它通过全面一致的语法帮助我们将多变量的数据集进行可视化,并且很容易生成R自带图形难以生成的图形。...与基础图形不同的是,要调用ggplot2函数需要下载并安装该包 > install.packages("ggplot2") 第一次使用前还要进行加载 > library(ggplot2) 本次教程中,将用三个数据集解释...了解了ggplot2的基本语法之后,我们首先介绍几何函数及其能够创建的图形类型,然后详细了解函数aes(),以及如何利用它来对数据进行分组。接下来,将考虑刻面和网格图形的建立。...函数ggplot()指定要绘制的数据源和变量,几何函数则指定这些变量如何在视觉上进行表示(使用点、条、线和阴影区)。表1列出了几种常见的几何函数(目前有37个几何函数可供使用)。 表1,几何函数 ?...我们在前面已经见过了函数geom_smooth()的例子,该函数中的参数含义依次为:method代表要使用的平滑函数,如lm、glm等;参数formula代表在函数中使用的公式,和回归分析中的参数formula
使用ggplot2进行数据可视化② 添加其他变量的一种方法是aesthetics。 另一种对分类变量特别有用的方法是将绘图分割为多个子图,每个子图显示一个数据子集。...如果这听起来很奇怪,我们可以通过在原始数据上叠加线条然后根据drv着色所有内容来使其更清晰。 请注意,此图包含同一图表中的两个geom!我们将很快学会如何在同一个地块中放置多个geoms。...许多geom,如geom_smooth(),使用单个几何对象来显示多行数据。对于这些geoms,您可以将组审美设置为分类变量以绘制多个对象。 ggplot2将为分组变量的每个唯一值绘制一个单独的对象。...实际上,每当您将美学映射到离散变量时,ggplot2都会自动将这些geoms的数据分组(如线型示例中所示)。依靠这个特征很方便,因为群体aesthetic本身并没有增加传说或区别特征与geoms。...image.png 如果将映射放在geom函数中,ggplot2会将它们视为图层的本地映射。 它将使用这些映射来仅扩展或覆盖该层的全局映射。 这使得可以在不同层中显示不同的aesthetics。
2 与lattice包的比较 ggplot2和lattice都属于高级的格点绘图包,初学R语言的朋友可能会在二者选择上有所疑惑。...ggplot2需要一段时间的学习,但当你跨过这个门槛之后,就能体会到它的简洁和优雅,而且ggplot2可以通过底层组件构造前所未有的图形,你所受到的限制只是你的想象力。...4 一个例子 下面用ggplot2包内带的汽车测试数据(mpg)来举个例子,用到的三个变量分别是发动机容量(displ)、高速公路上的每加仑行驶里数(hwy)、汽缸数目(cyl)。...首先加载ggplot2包,然后用ggplot定义第一层即数据来源。其中aes参数非常关键,它将displ映射到X轴,将hwy映射到Y轴,将cyl变为分类数据后映射为不同的颜色。...上图是对几种不同汽缸的数据分别平滑,如果需要对整体数据进行平滑,可将colour参数设置在散点图层内而非第一层,这样第三层的平滑图形就不会受到colour参数的影响。
写 在前面 在上一期中,大猫向大家强调了R学习路径中非常重要的一环:数据处理,也就是data.table包的作用。在本期,大猫将向大家介绍数据分析的另外一面:数据可视化的学习路径。...换句话说,如果要让你的文章在最短的时间内看起来”高大上“,画一张fancy一点的图吧! “数据处理与数据可视化是数据挖掘的两面。...ggvis最酷炫的地方在于它的interactivity,也就是说,你在画完图之后,如果觉得对哪个参数不满意,可以直接拨动滑杆进行调节!...由于比较新,所以和ggplot2相比,ggvis的学习资料要少一些,大猫建议大家先从ggvis的官方教程学起,ggvis的官网是: http://ggvis.rstudio.com/ 是不是有眼尖的小伙伴发现了什么问题...例如,我想学习如何在ggvis中添加图例(legend),那么我可以输入: [ggvis] legend 搜索结果如图: ?
