在本教程中，我们将讨论如何安装devtools并使用它直接从GitHub安装R包。...为了使devtools在系统范围内可用，我们将以root身份输入R的shell： sudo -i R 从监视器内部，我们将使用该install.packages() 功能devtools从官方的Comprehensive...使用以下命令安装： devtools::install_github('rstudio/shiny') 当我们在输出结尾附近看到以下行并返回到R提示时，安装已成功完成： . . . ** testing...检查防火墙 Shiny是一个Web应用程序框架，因此为了在浏览器中查看其示例，我们需要确保在我们的防火墙上允许Web流量。内置Web服务器在每次启动时随机选择一个端口，除非我们使用特定值启动它。...我们还将设置launch.browser为FALSE不会尝试在远程服务器上启动浏览器。
R 包的开发目前是前所未有的简单，但大部分 R 用户不了解，无从下手，希望这篇文章可以为大家减少一些拦路虎（下方有二维码可以直达视频）。...资料： 小抄[1] 图书：R 包开发 - http://r-pkgs.had.co.nz/ R 包开发最好和 Git（GitHub） 结合使用。...内容： 开发工具 RStudio usethis (devtools may be helpful) - usethis 是目前的开发核心包，里面有特别多的工具函数，自己开发时多看一看、试一试效果。...使用 RMarkdown 语法 testthat https://github.com/mikldk/roxytest 包使用说明/手册/网站 usethis::use_badge() usethis...总结一下要点： 掌握 R 包结构 掌握 usethis 、devtools包 编写简约有效的函数代码 处理好 devtools::check() 显示的 NOTE/WARNING/ERROR 逐步学习写示例
环境： struts 2.3.16.3 + Convention Plugin 2.3.16.3 实现零配置 现象：以文件夹方式部署在weblogic(10.3.3)上时一切正常，换成war包部署，运行时提示找不到...检查生成的war包中\WEB-INF\classes\下有无META-INF目录，如果没有，在eclipse里resource\META-INF下随便放一个文件，比如test.xml，这样maven打包生成...war包时，才会在classes下创建META-INF目录 ?
（3）它的灵活度非常高，不仅支持用户输入自己的暴露或者结局的数据，还提供各种方法将TwoSampleMR的分析结果转换为其它R包可以直接使用的形式。...下面，我将首先介绍TwoSampleMR包的安装 注意，TwoSampleMR这个包是存储在GitHub库里的，所以我们需要使用devtools来安装，具体代码如下： install.packages(...‘devtools’) devtools::install_github(‘MRCIEU/TwoSampleMR’) 上述代码是用来安装最新TwoSampleMR包的，如果你想使用老版的TwoSampleMR...万事开头难，我身边不少小伙伴在安装TwoSampleMR包时出现问题，米老鼠给大家总结了几点原因以及相关解决办法，可以一试： （1）出现网络连接不畅的问题，这可能是你频繁地从GitHub上获取数据，或者是...（2）出现某个依赖包安装失败时（比如“MRIntruments“），可以先安装这个依赖包试试，逐步排查问题，在安装过程中不要随便更新其它R包！只有当一个R包不更新便无法导致安装时，再更新这个R包。
require(devtools) install_github("ramnathv/rCharts") （如果出现问题，可以尝试先安装以下三个包，再试一下） library("curl") library...("openssl") library("httr") ###安装出现问题，可以尝试先加载前面三个包试试，自己安装时候搞了好久 require(devtools) install_github("...ramnathv/rCharts") library(rCharts) # 指定展示尺寸 options(RCHART_WIDTH = 700, RCHART_HEIGHT = 500) # 使用内置数据集...SepalLength ~ SepalWidth | Species, data = iris, color = 'Species', type = 'point',x="vehwv") rc$save('r1....html') ##保存成html格式 打开可以是交互的图 详细使用见https://zhuanlan.zhihu.com/p/24042457 知乎专栏
