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空间信息空间转录组运用

桑基图单细胞数据探索应用 热图单细胞数据分析应用 定量免疫浸润单细胞研究应用 Network单细胞转录组数据分析应用 你到底想要什么样umap/tsne图?...), 即空间隔离造成了地物之间差异,即异质性,可分为空间局域异质性和空间分层异质性 地理第三定律:两个点(区域)地理 配置 (环境) 越相似,目标变量在这两个点(区域)值(过程)越相似 这三条地理学定理对任何一张切片上...,MST ),也可以对应到空间中对象之间连接。...如 两个基因在空间不同位置(邻近,重叠,分离)表达意味着什么 一个基因集(通常意味着某个pathway或调控关系)空间表达模式与表型相应 A区域与B区域差别与连通对应基因表达模式 空间中基因表达模式格局与过程分析...最简单是按照细胞之间距离传统模型中加入一个距离权重,把空间信息加入到推断过程

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Java ,如何计算两个日期之间差距?

参考链接: Java程序计算两组之间差异 今天继续分享一道Java面试题:  题目:Java ,如何计算两个日期之间差距? ...查阅相关资料得到这些知识,分享给大家:  java计算两个日期相差多少天小时分钟等    转载2016年08月25日 11:50:00  1、时间转换  data默认有toString() 输出格林威治时间...,比如说Date date = new Date(); String toStr = date.toString(); 输出结果类似于: Wed Sep 16 19:02:36 CST 2012   ...ss").format(date); System.out.println(dateStr); 输出结果像下面这样: 2009-09-16 07:02:36当然啦,你也可以把:hh:mm:ss去掉,输出结果也就只有年...1000* 24* 60* 60;     longnh = 1000* 60* 60;     longnm = 1000* 60;     // long ns = 1000;     // 获得两个时间毫秒时间差异

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Android 两个Activity 之间传值问题

Android 两个Activity 之间传值问题 Android项目中,有时需要一些全局静态变量来保存一些数据,这样关闭赋值界面后,其他页面还可以调用这些数据。...但是我们知道,Java全局静态变量(java没有全局变量这一个概念,但是java提供了public static关键字来实现一些类似于全局变量关键字)都是程序加载时就放人到内存,它是存储方法区里...这是会影响到系统性能。那么android可不可以不通过这种方式来传递值呢? 今天自己做了一个小demo,感觉还不错:不通过全局静态变量而实现两个Activity之间传递数据。...Activity之间通过Intent传值,那么如果有三个Activity是依次显示,但是,第三个Activity需要用到第一个Activity值,这种方法是否还能够发挥功效?...是否还有其他更好方法? 以上就是Android 两个Activity 之间传值问题,如有疑问请留言或者到本站社区交流讨论,感谢阅读,希望能帮助到大家,谢谢大家对本站支持!

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Spring IOC 容器 Bean 之间关系

https://blog.csdn.net/sinat_35512245/article/details/52850068 一、 Spring IOC 容器 Bean 之间存在继承和依赖关系...需要注意是,这个继承和依赖指的是 bean 配置之间关系,而不是指实际意义上类与类之间继承与依赖,它们不是一个概念。 二、Bean 之间继承关系。...com.linuxidc.spring.bean.Employee2" id="employee22" p:address="123mutouren" parent="employee"/> 三、Bean 之间依赖关系...所谓前置依赖是指: IOC 初始化时刻,实例化配置文件 bean 时,前置依赖 bean 要在该 bean 实例化之前实例化。...我是 First 结论:由上述可以看出,不指定 depends-on 前提下,IOC 容器默认实例化顺序是按照 bean 配置文件顺序来实例化

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JVM新生代和老年代(Eden空间两个Survior空间)(转)

我们可以看到:Young Gen垃圾回收时,采用将存活对象复制到到空Suvivor Space方式来确保尽量不存在内存碎片,采用空间换时间方式来加速内存不再被持有的对象尽快能够得到回收。...Space,同时把无效对象所占用空间释放。...若垃圾收集器依据这种小幅度调整收集不能腾出足够空间,就会运行Full GC,此时JVM GC停止所有运行线程并执行清除动作。 1.为什么会有年轻代 我们先来屡屡,为什么需要把堆分代?...对象Survivor区每熬过一次Minor GC,年龄就会增加1岁,当它年龄增加到一定程度时,就会被移动到年老代。...3.一个对象这一辈子 我是一个普通Java对象,我出生在Eden区,Eden区我还看到和我长很像小兄弟,我们Eden区玩了挺长时间。