我们将函数调用的结果保存在变量中,如foo_foo_1,这样做的唯一目的就是将其传递到下一个函数调用中,如scoop()。 这导致许多变量的命名可能没那么有意义,结果增加了代码的复杂性。...在Pandas中,大多数数据框函数都会返回数据集本身,我们将利用这一事实。这被称之为方法链。让我们继续以foo_foo为例。...图片来自作者 筛选,分组并生成新变量 接下来的示例对住房按距离小于2来进行筛选,按照类型进行分组,然后计算每个类型分组的平均价格。然后进行一些格式化。...图片来自作者 接下来的示例,我们将使用多个条件进行筛选并计算其他特征。请注意,可以使用内置函数agg(用于数据聚合)。就我个人而言,我通常会将assign与lambda结合使用。代码和运行结果如下。...图片来自作者 结语 在本文中,我鼓励大家在Python代码中使用类似R语言中的管道和方法链,以提高代码可读性和效率。我重点介绍了管道的一些优点,然后我们将这一概念应用于住房数据。
5.8 ggplot2简介 5.8.1 什么是ggplot2 ggplot2是由Hadley Wickham设计的R软件包,它有助于数据绘图。在本实验中,我们将简要介绍该软件包的一些功能。...5.8.2 ggplot2的原理 如果要使用ggplot2绘制数据,则数据必须是数据框。 使用aes映射函数来指定数据框中的变量如何映射到图上的要素 使用geoms来指定数据在图表中的表示方式,例如。...5.8.5 从两个以上的细胞中绘制数据 到目前为止,我们一直在考虑数据框中2个细胞的基因数。但是我们的数据框中实际上有10个细胞,比较所有细胞会更好。...我们将研究如何在未来的实验室中更深入地使用单细胞RNA-seq分析中的PCA图,这里的目的是让您大概了解PCA图是什么以及它们是如何生成的。 让我们为我们的test数据制作一个PCA图。...任务6:将你的聚类与pheatmap聚类进行比较。它们有关系吗?
我们先了解下 ggplot2 的格式与术语。 格式与术语 数据格式 对ggplot2来说,数据的结构是一成不变的:它要求是“长”格式的数据框,而不是相反的“宽格式”。...其所属的分组不由它们在矩阵中的位置决定,而是在一个单独的列中指定。 术语 数据是我们想要可视化的对象。它包含了若干变量,变量存储于数据框的每一列。...用几何函数指定图的类型 ggplot()函数指定要绘制的数据源和变量,几何函数则指定这些变量如何在视觉上进行表示。目前,有37个几何函数可供使用。以下列出常用的函数。...让我们从分组开始吧——在一个图中展示多个分组观察值。 分组 在R中,组通常用分类变量的水平(因子)来定义。...分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如颜色、形状、填充、尺寸和线条类型的视觉特征的分组变量来完成的。ggplot()声明中的aes()函数负责分配变量(图形的视觉特征)。
最后,绘画在某个坐标系中(coordinate system, 记为coord),而分面(facet,将绘图窗口分成若干个子窗口)是用来生成数据中不同子集的图形 先介绍下它的基本元素: 数据与映射...以下用的数据是一份毕业生数据,来自王斌会主编的《数据分析与R语言建模》的练习数据,一共48个样本点,9个属性 一、数据 在ggplot2中,接受的数据集必须是以data.frame格式的。...中指定了x轴为score,y轴为income,颜色为sex,这与p1中的不同 2.设定与映射 映射将一个变量中离散或连续的数据与一个图形属性中以不同的参数来相互关联, 而设定能够将这个变量中所有的数据统一为一个图形属性...三、图层 1.在几何对象中设定映射 我们可以在在ggplot()中设定了映射了关系, 这种映射关系是默认的, 也可以在后面的几何对象中沿用已设定的默认映射关系, 也可以随时在几何对象中进行更改。...对比下两中做法 六、统计变换 统计变换对原始数据进行某种计算,然后在图上表示出来。
、形状或大小等图形属性的一个映射,其中还可能包含对数据进行统计变换(如求均值或方差),最后将这个映射绘制在一定的坐标系中就得到了我们需要的图形。...,在刚开始上手的时候可能稍有难度(而且官网的帮助内容比较不友好),而本文也是我在日常使用和与别人交流中摸索和总结出来的,将对ggplot2的绘图语法和绘图部件进行介绍,并附以常用的一些图形示例; 下面我们就来探索...,这是一种语法规则和参数设置介于常规plot与ggplot2之间的一种绘图函数; 与plot相似,qplot()的基本参数是x、y,分别代表所要绘制图像的x轴与y轴,并且为了和数据框高度契合(我也十分鼓励将变量都放进数据框中规整起来...,在qplot中,当传入x为类别型变量,y为数值型变量时,通过传入geom='boxplot',可以绘制出分组箱线图,例如下面绘制钻石颜色color与每颗钻石每克拉价格price/carat的分组箱线图...,如: xlim,ylim:设置x轴与y轴的显示区间 log:传入字符型,用于控制将哪个轴转成对数轴,'x'和'y'分别代表x轴与y轴,'xy'代表两个轴都进行变化 main:设置图形的主标题 xlab