我在 github 托管 Python 代码，然后将包发布到 Pypi，通常的操作步骤是，更新完代码将提交到 github ，然后手动将包更新到 pypi，这样比较繁琐，就想到了使用github+travis-ci...，这里使用setuptools自动决定要包含哪些包。...: true 意思是只有在发布一个新的版本时才执行打包部署 具体配置参考： Conditional-Releases-with-on 加密密码 上面的配置使用的是明文密码，这样就把pypi 账号公开了，...这里推荐使用travis-encrypt 加密密码。...安装 travis-encrypt pip install travis-encrypt 然后在 .travis.yml 所在目录执行： travis-encrypt --deploy gusibi python-weixin
travis.png PyPI部署 https://docs.travis-ci.com/user/deployment/pypi/ 成功构建后，Travis CI可以自动将Python包发布到PyPI...我们建议您加密密码并通过运行以下命令将其添加到.travis.yml： 安装 travis-encrypt pip install travis-encrypt 然后在 .travis.yml 所在目录执行...部署 tag 最有可能的是，当您的软件包的新版本被删除时，您只想部署到PyPI。...有条件的发布 只有在满足某些条件时才能部署。请参阅条件发布on:。 language: python deploy: provider: pypi user: ......pypi.travis.png 可以发现 slmethod 升级到了 0.1.3 版本，说明已经部署成功了。 测试一下，先安装 slmethod。
培训时，同一段代码，大家都运行的好好的，而你却出现问题了，一般都是考虑包里的函数冲突了。这时需要一个个去排查到底是哪个函数发生了冲突，有没有更好的办法呢？...本文介绍一个包conflicted，可以列出所有冲突的函数，并可以设置优先使用哪个函数来处理冲突。...包的安装 install.packages("conflicted") # 或 # install.packages("devtools") # devtools::install_github("r-lib...::指定使用哪个包的哪个函数 如下，虽然写的字母多了些，但清晰明了。...如果只用到了filter函数，dyplr包都不用显示加载。 另外，在Rstuido中，还会有函数自动补全功能，输入dplyr::后会列出这个包里面所有外部可用函数。
可以使用上面安装的“devtools”软件包直接从github下载和安装R软件包。...Bioconductor还鼓励使用标准数据结构或者类和编码样式或者命名约定，因此理论上，包和分析可以组合成大型管道或工作流。...在尝试安装课程包之前，请确保使用最新版本的bioconductor。...通常，只有在您自己编辑包时，或者由于因为某种原因之前的方法失败时才会执行此操作。...从“RUN Rscript -e”install.packages（'devtools'）“”开始，在命令行上运行每个命令（减去“RUN”）或启动R会话并运行引号内的每个命令。
当安装R时，它会自动安装许多默认包，但为了在R中做任何真正有意义的事情，你可能需要安装额外的包。为了安装许多软件包，至少有1 GB的RAM是很重要的。...现在退出R. q(save = "no") 第4步 - 安装devtools包 虽然许多R软件包托管在CRAN上并且可以使用内置install.packages()函数进行安装，但是有更多软件包托管在GitHub...第5步 - 从GitHub安装R包 现在我们已经安装devtools了，我们可以使用该install_github()函数安装GitHub上的任何R包。...与CRAN软件包一样，在安装GitHub软件包时，您需要从系统shell运行该命令，以使所有用户都可以使用该软件包。让我们尝试安装shinyjsGitHub包，它可以为shiny包添加功能。...在本指南中，我们完成了在Ubuntu 14.04 腾讯CVM上设置R所需的步骤。我们还了解了从GitHub和CRAN安装R软件包之间的区别，以及如何确保这些软件包可供CVM上的所有用户使用。