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spotBinning 空间数据应用

我们知道,空间分析中常见是解析每个spot细胞数,这是往细了做。而临近细胞放到一个bin获得概览,不仅是可视化方面,在数据集大了之后,这种分箱操作可以减少维度。...今天我们就来看看spotBinning 空间数据应用,主角是:同属于Seurat生态schex ,起初,schex 拟解决单细胞转录组图谱(tsne/umap)细胞重叠问题。...Spatial_snn_res.0.8", type="counts", feature="Cck", action="mean")+theme_bw() 本文提出问题其实是空间数据如何重采样...单细胞转录组重采样的话,随机抽取就可以了,但是空间中如果随机抽取的话,势必把好不容易得到空间信息采稀烂。...,不信请看: Binning 空间数据应用: ---- References [1] High-definition spatial transcriptomics for in situ tissue

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spotBinning 空间数据应用

我们知道,空间分析中常见是解析每个spot细胞数,这是往细了做。而临近细胞放到一个bin获得概览,不仅是可视化方面,在数据集大了之后,这种分箱操作可以减少维度。...今天我们就来看看spotBinning 空间数据应用,主角是:同属于Seurat生态schex ,起初,schex 拟解决单细胞转录组图谱(tsne/umap)细胞重叠问题。...可以看到schexpca空间中将细胞点划分为不同区域,并计算了该区域细胞数。当然,如果我们把pca空间换成空间位置信息,自然也是可以做类似的操作。...本文提出问题其实是空间数据如何重采样? 单细胞转录组重采样的话,随机抽取就可以了,但是空间中如果随机抽取的话,势必把好不容易得到空间信息采稀烂。...其实空间数据获得本身就是空间位置分箱采样过程,不信请看: ? Binning 空间数据应用: ?

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网络名称空间Linux虚拟化技术位置

这一特性Linux虚拟化技术占据了核心位置,它不仅为构建轻量级虚拟化解决方案(如容器)提供了基础支持,也传统虚拟机技术中发挥作用,实现资源隔离和网络虚拟化。1....安全性增强通过隔离网络环境,网络名称空间为Linux虚拟化技术提供了一层额外安全保障️。不同虚拟实例之间网络流量是隔离,这减少了恶意实例对其他实例发起网络攻击可能性。1.3....Linux虚拟化技术应用2.1. 容器化技术容器化技术(如Docker、Kubernetes),网络名称空间是实现容器网络隔离基石。...这使得网络名称空间成为构建高密度虚拟化环境(尤其是容器技术理想选择。不过,由于网络名称空间依赖于宿主机网络栈,网络I/O性能也受限于宿主机硬件和网络配置。3.2....此外,围绕网络名称空间,开发了众多工具和库(如CNI、Netlink库等),为自定义网络解决方案开发提供了便利。4. 结论 网络名称空间Linux虚拟化技术占据着不可或缺位置。

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空间音频视频会议场景应用

我们一开始想从纯技术角度研究空间音频技术视频会议场景如何应用,但在研究过程中发现这是一个非常复杂场景。因为视频会议从本质上来讲是人与人之间沟通交流。...虚拟声源与喇叭角度之间满足正弦定理关系,从公式可以看出,模拟虚拟声源位置是两个喇叭之间,一般情况下,立体声可听范围是正负45度左右。...以上提到两个问题是否可以解决呢?Ambisonics技术就可以做到。这个词70年代就有了,但没有对应中文翻译。在这个技术实现,录音用四个心型指向麦克风,四个麦克风之间角度都是120度。...这类系统一般是部署两个会议室之间,但是要注意是:第一,表面上这个系统连接了两个会议室,但这个本质是“把对方搬到自己所在物理空间”,并不是两个物理空间连接和扩展。...五是将远端的人拉到本地场景,远端的人在本地位置空间是由本地控制。 5.2 场景 这里选了两个场景,第一个场景是两个或者多个会议室之间视频会议中最常见场景之一,这里展示两个会议室。

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Mathematica空间解析几何应用之旋转曲面

空间解析几何是大学数学基础课程之一,是通向高等数学桥梁,线性代数、数学分析、微分方程、高等几何等均离不开空间解析几何基本知识与研究方法。...它是用代数方法研究几何图形一门学科,它主要讲解了包括向量代数、空间直线和平面、常见曲面、坐标变换、二次曲线方程等问题。...但是,初次接触解析几何时,由于学生空间想象能力不够,其学习会有一定阻碍;而立体空间难以描述对教师教学也有很大挑战。...一款强大通用计算软件-Mathematica能很好解决这个问题,它通过动态交互界面直观清晰向学生展示空间立体图效果,接下来我们通过两个旋转曲面的例子来讲解Mathematica解析几何方面的应用...注:以一条平面曲线绕其平面上一条定直线旋转一周所成曲面称为旋转曲面,该条直线称为该旋转曲面的轴。 曲线f[x]=Sqrt[4-x]R区域绕X轴旋转图形 ?

