大家好，我是邓飞，今天介绍一下GEMMA软件的安装和使用教程。...GCTA和GEMMA是GWAS分析中应用最广泛的两款软件，GCTA可以在Windows电脑下运行，而GEMMA软件只有Linux和Mac系统，这里介绍一下如何在Linux系统中安装GEMMA软件。...下载安装 第一种方法，在github手动下载，然后上传到Linux系统重： 第二种，使用wget直接下载到Linux系统中： wget https://github.com/genetics-statistics...运行GWAS教程中的数据 用data3中的数据： 把数据上传到Linux系统中，进入数据，运行下面代码： ...../gemma-0.98.5-linux-static-AMD64 -bfile c -p p.txt -c c.txt -lm 1 在Result文件夹中，查看结果： 上面代码是用GEMMA用GLM
Linux中安装JDK 1....软件准备 JDK安装包 下载地址：http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/archive-139210.html 我这里使用 jdk-8u73-linux-x64...installJDK.sh 作用： 负责从远程软件库(node01)下载 JDK 安装包 负责 JDK 的安装 负责 JDK 的环境变量配置 脚本内容： #!...node01 服务器上，用户 root 执行脚本 startInstallJDK.sh 在集群其他3个节点 node02 node03 node04 中安装了JDK 注意： 以上脚本执行需要配置集群各节点之间免秘钥登录...httpd start 在node01的/var/www/html目录下放置安装包 我在其中又创建了soft目录，然后在soft目录下放置了JDK安装包，所以在我的installJDK.sh中，从node01
第1步：安装Stow 在这个例子中，我们使用的是CentOS，因此我们需要扩展的EPEL库。...第4步：使用stow完成安装 要安装软件包，首先将“cd”放入stow目录，如下所示： cd /home/testuser/stow 确保包含文件的文件夹只是当前位置下的一个目录。...现在输入： stow hello 该软件包现已安装在您的系统上。这是“hello”命令的截图： ? 第5步：删除包 关于装载最酷的部分是从系统中移除包装是多么容易。无需保留源包或任何东西。...他们仍然在“hello”目录中。您可以使用stow命令再次轻松地安装软件包。如果您不再需要这些文件，只需删除“hello”文件夹，系统就干净了！...总结 以上所述是小编给大家介绍的在Linux中如何轻松删除源安装的软件包，希望对大家有所帮助，如果大家有任何疑问请给我留言，小编会及时回复大家的。
第1步：安装Stow 在这个例子中，我们使用的是CentOS，因此我们需要扩展的EPEL库。...第4步：使用stow完成安装 要安装软件包，首先将“cd”放入stow目录，如下所示： cd /home/testuser/stow 确保包含文件的文件夹只是当前位置下的一个目录。...现在输入： stow hello 该软件包现已安装在您的系统上。这是“hello”命令的截图： ? 第5步：删除包 关于装载最酷的部分是从系统中移除包装是多么容易。无需保留源包或任何东西。...他们仍然在“hello”目录中。您可以使用stow命令再次轻松地安装软件包。如果您不再需要这些文件，只需删除“hello”文件夹，系统就干净了！...总结 以上所述是小编给大家介绍的在Linux中怎么轻松删除源安装的软件包，希望对大家有所帮助，如果大家有任何疑问请给我留言，小编会及时回复大家的。
首先在官网下载jdk和Tomcat的压缩包 这里下载jdk-8u241-linux-x64 .tar.gz 和apache-tomcat-8.5.50.tar.gz 然后解压jdk压缩包 tar...–zxvf jdk-8u241-linux-x64 .tar.gz 把jdk放到/usr/local/目录下，并删除原本的jdk压缩包 mv jdk1.8.0_241/ /usr/local/ rm...jdk-8u241-linux-x64 .tar.gz 解压并删除原压缩包 tar –zxvf apache-tomcat-8.5.50.tar.gz rm apache-tomcat-8.5.50...apache-tomcat-8.5.50.tar.gz tomcat 用pwd命令查看jdk目录 cd /usr/local/jdk1.8.0_241 编辑/etc/profile文件 vim /etc/profile 在最后加入以下代码...:$JAVA_HOME/lib/dt.java:$JAVA_HOME/lib/tool.jar 重启服务器让它生效，输入java –version检查是否安装成功 在服务器上开放80端口，进入tomcat