当安装R时，它会自动安装许多默认包，但为了在R中做任何真正有意义的事情，你可能需要安装额外的包。为了安装许多软件包，至少有1 GB的RAM是很重要的。...现在退出R. q(save = "no") 第4步 - 安装devtools包 虽然许多R软件包托管在CRAN上并且可以使用内置install.packages()函数进行安装，但是有更多软件包托管在GitHub...第5步 - 从GitHub安装R包 现在我们已经安装devtools了，我们可以使用该install_github()函数安装GitHub上的任何R包。...与CRAN软件包一样，在安装GitHub软件包时，您需要从系统shell运行该命令，以使所有用户都可以使用该软件包。让我们尝试安装shinyjsGitHub包，它可以为shiny包添加功能。...## 在本指南中，我们完成了在Ubuntu 14.04 腾讯CVM上设置R所需的步骤。我们还了解了从GitHub和CRAN安装R软件包之间的区别，以及如何确保这些软件包可供CVM上的所有用户使用。
安装Bioconductor上的R包 总结 前言 我不生产知识，我只是知识的搬运工，以下内容是源于 B站 – 徐州更 的安装教程：可能是最好的R语言安装指南哔哩哔哩bilibili 个人是觉得 R 的安装是比较麻烦的...选择镜像点进去之后是这样的，可以看到这里提供了 三个操作系统的下载安装包 你是在那个系统上使用就下载那个系统对应的安装包 我这里是要在 windows 下面使用，所以我选择的是 Download for...安装 ---- 四、R 安装 双击之前下载好的可执行文件 R-X.X.X-xxx.exe 选择安装时使用的语言，确定 下一步 选择非中文安装路径，路径不建议有空格（如果用安装在中文路径下可能会出现问题...升级 R 包 以下是经常会使用到的包，复制以下命令回车执行就完事 update.packages() if(!...安装Bioconductor上的R包 复制以下命令回车执行就完事 BiocManager::install() if(!
Hexo 博客源代码 GitHub 托管 1.注册 travis-ci Travis CI 的网站有两个， travis-ci.org 专门针对开源项目，GitHub 上所有的公开仓库都能够免费使用；...首先进入 Travis CI 官网，这里我们使用的是免费版的，因为考虑到一般放在 GitHub 上的博客都是公开的，所以不需要付费版本。...2>Travis 配置文件 接下来还需要编写 Travis 的配置文件，用于指定构建时使用哪些命令。配置文件名为 .travis.yml，是自动化构建的配置文件。...目前还没找出问题在哪里，出现问题地方应该在生命周期 after_script: ,如果有知道还请留言回复，感激不尽。虽然没有成功使用吧。但是也算对 travis-ci 有初步的认识吧。继续折腾吧。...在 after_failure 和 after_success 中，您可以使用$TRAVIS_TEST_RESULT 环境变量获取构建结果。
说实话，自从之前好好学习了一下入门的R以后，一直没有用过R，很多东西都忘了，还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包来源及安装方法 1....Github 部分作者在写好R包以后还没来得及上传到CRAN上，便可通过其Github进行安装，通过devtools::install_github("用户名/pkg_name")安装。...安装指定版本R包 复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时，就需要考虑安装某个特定版本的R包了，这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。...在装有devtools的基础上，我使用以下命令重新装了0.1.8版本的rvcheck后，顺利的安装了clusterProfiler。...CMD INSTALL limma_1.8.10.tar.gz 但其实，在实际操作时我发现能不能装上还得看是什么R包以及你的网络情况。
r语言的包中，集成了众多函数，大大扩展了r的功能且降低了使用难度。本篇文章就来介绍r语言中包的两种安装方式：install.packages和从github安装包。...install.packages() install.packages()是从镜像安装包，在括号中输入包的名称字符串就可以完成包的安装。...通过github安装 一些开发者没有将包上传至镜像，而是在github上开发并分发，此时就需要从github安装相应包。这里提供两种方法。...library(devtools) install_github("twitter/AnomalyDetection") 这里，需要先安装并调用devtools包。...语句中的 AnomalyDetection为包名，twitter为仓库名。很明显，安装包时还需要知道仓库名，为我们带来了不便。