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分享八个免费Vue图标库,轻松修饰你应用

/vue-awesome 里面包括数千个高质量,可自定义图标,Vue-awesome将Font Awesome带入到Vue,使开发者可以通过单个组件访问所有的免费图标。...以上库都是一些单独图标库,下面给大家介绍一些不一样 4. Vuetify 项目中,有许多可能会用到验证,作为最流行且维护良好Vue组件库之一,它非常灵活。...官网:https://vuetifyjs.com/ 图标方面,Vuetify使用了Material Design和Font Awesome库。...IconMonstr 官网 https://iconmonstr.com/ 这个库与上述不同特点是,它图标不仅有svg格式图标,还有 png,psd和eps格式图标。...例如,Nuxt,有一个库名为 nuxt-svg-loader(地址:https://www.npmjs.com/package/nuxt-svg-loader) 它可以使SVG转为自己组件。

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如何在 Python 查找两个字符串之间差异位置?

文本处理和字符串比较任务,有时我们需要查找两个字符串之间差异位置,即找到它们在哪些位置上不同或不匹配。这种差异位置查找文本比较、版本控制、数据分析等场景中非常有用。...示例代码,我们只关注了 'replace' 操作码,你可以根据具体需求扩展操作码处理逻辑。...结论本文详细介绍了如何在 Python 查找两个字符串之间差异位置。我们介绍了使用 difflib 模块 SequenceMatcher 类和自定义算法两种方法。...通过了解和掌握这些方法,你可以更好地处理字符串比较和差异分析任务。无论是文本处理、版本控制还是数据分析等领域,查找两个字符串之间差异位置都是一项重要任务。...实际应用,根据具体需求和性能要求,选择合适方法来实现字符串差异分析。

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空间转录组技术肿瘤免疫治疗应用潜力

虽然免疫疗法可以获得很高成功率,但选择压力加上肿瘤内部动态进化推动耐药克隆出现,使肿瘤某些患者持续存在。...FISH还被用于确认乳腺癌HER2基因扩增,从而确定最有可能受益于曲妥珠单抗(一种抗HER2单克隆抗体)治疗患者。另一个重要例子是非小细胞肺癌检测EML4-ALK融合基因。...免疫疗法背景下,RNAscope在理解CAR-T细胞疗法方面发挥了宝贵作用。RNAscope已被用于评估靶基因表达特异性,并跟踪CAR-T细胞异种移植小鼠模型分布。...空间转录组技术(ST) 单细胞RNA测序过程,由于组织通常被均质化以获得转录组平均概况,造成空间信息丢失。...作为概念证明,MIA是胰腺导管腺癌数据集上进行,并且揭示了特定细胞类型和亚群空间限制区域富集,这些区域以前是未知或不可检测

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空间转录组技术肿瘤免疫治疗应用潜力

虽然免疫疗法可以获得很高成功率,但选择压力加上肿瘤内部动态进化推动耐药克隆出现,使肿瘤某些患者持续存在。...FISH还被用于确认乳腺癌HER2基因扩增,从而确定最有可能受益于曲妥珠单抗(一种抗HER2单克隆抗体)治疗患者。另一个重要例子是非小细胞肺癌检测EML4-ALK融合基因。...免疫疗法背景下,RNAscope在理解CAR-T细胞疗法方面发挥了宝贵作用。RNAscope已被用于评估靶基因表达特异性,并跟踪CAR-T细胞异种移植小鼠模型分布。...空间转录组技术(ST) 单细胞RNA测序过程,由于组织通常被均质化以获得转录组平均概况,造成空间信息丢失。...作为概念证明,MIA是胰腺导管腺癌数据集上进行,并且揭示了特定细胞类型和亚群空间限制区域富集,这些区域以前是未知或不可检测

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Baysor:基于成像空间转录组学实现细胞分割

空间转录组学许多分析都可以被表述为标签分配问题。例如,细胞分割是将细胞标签分配给观察到分子。细胞间背景分离是一个将分子标记为“信号”与“背景”问题。...从数学角度来看,这种空间聚类趋势可以简单细分图上使用马尔可夫随机场(MRF)预设来捕捉,不同标签问题可以通过选择适当标签概率模型和可观察数据来解决。...同时,研究人员还证明了Baysor使用五种不同方案获得数据上表现良好,使其成为分析基于成像空间转录组学有力通用工具。...Baysor和其他分割方法使用五种不同方案产生数据集上表现:检查汇总统计数据时,发现Baysor报告细胞包含分子数量和面积与最初发表("论文")分割结果大致相同;与其他分割方法相比,Baysor...尽管Baysor算法大多数已发表方案中表现良好,但仍可引入一些潜在改进,如改进细胞形状建模。

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