wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-aarch64.sh 然后安装命令 下载 Miniconda3...的安装包，则执行以下这条（建议执行py3.9的） /bin/bash Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-aarch64.sh 不行或者就用root命令（以3.9为例） sudo bash...Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-aarch64.sh 然后 yes 一直回车或者空格、按S跳读；再yes yes 接着；输入安装位置； /home/pi/miniconda3...PATH="/home/pi/miniconda3/bin:$PATH" ctrl+s保存后；ctrl+x退出 请确保将/home/pi/miniconda3/bin替换为你的miniconda安装路径...参考文章：Raspberry Pi 3B 安装Miniconda_initialize miniconda3 no change-CSDN博客 树莓派3B+中下载miniconda3(图文全过程)
在https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/中找到最新的 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/.../anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh下载Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.shbash...Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh看到“Thank you for installing Miniconda3 ！”...说明安装成功source ~/.bashrc #激活conda的代码,注意空格conda #出现满屏的信息说明成功了# 使用北外的镜像conda config --add channels https:...anaconda/pkgs/main/conda config --set show_channel_urls yes配置镜像conda list查看所有的软件conda install fastqc -y 安装软件
-Linux-x86_64.sh安装minicondabash Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh sh是脚本，类似软件安装包，需要运行bash 开始安装。...安装过程会出现很多版权信息，可按q跳过，有提示需要按enter的地方要按enter，遇到问题回答yes。最后出现“Thank you for installing Miniconda3 ！”...#使用北外的镜像使用condaconda list #查看服务器上安装的所有软件conda install fastqc=0.11.7 -y #默认安装最新版本，防止新版本有bug，指定特定版本，此处=...后面终于醒悟，因为我在服务器操作，所以我需要安装的是Linux版本，之后终于安装成功。...划重点：生信的Linux操作是在服务器上，是Linux环境。
Containers能更简单的传导（对开发人员有用）和更简单地在本地系统上使用不同的工具（对用户有用）。...Containers封装了软件组件及其相应的依赖项，因此你只需下载对应的镜像就相当于安装了软件，然后在支持Docker的任何系统上运行它。...他们在Docker Hub上有1000多个存储库，其中包含各种生物信息工具的Docker镜像。 关于Docker的基础 首先下载Docker,到下面的网站下载好对应版本的docker，然后进行安装。...这里先下载安装好Conda的: docker pull continuumio/miniconda3 接着使用以下命令将容器外部的数据链接到容器里： docker run -it --rm -v /tmp.../:/data continuumio/miniconda3 /tmp/是本地文件系统上数据目录的文件路径。
本篇文章将分享如何通过 Docker 来在本地快速运行 Hugging Face 上的有趣模型。用比原项目更少的代码，和更短的时间成本将模型跑起来。...瞳孔和毛发细节也非常接近真实 相比较原始照片新照片清晰不少 上面的图片处理所使用的 AI 模型，是我在 Hugging Face 上找到的。...接下来，我们来聊聊如何编写这类基础镜像的 Dockerfile ，以及编写过程中的思考： 考虑到模型可能需要在 x86 和 ARM 两类设备上运行，推荐使用 miniconda3 这个基于 debian...FROM continuumio/miniconda3:4.11.0 关于基础环境镜像的使用，我推荐大家使用具体版本号，而不是 latest，这样可以让你的容器在需要重复构建的时候，也能保持“稳定”，减少...--EOF 引用链接 [1] 这里: https://hub.docker.com/r/continuumio/miniconda3/tags [2] 官方仓库: https://github.com
