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R in action读书笔记(22)第十六章 高级图形进阶(下)

position = c(xmin, ymin, xmax, ymax),该页面的x-y坐标系统是矩形,x和y维度范围都是从0到1,原点(0, 0)图形左下角。...lattice图形中你还可以改变面板顺序。高级绘图函数index.cond =选项可以设定条件变量水平顺序。...对于method ="rml",则需加载MASS包 x、y :指定摆放在水平和竖直变量。...Theme(主题)菜单一些选项仅与基础图形契合很好,一些则与ggplot2图形契合较好(如标注),还有些对ggplot2图形无效(如识别点)。... 拖动鼠标可选择不止一个对象(点、等),或使用Shift键通过单击选择不邻接对象。 你可尝试柱状图(gears)窗口选择三号和五号齿轮

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如何通过R语言制作BBC风格精美图片

image.png 这就是bbc_style()函数实际是在做什么。 它本质修改了ggplot2主题功能中某些参数。例如,第一个参数是设置绘图标题元素字体,大小,字体和颜色。...这也很容易通过scale_y_continuous中添加参数来实现: + scale_y_continuous(labels = function(x) paste0(x, "%")) 更改限制 bars...左对齐/右对齐文本 参数'hjust'和'vjust'指示水平和垂直文本对齐方式。 它们值可以0到1之间,其中0左对齐,而1右对齐(或垂直对齐底部和顶部对齐)。...image.png 增加一贯穿整个图片线条 整个图上添加一线最简单方法是使用geom_vline()表示垂直线,或者geom_hline()表示水平线。...在此示例对想突出显示某些内容(例如, 阈值水平或平均值)特别有用。

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ggplot2--R语言宏基因组学统计分析(第四章)笔记

ggplot2使用grid包来提供一系列水平函数,并将其延伸为图形语法,即独立指定绘图组件,并将它们组合起来,以构建我们想要任何图形显示。...因为到目前为止,我们只告诉gglot()应该使用什么数据集,以及应该为x、y和颜色使用哪些列。但是我们还没有明确要求它画任何点或者一线。...输出显示plot对象中添加了一个附加层,该层使用线性模型进行拟合。曲线也有置信,我们可以设置se=FALSE来关闭置信。...4.3.3.3 使用坐标系统来调节和限制X和Y 坐标系用途是计算机屏幕上调整从坐标到二维平面的映射。ggplot2中可用不同坐标系中,笛卡尔坐标系和极坐标系是最常用坐标系。...在下面的代码中,我们创建一个新plot对象p5,并使用coord_cartesian()更改X和Y限制以放大到感兴趣区域。

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R语言从入门到精通:Day17 (ggplot2绘图)

这里,变量wt值映射到沿x距离,变量mpg值映射到沿y距离。...分组指的是一个图形中显示两组或多组观察结果。小面化指的是单独、并排图形显示观察组。ggplot2定义组或面时使用因子(factor)(主要涉及函数facet_grid())。...R中,组通常用分类变量水平(因子)来定义。分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如形状、颜色、填充、尺寸和线类型视觉特征分组变量来完成。...首先是可以灵活控制坐标外观函数,如图13(用到函数scale_x_continuous()等,具体见代码)。 图13,坐标改动示意图 ?...ggplot2包学习起来可能有些困难,同时网上也有很多学习资料,一系列ggplot2函数及相应例子可以http://docs.ggplot2.org找到,但最重要还是要多动手!多动手!

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「R」ggplot2精要:线图

这个R教程讲解如何使用R和ggplot2包创建线图。 一个线图中,观察值都按照x排列并连接起来。 可以使用函数geom_line()、geom_step()或geom_path()。...(0.5, 1, 2) 创建带点线图 library(ggplot2) # 带点基本线图 ggplot(data=df, aes(x=dose, y=len, group=1)) + geom_line...阅读更多线型 : ggplot2 line types[1] 你可以使用grid包为线条添加一个箭头: library(grid) # 添加箭头 ggplot(data=df, aes(x=dose,...阅读ggplot2图例: ggplot2 legend[5] 数值型x线图 如果x变量是数值型,我可以可以将它根据自己需要看做连续值或转换为因子变量。...x是日期线图 这里是有economics数据集: head(economics) ## date pce pop psavert uempmed unemploy ## 1