下图为RabbitMQ下载界面 首先连接到linux,切换至root用户,并cd至usr/local目录下,在该目录下使用如下命令新建erlang和rabbitmq文件夹 cd /usr...编译安装结束后如下图所示 使用如下命令测试erlang是否安装成功 ....使用如下命令修改系统环境变量 vim /etc/profile 进入配置文件后,按i开始编辑,在空白处加入如下代码: #set erlang export ERLANG_HOME=$PATH:/usr/...firewall-cmd --list-port //禁用端口 firewall-cmd --zone=public --remove-port=15672/tcp --permanent 开放端口后在浏览器地址栏输入...http://ip:15672/尝试访问rabbitmq的web页面,如下图所示则成功,并使用新创建的用户访问 至此linux系统下安装rabbitmq结束 发布者：全栈程序员栈长，转载请注明出处
GISTIC这个软件在TCGA计划里面被频繁使用者，用这个软件的目的很简单，就是你研究了很多癌症样本，通过芯片或者肿瘤外显子测序+得到了每个样本的拷贝数变化信息，一般是segment结果，可以解释为CNV...GISTIC软件的使用有两个难点，一是在linux下面安装matlab工作环境，二是如何制作输入文件。...c 安装MCR_Installer 因为GISTIC软件是一个MATLAB程序，在Linux环境下运行需要MCR_Installer。matlab毕竟是收费软件，而且是有界面的。...但是考虑到大多研究者用不起matlab，或者不会用，所以就用linux系统里面安装matlab运行环境来解决这个问题，我们仍然可以把人家写的matlab程序，在linux命令行下面，当做一个脚本来运行！...cd MCR_Installer unzip MCRInstaller.zip chmod 744 installer_input.txt 因为是Linux，所以使用安静模式安装软件，没有鼠标点点点的交互动画过程啦
创建小环境:-n 指定小环境的名字 rna，并指定环境的python版本为python=3 conda create -y -n rna python=3 创建小环境成功后会出现3个done 图片 三、安装软件...图片 1.安装软件的方法： 图片 安装 conda install 出现三个done 显示安装完成 图片 2.安装特定版本 图片 3.特殊情况 图片 4.查看conda 环境中已经安装的软件...conda list #基本用法 conda list fast #查看符合正则表达式的软件 conda list -n rna #查看指定环境的软件 5.删除软件 conda remove conda remove -n rna #删除指定环境里的软件 6.常用命令 图片 7.安装软件的另一种方式：用yml文件安装 • 导出当前环境: conda env export...envname > env.yml • 导入环境: conda env create -n envname --file env.yml 8.mamba 安装软件更加丝滑 #安装mamba conda
本文以在CentOS 7.6中安装Tomcat8.5为例进行安装，其他系统和版本都是大同小异的。...安装JDK 安装Tomcat之前，需要先安装JDK，可以参看之前的文章详解在Linux系统中安装JDK 下载 进入Tomcat官方网站的下载页面（https://tomcat.apache.org/...download-80.cgi）,点击下载gz压缩包，如下图： 安装 把下载好的压缩包，上传到Linux系统中。...创建安装目录 mkdir /usr/local/tomcat/ 解压缩到安装目录 tar -zxvf apache-tomcat-8.5.49.tar.gz -C /usr/local/tomcat/...验证 Tomcat默认端口是8080，在浏览器中输入对应IP和端口，比如：http://192.168.1.111:8080，就可以访问了，如下图：
在docker中安装常用软件 一、Mysql 下载mysql docker pull mysql:5.7.15 启动mysql docker run -p 3306:3306 --name MySQLDocker
