/向量 9、unique（）返回 x 但是省去重复的数值 10、round（），floor（）和ceiling（） 11、sign（） 符号函数 12、%in% 检验x是否为集合y中的元素（x%in%y...#……省略部分内容 3、which.min(), which.max()和which() which(), which.max(), which.min()返回的是位置（索引） which(x, arr.ind...这一函数在去除数据框中缺失值时很有用。...12、%in% 检验x是否为集合y中的元素（x%in%y ） > y <- c(1,3,5) > 5%in%y [1] TRUE > 4%in%y [1] FALSE 13、ls( )用来列出现存的所有对象...window：时间窗 说明：本文中前半部分内容为作者自行整理，后半部分内容引自网络，稍作整理（蓝色标记部分是笔者认为比较常见和使用的函数）。
回归分析只涉及到两个变量的，称一元回归分析。一元回归的主要任务是从两个相关变量中的一个变量去估计另一个变量，被估计的变量，称因变量，可设为Y；估计出的变量，称自变量，设为X。...回归分析就是要找出一个数学模型Y=f(X)，使得从X估计Y可以用一个函数式去计算。当Y=f(X)的形式是一个直线方程时，称为一元线性回归。这个方程一般可表示为Y=A+BX。...有无显著的相关关系以及样本的大小等等，是影响回归方程可靠性的因素。R语言中的一元线性回归是用lm()函数实现的。 lm是用来满足线性模型。...参数：subset 一个可选的向量指定要在装修过程中使用的观测的子集。 参数：weights 一个向量。指定用于回归的每个观测值的权重。...参数：model, x, y, qr 逻辑值。如果TRUE返回合适的模型框架，模型矩阵，响应，QR分解的相应部件。 参数：singular.ok 逻辑值。指定奇异拟合是否报错，默认TRUE。
数据选取与简单操作： which 返回一个向量中指定元素的索引 which.max 返回最大元素的索引 which.min 返回最小元素的索引 sample 随机在向量中抽取元素 subset 根据条件选取元素...",all=F) #默认，只取两者的共有的部分 id R M 1 1 9 7 2 2 7 2 其中，all=T代表全连接，all.x=T代表左联结；all.y=T代表右连接 2、dplyr...包 dplyr包的数据合并， 一般用left_join(x,y,by="name") 以x为主，y中匹配到的都放进来， 但，y中没有的则不放过来。...paste(c("X","Y"),1:10,sep="") #"X”,"Y"是长度为2的字符向量,1:10 长度为10的向量。...包中的rbind.fill函数（合并的数据，必须是data.frame），do.call可以用来批量执行。
X χ \chi psi Ψ \Psi ψ \psi omega Ω \Omega ω \omega 上标与下标 上标和下标分别使用 ^ 与 _ ，例如 x_n^2表示的是：\displaystyle...一个组即单个字符或者使用 {..} 包裹起来的内容。如果使用 10^10 表示的是\displaystyle 0^10，而 10^{10} 才是 \displaystyle 10^{10}。...同时，大括号还能消除二义性，如 $x^5^6$ 将得到一个错误，必须使用大括号来界定 ^ 的结合性，如 {x^5}^6 ：\displaystyle{x^5}^6 或者 x^{5^6} ：\displaystyle...括号插入 小括号和中括号 使用原始的 ( )、[ ]即可，如 (a+b) [x+y]：\displaystyle(a+b) [x+y]。...表格中各行使用 \ 分隔，各列使用 & 分隔。使用 \hline 在本行前加入一条直线。
所以在我们的分析中需要慎重考虑，另外需要注意的是我们的spot 并不是一个细胞。 ? 其实不好的亚群，说到底还是该亚群的基因不make sense。...掩蔽是一个重要的问题，由于染色，切片等原因，在某些组织类型中它可能会失败。如果发生这种情况，你可以尝试修改MaskImages()中的参数，或者创建你自己的屏蔽函数，看看你是否可以获得更好的结果。...在以下情况下通常需要这样做: (1)组织比图像背景大，因此部分组织在帧边缘之外 (2)组织具有对称的形状(例如，如果组织是圆形，使用组织边缘将很难找到最佳对齐) (3)masking 失败 实际的转换是使用...imager R包中的imwarp()函数使用“反向”转换策略完成的。...注释完成后，只需关闭浏览器窗口并返回R。这里我们不再演示。