qplot(gdpPercap, lifeExp, data=X) 我们可以看到一些位置样本分布比较密集,所以我们可以采用log函数来做一次均匀化。顺带依据年份进行区分。...除去用气泡大小表示连续变量(例如人口数目),对于离散变量(例如所属大洲),我们还可以用点的形状加以区分,下面我们就把各个样本所在大洲用点的形状在图中区分出来: qplot(gdpPercap, lifeExp...但是我们同样观察到在图右侧,一些gdp非常高而预期寿命中等的国家影响了曲线的走势。对于这种干扰,我们可以进一步采用可靠的线性模型,重新对数据进行拟合。...然后我们继续观察年份与寿命的关系,通常我们可以猜测,随时间推移,人的寿命是可以续一波的(例如改变了中国的他),所以我们尝试在图中将这种趋势展现。...(非酋的生活不轻松啊……) 亚洲国家的寿命预期分布比较平均。 大洋洲国家,全都分布在lifeExp>60的区域里。
在R语言的ggplot2包中,读者可以借助于geom_bar函数轻松地绘制条形图。对于条形图大家对其的印象是什么呢?又见过哪些种类的条形图呢?在本篇文章我将带着各位网友说道说道有关条形图的哪些品种。...ggplot2的语法讲解 ---- 如果读者对R语言比较熟悉,一定听过或使用过ggplot2的绘图体系了。...,有两点需要说明,一方面,在ggplot2绘图过程中均采用图层思想,将多个图形进行叠加和设置;另一方面,图层思想是通过代码中的加号(+)表现出来的。...如上图所示,该图形的最大的好处是既可以实现数据的组内比较(如相同空气质量等级下不同风力的比较),也可以实现数据的组间比较(如相同风力下不同空气质量的比较)。...如上图所示,浅色且较宽的条形图可以用作参考对象(如数据中的目标销售额),深色且较窄的条形图可以用作比较对象(如数据中的实际销售额)。通过这种图形,就能够一眼发现参考对象与比较对象之间的差异。
图层(Layer):图层是ggplot2中最基本的组成单元。每个图层都由数据、图形属性和统计变换组成。通过将多个图层叠加在一起,可以创建复杂的图形。...几何对象(Geom):几何对象是图层中的图形元素,用于表示数据的形状、大小、颜色等属性。ggplot2提供了多种几何对象,如点、线、条形、面积等。...映射(Mapping):映射是将数据变量与图形属性进行关联的过程。例如,将数据的x轴映射到图形的横坐标,将数据的颜色映射到图形的填充颜色。...统计变换(Stat):统计变换是对数据进行汇总、转换或计算的过程。例如,计算数据的均值、中位数、频率等。ggplot2提供了多种统计变换函数,如summarize、count、bin等。...组装较复杂:提供了许多零件,供用户跟需要进行组装,比较费时间。
A: 使用library() 函数,在括号内直接添加加载包的名字。但是要注意包与库之间的区别,即库实际上是一个包含了若干包的目录。...绘制散点图 library(ggplot2) ggplot(mtcars, aes(x= wt, y= mpg))+geom_point() #这里的第一部分ggplot2创建绘图对象,将数据框传递给该函数...() #将x转化为因子型向量从而使系统视其为离散值 ggplot(BOD,aes(x=factor(Time),Y=BOD$demand))+geom_col() #变量值的频数表,使用mtcars数据...geom_histogram()#默认的组距为30 ggplot(mtcars,aes(x=mpg))+geom_histogram(binwidth = 4) 2.5绘制箱型图 Q: 如何绘制箱型图以对不同分布进行比较...plot(ToothGrowth$supp,ToothGrowth$len) 当两个参数向量在同一个数据框中时,使用boxplot(),其允许我们在x轴上使用变量 组合 #公式语法 boxplot(len
❞ 作为专业人员,要不断的学习新事物,多多读书思考,克服浮躁情绪,才可以让自己的内心清澈如池水。不断的注入活水(新知识),才能滋润心灵焕发神采,才能达到比较高的境界!...这本书主要通过tidyverse包的介绍,展示数据分析的各种问题的解决方法,比如 数据清洗:dplyr 数据转换:tidyr 数据读取:readr 可视化:ggplot2 平时,我的工作中,读取数据一般使用...sure your understanding is solid before you move on to the next interesting thing. ❞ 作者的这段话很触动我,他说“建议在一段时间内...,学习掌握一门语言,如果你学得比较深,你就会获得的比较多,这比你广泛学习各种工具却又都浅尝辄止要好很多。...这不是说你不需要学习其他工具,而是说如果你把一门语言学得比较深,学习起其他语言也会很快。但是要确保在你的职业生涯中,把一件事物学得足够好,再去学习其他事物”。
