在ggplot中使用geom_function() - 腾讯云开发者社区 - 腾讯云

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「R」ggplot2在R包开发中的使用

在撰写本文时，ggplot2涉及在CRAN上的超过2,000个包和其他地方的更多包！在包中使用ggplot2编程增加了几个约束，特别是如果你想将包提交给CRAN。...尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式，以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...在包函数中使用 aes() 和 vars() 为了使用ggplot2创建图形，你很可能至少要使用一次aes()函数。如果你的图形使用了分面操作，你可能也会使用vars()用来指向绘图数据。...常规任务最佳实践使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象（例如，在一个plot()-风格的函数中）。...) ggplot2在Suggests 如果你在包中使用ggplot2，大概率你会想要将它列入Imports。

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使用element_text在ggplot2中自定义文本

ggplot2的主题系统可以让我们更好的控制图形非数据元素的细节，通过更加精细的修改来提升图像的美感，ggplot2 的主题系统自带多个 element_ 功能 element_text( ) element_line...( ) element_rect( ) element_blank( ) 本节来介绍主题元素element_text() ,使用它控制绘图中文本元素的许多部分，如字体大小、颜色和字体类型。...ggplot2的element_text()剖析 element_text() 控制的元素列表 axis.title.x: 自定义 x 轴标签/标题 axis.title.y : 自定义 y 轴标签/标题...自定义图像副标题 plot.caption: 自定义图像的脚注 plot.tag: 自定义绘图的标签加载R包 library(tidyverse) library(palmerpenguins) 依旧还是使用企鹅的数据集...，接下来使用element_text() 函数来调整图像的文本元素 p% drop_na() %>% ggplot(aes(x=flipper_length_mm,

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ggplot2 中 scale 的使用

ggplot 中 scale 的使用 ggplot画图是画图中的战斗机，但是往往在我们用ggplot2画图时候，需要根据需求更改坐标，图例等，最常见的就是更改x，y坐标系的名称。...在ggplot2中，坐标系与比例尺和参考线是自动生成的，并且生成得很好。...我们会使用scale_color_和scale_fill_来更改调色板，今天我们就来介绍如何在ggplot中调整比例尺，调整中断和标签，修改轴和图例等。...强大的 Scale包，可以实现在ggplot基础上，对图形进行微调及更改。...1.基础底图 Scale包为ggplot底图提供了四种样式的比例尺： demo_continuous() and demo_log10() for numerical axes demo_discrete

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R语言基础-画图（ggplot2）

color = Species), shape = 2) #2号，空心的例子图片#通过color-shape-fill三个参数的连用，可以达到双色实心的目的#类似于ppt中的轮廓颜色...Sepal.Length,y = Petal.Width, color = Species))+ facet_grid(Group~Species)#依旧在facet...函数上做文章图片2.4 几何对象-绘图模版“geom_FUNCTION”1.不同的几何对象可以叠加2.可以通过局部设置以及全局设置的切换高度自定义不同的几何对象#局部设置ggplot(data = iris...aes(x = cut, fill = clarity), position = "dodge")图片#position = 'fill' 填充式（cibersort免疫浸润分析使用较多...cut, fill = clarity), position = "fill")+ theme_classic() #加一句这个就可以了哦图片3.ggpubr#这边仅展示日常使用较多的箱线图组间比较

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第六课

require(ggplot2))install.packages('ggplot2',update = F,ask = F)if(!...#ggplot(data=)+#GEOM_FUNCTION(mapping=aes())library(ggplot2)ggplot(data = iris)+ geom_point...(data = iris)+ geom_point(mapping = aes(x=Sepal.Length,y=Petal.Length),color="blue")图片ggplot(data =...(x=cut))图片ggplot(data = diamonds)+ #不统计count，统计prop（比例） geom_bar(mapping = aes(x=cut,y=..prop.....Species))+ geom_jitter()图片#完美模板#ggplot(data=)+# GEOM_FUNCTION>(# mapping=aes(),#