R 当中是split( ),*apply( ),aggregate( )…,以及plyr包 1、split函数 split( )的基本用法是：group X,f) 其中X 是待分组的向量...总结： 本算法在性能上有所提高，但在易用性上明显不足，在代码写法、业务逻辑、计算结果上仍然存在不一致。...")],function(x) sum(x)) 4、subset()函数 利用subset()函数进行访问和选取数据框的数据更为灵活，subset函数将满足条件的向量、矩阵和数据框按子集的方式返回。...##对于数据框 x是对象，subset是保留元素或者行列的逻辑表达式，对于缺失值用NA代替。 Select 是选取的范围，应小于x。...在使用data.table时候，需要预先布置一下环境： data<-data.table(data) 如果不布置环境，很多内容用不了。
岭回归的目的就是寻找使RSS最小时的参数估计，在R中，包MASS中的函数lm.ridgc(可以满足要求，函数的基本书写格式为: Im.ridge(formula, data, subset, na.action...: Na.action:一个函数，指定当数据中存在缺失值时的处理办法，用法与Im中的一致: Lambda:指定RSS的表达式中系数平方和的倍数项，默认值为0; Model:逻辑值，指定是否返回“模型框架...”，默认值为FALSE: X:逻辑值，指定是否返回“模型矩阵”，默认值为FALSE: Y:逻辑值，制度能够是否返回响应变量，默认值为FALSE: Contrasts:模型中因子对照的列表。...lasso的目的就是寻找使RSS最小时的参数估计，在R语言中，包lars中的函数lasr()可以满足要求，其函数的基本书写格式为: lars(x, y，type = c("lasso", "lar",...; Intercept:逻辑值，指定是否将解决项包含在模型中,默认值为TRUE; Gram: 计算过程中的x'x矩阵; Eps: 有效的0值: Max.steps:算法迭代的最大次数; use.Gram
所以在我们的分析中需要慎重考虑，另外需要注意的是我们的spot 并不是一个细胞。 其实不好的亚群，说到底还是该亚群的基因不make sense。...函数MaskImages()可以移除背景，目前对于边界清晰的组织来说效果很好。掩蔽是一个重要的问题，由于染色，切片等原因，在某些组织类型中它可能会失败。...在以下情况下通常需要这样做: (1)组织比图像背景大，因此部分组织在帧边缘之外 (2)组织具有对称的形状(例如，如果组织是圆形，使用组织边缘将很难找到最佳对齐) (3)masking 失败 实际的转换是使用...imager R包中的imwarp()函数使用“反向”转换策略完成的。...下面是一些标准，必须满足： 切片必须来自相同的组织类型，每个切片的形态必须相似 （切的方向要一致） 图像必须是对齐的，也就是说你必须先运行LoadImages()， MaskImages()和AlignImages
1.数据合并 我们在R语言基础语法教程中介绍了数据合并的一般方法，即利用函数cbind()和rbind()来进行合并，但这只是对数据进行简单的连接，且要求用于合并的数据集有相同的维数，否则R语言将会报错...参数介绍: x, y:用子合并的两个数据框或其他数据对象; by, by.x, by.y: 指定依据哪些行合并数据框，默认值为x、y中列名相同的列; all, all.x, all.y:逻辑值，指定x和...y的行是否全在输出文件中，默认值为FALSE; Sort:逻辑值，指定参数by中的列是否需要排序，默认值为TRUE; Sutlives:字符串向量，指定除参数by小中的列外相同列名的后缀； Incomparables...subset(x, subset, select, drop = FALSE, ...) x是操作的对象，subset是逻辑值，指定需要选取的行或元素，select指定需要选取的列。...需要注意的是:函数within()中需要将具体指令用花括号括起来，如果指令有多条，每一条之间使用分号隔开;删除数据集中的列变量需要用到函数rm()。