本文以在CentOS 7.6中安装JDK8为例进行安装，其他系统和版本都是大同小异的。...下载 进入官方网站的下载页面 首先，接受许可协议，如下图： 然后，根据Linux系统的位数选择要下载的压缩包。怎么知道Linux系统的位数呢？...这里是64位的，所以下载Linux x64，如下图： 安装 把下载好的压缩包，上传到Linux系统中。...创建安装目录 mkdir /usr/local/java/ 解压缩到安装目录 tar -zxvf jdk-8u231-linux-x64.tar.gz -C /usr/local/java/ 解压缩以后...设置环境变量 执行以下命令，编辑/etc/bashrc文件： vi /etc/bashrc 在文件的末尾添加如下内容： export JAVA_HOME=/usr/local/java/jdk1.8.0
1.4 安装软件的方法RPM（红帽软件包管理器）RPM有点像Windows系统中的控制面板，会建立统一的数据库，详细记录软件信息并能够自动分析依赖关系。...软件包名称移除软件包yum clean all清除所有仓库缓存yum check-update检查可更新的软件包yum grouplist查看系统中已经安装的软件包组yum groupinstall 软件包组安装指定的软件包组...当然RHEL 8系统也照顾到了老用户的习惯问题，同时兼容并保留了yum和dnf两个命令，大家在实际操作中随意选择就好。甚至这两个命令的提示信息都基本一样，感知不到什么区别。...初始化进程作为Linux系统启动后的第一个正式服务，它需要完成Linux系统中相关的初始化工作，为用户提供合适的工作环境。同学们可以将初始化进程粗犷地理解成从我们按下开机键到看见系统桌面的这个过程。...Linux系统在启动时要进行大量的初始化工作，比如挂载文件系统和交换分区、启动各类进程服务等，这些都可以看作是一个一个的单元（unit），systemd用目标（target）代替了System V init
Linux安装软件命令是什么 一、使用dpkg命令安装deb安装包文件 Debian软件包命名遵循下列约定: -.deb 安装步骤：1、找到相应的软件包，比如xx.deb，下载到本机某个目录； 2、cd...使用apt在线安装、卸载sudo apt install sudo apt remove 二、使用rpm命令安装rpm安装包文件 安装步骤：1、找到相应的软件包，比如xx.rpm，下载到本机某个目录.../configure； 6、开始编译： make； 7、安装生成的二进制文件：make install。 注意：具体安装方法以软件源代码中的README等帮助文件为准。...卸载步骤: 1、在源代码包目录中,终端执行：make uninstall。 上述是较主流的服务器Linux发行版的软件安装方法，其他Linux发行版请自行百度。...更多Linux相关教程，请关注PHP中文网！
域名查询工具nslookup并不是Win系统的专利，Linux系统中也可以使用，不过要安装，默认没有。...在CentOS中安装nslookup命令: $ sudo yum install bind-utils 这个bind-utils包，就包含了nslookup命令。...在“交互模式”下，用户可以向域名服务器查询各类主机、域名的信息，或者输出域名中的主机列表。而在“非交互模式”下，用户可以针对一个主机或域名仅仅获取特定的名称或所需信息。...个人发现Linux下的nslookup的使用与Win系统下的使用不太一样，还好Linux下有man page可以查询。...(Win系统nslookup工具的使用) 在Linux系统下，默认安装有另外一个域名查询的工具dig，估计现在大家都用这个工具吧。 版权声明：本文内容由互联网用户自发贡献，该文观点仅代表作者本人。
长期以来，Homebrew软件一直是Mac用户的便捷工具，但仅适用于Mac用户。 该应用程序增加了Linux风格的软件包管理，使用户可以轻松安装命令行实用程序。...现在，在2.0.0及更高版本中，该应用程序不再是Mac专有的。 借助适用于Linux的Windows子系统，Homebrew现在可用于Linux用户和Windows用户。...在Linux系统上，该应用程序称为Linuxbrew。 为什么用Homebrew代替发行版的软件包管理器？...软件包安装在您的主目录或特定于Linuxbrew的主目录中。 使用Homebrew/Linuxbrew的另一个原因是，您可能想在不同的系统上使用相同的软件包管理器。...安装Linuxbrew的依赖项 对于Ubuntu或其他基于Debian的系统，您可以在一个命令中安装Homebrew需要运行的所有内容： linuxidc@linuxidc:~/