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R语言作图

,可以存储）eoffice （可以导出为ppt）ggplot2语法入门级绘图模板ggplot(data=)+ GEOM_FUNCTION>(mapping=aes())...(test)，不是ggplot("test.Rdata")!...文件名称出现在代码里，必须是在实际参数的位置上，带着引号出现，并且函数是能识别文件名称的函数。ggplot函数不能识别文件，只能识别变量。看环境中是否有这个变量。画图是用数据画图。...= aes(x = cut))使用表中数据直接作图，而不统计ggplot(data = fre) + geom_bar(mapping = aes(x = Var1, y = Freq), stat..."dodge")2.7 坐标系#翻转coord_flip()#极坐标系coord_polar()总结：完整绘图模板ggplot(data=)+GEOM_FUNCTION>(mapping=

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ggplot2：point在legend中的size修改

library(tidyverse)dt % ggplot(aes(x = carat, y = cut, color = cut...)) + geom_point() + labs(title = "修改前")p2 % ggplot(aes(x = carat, y = cut, color = cut))

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Day06 生信马拉松-R语言作图

geom中仅对单个图层有效ggplot(data = iris) + geom_smooth(mapping = aes(x = Sepal.Length,...为一个图层，可叠加4.2 全局设置: mapping =在ggplot中对所有图层有效ggplot(data = iris,mapping = aes(x = Sepal.Length,...geom_bar(mapping = aes(x = cut)) #geom_bar与stat_count相对应，属于ggplot中不同的体系，不用细究ggplot(data = diamonds...) + stat_count(mapping = aes(x = cut))5.1 使用表中数据直接做图,不统计(统计变化使用场景1)fre = as.data.frame(table(diamonds...(data = )+ GEOM_FUNCTION>( mapping = aes(), stat = position =

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生信技能树七天学习小组 Day4笔记——R语言基础

绘图模板ggplot(data = )+ GEOM_FUNCTION>(mapping = aes())在使用时将DATA、GEOM_FUNCTION、MAPPINGS...,mapping = aes(x=displ,y=hwy))+ geom_point()+ geom_smooth()这里x、y传递给了ggplot()函数作为全局映射可以在不同的图层中显示不同的图形属性...()1.6.3 练习题（1）在绘制折线图、箱线图、直方图和分区图时，应该分别使用哪种几何对象？...geom_line、geom_boxplot、geom_histogram、facet_grid（2）在脑海中运行以下代码，并预测会有何种输出。接着在R中运行代码，并检查你的预测是否正确。...为什么要在本章前面的示例中使用这句代码？不显示图例（4）geom_smooth()函数中的se参数的作用是什么？

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55-R可视化-4-ggplot2基石三部曲之基础一

开篇语这一个部分一共三篇，学会了基本上你的ggplot 就达到ggplot 界小学二年级的水平了吧~ 开始前主要为ggplot2 中的前三个部分的内容。...ggplot2 可视化使得数据科学从业者更好地分析并解释数据常用的ggplot 模版 ggplot2 的图形可以按照七种参数来对其进行调整简单模版 ggplot(data = ) + geom_function...与grid 的区别 warp 只能对一种变量进行分类（一个维度），因此如果对其使用两个变量，则其会罗列在一个维度。...练习题 6-1 #练习6-1 # 示例数据：ggplot2中数据集mpg # 1.分别以mpg的displ和hwy两列作为横纵坐标，画点图。...ggplot(mpg) + geom_point(aes(displ,hwy)) # 2.尝试修改颜色或大小，从mpg数据框中任选可以用来分类的列。

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ggplot2画SNPs在染色体中的分布

如果想找到的功能SNPs在染色体上的展现出来分布，可以用ggplot2用一下的方式画出来（如果SNPs很少的话估计没效果）： as <- read.table('~/snps.txt', header...= T) as$chr <- factor(as$chr, c(as.character(seq(1,22)),'X')) ggplot() + geom_point(data = as, aes(x...然后将所在位置转为高度，将其除以1000000更方便的在图中展现出来。

