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bash 脚本嵌入 expect

执行一些命令总是需要交互式的输入信息,如 等等,这可以起到提醒用户的作用,也更加保险。...但是有的时候执行自动化脚本并不希望一直进行交互式的操作,所以 便显得极为有用。 是一个免费的编程工具,可以完成自动化交互式任务,无需人为干预。...由于 并没有默认安装,所以需要先安装: sudo apt install expect 另外因为 脚本有专用的解释器,所以脚本的第一行不是: #!/bin/bash 而是: #!...因此需要想办法将 脚本嵌入到 脚本执行 脚本时有三种方法,第一种: ./bash_script.bash 这要求脚本有可执行权限并且第一行是: #!...这第三种的语法同样可以用在 解释器上: expece -c "cmd string" 同理,这样写意味着将 通过 解释器运行。 完整的样例: #!

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批量运行多个R脚本

一个小技巧分享,假如有人写了很多绘图脚本,比如文献:《Preoperative immune landscape predisposes adverse outcomes in hepatocellular...里面就有很多R代码 : 代码文件很多 如果把这些R代码文件一个个打开,然后一个个运行,工作量也不小,所以我们推荐一个技巧: fs=list.files('..../',pattern = '*.R$') fs lapply(fs, function(x){ print(x) source(x) }) 这个技巧有一个小问题,就是有一些脚本可能是缺包或者里面有小...其实理论上应该是在运行每个脚本的时候加上try catch,不过咱们的目标是批量运行每个代码并且保证成功,所以跳过那些运行失败的解决不了问题,反而应该是勇往直前解决问题。...,然后批量运行成功为止。

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bash运行脚本的几种方式 转

bash shell 脚本执行的方法有多种,本文作一个总结,供大家学习参考。 假设我们编写好的shell脚本的文件名为hello.sh,文件位置/data/shell目录并已有执行权限。...方法四:在当前的shell环境执行bash shell脚本: cd /data/shell . hello.sh 或 cd /data/shell source hello.sh 前三种方法执行shell...脚本都是在当前shell(称为父shell)开启一个子shell环境,此shell脚本就在这个子shell环境执行。...shell脚本执行完后子shell环境随即关闭,然后又回到父shell。而方法四则是在当前shell执行的。 假设shell脚本文件为hello.sh 放在/root目录下。...也可以让shell脚本现行的shell执行: 4.现行的shell执行 代码如下: [root@localhost ~]# . hello.sh hello guys!

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Linux使用Bash脚本命令

编写Bash脚本或在Linux命令行上工作,最常见的任务之一是读写文件。 本文介绍了如何使用重定向操作符和tee命令或者bash脚本将文本写入文件。...使用重定向操作符写入文件 Bash,输出的重定向使您可以从命令捕获输出并将其写入文件。...使用此运算符要格外小心,因为您可能会覆盖重要文件。 >>重定向运算符会将输出追加到给定文件。 如果文件不存在,则会创建该文件。 您需要具有对该文件的写入权限。 否则,您将收到拒绝权限错误。...: file.txt: cannot overwrite existing file >|运算符可让您覆盖Bash的“ noclobber”选项: set -o noclobber echo "this...要将文本追加到您没有写权限的文件,请在tee之前加 sudo : echo "this is a line" | sudo tee file.txt echo命令输出作为输入传递到tee,这将提升sudo

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批量运行多个R脚本代码

今天,我们利用健明老师推荐的批量运行多个R脚本代码,见证一下该代码的优势。...patients with liver transplantation》的 GitHub (https://github.com/sangho1130/KOR_HCC) ,我们发现其共包含19个R脚本...然后,我们一个一个打开脚本检查了一下其所用到的R包,下载好所要用到的所有R包。但是在下载R包过程我们发现RGtk2和rsgcc这两个包一直报错,没有解决掉这个问题。...所以,我们把包含这两个包的5个脚本剔除,把剩下的14个R脚本进行批量运行。 #这两个R包下载失败了,如果你们下载成功了,也欢迎分享以下方法!.../',pattern = '*.R$') fs lapply(fs, function(x){ print(x) source(x) }) #正常运行结果 [1] "Figure_1A.R

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Java运行shell脚本

需求 忽然想写个东西,然后发现自己的linux端口开放问题以及端口占用问题很麻烦,因为我经常用8080端口,如果有一个图形化界面看某个端口被占用以及被什么占用就好了。...br.close(); } catch (Exception e) { e.printStackTrace(); } return result; } } 前提是:你的脚本有权限去运行...,即在linux上有权限去运行,否则不通; 如果不满足,如果不满足,下下策为执行脚本之前先执行以下赋予权限的命令 ,执行你的命令 ShellUtils.exceShell("chmod -R 777.../opt/project/firewalld_status.sh"); ShellUtils.exceShell("/opt/project/firewalld_status.sh"); (3)脚本项目里...(jar包里) (1)复制sh到操作系统的某个目录下(亲测,可用) 从jar包内复制文件到系统目录内_CBeann的博客-CSDN博客_java将jar包中文件复制到 (2)用方式二执行脚本

