其中网页工具和云平台都不是针对专门的生物信息学工程师设计的，因为并不需要使用者会编程语言，所以使用起来非常简单。下面来一一介绍一下它们：
深度学习，一直在了解之中啦！不过由于数学基础的问题，始终在门口徘徊，最近发现了一些有趣的内容，分享一下，希望大家都能早日入门！
如果是在R编程语言，我们会推荐大家写rmarkdown，交互式动态呈现每次代码以及它的运行结果，一步到位输出HTML或者PDF格式的数据分析报表，非常方便。在Python编程语言里面，能实现类似的功能的就是Jupter的Notebook。
大数据文摘作品 编译：大茜、钱天培 R还是Python？ 真是个千古难题！ 如果你主要从事数据分析、统计建模和可视化，R大概是你的不二之选。但如果你还想来搞点深度学习，整个自然语言处理，那你可还真得用Python。 如果你处于交叉领域，很可能就需要两种语言切换。后果是，写个for loop还出bug真的是家常便饭。报警！ 面对这种困境的绝不止你一个人！最近的KDnuggets Analytics的软件调查中，Python和R位居数据科学和机器学习软件的前两名。 如果你真的想提高你在数据科学领域的能力，这两种
如果你主要从事数据分析、统计建模和可视化，R大概是你的不二之选。但如果你还想来搞点深度学习，整个自然语言处理，那你可还真得用Python。
网上Seurat转scanpy的教程一抓一大堆，然鹅找遍全网都没找到一个靠谱的反向操作方法。唯一找到一个ReadH5AD用起来是这样的：
前言 一、安装python运行环境 1.官网https://www.python.org下载安装包.exe 2.安装python 二、python模块下载 1.配置pip环境变量 2.下载python模块 二、python模块下载 三、第一个python脚本运行 四、相关命令 总结
说明： 在使用python的时候我们除了使用内置的函数之外，可能还需要使用一些别人写的函数。或者我们写的代码也希望可以给其他人使用。要实现这样的功能，我们就需要按照下面的步骤来定义自己的模块： Step1：新建一个py文件 首先我们将前面一章所写的打印列表的函数保存为一个.py文件，假设我这里保存为 kider.py。 1 """ 2 这是一个打印列表的函数，如果列表中有嵌套的列表也会展开打印出来 3 """ 4 def print_list(movies): 5 if isinstance(mov
最近因工作需要，研究了一款Python项目。作为java程序猿，习惯于java项目一个包就可以在任何平台上运行，因此在研究该项目伊始，本着也能够将Python项目打包部署的期望，研究了下python项目部署方法。
本文教程操作环境：windows7系统、Python 3.9.1，DELL G3电脑。
使用第三方模块之前，需要先下载并安装该模块，然后就能像使用标准模块和自定义模块那样导入并使用了。因此，本节主要讲解如何下载并安装第三方模块。
Python模块只是一个Python文件或一组Python文件。使用Python模块，可以编写可重用和更有组织的代码。例如，可以编写一个执行CSV文件处理任务的通用Python模块，世界各地的数据科学家都可以使用该模块来读取、写入和操作CSV文件。
Pip是用于安装Python软件包的工具。 使用pip，您可以从Python软件包索引库（PyPI）和其他软件包索引中搜索，下载和安装软件包。
随着使用Python的时间越来越长，安装的python模块也越来越多。然而时间久了都不记得自己之前到底对自己的电脑做过些什么了，特别是当某个package新出了一个package的时候，老版本是不是就要退出了呢？哈哈哈，于是乎小编今天就整理了一下，如何就查看已经安装的python模块，以及该安装模块的具体信息的操作步骤。以Tensorflow为例，选中即可打开，效果如下：
Python模块并不神秘，它只是一个Python文件或一组Python文件。使用Python模块，可以编写可重用的、更有条理的代码。例如，可以编写一个通用Python模块来执行CSV文件处理任务，世界各地的数据科学家都可以使用该模块来读取、写入和操作CSV文件。
随着使用python的时间越来越长，安装的python模块也越来越多，时间久了都不记得自己之前到底对自己的电脑做过些什么了，于是乎就想要查看一下自己安装的python模块，现将查看方法总结如下
使用python进行程序编写时，经常会使用第三方模块包。这种包我们可以通过python setup install 进行安装后，通过import XXX或from XXX import yyy 进行导入。不过如果是自己遍写的依赖包，又不想安装到python的相应目录，可以放到本目录里进行import进行调用；为了更清晰的理清程序之间的关系，例如我们会把这种包放到lib目录再调用。本篇就针对常见的模块调用方法汇总下。
NetworKit是一款针对高性能网络安全分析的开源工具，该工具旨在帮助广大安全研究人员分析具备数千到数十亿条边界的大型网络。为了实现这个目标，该工具实现了非常高效的图形算法，其中许多算法是并行的，以利用多核架构来计算网络分析的标准度量。NetworKit专注于功能方面的可扩展性和全面性，而NetworKit也是一种算法工程的试验平台，其中包含了很多最新发表的处于研究中的新算法。
NetworKit - NetworKit is a growing open-source toolkit for large-scale network analysis.
