在dplyr管道期间添加rnorm，但在设置sd时按组设置 - 腾讯云开发者社区

["Median"]) iris %>% dplyr::select(-Species) %>% map(summary) %>%map_dbl("Median") # 数字：也是用于快速提取内容，按位置取值...iris %>% dplyr::select(-Species) %>% map(summary) %>% map_dbl(3) map2 map2(.x, .y, .f, ...) map2可以对两个向量..." map2在使用管道时，可以使用%$%： library(magrittr) list(mean=1:3, sd=4:6) %>% tibble::enframe() %$% map2(name...x <- 1:3 y <- list(4,5,6) z <- list(1,2,3) pmap(list(mean=x, sd=y, n=z), rnorm) #相当于rnorm(mean=1, sd=...4, n=1)、rnorm(mean=2, sd=5, n=2)、rnorm(mean=3, sd=6, n=3) #[[1]] #[1] 6.224277 # #[[2]] #[1] 12.32054

1.6K1 0

R语言ggplot2画图比较两组连续型数据的几种方案

连续型数据的的分组比较在科研生活中非常常见，比如：实验组和对照组基因表达量的比较、临床病人存活组和死亡组某项检查指标的比较等等。检验两组连续型数据之间是否存在差异通常会使用T检验。...("ggplot2") install.packages("dplyr") 首先是模拟数据集 set.seed(1234) crp1rnorm(200, mean = 150,...sd = 48))) status1<-rep("Death", 200) data1<-data.frame(crp1, status1) crp2rnorm(200, mean...但这里因为图形有重叠，我们需要用alpha参数对透明度进行设置。 ?...此外，在直方图的基础上，我们也可以添加核密度曲线： ggplot(data, aes(CRP))+ geom_histogram(aes(y = ..density.., fill = Status

4.6K2 0

您找到你想要的搜索结果了吗？

是的

没有找到

比Python绘制散点密度图还方便？！怎么选？当然全都要...

(ps:Python和R我全都要) R语言中虽然可以使用ggplot2中的geom_density_2d()函数完成散点密度图的绘制，但在参数的设置上稍显复杂，所以我们今天给大家推荐一个非常好用的拓展工具包...与ggplot2无缝集成：ggpointdensity包是基于ggplot2的，因此可以与ggplot2的其他功能无缝集成，如添加标签、调整坐标轴等。...) library(viridis) library(ggpointdensity) dat <- bind_rows( tibble(x = rnorm(7000, sd = 1),...y = rnorm(7000, sd = 10), group = "foo"), tibble(x = rnorm(3000, mean = 1, sd = .5),...y = rnorm(3000, mean = 7, sd = 5), group = "bar")) ggplot(data = dat, mapping = aes(x = x,

3701 0

「R」用purrr实现迭代

使用purrr，我们可以解决子问题，然后用管道将其组合起来。映射函数先对向量进行循环，然后对其每一个元素进行一番处理，最后保存结果。...使用管道时这一点尤为突出： df %>% map_dbl(mean) #> a b c d #> 0.45635 -0.17938 0.32879...这样做容易出错而且可读性差，因此最后使用命名参数： args2 = list(mean = mu, sd = sigma, n = n) args2 %>% pmap(rnorm) %>%...f = c("runif", "rnorm", "rpois") param = list( list(min = -1, max = 1), list(sd = 5), list...", list(sd = 5), "rpois", list(lambda = 10) ) sim %>% dplyr::mutate(sim = invoke_map(f, params

4.8K2 0

R︱高效数据操作——data.table包（实战心得、dplyr对比、key灵活用法、数据合并）

设置key的方式有很多种： 1、创建数据时直接设置key dt rnorm(6),key="a") 2、setkey...2、按条件行筛选从前用subset的方式进行筛选比较多， new=14,select=a:f) （1）单变量现在data.table与dplyr from_dplyr =...="Hospice"] （3）还有一些复杂结构： dt[a=='B' & c2>3, b:=100] #其他结构在dt数据集中，筛选a变量等于"B"，c2变量大于3，同时将添加b变量，数值等于...在dplyr分组求和的过程中，还是挺有用的。...SD只能在位置j中使用。 .SDcols常于.SD用在一起，他可以指定.SD中所包含的列，也就是对.SD取子集。