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详解bash脚本调试机制

以调试模式运行脚本 通过bash -x 的方式可以调试模式下运行整个脚本, bash会在在运行前打印出了每一行命令, 而且每行前面用+号表明命令的嵌套层数. > bash -x debug.sh..., 例如打印出错的命令: trap 'echo $BASH_COMMAND' ERR 但鉴于使用trap进行调试的执行效率过低, 建议较为复杂的脚本中直接使用调试选项或者使用bashdb等调试工具....() { func1 } func3 () { func2 } func3 caller 0 # 必须在函数调用 否则无输出 exit 0 运行脚本可以得到以下输出: Level0.../bin/bash -xv 还可以可能出错的命令前用echo输出调试信息: echo "debug message: now attempting to start w command"; w # 用...* > ll * -rw-rw-r-- 1 remilia remilia 0 Mar 1 20:09 '*' 到此这篇关于详解bash脚本调试机制的文章就介绍到这了,更多相关bash 脚本调试

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【shell脚本】$ shell脚本的使用

shell脚本 '$' 与不同的符号搭配其表示的意义也会不同 特殊标志符 含义 $0 当前脚本的文件名 $n 传递给脚本或函数的参数。n 是一个数字,表示第几个参数。...例如,第一个参数是$1,第二个参数是$2 $# 传递给脚本或函数的参数个数 $* 传递给脚本或函数的所有参数 $@ 传递给脚本或函数的所有参数 $?...)包含,都以"$1" "$2" … "$n" 的形式输出所有参数。...但是当它们被双引号(" ")包含,"$*" 会将所有的参数作为一个整体,以"$1 $2 … $n"的形式输出所有参数;"$@" 会将各个参数分开,以"$1" "$2" … "$n" 的形式输出所有参数.../bin/bash echo "file name $0" echo "first param $1" echo "pid $$" echo "total num of param $#" echo

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Centos8 脚本模式运行 Top

使用 Top 命令脚本模式的方法 Centos8 ,我们执行本文中的命令。下面命令按照 CPU 使用率对数据进行排序,并打印命令中指定的前 20 行。...top命令使用的选项解释如下: -b: 运行脚本模式 -c: 显示COMMAND列命令的完整路径 -n: 指定top结束之前应该产生的最大迭代数。...批处理模式下,使用 top 命令根据进程的使用的时间排列数据。它显示进程自启动以来消耗的 CPU 时间总量。...10 root 20 0 0 0 0 S 0.0 0.0 0:00.79 [ksoftirqd/0] 下面可以将top的输出结果保存到文件:...它将显示 CPU 和内存使用情况及其他信息,例如正在运行的程序。可以利用脚本模式的选项将top命令输出传输到其他应用程序或文件。

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批量运行多个R脚本并打印运行状态

曾老师曾经有一篇推文《批量运行多个R脚本》,介绍了批量运行R脚本的思路,同时也提出了一些问题,今天就这个学徒作业,我们来探究一下。 首先前往github[1]下载R脚本。...打开以后可以发现这里有19个R脚本,如果把这些R代码文件一个个打开再运行,无疑增加了很多工作量。...首先在「KOR_HCC-main/code」文件夹中新建一个R project,然后「KOR_HCC-main」文件夹下新建一个「results」目录。...实测我的R环境下,运行到第3个代码遇到了报错,此时Fig 1A和Fig 1B的结果已经产生。 这个时候我们希望脚本继续运行,同时打印各个脚本运行情况。...我们参考教程R语言tryCatch使用方法:判断Warning和Error[2]和中断运行 r 忽略报错 继续运行[3](这个教程的代码有些问题,需要自己修改调试),使用「tryCatch」来解决这个问题

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Bash shell脚本如何检查一个目录是否存在

问: Bash shell 脚本什么命令检查某个目录是否存在?...例如,运行以下代码: ln -s "$ACTUAL_DIR" "$SYMLINK" if [ -d "$SYMLINK" ]; then rmdir "$SYMLINK" fi 将产生错误消息... Unix 的早期设计,许多系统资源都被抽象为文件,以实现统一和一致的接口处理,这样程序员可以使用相同的系统调用来操作不同的资源,如普通文件、目录、设备等。...这里顺便整理一下 Bash 对文件的各种测试: -a file -- 如果文件存在则为真。 -b file -- 如果文件存在且为块特殊文件则为真。...-r file -- 如果文件存在且可读则为真。 -s file -- 如果文件存在且大小大于零则为真。 -u file -- 如果文件存在且设置了用户ID位(set-user-id)则为真。

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