conda install r-rvcheck；可以通过搜索关键字找到安装的命令和在
，主要有两种方式，第一种是将shiny应用发布在shinyapps上，第二种是将你的shiny应用部署到自己租用的服务器上，前者比较方便但遇到一些R包环境或中文显示等问题时几乎是无解的，而后者虽然麻烦，...2.2 安装最新版R 首先我们需要安装最新版的R（写作此文时最新的稳定版本为3.6.1），查看R官网对于ubuntu安装最新版R的介绍： ? ...可以看到熟悉的界面，就是个在线版的Rstudio，可以通过它来方便地修改服务器上的R代码。...这时可以发现右侧下方的应用没有正常显示，但这里并没有明确显示具体的报错信息，为了在shiny应用出错时能显示具体的错误信息，我们需要修改shiny server的配置文件，执行下列命令打开shiny server...如图所示位置添加上两行语句用于设置shiny应用出错时显示具体错误信息，保存退出，重新访问刚才的页面： ?
R4.0的安装借助于conda，并创建R4的环境安装4.0的R包，参考《遇到不省心的Rstudio Server安装R包总是失败怎么办？》...之后登录http://8.130.51.225:8787/，用户名和密码就是前面adduser时设置的，可见R版本为3.6.3，R包的安装位置比在shell终端多了一个"/home/scR2021/R/...后续R包的安装可以在RStudio Server的这个界面进行，也可以在shell终端敲“R”进入R界面进行，安装的位置可能有所不同，但设置好了都是可以调用的。...conda安装： 参考《遇到不省心的Rstudio Server安装R包总是失败怎么办？》...r error 4 #网页上需要退出（Quit the current R session）并重启（Start New Session） #可以看到R_LIBS的值为/home/scR2021/miniconda3
: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation) make: *** [Matrix.so] Error...关于Homebrew Homebrew 是一款用于在 macOS 上安装和管理软件包的包管理器。它使得在 macOS 系统上安装、更新和删除软件变得更加简单。...用于编译和链接 Fortran 语言的源代码。 在终端中可以使用 gfortran 命令调用。...在 macOS 上，gcc 实际上是一个指向 clang（LLVM 编译器）的符号链接。 当你在终端中使用 gcc 命令时，实际上是在调用 LLVM 的 Clang 编译器。...在 macOS 中，由于默认情况下系统使用 LLVM 的 Clang 作为 C/C++ 编译器，gcc 实际上是一个指向 Clang 的符号链接。
3这是第13行和第36行的运行结果，提示 error 不知哪里出错了 第一个运行结果，提示你已经安装过了，不需要额外操作。 第二个运行结果，为报错，需要注意，缺什么就安装缺的包。...14我的R是4.3.0版本，这个安装包是要求4.3.1，我怎么升级我的R版本到4.3.1，不影响之前包的使用啊 ？ 这不是报错 不用管~ 15Rstudio服务器版能给非root权限用户使用吗？...这里能不能加个什么条件让这条命令统计FALSE? 没错，你可以理解成，T是1，F是0，所有的1加起来的长度。第二个问题可以用“!”取反集。 25小洁老师使用的截图软件是这个么 对。...26“=”和“<-”可以理解为是具有同样的赋值功能么 是的，这两个是等价的。 27我想问一下这个位置就是显示的已经安装过的R包吗？ 对的。 28这个会有关系嘛 没关系，保留安装它。...57请问大家在rna环境中安装multiqc这个软件时会有安装不上的情况吗，具体表现为一直在solving environment，但切换安装同一环境下的其他软件时却可以 可能是遇到了软件之间的冲突 如果持续遇到相同的问题
: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation) make[3]: *** [libtvm_runtime.dylib...] Error 1 make[2]: *** [CMakeFiles/tvm_runtime.dir/all] Error 2 make[2]: *** Waiting for unfinished jobs...在Mac下，有两套编译工具链，GNU的和Apple（通过Xcode安装）的，GNU的以gcc为代表，而Apple的则以clang为代表，在这两个核心编译工具周围，又有很多别的小的编译工具。...所以在搜索可执行文件时，先找到了GNU的ranlib，而这个又与Apple的编译工具链不兼容。导致编译出错。 那ranlib是干什么用的呢？...其实我不记得在PATH中添加过/usr/local/opt/binutils/bin这个目录，应该是安装某些包后自动更新的。 那这个问题该怎么解决呢？