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Learn R 画图1-3

1.入门级绘图模板：作图数据，横纵坐标 ggplot2代码模板 >library(ggplot2) >ggplot(data = )+ GEOM_FUNCTION>(mapping=...aes()) #代表着模版不是具体的代码 #GEOM_FUNCTION>代表画图的函数 #写横纵坐标列名不带“” #“+”代表ggplot()和geom_point...y = Petal.Length, + color = Species) #这个color是aes的参数，aes是不带引号的，存在于数据中的列名...facet_wrap(~ Species) #分面代码，根据species的取值分开图片 2.双分面 #原本该数据中是没有group这一组的 dat = iris #不推荐用data做变量名称，data...= aes(x = cut)) #这两个函数效果一样geom开头是画图函数，stat开头是统计变换函数 #x=cut是将cut作为横坐标，默认统计数为纵坐标，不用写y= 统计变换使用场景 #5.1.不统计

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Day6 画图

作图base(plot函数)ggplot2ggpubr拼图：patchwork导出经典三段论ggsaveeoffice-topptx基础包-绘图函数低级绘图函数不能单独运行，必须依托高级绘图函数，可以对画出来的图添加细节...ggplot21.入门级绘图模板ggplot(data = ) +GEOM_FUNCTION>(mapping = aes()) 特殊语法：列名不带引号，行末写加号2....2.1 手动设置2.2 映射：按照数据框的某一列来定义图的某个属性映射与手动设置的比较映射：根据数据的某一列的内容分配颜色手动设置：把图形设置为一个或n个颜色，与数据内容无关Q1：自行指定映射的颜色ggplot...color = Species))+scale_color_manual(values = c("blue","grey","red"))#使用配色包配色...ggplot(data = iris)+ geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length

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在 R 中使用 sf 和 ggplot2 绘制河流地图

在本教程中，我们将深入探讨重建此地图的具体细节。我们将使用全球河流分类（GloRiC).GloRiC对世界野生动物基金会HydroSHEDS的全球河流网络进行监督分类，以在全球层面创建河流覆盖类型。...我们在下面使用 mutate 来创建宽度，并使用case_when来分配宽度。后者在SQL用户中是众所周知的。在此上下文中，如果满足条件，它会根据宽度列分配一个值。 # 2....相反，包使用 s2 库中的球面几何运算符。在我们的例子中，这会破坏代码，因为某些河流线具有无效的球形几何图形。一个快速的解决方法是通过sf：：sf_use_s2（FALSE）关闭此功能。...边界框在我们用ggplot2做魔术之前再走几步。我们的目标包括欧洲和中东，因此我们希望确保我们主要占领欧洲。我们通过制作一个边界框来做到这一点。让我们使用 WGS84 坐标定义边界框的参数。...在本教程中，我们将使用世界等距圆柱投影来展平地图。因此，我们首先定义此投影，然后转换坐标。 # 3.

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R语言基础笔记-03（ggplot2)

一、ggplot2 模板： ggplot(data = )+ GEOM_FUNCTION>(mapping =aes()) 注意：低级绘图函数单独使用会报错，...ggplot2特殊语法：列名不带引号，行末写加号！...iris #sample()取值,replace表示是否放回 dat$Group = sample(letters[1:5],150,replace = T)#结果是新增一列group内容为随机取的1：5中一个...直接使用只需指定x，默认y是统计值 #统计变换-直方图 head(diamonds) table(diamonds$cut) ## ## Fair Good Very Good...p.pptx") 四、拼图 library(patchwork) p1+p2 TIPS 不要漏了+ 注意color是aes的参数还是gp的参数不要修改内置数据 boxplot叠加点图的时候，点图要分散开：使用