9.3K4 3

生信星球——生信入门DAY6:学习R包

以dplyr为例首先设置镜像options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) options(BioC_mirror...(package)将加载名为package的命名空间，并添加到包的搜索列表中。...从该文件读取和分析输入，直到到达文件的结尾，然后在选定的环境中按顺序解析表达式。简单来讲，library更像装载，require不会报错，source装载的方式则不太一样。...使用，第二行代码即是先将数据按species分组，再计算均值和标准差同时，对于这样一组简单的数据，用管道操作也可以达成相同的目的，但是更有趣test %>% group_by(Species) %>...% summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))跑出来会发现两个代码得出的数据是一样的，但是管道操作(%>%)在复杂的数据中起到更亮眼的作用简单的统计命令

1431 0

数据框的列名居然会影响绘图

(100, mean = 50, sd = 10), rnorm(100, mean = 60, sd = 15)) ) # 使用ggplot2绘制箱线图 ggplot(data, aes(x = Category...在使用ggstatsplot包绘制图形时遇到"Error in select(): ! Names must be unique."的错误，这通常意味着在数据处理过程中，列名或其他标识符出现了重复。...根据搜索结果，这个问题可能与数据处理方式有关，尤其是在使用dplyr包的select()函数时。解决这个问题的一种方法是确保在进行选择操作时，所选的列名是唯一的。...此外，如果错误发生在使用ggstatsplot的ggwithinstats()函数时，这可能是因为在处理大量数据点时，函数内部的某些操作导致了列名不唯一。...(100, mean = 50, sd = 10), rnorm(100, mean = 60, sd = 15)) ) library(ggplot2) # 使用ggplot2绘制箱线图 ggplot

821 0

生信学习小组Day6笔记—Chocolate Ice

安装与加载R包镜像设置目的：加快加载速度方法：应用R的配置文件：Rprofile说起来这个，就必须提到Rstudio最重要的两个配置文件：在刚开始运行Rstudio的时候，程序会查看许多配置内容，其中一个就是....Renviron，它是为了设置R的环境变量（这里先不说它）；而.Rprofile就是一个代码文件，如果启动时找到这个文件，那么就替我们先运行一遍（这个过程就是在启动Rstudio时完成的） -----...-微信公众号：生信星球首先用file.edit('~/.Rprofile')打开.Rprofile文件；然后在.Rprofile文件内添加下列两行代码# options函数就是设置R运行过程中的一些选项设置...（1）按列号筛选#筛选一列select(test,1)#筛选多列select(test,c(1,5))（2）按列名筛选#筛选一列select(test,Sepal.Length)#筛选多列#方法1select...两个实用技能管道操作管道操作是一种强大的工具，能够通过管道将数据从一个函数传给另外一个函数，从而用若干函数构成的管道依次变换你的数据。

7553 0

2023.4生信马拉松day7-R语言综合应用

Species'列去完重复后保留所有列”，其默认设置是.keep_all = F，表示“按'Species'列去完重复后只保留'Species'列”； 3....以上操作根据此前学过的知识新增列的话这么写：图片 4.简单了解：select() 、filter()筛选列、行 5.补充知识：管道符%>% -（1）当遇到连续的步骤时：多次赋值，会产生多个中间的变量；...-（2）用多次嵌套避免中间变量不直观，且容易出错； ——设置彩虹括号，可以在多层嵌套时看清楚哪个括号和哪个括号是一对： options -- code -- display --use rainbow...parentheses -（3）用管道符%>%可以更加简洁明了；%>%表示向后传递，把管道符前面所有的东西作为后一个函数的第一个参数；管道符号永远在中间，后面一定有东西； # 连续的步骤 # 1.多次赋值...——现学就行~ # 生成一个表达矩阵 set.seed(10086) #为了让模拟分析的结果可重现，给rnorm设计一个随机数种子，保证它每次生成的随机数都是那一组； exp = matrix(rnorm

3.6K8 0

tidyverse：R语言中相当于python中pandas+matplotlib的存在

；查看数据时，不再会一行显示不下（会自动隐藏一部分，自带head）；有两种方式来创建tibble格式的数据： 1....——将左侧的值应用到右侧数据data位置管道函数在tidyverse中，管道符号是数据整理的主力，可以把许多功能连在一起，而且简洁好看，比起R的基本代码更加容易阅读！...4.6 分组: group_by # install.packages("dplyr") library(dplyr) 4.1 筛选: filter() #按给定的逻辑判断筛选出符合要求的子数据集...这些函数允许在长数据格式（long data）和宽数据格式（wide data）之间进行转换（功能类似于reshape包，但是比reshape更好用，并且可以用于管道%>%连接）。...(10, 0, 1), Y = rnorm(10, 0, 2), Z = rnorm(10, 0, 4) ) stocksm % gather(stock, price