test.c:(.text+0x13): undefined reference to `func' collect2: ld returned 1 exit status 因此，在链接命令中给出所依赖的库时...备注：在MAC上可以正常编译通过。...o ld: symbol(s) not found for architecture x86_64 clang: error: linker command failed with exit code...在c++代码中链接c语言的库 代码同示例一的代码一样，只是把main.c更改成了main.cpp。编译test.c，并打包为静态库。...: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation) 原因就是main.cpp为c++代码，调用了c语言库的函数
练习和思考ppt上的内容！【要在接受这个体系知识的基础上去思考去创新去拓展】二、课堂内容之：R语言与Rstudio1.【解释】R语言的世界是关于函数与数据的世界=简单来说就是利用函数去处理数据。...【最初了解Rstudio步骤】最初学习的步骤：安装R包--读写文件--函数与数据有什么规则【安装R包出现的问题】按照上课需要，安装了一些R包，而R包是需要install（安装）后，在console（控制台中...是集成开发环境【是一种图形界面----对初学者友好、R语言中的“>”（大于号）是命令提示符号，只有在>后写代码才有用！...【对象/变量列表】&history【历史命令】右下角4.文件、图片、帮助、包2.在控制台console与系统进行交流使用语言：代码----括号前面的字母、单词是函数；函数后面通常带括号，括号里放数值比如...>号的地方出现+，代表命令不完整【解决方式：能补全时可补全/不能补全时在console中按esc键终止】8.出现提示信息，可忽略！！没有error就可忽略！！9.需要去看看提示信息，需要回答！
生成安装包。...使用 Terminal 进入 Zeal.app 所在目录，运行如下命令生成 Zeal.dmg 文件： macdeployqt Zeal.app -dmg macdeployqt 命令在 Qt 安装目录下能找到...，比如我的这个命令在 /Users/mazhuang/Qt5.5.0/5.5/clang_64/bin 目录下。...: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation) make[1]: *** [....."/usr/bin/make"退出，退出代码 2 。
但是，这种模式有一定的失败率，比如以下一些情况，都会可能导致构建失败： 项目代码自身存在缺陷，导致编译错误 项目代码不支持当前平台 构建脚本存在缺陷 缺少特定的配置参数 缺少依赖库，需要用户手动安装 编译器版本太低...，不支持部分代码 而 TryBuild 模式通常处理这些情况，但是在新版本中，我们对 TryBuild 模式引入了一种新的机制，通过复用 xmake-repo 仓库中的构建脚本，来改进构建逻辑。...它大概得处理流程是这样子的： 在第三方源码库目录执行 xmake 命令 Xmake 获取目录名，尝试解析项目名和版本 尝试从 xmake-repo 仓库匹配现有的包 如果匹配成功，直接采用包中构建逻辑来构建...shared library linker (sh) ... clang++ checking for clang++ ......现在，我们还可以在包管理仓库中，添加自定义构架规则脚本，实现跟随包进行动态下发和安装。
其实这个问题比较好解决，大家如果测试过的话，可能会发现这个报错只会在一个特定场合出现：一个已经打开过的R或Rstudio项目，且上次退出时保存过R数据，而且大概率是你这些R数据直接/间接依赖了一个dbplyr...Tips: 由于一些编译型R包可能也在安装时载入R，为避免可能的编译错误，建议将这所code的输出隐藏，比如我的Rprofile.site文件中是添加的如下代码： suppressWarnings(library...而且此时在Rprofile.site文件里面已经添加了载入dbplyr包的代码，包括手动载入dbplyr包也会正常载入，但是在这种情况下这里依然报错dbplyr包的NULL subclasses error...手动安装R包 手动安装源码包可以通过两个方式，一个是R里面使用install.packages函数，另一 个是使用命令行工具R CMD INSTLAL。...pkgs参数传递的就是是刚才重新压缩的R源码压缩文件，注意repos = NULL不可省略。 (2) R CMD INSTALL 在命令行或者shell下，也可以使用R CMD INSTALL安装。