步骤2 - 解压并安装OrientDB 在Linux中 下载后，您将在您的下载文件夹中获得orientdb-community-2.1.9.tar.gz文件。...export ORIENTDB_HoME = /opt/orientdb $ export PATH = $PATH:$ORIENTDB_HOME/bin 步骤3 - 配置OrientDB服务器作为服务 在Linux...您可以在OrientDB安装目录的$ ORIENTDB_HOME / bin / orientdb.sh的bin /目录中找到它。...在Linux中 按照给定的步骤在Linux中验证OrientDB安装。 运行服务器：可以使用以下命令启动服务器。 $ cd $ORIENTDB_HOME/bin $ ....在Windows
2.如果你是在大公司做运维的话，为了服务器系统的安全，你不可能轻易去网上下载RPM包安装的，因为别人可能恶意的注入木马后门什么也不是不可能的，所有为了安全期间，还是要自己手动进行编译安装的。...大概有多少种编译器呢，我们可以在使用yum groupinfo Development tools 进行包组的查看了。...2.下载httpd源码包 在网上找到源码的地址，如图所示： 复制链接地址后，进去xshell中在命令行中输入： wget 链接地址，下载下来的源码包就存在你当前的路径下。...我们在编译之前还需要定义一下，对当前程序编译时启用哪些特性或者功能，已经自定义安装路径等等。包中的 configure 脚本就是用来设置的，说到这里有必要让大家对这个编译前的设定做一个更深入的介绍。...，顾名思义下来就是要运行了，运行之前能需要设置下环境变量，这样才能让我们在shell中输入程序的时候，好让shell能够找到我们的源程序的位置来进行启动。
在Linux中，安装软件通常有三种途径：既可以使用安装包，也可以借助于APT，还可以从源码安装。他们各有特点，操作方式也不尽相同。...Linux下的软件既可以是软件安装包，就像windows一样，也可以是源码包。...而对于安装包而言，不同的Linux发行版所使用的格式不一样，比如RedHat使用的是yum格式安装包，Ubuntu则使用deb格式 以Ubuntu为例，安装软件的第一种方法，就是搜索并找到所需要的deb...但是这种办法一般不推荐使用，因为Linux下软件一般都只包含最精简的代码，不会包含所依赖的库或者其他函数接口程序，这就导致我们直接安装deb包时常常会发现系统缺少它所依赖的其他库或者服务，不得已需要先安装它们...然而，有时我们需要研究、改造软件源码，在Linux世界中绝大多数的软件都遵循GPL开源条款，我们可以获取源代码并编译他们，例如我们获取了jpeg库的源码，在源码顶层目录中编译安装的三部曲如下： .
软件安装 1.1 软件安装方式 在Linux系统中，安装软件的方式主要有四种，这四种安装方式的特点如下： 安装方式 特点 二进制发布包安装 软件已经针对具体平台编译打包发布，只要解压，修改配置即可 rpm...(安装过程需要联网) 源码编译安装 软件以源码工程的形式发布，需要自己编译打包 1.2 安装JDK 上述我们介绍了Linux系统软件安装的四种形式，接下来我们就通过第一种(二进制发布包)形式来安装JDK...1.3.4 停止Tomcat 在Linux系统中，停止Tomcat服务的方式主要有两种： 1)....将资料中提供的MySQL安装包上传到Linux并解压 A. 上传MySQL安装包 在课程资料中，提供的有MySQL的安装包 ，我们需要将该安装包上传到Linux系统的根目录 / 下面。 B....lrzsz lrzsz 是用于在Linux系统中文件上传下载的软件。
大家都知道，Windows下安装软件时，只需用鼠标双击软件的安装程序，或者用Zip等解压缩软件解压缩即可安装；在android或者apple中安装软件时，只需要在手机应用商店点击安装即可。...源码安装 3.2 二进制安装 Linux下二进制格式的软件是指事先已经在各种平台编译安装好相关软件，然后压缩打包，在安装时只需解压或者执行安装可执行文件即可。...RPM文件在Linux系统中的安装最为简便 RPM命令使用 rpm的常用参数 i：安装应用程序（install） vh：显示安装进度（verbose hash） U：升级软件包（update...下软件的安装受到操作系统安装环境的影响，比如某些软件在安装或者运行过程中需要调用操作系统本身的库文件，或者需要运行系统的某个工具等等，但是系统中不存在这个库文件或者这个工具没有安装，那么安装或者运行软件就会失败...通常的，源码安装都需要GCC或者CC编译器，这些编译器一般在安装系统时定制安装包中的开发工具选项下，其实这也是我们在第二章安装linux系统中要求选择开发工具包的原因所在。
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