一开始我尝试着通过 msysy2 安装 MinGW，但是问题层出不穷，因为平时笔者平时编码都是在 Linux 操作系统，Windows 下的环境配置并不算熟悉，之后还要考虑动态库链接和 Python 环境等问题...，于是我在 Github 上找了一圈，看见有人通过 Docker 配置编译环境，只需要本地电脑安装 Git bash 和 Docker 即可，这种方式简单快捷，并且解耦了环境配置与实际开发环境，以后我即使换电脑...我在该方案上做了些许调整，接下来介绍一下具体的配置过程。...基础镜像选择的是 continuumio/miniconda3，默认安装了 conda 环境，方便指定 Python 版本和安装 scons 编译工具。...FROM continuumio/miniconda3:latest这里的 Python 选择的是 3.11.9 版本，一开始我试着配置 Python 3.12.3 + scons 4.7，编译 godot-cpp
本篇文章将分享如何通过 Docker 来在本地快速运行 Hugging Face 上的有趣模型。用比原项目更少的代码，和更短的时间成本将模型跑起来。...[瞳孔和毛发细节也非常接近真实] [相比较原始照片新照片清晰不少] 上面的图片处理所使用的 AI 模型，是我在 Hugging Face 上找到的。...接下来，我们来聊聊如何编写这类基础镜像的 Dockerfile ，以及编写过程中的思考： 考虑到模型可能需要在 x86 和 ARM 两类设备上运行，推荐使用 miniconda3 这个基于 debian...FROM continuumio/miniconda3:4.11.0 关于基础环境镜像的使用，我推荐大家使用具体版本号，而不是 latest，这样可以让你的容器在需要重复构建的时候，也能保持“稳定”，减少...将下载好的模型文件和新的 Dockerfile 文件放置于相同目录之后，我们来继续完善 Dockerfile 的内容，完成项目依赖的安装，并将模型放置在容器内合适的目录位置： # 安装模型相关代码库 RUN
文章目录 1 mlflow Dockerfile 2 训练模型 3 对比模型 4 打包模型 5 模型部署 6 模型inference调用 mlflow的安装与使用，可以直接： pip install mlflow...mlflow Dockerfile 本来按照这个MLFlow教程（MLflow系列1：MLflow入门教程（Python）），找台机器跑起来没啥问题； 不过，看到项目的github有Dockerfile那必须上啊...首先，来看一下全环境的官方mlflow/Dockerfile： FROM continuumio/miniconda WORKDIR /app ADD ..../miniconda，后续还是改成了continuumio/anaconda3，在安装两个requirements.txt会遇到各种time-out报错，没后续尝试。...mlflow.exceptions.ExecutionException: Run (ID 'fc28f62058144c778a8ca2ae49d0c7ab') failed 一种方式就是conda activate mlflow-xxxxxx，然后把该安装的都安装了
安装 Anaconda 这一部分上一篇已经说过了，这里再说一下。 anaconda 官网 - 是Python的一个科学计算的发行版。...这里以官方最新版本（18/1/10）3-5.0.1为例，通过安装脚本安装(Ubuntu环境)。 事实上，win下的安装更为简单，也可以配合PyCharm食用更佳。...注意： Anaconda 和 jupyter Notebook 在Linux环境下都不推荐使用root权限，因此最好使用其他用户进行安装。...以上设置完以后就可以在服务器上直接输入 jupyter notebook 启动， root 用户使用 jupyter notebook --allow-root 。...然而实际上并不需要这么复杂！ 为啥捏~(￣▽￣)~*？
基本介绍与其特点 从Conda的官方文件中找到了下面这一段解析: Conda是在Windows，macOS和Linux上运行的开源软件管理系统和环境管理系统。...如果你在安装生物信息学工具之前遇到过依赖性问题，Conda会轻而易举帮助您解决这一问题。此外，Conda使安装和使用不兼容的工具变更加容易。...使用docker安装,使用conda 将上节课所学的知识运用，使用docker来安装conda: docker pull continuumio/miniconda3 使用docker，运行新的conda...bcftools 在没有conda之前，我们需要 通过一系列的操作，才能完成安装: ?...我强烈不建议在同一环境中安装所有软件包/工具。这个是很多新手玩家会犯的错误。很多刚刚入门生信的初学者，都会一个劲的在base的环境里，安装各种各样他们所需的工具。