【Python】VMware vSphere是什么中已经说过需要使用python的背景了（java不会，.Net SDK没有与时俱进），没办法，只有去试试python。不过距离上一次使用python，已经过去了4年了。革命需要，必须快速把python捡起来，看懂项目，并编写python脚本。我大致总结如下几个方面，便可完成快速复习。
参见：https://cloud.tencent.com/developer/article/1657000 https://zhuanlan.zhihu.com/p/164507492 https://rstudio.github.io/reticulate/index.html
关于搭建apache+python的运行环境，网上很多文章都是用cgi方式，配置非常繁琐，把很多不相干的东西都扯了进来，都没有说到要点上。对于很多新手朋友来说，估计摸不着南北。这里采用mod_pyth
通常情况下，我们拿到了Python代码后在运行它的过程中大概率上需要加载很多Python模块，但是对初学者的电脑来说，是接近于空白的，需要一个个模块自己安装。如果我们类比R语言来说，安装R包的代码是非常简洁，如下所示的规律代码安装任意包：
CentOS 8 中如何安装python3？在CentOS 8 没有默认安装Python 3，而Ubuntu系统则默认安装了，本篇文章重点为大家讲解一下CentOS 8 中安装python3具体方法以及在CentOS 8上安装Python 2。
Python是世界上最受欢迎的编程语言之一。 凭借其简单易学的语法，Python是初学者和经验丰富的开发人员的流行选择。
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centos安装默认python2.6升级为python2.7，并解决python工具包安装的各种问题。
直接将Python以mod_python模块的形式集成到Apache中。客户端请求到达apache，apache找到cgi脚本后，在服务器上直接使用指定python解释器来执行python脚本，然后将执行结果返回给client。如果要使用mod_python模块，那么mod_python可以让Python解释器直接成为apache的一部分，带来的直接效果就是使执行python cgi脚本的速度大大提高了。
Tablib是MIT许可格式⽆关的表格数据集库，⽤Python编写。它允许您导⼊，导出和操作表格数据集。⾼级功能包括隔离，动态列，标签和过滤以及⽆缝格式导⼊和导出。
模块是一个包含了Python定义和语句的文件，可用于将功能组织成可重用和可维护的代码块。每个Python文件都可以作为一个模块，模块可以包含变量、函数、类或可执行代码。通过使用模块，我们可以将代码分离成逻辑单元，促进模块化编程。所以我们可以简单的理解为，一个py文件就是一个模块，大部分情况都是这样的。
但是，如果Python的模块太多了，就可能造成一定的混乱，那么如何管理呢？ 通过Python包的功能来管理。
之前的课程中，我们已经了解了python程序设计开发的基础部分内容 包含了数据类型、变量、运算符、程序选择结构、循环结构、函数处理、字符串处理等等内容。
mysql-python包含MySQLdb模块，此模块是python用来连接mysql数据库，今天在windows上安装mysql-python模块遇到了一些问题，记录下来，供参考，我的机器是win7 64bit
下面将介绍XGBoost的Python模块，内容如下： * 编译及导入Python模块 * 数据接口 * 参数设置 * 训练模型l * 提前终止程序 * 预测
文章目录 模块 Python模块 导入模块 查找模块 模块编译 包 Python包 包的导入 内嵌包 在使用Python开发程序时，如果是比较复杂的功能，可以把功能分成几个部分，则需要用到Python的模块和包。 📷 模块 ---- 顾名思义，模块就是一块一块的代码。 Python模块 ---- 在Python中一个py文件被认为是一个模块(module)。 📷 导入模块 ---- 导入一个模块到当前模块，语法： import_smt ::= "import" module ["as" nam
Python模块（第三方库）： https://pypi.python.org/pypi