4.2K1 0

Day6生信入门—R包

options函数就是设置R运行过程中的一些选项设置 options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #对应清华源...'~/.Rprofile') 2) 然后在左上添加两行options代码： options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/...") library(dplyr) 示例数据直接使用内置数据集iris的简化版: test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),] dplyr五个基础函数注意，井号开头的是代码运行记录...可以和自己的运行结果做对比 1.mutate(),新增列 mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width) 2.select(),按列筛选 1)按列号筛选 select...(Sepal.Length)) 图片 # dplyr两个实用技能 ## 1：管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M) （加载任意一个tidyverse包即可用管道符号） test %

5442 0

生信星球Day4 学习R包

认识dplyr，函数、功能等---安装和加载R包镜像设置方法一：手动设置，Tools→Packages→Primary CRAN repository方法二：自动运行教程来自：https://www.jianshu.com.../p/861224f4251aoptions() 设置R运行过程中的一些选项设置options()$repos 查看使用install.packages安装时的默认镜像options()$BioC_mirror...查看使用bioconductor的默认镜像R最重要的两个配置文件: 一是.Renviron，能够设置R的环境变量；二是.Rprofile，如果启动时找到这个文件，那么就替我们先运行一遍（这个过程就是在启动...() 按某1列或某几列对整个表格进行排序，默认从小到大，用desc()可从大到小summarise() 汇总，配合group_by()分组，可以mean()求平均值，sd()求标准差test 管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M) test %>% group_by(Species) %>% summarise(mean

2114 0

生信技能树七天学习小组 Day6笔记——学习R包

呜呜今天是补昨天的内容昨天临床任务太多只看了一下要学习的内容没有做笔记T T1 安装和加载R包1.1 镜像设置1.2 安装install.packages()/BiocManager::install...")library(dplyr)2 dplyr的五个基础函数test 按列筛选2.2.1 按列号筛选select(test,1)select(test,c(1,5))2.2.2 按列名筛选select(test, Petal.Length...))3 dplyr的两个实用技能3.1 管道操作 %>% (ctr + shift + M)可以在 R 中使用管道运算符 ( %>% ) 将一系列操作“通过管道”连接在一起，该运算符最常与 R 中的dplyr...管道运算符只是将一个操作的结果传递到其下面的下一个操作。使用管道运算符的优点是它使代码非常易于阅读。

991 0

生信星球学习小组Day6-R包学习 Jerry

镜像设置（1）在Rstudio程序设置中设置，可以用options()$repos来检验，但有时候还是不能成功，也不能下载Bioconductor的包（2）代码设置 # options函数就是设置R...") library(dplyr) test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),] #示例数据 2. dplyr五个基础函数 a. mutate(),新增列 mutate(test..., new = Sepal.Length * Sepal.Width) # 新增一列new b. select(),按列筛选 # (1)按列号筛选 select(test,1) select(test,...管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M) （加载任意一个tidyverse包即可用管道符号） test %>% group_by(Species) %>% summarise...(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length)) #管道上一个输出赋给了下一个输入 b. count统计某列的unique值 count(test,Species) ## #

2082 1

从头学R语言——DAY 3

“command”+“，”）-packages中设置，这样一劳永逸，不用每次安装前设置options("repos"=c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn...包dplyr作为tidyverse中的核心包之一，主要用于数据转换。...此处先掌握dplyr的5个基本函数：mutate()，select()，filter()，arrange()，summaries()；1个重要的管道工具%>%#用dplyr包进行数据转换#5个核心函数test...Species == "setosa"&Sepal.Length > 5 )filter(test, Species %in% c("setosa","versicolor"))#arrange()，按列排序...(Sepal.Length))#2个实用工具#管道工具，表示然后test %>% group_by(Species) %>% summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length

841 0

Day6 呦呦鹿鸣—学习R包

内容源自生信星球学习小组安装和加载R包1.镜像设置(设置国内镜像网站能加快R包的下载）options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn...)以dplyr包为例官方包的文档dplyr示例数据test 按列筛选,按名称选择变量(1)按列号筛选select(test,1)# 筛选test数据集的第一列iris %>% select(1:3)# 筛选iris数据集的第一到第三列...的平均值和标准差dplyr两个实用技能1：管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)向右传递test %>% group_by(Species) %>% summarise(mean...(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))R中的管道操作符2：count统计某列的unique值count(test,Species)分类变量每个变量值的频数dplyr处理关系数据将