RStudio Server 是一个 Linux 服务器上的应用程序，提供了在服务器上运行的 R 环境，而用户通过浏览器来访问。...server加装rJava包 Rstudio server是搭载在linux之上的，rJava在Rstudio server 下载，需要先在Linux下安装JDK（Java环境），然后才能安装rJava...library()和require()的最大区别：找不到包时，library()抛出错误，require()打印警告信息并返回FALSE。...在rstudio下，安装包时，默认的库路径是"/home/enn_james/R/x86_64-unknown-linux-gnu-library/3.2"，而R软件本身的默认路径是/usr/local...2、查看包安装路径 在R的命令窗口输入 library() 可以看到全部的包，分为系统包和用户包，用户包在 "/home/enn_james/R/x86_64-unknown-linux-gnu-library
4【R包】安装的时候遇见这个error 该如何解决呢？...你一直在点run或者输入了别的。你重新运行回答一个yes就可以了。 5【R包】我重新下载了R后，hug133plus2这个包安装不上了 把这个包对应的安装代码重新运行一遍。...29【Rstudio】在Rstudio的左上角输入代码后用什么快捷键run？...，如果运行失败，说明大家的r包版本有问题哦，因为上面的代码是测试数据和示例代码，理论上任何人的任何的电脑设备都是联网就可以运行的。...，是告诉上一条命令，“上一步的输出要放到这个位置”，如果不设置的话默认是在最末尾的。
但是如果任务比较复杂，代码量比较大，则应该将代码写在 R 脚本中，保存脚本时，通常以.R结尾。...rm(list = ls())命令会删除当前工作空间中的所有对象。 退出 R 时，如果选择保存工作空间，R 将会在工作空间所有文件夹中创建两个新文件。...所有运行过的命令都被保存到一个名为“.Rhistory”的文件中，所有对象被保存到名为“.Rdata”的文件中。当 R 重新启动后，将自动恢复上一次保存的工作环境以及使用过的命令。...建议不保存工作空间，因为代码才是最重要的，命令和对象都可以通过代码重新生成。...R 包有 3 种类型： 基础包，在 R 启动时就自动调入内存，可以直接使用； 推荐包，这些包已经随 R 安装好，但需要使用 library()或 require()函数调入内存后才能使用； 其他第三方包
反射信息生成 回到反射信息生成上, 我们直接工作在libclang这一层就足够了, 原因是AST本身有足够多的相关信息, 我们能够提取到足够的类型和组成信息来组织最终的注册代码....编译生成CXTranslationUnit对象, 出错则直接输出错误信息 5. 在正确生成的CXTranslationUnit上执行后续需要的操作....整个流程与我们平时对代码进行编译是高度一致的. 2. 一些-I -D等命令行参数与常规的compiler保持一致. 3. 代码出错情况的处理. 4....熟悉clang的同学可能知道clang是可以通过命令行参数来支持AST输出的: clang -cc1 -ast-dump your_file.c clang -cc1 -ast-view your_file.c...clang -cc1 -ast-print your_file.c 在正常的编译流程中, 我们很少需要对AST进行分析和处理, 基本很少使用相关功能.
当安装R时，它会自动安装许多默认包，但为了在R中做任何真正有意义的事情，你可能需要安装额外的包。为了安装许多软件包，至少有1 GB的RAM是很重要的。...作为一个例子，让我们安装shiny包，这是一个非常流行的包，用于从R代码创建Web应用程序。安装程序包作为单程根将登录为根，运行R，并运行该install.packages()命令。...但是，建议不要以root身份登录，因此我们只能以root身份运行R命令。我们还将指定repos参数，以便从RStudio CRAN存储库下载包，这与我们下载R本身时使用的相同。...现在退出R. q(save = "no") 第4步 - 安装devtools包 虽然许多R软件包托管在CRAN上并且可以使用内置install.packages()函数进行安装，但是有更多软件包托管在GitHub...现在退出R. q(save = "no") 下一步 您现在可以在腾讯CVM上安装R。 要了解有关R的更多信息，请访问官方R网站，或尝试使用该swirl软件包学习R实践和交互式。
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