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「R」ggplot2数据可视化

最常见元素是坐标刻度线和标签(还有图例)。 接下来以三个数据集解释ggplot2使用。第一个是lattice包中singer数据集,它包括纽约合唱团歌手高度和语音变量。...分组指的是一个图形中显示两组或多组观察结果。小面化指的是单独、并排图形显示观察组。需要注意,ggplot2定义组或面时使用因子。 这里我们使用mtcars数据集查看分组和面,并进行绘图。...Salaries by Rank.png 该图显示了不同学术地位对应薪水缺口箱线图。实际观察值(教师)是重叠,因而给予一定透明度以避免遮挡箱线图。它们还抖动以减少重叠。...Number by Rank3.png 值得注意是,第三个图形中y标签是错误,它应该是比例而不是数量。我们可以通过添加y="proportion"参数到labs()函数来解决。...=指定这些水平标签,limits=表示哪些水平应该展示 coord_filp() 颠倒x和y 我们将这些函数应用一个分组箱线图中,其中包含按学术等级和性别分组薪资水平,代码如下: data(Salaries

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R语言绘制双标图

大家介绍一个可视化PCA双标图(biplot),顾名思义也就是一个图中包含了两个坐标系,其主要应用在物种分析中。今天跟大家介绍下此图R语言中绘制。...两个包各自有各自优势,GGEBiplotGUI绘制图形界面比较简化,但是包含多种绘制形式;ggbiplot借用了ggplot2优势可以使得图像更加美化,但是呢,绘制形式比较单一。 ?...接下来操作就是全部可视化操作菜单,其中主要图形形式如下图: ? 我们对几个主要双标图形式进行解释说明: 1. 图中箭头为平均环境。...平均环境箭头所指方向是对试验点区分力和代表性两方面的评价。既有区分力又有代表性试验点才能最好选择高产稳产品种 ? 2....高产稳产功能图也需要环境平均箭头直线),和平均环境值(箭头位置)。还有一通过中心与环境平均垂直直线。将品种点和平均环境做一垂线(绿色虚线)。

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(数据科学学习手札38)ggplot2基本图形简述

一、简介   一篇中我们介绍了ggplot2基本语法规则,为了生成各种复杂叠加图层,需要了解ggplot2中一些基本几何图形构造规则,本文便就常见基础几何图形进行说明; 二、各基础图形 2.1...我们主要使用两个参数控制线条位置,slope控制斜率,intercept控制截距,下面是一个简单例子,我们散点图层叠加截距为20,斜率为2直线: library(ggplot2) p <-...x,则可以使用geom_vline()来快捷地添加垂直线条,xintercept传入参数即为线条x位置,若传入向量则可同时添加多条线条: library(ggplot2) p <- ggplot...,多用于表现某些水平或比例类指标随时间变化情况,下面是一个朴素例子,以huron湖水水平变化数据为例: library(ggplot2) p <- ggplot(huron,aes(x=year,...data=data,aes(x=x[1],y=y[1],xend=x[4],yend=y[4],colour='曲线')) 原有图形基础添加线段并带上小箭头: p + geom_curve(data

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UML 教程

分叉和结合节点 分叉和结合节点有同样标柱:垂直或水平(方向取决于工作流从左到右,还是从上到下)。它们说明了控制并发线程起始和终点,下图显示他们使用示例。 ?...通信图中,对象之间显示关联连接器。消息附加到这些关联显示箭头指向消息流方向。消息顺序通过编号码显示。 下面的两个图用通信图和时序图分别显示相同信息。...在前面的例子中,生命线顶端符号(Child)显示比创建它对象符号(parent)沿页面要低位置。下图显示创建和终止对象。 ? 时间和期限约束 消息默认显示水平线。...不论时间单位如何选择,X 显示经过时间,Y 被标为给出状态列表。状态生命线如下所示: ? 值生命线 值生命线显示随时间变化,一个单项变化。...X 显示经过时间,时间单位为任意,和状态生命线一样。平行线之间显示值,每次值变化,平行线交叉。如下图所示。 ? 将它们放在一起 状态和值生命线能叠加组合。它们必须有相同 X

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画了1000次折线图后,我总结出一个套路……

想一想:普通折线图中,如何自动地添加一代表平均值横线?如何添加一箭头趋势线?如何快速地标注最大值和最小值?如何标注特殊事件?如何对折线图进行数据分析?...排除周期性因素之后,我们观察折线图中最大值和最小值,看看它们是否正常范围以内,如果不是的话,那么要分析背后原因。...比如说,9 月 30 日销量最高,明显高于平时正常水平,经过与业务沟通和分析发现,是因为这一天做了打折促销运营活动。...折线图中,有一代表平均值横线,以及一箭头趋势线,它们有助于对数据整体趋势把握。...y2, ls='--', color=color2, label='7 天移动平均') # 绘制箭头 plt.annotate('', xy=(x[-1:], y2[-1:]),

