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python并行计算之mpi4py的安装与基本使用

在之前的博客中我们介绍过concurrent等python多进程任务的方案,而之所以我们又在考虑MPI等方案来实现python并行计算的原因,其实是将python的计算任务与并行计算的任务调度分层实现。在concurrent和multiprocessing等方案中,我们的python计算任务和调度任务是一体化的,而且还有一个比较大的限制是没办法跨节点操作的,这对于任务与环境的定制化程度要求是比较高的。而MPI的方案在设计初期就考虑到了多节点之间通信的问题,而这种分层式的任务调度解决方案其实在架构上看也更加的合理。做计算的人只要考虑单个进程下的任务如何执行就可以了,至于任务如何并行如何调度,那就是上层的MPI该做的事情了。

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程序分析工具gprof介绍

程序分析是以某种语言书写的程序为对象,对其内部的运作流程进行分析。程序分析的目的主要有三点:一是通过程序内部各个模块之间的调用关系,整体上把握程序的运行流程,从而更好地理解程序,从中汲取有价值的内容。二是以系统优化为目的,通过对程序中关键函数的跟踪或者运行时信息的统计,找到系统性能的瓶颈,从而采取进一步行动对程序进行优化。最后一点,程序分析也有可能用于系统测试和程序调试中。当系统跟踪起来比较复杂,而某个BUG又比较难找时,可以通过一些特殊的数据构造一个测试用例,然后将分析到的函数调用关系和运行时实际的函数调用关系进行对比,从而找出错误代码的位置。

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IOR中文文档

IOR是一个并行的IO基准,可用于测试使用各种接口和访问模式的并行存储系统的性能。接口和访问模式的并行存储系统的性能。IOR资源库还包括mdtest基准,专门测试不同目录结构下存储系统的元数据峰值速率。在不同目录结构下存储系统的元数据峰值速率。这两个基准都使用一个共同的并行 I/O抽象后端,并依靠MPI进行同步。本文档由两部分组成。用户文档包括安装说明(Install),初学者教程(IOR的第一步),以及关于IOR的运行时选项的信息。开发者文档包括用Doxygen生成的代码文档和一些关于与Travis的连续整合的说明。IOR/mdtest用户和开发者文档的许多方面都是不完整的,我们鼓励贡献者 鼓励贡献者直接评论代码或在此基础上扩展文档。

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