1711 0

从零开始的异世界生信学习 R语言部分 06 R应用专题

"T") ##检测是否以T开头 str_ends(x2,"e") ##检测是否以e结尾图片 5. str_replace 字符串替换 x2 str_replace(x2,"o","A") ##在"...新增一列是两列数值的乘积 mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width) 图片图片 select和filter 筛选出来的结果是数据框 3.连续操作，优秀的管道符号...Sepal.Width), Sepal.Length) 三、条件和循环 1. if 条件语句 ###1.if(){ } 如果...就... #### (1)只有if没有else，那么条件是FALSE时就什么都不做...<- list(1:10, 10:5) l2 <- list() l2[[1]] <- 1:10 l2[[2]] <- 10:5 ##生成列表的方式，直接生成以及生成一个空列表后添加元素...（向量）求均值(试试方差var,分位数quantile) lapply(test,mean) lapply(test,fivenum) lapply(test, var) lapply(test, sd

2.5K3 0

Day4——查布铎徳勒

mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #以上都是镜像设置...，为了加速下载R包install.packages('dplyr') #安装“dplyr”包library(dplyr) #加载“dplyr”包使用 iris的简化版testdplyr五个基本函数1.mutate(),新增列mutate(test,new=Sepal.Length*Sepal.Width)2.select(),按列筛选按列号筛选select...(Sepal.Length))dplyr两个实用技能(加载任意一个tidyverse包即可用管道符号)1.管道操作%>%(cmd/ctr+shift+M)test %>%+ group_by(Species...) %>%+ summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))2.count统计某列的unique值count(test,Species)dplyr处理关系数据即将两个表进行连接

1995 0

学习R包

本次以dplyr为例安装和加载R包镜像设置运行这两行代码options("repos"=c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))options...dplyr包有很多函数，为了防止dplyr包中的函数名与其他函数产生冲突，使用时前面加上“包名::”dplyr五个基础函数mutate(),新增列select(),按列筛选按列号筛选注意筛选内容与表格内容的统一...，包括大小写按列名筛选filter()筛选行arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序arrange(test, Sepal.Length)#默认从小到大排序arrange(test, desc...(Sepal.Length))dplyr两个实用技能管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)同时执行三件事（加载任意一个tidyverse包即可用管道符号）count统计某列的unique...sd?

1231 0

生信学习小组

安装和加载R包1.镜像设置生信星球公众号：你还在每次配置Rstudio的下载镜像吗？...(),新增列mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)图片2.select(),按列筛选(1)按列号筛选select(test,1)select(test...92df4aeb915)group_by(test, Species)# 先按照Species分组summarise(group_by(test, Species),mean(Sepal.Length), sd...(Sepal.Length))#计算每组Sepal.Length的平均值和标准差图片dplyr两个实用技能1：管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)（加载任意一个tidyverse...包即可用管道符号）图片2：count统计某列的unique值count(test,Species)图片dplyr处理关系数据

1842 0

点击加载更多

扫码

添加站长进交流群

领取专属 10元无门槛券

手把手带您无忧上云

R：purrr包用于循环迭代

R语言ggplot2画图比较两组连续型数据的几种方案

比Python绘制散点密度图还方便？！怎么选？当然全都要...

「R」用purrr实现迭代

R︱高效数据操作——data.table包（实战心得、dplyr对比、key灵活用法、数据合并）

生信星球——生信入门DAY6:学习R包

数据框的列名居然会影响绘图

生信学习小组Day6笔记—Chocolate Ice

2023.4生信马拉松day7-R语言综合应用

tidyverse：R语言中相当于python中pandas+matplotlib的存在

Day6生信入门—R包

生信星球Day4 学习R包

生信技能树七天学习小组 Day6笔记——学习R包

生信星球学习小组Day6-R包学习 Jerry

从头学R语言——DAY 3

Day6 呦呦鹿鸣—学习R包

从零开始的异世界生信学习 R语言部分 06 R应用专题

Day4——查布铎徳勒

学习R包

生信学习小组

扫码

相关资讯

热门标签

活动推荐

运营活动

社区

活动

资源

关于

腾讯云开发者

热门产品

热门推荐

更多推荐