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Pandas之read_csv()读取文件跳过报错解决

读取文件遇到和列数不对应,此时会报错。...解决办法:把第407多出字段删除,或者通过read_csv方法设置error_bad_lines=False来忽略这种错误: 改为 pandas.read_csv(filePath,error_bad_lines...到底有哪些字段: print(df.columns.values) .操作DataFrame过程丢掉了id字段header,却没发现该字段已丢失。...补充知识:pandas 使用read_csv读取文件产生错误:EOF inside string starting at line 解决方法:使用参数 quoting df = pd.read_csv...csvfile, header = None, delimiter=”\t”, quoting=csv.QUOTE_NONE, encoding=’utf-8′) 以上这篇Pandas之read_csv()读取文件跳过报错解决就是小编分享给大家全部内容了

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读取文件大坑(pythonscanpy库)

基于《pythonscanpy库读取几种常见格式单细胞数据文件汇总》文章,不知道有没有细心小伙伴发现,使用scanpy读取单细胞数据txt文件或者其他格式文件,得到AnnData数据对象有点奇怪...使用scanpyread_text()进行读取txt文件,要注意了哦!...注意:如果你使用scanpy其他读取文件函数进行读取不同格式文件,一定要小心了哦,一定要查看读取后Anndataobs是不是存储细胞信息,var是不是存储基因信息!..."填坑" 如果你也使用scanpyread_text()这个函数来读取txt文件,或使用scanpy别的读文件函数读取别的格式文件读取AnnData也出现上述这种情况,别慌!...可以看出var存储都是基因信息 哈哈,我们通过"补救措施"把它变成了一个正常AnnData数据对象了。 如果你使用scanpy文件函数要注意哦,一定要先查看obs和var存储是什么!

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python读取多层嵌套文件文件实例

由于工作安排,需要读取多层文件夹下嵌套文件文件结构如下图所示: ?...想到了递归函数,使用pythonos.path.isfile方法判断当前是不是可执行文件,如果不是再用os.listdir方法将子目录循环判断。...由于自己拿到数据集中,一个文件夹下要么全是文件夹,要么全是文件,所以第一次写这个函数,通过temp_list[0] 直接判断list第一个文件是不是文件。...所以自己第一次写代码有一个很大bug,就是当一个文件夹下既有文件夹又有文件情况下,会尝试将一个文件夹按照文件读取,报错。...读取多层嵌套文件文件实例就是小编分享给大家全部内容了,希望能给大家一个参考。

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Python按路径读取数据文件几种方式

img 其中test_1是一个包,util.py里面想导入同一个包里面的read.pyread函数,那么代码可以写为: from .read import read def util():...img 这个原因很简单,就是如果数据文件地址写为:./data.txt,那么Python就会从当前工作区文件夹里面寻找data.txt。...img pkgutil是Python自带用于包管理相关操作库,pkgutil能根据包名找到包里面的数据文件,然后读取为bytes型数据。...这是因为并不是所有数据文件都是字符串,如果某些数据文件是二进制文件或者图片,那么以字符串方式打开就会导致报错。...此时如果要在teat_1包read.py读取data2.txt内容,那么只需要修改pkgutil.get_data第一个参数为test_2和数据文件名字即可,运行效果如下图所示: ?

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Shell脚本循环读取文件每一

read命令从标准输入读取,并将内容保存到变量line。...在这里,-r选项保证读入内容是原始内容,意味着反斜杠转义行为不会发生。输入重定向操作符< file打开并读取文件file,然后将它作为read命令标准输入。...今天遇到一个问题弄了好久才搞明白:我想在循环中动态链接字符串,代码如下: for line in `cat filename` do echo ${line}XXYY done 就是每一次循环过程给取出来字符串后面添加...后来发现是因为我文件是才Window下生产Linux下读取这样文件由于换行符不同会导致程序运行不出来正确结果。...解决办法:Linux安装dos2unix小工具,经过该工具转化以后文件再进行读取就没有问题了。