作为一种胶水语言，Python 能够很容易地调用 C 、 C++ 等语言，也能够通过其他语言调用 Python 的模块。
很多时候我们并没有耐心去完整学习一本书，因为它耗费时间长，而且不容易牢固掌握知识。更多的情况是，我们想知道某一个函数或者功能的知识。就像是你写作文的时候想知道某个具体的成语或者词怎么用。今天我们给大家做一个官方Python文档使用指北。方便大家可以更多地了解Python查阅到相关函数或者功能的用法。
教程地址：http://www.showmeai.tech/tutorials/56
reticulate可以实现R与python的相互切换,即在R里面调用python的脚本、模块等。
今天遇到的新单词： editor n编辑，作者 general adj大致的一般的 repository n仓库 distribute v分配，发布 wrapper n封装 volume n音量
大家好，我是朱小五。前几周我们公众号曾经分享过一篇《酷炫，Python实现交通数据可视化！》文章，在其中介绍了开源库TransBigData并使用该模块对出租车GPS数据进行了交通时空大数据分析！
首先我们先来了解一下什么是python模块？为了方便编写可维护的代码，我们会把很多函数进行分组，分别放到不同的文件里，这样的话，每个文件包含的代码就会相对较少一些，在python中，一个.py文件就可以称为一个模块（Module）
前面我们讲了python爬虫用到的工具及模块：phantomjs、beautifulsoup4、selenium、lxml等，如果我们想随时随地用到这个已经搭建好的python环境，这就有两个方案：一是利用vagrant打包python环境的box；二是创建一个python环境的docker镜像。
导读：近几年随着深度学习算法的发展，出现了许多深度学习框架。这些框架各有所长，各具特色。常用的开源框架有TensorFlow、Keras、Caffe、PyTorch、Theano、CNTK、MXNet、PaddlePaddle、Deeplearning4j、ONNX等。
Python模块化编程有助于开发者统筹兼顾和分工协作，并提升代码灵活性和可维护性，是编程开发者不可或缺的一项重要工具。
一、简介 py2exe是一个将python脚本转换成windows上的可独立执行的可执行程序(*.exe)的工具，这样，你就可以不用装python而在windows系统上运行这个可执行程序。 py2exe已经被用于创建wxPython,Tkinter,Pmw,PyGTK,pygame,win32com client和server,和其它的独立程序。py2exe是发布在开源许可证下的。目前只有python2.x的才有对应版本的。 二、安装py2exe 从http://prdownloads.sourceforge.net/py2exe下载并运行与你所安装的Python对应的py2exe版本的installer，这将安装py2exe和相应的例子；这些例子被安装在lib\site-packages\py2exe\samples目录下。 三、py2exe的用法 如果你有一个名为helloworld.py的python脚本，你想把它转换为运行在windows上的可执行程序，并运行在没有安装python的windows系统上，那么首先你应写一个用于发布程序的设置脚本例如mysetup.py，在其中的setup函数前插入语句import py2exe 。 mysetup.py示例如下: # mysetup.py from distutils.core import setup import py2exe setup(console=["myapp.py"])
如果你想进入数据科学领域，你可能立即会想到R和Python。然而，我们并不是要以作为两种选择来考虑他们，相反地，我们更多的是去比较他们。R和Pyhton在他们各自的领域里，都是非常完美的工具。尽管如此，他们往往成为各自敌人而争吵。如果你在谷歌搜索栏里输入“R vs Python”,你会看到非常多的关于他们霸权之争。
X11是执行Unix程序的图形窗口环境。Mac OS X本身的程序是Aqua界面的，但是为了能够兼容unix和linux移植过来的程序（Mac OS X由BSD-UNIX修改而来），比如MatLab，就需要x11窗口环境。
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