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Matlab绘图

axis on: 显示坐标 axis equal后,如:x0到1长度等于y0到1长度。...维向量,显示n个箭头箭头起点为原点,箭头位置为(x(i),y(i)). compazz(z):参量z为n维复数向量,命令显示n个箭头箭头起点为原点,箭头位置为(real(z),image(z))。...feather: feather(x,y) :函数绘制由向量参量x与y构成速度向量,沿水平方向,从均匀间隔点以箭头发射出来 feather(z) :函数绘制羽毛图。...surf函数 基本调用格式 mesh(x,y,z,c) surf(x,y,z,c) 其中x、y是网络坐标矩阵,z是网格点该网格点高度矩阵,c用于指定在不同高度下曲面颜色。...NaN,这样绘制图形时,函数值为NaN部分将不显示出来,从而达到对图形进行裁剪目的。

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Excel图表学习:创建子弹图

从Excel角度来看,下面是子弹图一些高级方面: 它们是组合图表,使用条形图或柱形图以及散点图。 使用主坐标和次坐标,但在很大程度上忽略了次坐标。 多个条形或列“显示”必须始终为零值。...系列选项中,将分类间距设置为0。现在图表应该看起来如下图3所示。 图3 注意蓝色是如何夹在红色和灰色之间,这就是我将其称为“三明治”方法原因。 6.选择绘图区。...图4 9.因为我们不需要X标签,只需选择X 并按Delete。 10.要添加目标条形,首先选择图表边缘,以便看不到系列公式。然后将下面的公式复制并粘贴到公式栏中: =SERIES(,GG!...XY(散点)选项卡中,选择“直线散点图”,如下图6所示。 图6 12.将系列4移动到主坐标。首先确保选择了系列4,然后按 Ctrl+1 启动“设置数据系列格式”窗格。...“系列选项”中,选择系列绘制主坐标

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R语言之 ggplot 2 和其他图形

想象有一张空白画布,画布我们需要定义可视化数据(data),以及数据变量到图形属性映射(mapping)。 下面使用数据集 mtcars 作图。...我们首先来探索车重和耗油量关系,将变量 wt 映射到 x ,变量 mpg 映射到 y 。...变量 am 原数据集里是一个数值型变量(取值为 0 和 1),实质它应该是一个分类变量,因此我们先把它转换为一个二水平因子。...如果只想显示平滑线,就需要在 geom_point( )函数中单独设置颜色映射,结果如下图所示。...一个图层就像是一张玻璃纸,包含各种图形元素,我们可以分别建立多个图层,然后把它们叠放在一起组成最终显示效果。

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24式R入门作图必学之barplot条形图(一)

一、前言二、初阶图形2.1 基本条形图2.2 水平柱状图2.3 图例堆叠柱状图2.4 图例分组柱状图2.5 ggplot作图2.6 plotly作图三、进阶图形3.1 水平柱状图3.2 显著性柱状图...3.3 堆积百分比柱状图3.4 分组柱状图四、讨论一、前言柱状图又称条形图,统计分析中使用频率最高,也是众多小白入门R最早绘制可视化图形。...#353436")) #图例legend("topright",legend = c("Group 1","Group 2"),fill = c("#1b98e0", "#353436"))图片2.4 图例分组柱状图...= "bar")图片三、进阶图形3.1 水平柱状图和刚刚初阶一样,只是多添加了标签和y,常用于计算靶点交叉数目可视化、多项频数可视化等#读取文件rt=read.table(inputFile, header...n*0.95,y=bar,n) #显示交叉个数text(x=-0.2,y=bar,label=names(n),xpd=T,pos=2) #基因名称dev.off()图片3.2 显著性柱状图常用于展示KEGG

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三种可视化方法,手把手教你用R绘制地图网络图!

nodes$weight = degree(g) 现在我们定义一个通用ggplot2 主题(ggplot中设置及美化图形一个工具)来展示地图 (无坐标和网格线): maptheme <- theme...比较麻烦是,我们不能在同一个图形属性定义两种不同标度,即使这个图形属性要用于不同几何对象(比如在我们这个例子里:“尺寸”这个图形属性被同时用于节点大小和边线宽)。...这可能不是图形对象标注功能本来目的,但总之,当你真的需要克服上面图1中所描述ggplot2图形属性限制时,它随时可以派上用场。...这样设置后,我们便可以分别控制边线线宽和节点大小,因为它们图中各自单独生成。...显示地图某些细节,或者对边定位点添加一些抖动时,这种方法可能会很有用。 完整R脚本可参阅githubgist。

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什么时候应该听取机器决定?