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Python读取文件所有Excel文件

【知识点一】 Python os.walk() 方法 概述 os.walk() 方法用于通过目录树中游走输出在目录文件名,向上或者向下。...os.walk() 方法是一个简单易用文件、目录遍历器,可以帮助我们高效处理文件、目录方面的事情。...root 所指的是当前正在遍历这个文件本身地址 dirs 是一个 list ,内容是该文件夹中所有的目录名字(不包括子目录) files 同样是 list , 内容是该文件夹中所有的文件(不包括子目录...如果 topdown 参数为 True,walk 会遍历top文件夹,与top 文件每一个子目录。 onerror -- 可选,需要一个callable 对象,当 walk 需要异常,会调用。...os.listdir() 方法用于返回指定文件夹包含文件文件名字列表。这个列表以字母顺序。它不包括 '.' 和'..' 即使它在文件

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解决Python导入文件FileNotFoundError问题

文件名称为 temp.py 要导入文件temp.py同级目录images文件夹下那么应该保证要导入文件 imagesmodel_mnist.png 要跟前面的temp文件同一目录(不满足...,也就是你访问了不存在文件,但其实你访问文件如果不存在,切访问用是w方法法,是会新建文档,所以问题主要是,没有这个文件夹,新建即可。...详细解释 python,os库对于文件读写,是有要求。...由于你文件打开方式是’w’,也就是文件不存在就创建文件,所以那个pkl文件(我指的是相对路径pkl)不存在会自动创建,这不是问题,问题就在于那个相对路径,就是那个path是否存在,这个文件夹不存在一样会出问题...以上这篇解决Python导入文件FileNotFoundError问题就是小编分享给大家全部内容了,希望能给大家一个参考。

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关于Python读取文件路径斜杠问题

最近用Python读取文件,发现有时候用 '\' 会报错,换成 '\\' 就不会报错。...查了下资料发现,'\'是Python转义字符,如果路径存在'\t'或者'\r'这样特殊字符,'\'就无法起到目录跳转作用,因此报错。...python文件需要输入目录参数,列出以下例子: path = r"C:\Windows\temp\readme.txt" path1 = r"c:\windows\temp\readme.txt...path:"\"为字符串特殊字符,加上r后变为原始字符串,则不会对字符串"\t"、"\r" 进行字符串转义; path1:大小写不影响windows定位到文件; path2:用一个"\"取消第二个..."\"特殊转义作用,即为"\\"; path3:用正斜杠做目录分隔符也可以转到对应目录,并且pythonpath3方式也省去了反斜杠\转义烦恼。

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python3读取文件指定三种方案

其中关于内存映射技术一些应用,在前面的这2篇博客1和博客2有所介绍,而本文将要介绍是从文件读取特定内容3种解决方案。...遍历实现 python如果要将一个文件完全加载到内存,通过file.readlines()即可,但是文件占用较高,我们是无法完整文件加载到内存,这时候就需要用到pythonfile.readline...linecache实现 虽然pythonreadline函数并没有实现读取指定行内容方案,但是另一个库linecache是实现了,由于使用方式较为简单,这里直接放上代码示例供参考: filename...命令行sed获取 我们知道用Linux系统本身自带sed指令也是可以获取到文件指定或者是指定范围数据,其执行指令为:sed -n 50000000p filename即表示读取文件第50000000...总结概要 本文通过4个测试案例分析了python读取文件指定行内容方案,并得到了一些运行耗时数据。

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Python读取excel文件带公式实现

进行excel文件读取时候,我自己设置了部分直接从公式获取单元格值 但是用之前读取方法进行读取时候,返回值为空 import os import xlrd from xlutils.copy...+ '\api.xlsx' # 拼接excel文件地址 data = xlrd.open_workbook(data_file) # 读取文件 sheet = data.sheet_by_index...excel,可能会存在这些问题 要么读出来是“None”,要么是“公式本身” wb = openpyxl.load_workbook('daikuan.xlsx',data_only = True)...手动写入公式并保存,再用openpyxl读取,能读取到公式结果。 代码写入公式/值,需要手动打开Excel,并保存,再用openpyxl读取,就能读取到公式了。...读取excel文件带公式实现文章就介绍到这了,更多相关Python读取excel公式值内容请搜索ZaLou.Cn

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