概述 在本教程中，学习如何使用 RPM 和 YUM 工具管理 Linux 系统上的包。学习： 使用 RPM 和 YUM 安装、重新安装、升级和删除包。...现在，大部分 Linux 发行商都使用预先构建的程序或称为包 的程序集，这些包已准备好安装在该发行版上。在本教程，您将学习可帮助安装、更新和删除包的包管理工具。...假设您知道它实际上在 gcc-gfortran 包中，而且您已下载或获取了该包的副本，您可以尝试使用 rpm 命令和 -i（表示安装）选项来安装它，如 中所示。...但是，如果您在单个命令上指定删除多个包，没有依赖项的包会在有依赖项的包之前删除。 使用 rpm 删除包时，在删除包之前没有提示，这与安装包时不同。...在 RPM 主页上也可以找到已签名二进制文件的更多信息。 验证已安装的包 就像检查 rpm 的完整性一样，也可以使用 rpm -V 检查已安装文件的完整性。
现在，大部分 Linux 发行商都使用预先构建的程序或称为包 的程序集，这些包已准备好安装在该发行版上。在本教程，你将学习可帮助安装、更新和删除包的包管理工具。...假设您知道它实际上在 gcc-gfortran 包中，而且您已下载或获取了该包的副本，您可以尝试使用 rpm 命令和 -i（表示安装）选项来安装它，如 中所示。...备注：在 中，YUM 找到了 gcc-gfortran 包的最新版本，该恰好具有与我们尝试在 中安装的版本相同的级别 (4.9.2-6)。...但是，如果您在单个命令上指定删除多个包，没有依赖项的包会在有依赖项的包之前删除。 使用 rpm 删除包时，在删除包之前没有提示，这与安装包时不同。...如果您将有序输出重定向到一个机器上的一个文件，然后在另一个机器上执行相同操作，可以使用 diff 程序查找区别。
早在 18 年 6 月的时候，我公众号上写过一篇关于UpSetR的学习笔记《UpSetR：多数据集绘图可视化处理利器》，提到过一下venneuler，当时也没怎么留意，直到前不久有个读者在使用UpSetR...，并解决它们其中的依赖，但即使安装过程没有任何问题，在使用library(venneuler)后上面提到的问题也仍然会出现。...conda环境中openjdk，r-rjava，r-venneuler都可以安装成功，但就是用不了，这是我在 conda 中遇到的问题，暂时没找到解决方法。...安装二进制的 java 在 Java SE 7 Archive Downloads 页面下载 jdk-7u80-linux-x64.tar.gz，解压缩。...安装 rJava 和 venneuler 上面的步骤完成后，在 R 中使用rJava和venneuler，发现一切正常。
今天也是记流水账的一天，下载安装了 conda ，了解了一下 conda 环境，今天的任务还挺轻松的，但是让我对linux服务器上的软件安装好像认识得更直观了一点点。...不过还是不完全明白，我们在服务器上能调用哪些范围内的软件？...直接在主目录下输入 source ~/.bashrc ，之后在随便哪个文件夹下输入conda都能出来conda的基本信息，不太懂它的作用范围，查了一下安装路径，是在conda里面，所以是在我的主目录下都可以调用的意思吗...(base) bio04@VM-0-6-ubuntu:~/tmp$ whereis condaconda: /home/bio04/miniconda3/bin/conda /home/bio04/miniconda3...fastqc 啦，也顺便看了看它安装到了哪里(base) bio04@VM-0-6-ubuntu:~$ whereis fastqcfastqc: /home/bio04/miniconda3/bin
例如，默认安装不会将任何 python 信息添加到操作系统的默认路径，也不需要管理员权限就可以进行安装。...在我的系统上（默认安装 miniconda），文件存储在这里：C:/Users/luobo/AppData/Local/Continuum/miniconda3/Scripts/activate.bat...当 conda 在 Windows 上创建新环境时，该环境的默认目录位置如下所示：C:/Users/luobo/AppData/Local/Continuum/miniconda3/envs/work...这样，我们的脚本应该可以在其他人的机器上无缝运行，并且可以跨不同版本的 Windows 运行。...生成快捷方式 在 Windows 上使用快捷方式时，可以右键单击快捷方式图标并查看属性。我们大多数人可能见过这样的事情： Winshell 提供了一个转储功能，使实际的快捷方式属性更容易查看。