水平表示可预测性,与之前图表呼应。垂直代表错误成本,它可以根据情况通过货币或其他单位形式表现出来。 ◆ ◆ ◆ 第二个维度:错误成本 第二个维度引入提供了非常重要新视角。...更多数据更好算法带来预测能力改善,会让问题往右移(这种移动由水平箭头指示)。更多监管负担会加大出错成本因而让问题上移,而减少监管或减少赔偿责任将让它下移(以垂直箭头来指示)。...自动化边界(图中由虚线表示)是一向上倾斜线,它表示可接受可预测性和失误之间现有边界。单位失误成本越高,自动化所需可预测性水平越高。图中凸边界曲线表示比线性更严格自动化屏障。 ?...相比之下,自动化边界上方,我们发现,即使是目前最好糖尿病预测系统仍然会产生过多假阳性和假阴性,而每个失误都代价过高以至于不能论证纯粹使用自动化合理性。...这就是为什么医生仍然全面参与诊断病人患糖尿病风险。另一方面,拥有基因和其他个人数据可戏剧性地提高预测准确度(图中长橙色水平箭头),以未来创造值得信赖专业医护机器人。

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ggThemeAssist|鼠标调整主题,并返回代码

坐标文字 Axis text Family:字体家族,默认为Sans,和我们常用Arial类似;还常用Courier系列等宽字体,如显示核酸、蛋白序列对齐时要求使用;Helvetica是Science...,一般要配合Hjust等于1(右对齐)才更美观;一般情况下要对x或y单独修改 x坐标文字属性 Axis text.x 默认可以不修改,自动继承Axis text属性。...仅用于y属性需单独设置时修改,解释同上 坐标轴线属性 Axis line 主要修改X/Y线型Type、宽度Size和颜色Colour 刻度线 Axis ticks 同坐标轴线,可修改X/Y线型...,即标准字体系1.5倍,并加粗 Colour:颜色 Hjust:沿X水平位置调整 Vjust:沿Y垂直位置调整 Angle:文字旋转角度,逆时针 坐标标签属性 Axis Labels 解释同上 图例...图例位置 Legend position Position:位置,可选无-none,左-left,右-right,-top,下-buttom Direction:方向,水平-horizontal,垂直

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52个数据可视化图表鉴赏

这时候需要站在前人肩膀即使轮子不是最圆,在此基础修改即可,不必完全通晓造轮子全部过程。 三、在做数据可视化这一年多,我觉得很多现实中业务场景其实也是造轮子。...与线之间区域通常用颜色、纹理和图案填充来强调。通常一个面积图用于比较两个或两个以上变量。 3.箭头箭头图可用作多个饼图替代品。...4.条形图 条形图是一种用矩形表示分组数据图表,矩形长度与其表示值成比例。可以垂直或水平绘制条形图。垂直条形图有时也称为折线图。图表一个显示要比较特定类别,另一个表示离散值。...定性范围显示为单个色调不同强度,以使色盲者能够识别,并将仪表板颜色使用限制最低限度。 9.凹凸图 (不同产品半年内排名变化) 凹凸图用于使用其中一个测量值将两个维度相互比较。...外部每个相对于最后一个相对较长,即使它们代表相同值。这是因为每个杆必须位于不同半径,所以每个杆都是根据其角度来判断。我们视觉系统更擅长解释直线,因此笛卡尔条形图是比较数值更好选择。

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SVG基础知识

写在前面 之前有提到过SVG描边动画,可以实现很神奇手写签名动画效果,当然,理论可以用来实现任意不规则路径填充动画 支持SVG场景,可以考虑采用强大SVG描边动画,能够实现一些incredible..."50" y="10" width="30" height="30" rx="5" ry="5"> 其中rx, ry用来定义圆角,分别表示四角椭圆x、y方向半径。...C画三次贝塞尔曲线到(需要提供2个控制点) S与三次贝塞尔曲线连起来(只需要提供第二个控制点和终点,第一个控制点是曲线第二个控制点对称点)...Q画二次贝塞尔曲线到(需要提供1个控制点) T与二次贝塞尔曲线连起来(只需要提供终点,控制点是曲线控制点对称点) Arcto A画椭圆曲线到 ClosePath...,SweepFlag x,y x,y方向半径 x水平顺时针夹角 [1/0]大/小角度弧线 [1/0]顺/逆时针到终点 终点Z/z 无参,Z和z没有区别 例如: <!

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