机器重启不会置零,在使用这种指标类型时,通常会结合rate()方法获取该指标在某个时间段的变化率 Histograms:直方图,用于观察结果采样,分组及统计,如:请求持续时间,响应大小。...其主要用于表示一段时间内对数据的采样,并能够对其指定区间及总数进行统计。...其中仪表盘和计数器使用比较简单,展示的是一个数字和一段时间内的趋势。...比如可以使用计数器统计一段时间内的缓存命中次数或者某个应用的调用次数,其使用也非常简单,只需要按照某个维度进行递增,Prometheus存储时会关联时间戳,这样你就可以查询出某个维度在某个时间段内的走势或者数量...比较令人费解的是Histograms和Summary,Summary表示一段时间内的采样结果,并且直接存储相应区间比例的结果,比如一段时间内的响应时间准确数值,所以这种数值是什么就是什么,不能进行再次聚合计算
在require()函数中,如果直接传递包的名称作为参数,不需要加引号;如果包的名称以字符串形式存储在变量中,则需要使用character.only = TRUE来指定这个变量是一个字符串1.2 解析1.2.1...require(pkg,character.only=T,quietly = T)直接传递包名称(不加引号)require(ggplot2) # 加载ggplot2包包名称存储在字符串变量中(需要加引号并使用...为什么需要character.only = TRUE当包名称存储在一个变量中时,比如package_name ggplot2",变量package_name包含的是一个字符串。...默认情况下,R的timeout值可能设置得较低(如60秒),这意味着如果网络操作在该时间内未完成,R会抛出一个超时错误。通过设置一个较大的timeout值,可以避免网络操作因超时而失败。...scale = "row"`:按行标准化数据,使得每个基因的表达值在同一范围内进行比较。
在进行基因分析中,我们时常会对样本或基因之间的相关性进行分析,虽然R语言中的cor函数可以进行计算,但并没有提供合适的可视化方法,今天我们介绍一个R包-ggcorr(https://briatte.github.io...让我们将整个数据集直接用ggcorr进行分析,计算每一列数值列之间的相关性,并绘制一个下三角热图展示: ggcorr(nba) ## Warning in ggcorr(nba): data in column...在上面的几个示例中,变量标签(在相关矩阵的对角线上显示)的呈现不一定是最佳的。...以下示例显示了如何在将标签向左移动并更改其颜色的同时减小标签的尺寸: ggcorr(nba[, 2:15], hjust = 0.75, size = 5, color = "grey50") ?...相关矩阵中的变量标签可能会出现的一个问题是,变量标签太长而无法在图的左下方完整显示。
这样就达到了对数据进行保护的目的。 混淆 通过一些字符串替换规则或者抽象语法树变换规则,将一段代码等价替换成另一段可读性很差的代码,从而达到保护原有代码安全。这个过程通常是不可逆的。...其实逆向字符串相对比较简单,但这已经是个开始,逆向出逻辑是迟早的事。普通强度的混淆可以在一段时间内保护业务逻辑,一段时间以后,代码便没那么安全了。...接下来将针对以上问题,探索如何在工程上一一解决。 0x04 工程化问题探索 1. 如何标识某次请求的函数组合?...理想情况下,用户在一段时间内仅会访问一次人机验证的逻辑。此时要做好的是保证用户首次加载的体验,而二次访问的体验可以暂且不予考虑。...比较简单的方案是循环跑编译脚本,编译好一个替换一次,短时间内用户可能会访问到同一个js,随着旧js被新编译出来的js替换,一段时间内用户访问的js可以认为是随机的,此时js的变换间隔取决于编译速度。
它还告诉您tidyverse中的哪些函数与基本R(或您可能已加载的其他包)中的函数冲突。...mapping参数始终与aes()配对,aes()的x和y参数指定要映射到x和y轴的变量。 ggplot2在data参数中查找映射变量,在本例中为mpg。...您可以将第三个变量(如类)添加到二维散点图中,方法是将其映射到美学。aesthetic是你的情节中物体的视觉属性。美学包括诸如点的大小,形状或颜色之类的东西。...要将aesthetic映射到变量,请将aesthetic的名称与aes()中的变量名称相关联。 ggplot2将自动为变量的每个唯一值分配唯一级别(这里是一种独特的颜色),这个过程称为缩放。...ggplot2一次只能使用六个形状。默认情况下,使用形状美学时,其他组将进行非开槽。 对于每种美学,您使用aes()将aesthetic名称与要显示的变量相关联。
目前R主要支持四套图形系统:基础图形(base)、网格图形(grid)、lattice图形和ggplot2。其中ggplot2凭借强大的语法特性和优雅的图形外观,逐渐成为R中数据可视化的主流选择。...facet_wrap( ~ class, nrow=2) facet_wrap( ~ class, ncol=4) 分面方向的选择依赖于你更倾向于鼓励读图者进行哪种类型的比较。...5.2 在不同坐标轴下使用分面 使每个分面的坐标轴不一样,将标度设置为"free_x"、"free_y"或"free"。...在修改分面变量水平时,各水平可以输入为数学表达式。...6.2 将变量映射到颜色上 对于几何对象,将colour或fill参数的值设置为数据中某一列的列名即可。
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