它在安装软件的时候需要C库就自己安装，需要R包就自己按照R，需要perl就自己安装，而且我把conda的默认路径添加到环境变量最新，最高权限，就把我默认的perl,r全部替换了。...leotao的建议 不要让conda在安装时，把path加到系统里去，要用的时候激活 激活后，用conda install -p /path/for/biotools/把 生信软件装到特定位置,而且这个位置的...home/jianmingzeng/miniconda2/lib/libicuuc.so.58 /home/jianmingzeng/miniconda2/lib/libicuuc.so.58.2 实际上我在我的另外一个服务器上面同样的查找....58.2 /usr/local/bin/miniconda3/lib/libicuuc.so.58 可以看到这个库文件是conda安装了icu后获得的，那么我应该是要安装特定版本的icu才行。...这个库是在一种无限制的开放源码许可证下发布的，这使它可以在许多应用程序中使用。 问题是解决了，可是我首先不明白问题是如何产生的，其次也不明白，问题被解决的原理是什么。纯粹是凭感觉，凭经验。
https://www.jianshu.com/p/d09ee5e6a94f 鉴于之前在笔记本上使用Rstudio Desktop可以自由切换R版本，于是本人想尝试服务器上Rstudio Server配置不同的...R版本，并实现版本间的切换，遂尝试如下： 服务器：阿里云；系统：Ubuntu 18.04 64位 R3.6的安装和Rstudio Server的配置参考《在Ubuntu下安装单细胞3大R包》—— 生信技能树...R3.6的安装和Rstudio Server的配置 参考《在Ubuntu下安装单细胞3大R包》—— 生信技能树 2.1 R3.6的安装 scR2021@iZ0jlac7d4cxlrxfyzxkgoZ:~...后续R包的安装可以在RStudio Server的这个界面进行，也可以在shell终端敲“R”进入R界面进行，安装的位置可能有所不同，但设置好了都是可以调用的。...3.3 R4中R包的安装和调用 有些R包需要调用很多动态库和一些依赖包，在R中安装经常报错，很伤脑细胞，还打击学习生信的积极性，经常让人累觉不爱，所幸现在conda越来越万能，所以遇到不省心的R包可以尝试
ChatGLM3-6B 是 ChatGLM3 系列中的开源模型，在保留了前两代模型对话流畅、部署门槛低等众多优秀特性的基础上，ChatGLM3-6B 引入了如下特性： 更强大的基础模型： ChatGLM3...在语义、数学、推理、代码、知识等不同角度的数据集上测评显示，* ChatGLM3-6B-Base 具有在 10B 以下的基础模型中最强的性能*。...conda 建议直接安装Anaconda即可本地 mkdir -p ~/miniconda3 wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86..._64.sh -O ~/miniconda3/miniconda.sh bash ~/miniconda3/miniconda.sh -b -u -p ~/miniconda3 rm -rf ~/miniconda3...） 在Ubuntu系统上安装Git Large File Storage (Git LFS) 的步骤如下： 安装Git（如果尚未安装）： 确保你的系统上已经安装了Git。
前一阵排查一个线上问题，链路较长，排查这种问题基本就是靠日志，日志不足时，靠网络抓包，在linux上基本就是使用tcpdump。...因为知道机器上没有tcpdump，我就自己在网上下载了一个tcpdump的rpm包，发给运维同事，然后在约好的时间，几个开发同事一起去他那边排查。...在开发环境的centos 7.x机器上执行： yum install --downloadonly --downloaddir=/root/download tcpdump 执行完成后，就在/root...-3.el7.x86_64.rpm 这次发过去后，在某台机器上安装了，没问题，可以抓包，挺好。...from package libpcap-14:1.5.3-8.el7.x86_64 上面说了，centos 7.x会有对应的版本的tcpdump，tcpdump依赖libpcap，但是很可能，线上机器在安装别的什么软件的时候
文件夹下wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh...下载sh脚本文件通过bash命令运行sh文件bash Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh最后source ~/.bashrc激活conda，进一步在base环境下输入...conda，出现满屏的信息说明成功了设置镜像所谓镜像网站，相当于主网站的副本，conda在国外，我们在国内下载软件速度会很慢，因此配置镜像，从镜像网站下载，可以加快下载速度把下面的代码全部复制到命令行，...https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/conda config --set show_channel_urls yes使用conda查看当前服务器上安装的所有软件列表...conda list安装软件 conda install fastqc -y【-y是yes，安装过程中conda问你的问题全部回答yes，不加yes需要手动键入确认安装】，键入fastqc --help
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