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R语言作图基础20230206

即x轴的数据是Sepal.Length，y轴数据Petal.Length，不需要加引号（以上代码的数据的映射放在了具体的geom_point函数中，如果整体映射是一致的，可以把映射放到ggplot()中...，这样子如果没有特殊情况，后面的绘图函数不需要重新映射，但是如果映射在geom_开头的函数中，每一个函数都需要重新映射）例如：> ggplot(data=iris,mapping = aes(x =...geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length)) + facet_grid(Group ~ Species)图片6）几何对象（可以叠加使用...）图片ggplot() 的映射可以在全局使用，geom_function的映射只能在局部使用7）柱状图/直方图（y轴无需映射）ggplot(data = diamonds) + geom_bar(...",color = "Species",shape="Species",add="jitter")ps:在ggplot2用geom_jitter() ,在ggpubr用add="jitter"图片五、保存文件

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R06-R语言作图

(ggplot2)ggplot(data = iris)+geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length,color = Species...))2.1 入门级绘图模板ggplot(data = )+GEOM_FUNCTION>(mapping = aes()ggplot(data = iris)+geom_point...(mapping = aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length))ggplot2的特殊语法:列名不带引号,行末写加号2.2属性设置（颜色、大小、透明度、点的形状、线型等...）2.2.1 手动设置ggplot(data = iris) + geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length), size =...()#geom_point(position = "jitter")ggplot2.5坐标系ggplot(data = iris,mapping = aes(x = Species, y = Sepal.Width

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R语言学习笔记-Day5

#eoffice可将图导出为ppt内可编辑元素1.2 基础包（base）-绘图函数高级/低级绘图函数 #高级绘图函数可独立于其它函数，低级绘图函数：用于在图中添加元素高级绘图函数：低级绘图函数：plot..., #透明度为50 % shape = 8) #点的形状映射：按照数据框的某一列定义某个属性#可以将点设置成多个颜色，与数据对应，而非统一颜色#统一设置时的参数从属于geom_function...scale_color_paletteer_d("awtools::mpalette")#"配色R包::配色名"1.4.3 几何对象一个geom函数所画出来的所有元素被称为几何对象几何对象可叠加（在同一张图展示多中图像...x = Sepal.Length,y = Petal.Length))+ geom_point(color = red")+ geom_smooth()aes()代表映射，只有键入该函数才能从数据中读取相应的内容可以在已有公共设置下进行二次映射代码不报错不代表没错...系列：ggsave("iris_box_ggpubr.png")ggsave(p,filename = "iris_box_ggpubr2.png")#已赋值可使用绝对路径进行保存，但是更换设备无法从该路径进行导入绝对路径

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ggplot2中ylim的坑

在ggplot2中很容易出现一个修改坐标轴范围的问题，喜欢用ggplot2画图的需要注意一下。...ylim和coord_cartesian都是调整坐标轴范围，但是它们的结果是有可能不一样的，看下面的一个例子： data(diamonds) p ggplot(data = diamonds, aes...这里是因为ylim是直接处理的数据导致的，比如例子中不在范围的数据就直接被移除。同等操作应该用coord_cartesian来实现。...即使用原数据作图，再对图形进行变动。内部参数xlim 和 ylim 各接一个二元数值向量，控制显示的区域范围，原理不是截取，而是放大该区域，原有图形不变。

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ggplot2中 ggsave如何用？

问题：我将ggsave应用在pipe %>%符号中，报错！...中调用ggsave有以下三种： 1....把ggplot2保存为对象，然后调用 p1 = ggplot(diamonds, aes(x=cut,y = price,colour = cut)) + geom_boxplot() p1 ggsave...在pipe中调用时，直接用+号，而不是%>% ggplot(diamonds,aes(x = cut, y = price, colour = cut)) + geom_boxplot() + ggsave...这里面，用（）将ggplot作图的代码括住，它会输出到屏幕上，使用%>%将其作为对象传递给ggsave，用.表示它，写作ggsave("plot3.png",.)，即可。保存文件： ? 4.

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