说实话，自从之前好好学习了一下入门的R以后，一直没有用过R，很多东西都忘了，还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包的来源 1....CRAN网站 可以理解为R包的官网，凡是需要通过CRAN下载的R包，都可以通过install.packages("包名")来安装 2....部分作者在写好R包以后还没来得及上传到CRAN上，便可以在其Github上安装，通过devtools::install_github("用户名/包名")安装 # 综上 install.packages(...安装指定版本R包 复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时，就需要考虑安装某个特定版本的R包了，这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。...CMD INSTALL limma_1.8.10.tar.gz 但其实，在实际操作时我发现能不能装上还得看是什么R包以及你的网络情况。
目录： 判断式安装 向量保存包名再安装 安装包技巧 还是使用我的R 包 R studio 修改镜像 如果你是通过R studio 使用R，是可以直接通过偏好中的设置去修改镜像： R 默认提供了非常多的镜像来源...使用R 包 比如我的R 包，你可以在主界面了解详细信息：https://github.com/mugpeng/pengToolkit (也可以点击原文链接) # install devtools install.packages...上的软件包 if (!...library 验证一下是否安装成功，如果还没有，可能你的网络环境出了问题，或者这个包需要通过源文件安装，或是在github 上，需要使用devtools 安装。...你也可以不输出信息到屏幕进行加载： suppressMessages(library(limma)) 还是使用我的R 包
问题 你想安装和使用一个 R 包。...这里主要介绍如何用命令行来安装 R 包，如下所示： install.packages("reshape2") # reshap2为包名 在一个新 R 线程中使用该包之前，你必须先导入它。...如果想要将所有已安装的软件包更新为可用的最新版本，使用以下命令： update.packages() 如果你在 Linux 系统上使用 R ，管理员可能已经在系统上安装了一些 R 包，由于普通用户没有更改权限...R 包 R CMD INSTALL aplpack_1.1.1.tgz # 安装aplpack包 从其他资源库安装 R 包 devtools 包提供了从其他流行的 Git 资源库或其他 URL 上安装...例如，我们想安装开发版本的 ggplot2 包，可以使用下面命令： # 如果没有安装devtools，需要先安装 install.packages("devtools") library(devtools
目录： R包来源 R包安装前设置 R包安装与加载 R包来源决定安装使用的代码 安装后需要加载才能用 R包的使用逻辑及帮助 帮助 R包使用常见问题 (1)大片提示信息 (2)packages not available...://github.com R包安装前设置 镜像 镜像网站相当于主网站的副本，在访问主网站存在障碍时，访问镜像 网站也可。...from github install.packages('devtools') devtools::install_github("jmzeng1314/biotrainee") #括号里写包名，本地安装的方法...问是否更新的、“不存在”的是依赖包 (4)依赖包问题 它问是否更新的是依赖包 R包之间存在复杂的依赖关系 使用A包，就必须同时用B、C， 而C又依赖了D包 理论上: 安装A，就会自动安装BCD 加载A，...就会自动加载BCD 实际上：常会因为一两个依赖包的安装失败，导致你想安装的那个包安装失败。
1、安装 npm init ava 2、使用示例 编写 test.js 文件： import test from 'ava' import Memcached from '.....安装 codecov : npm install --save-dev codecov 在 package.json 文件中增加一个上报测试覆盖率的脚本: { "scripts": {...Travis-ci 本文使用 travis-ci 来做持续集成，同样的你需要使用 GitHub 账号登录 travis-ci 并关联我们的 repository 库。...sudo : 声明在 CI 的虚拟环境中是否需要管理员权限。 before_install : 安装额外的系统依赖。...由于我们在 travis-ci 上执行 npm run report-coverage 向 codecov 上报测试覆盖率时需要其权限，因此还需要在 travis-ci 的 Settings 中设置环境变量
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