在之前R语言基础教程——第3章：数据结构——向量中我们介绍过向量的加减乘除运算，在这里介绍一下>，的是，x > y运算过程中，x[1]与y[1]运算得FALSE，x[2]与y[2]运算得TRUE，以此类推，得到的所有结果最后还是一个向量。...如果数据中用NA值，那么在进行相应的运算时会出错，可通过na.rm = T(意思为移除NA）声明，计算其余的值，而对于NULL，R会自动跳过。...> which(aa>5) [1] 4 7 9 > 注意在矩阵和数据框中的使用。...is.na(subset), vars, drop = drop] : (下标)逻辑下标太长 > subset(matrix1[,1],matrix1[,1]>3) #指定特定的行或列可以用subset
前面已经介绍的四个软件： maftools（r包）绘制棒棒图等 trackview（r包）包绘制 基因棒棒图 GenVisR（r包）介绍：基因组可视化工具 G3viz（r包）绘制基因棒棒糖图 数据准备...(limits = c(0, 10), breaks = 0:10) gp 3、添加棒棒图 使用geom_segment添加棒棒图的棒子，geom_point添加棒棒图上面的圈圈，geom_text_repel...min(abs(x - mut.df$AA[!...函数 data %>% ggraph(layout = 'manual', x = AA, y = Freq) + # 绘制一个空白图 # 绘制边框 geom_rect(data = subset...- set1 + mod.start/3 as.data.frame(cbind(set1,set2)) } 使用上面定义的函数修改数据并绘图： # 修改数据 mut.df$Shift.AA
这有点类似于shell中通过$引用相应的参数。看来很多的编程语言都存有相同的参数传递机制。 函数的属性 R中包含了一系列的函数用于提取函数类型对象的信息。...NULL 如果我们想要在R代码中对函数的参数列表进行操作，formals函数是一个很好的工具，它会返回一个配对列表对象（对应参数名和设定的默认参数值）。...(x, y = 100, z = 200) NULL R提供了与formals函数类似的函数body来返回函数的函数体： > body(f) { x + y + z } 我们也可以将它放在赋值语句的左边...(x, y = 100, z = 200) { x * y * z } 注意，函数体的类型为expression，所以重新赋值时，也必须为expression类型。...解释器将这样递归地在各个环境中寻找直到找到该符号或到达全局环境。加入解释器在到达全局环境时依然没有找到var，那么R会在全局环境中指定var的值为value。
精确的棋子识别：下棋机器人必须能够精确地识别棋盘上每个棋子的位置。自定义姿势关键点检测使机器人能够识别每个棋子的类型和位置，使其能够在游戏过程中做出明智的决定。...自定义姿势关键点检测可以适应不同的棋盘尺寸和棋子设置，使机器人具有多功能性并能够下不同的国际象棋变体。 实现步骤 下面是具体步骤： 【1】使用CVAT标注样本。...= (y_min + y_max) / (2 * image_height) width = (x_max - x_min) / image_width...在colab中训练。...【3】在本地使用best.pt进行预测。
二分 or 回溯 or bitmask dp 0.导语 在leetcode上有如下四种题目，做法类似，题目描述大同小异，涉及的算法包括：状态压缩dp、二分、递归、回溯，可算得上是比较好的几道题，今天来做个小结...每个数可以放在任何一个组中，因此是个分配问题，这里可以递归，我们可以放进去 再取出来，采用回溯完成所有分配，在分配中看看是否满足题意。...在 D 天内送达包裹的能力 题目描述： 传送带上的包裹必须在 D 天内从一个港口运送到另一个港口。 传送带上的第 i 个包裹的重量为 weights[i]。...2, 3, 4, 5 第 2 天：6, 7 第 3 天：8 第 4 天：9 第 5 天：10 请注意，货物必须按照给定的顺序装运，因此使用载重能力为 14 的船舶并将包装分成 (2, 3, 4, 5)...工人的 工作时间 是完成分配给他们的所有工作花费时间的总和。请你设计一套最佳的工作分配方案，使工人的 最大工作时间 得以 最小化 。 返回分配方案中尽可能 最小 的 最大工作时间 。
R语言中用于实现logistic回归的函数是glm()，其基本书写格式为: glm(formula, family = gaussian, data, weights, subset, na.action...binomial(link = "logit"); Data:指定用于回归的数据对象，可以是数据框、列表或能被强制转换为数据框的数据对象: Weights:一个向量，用于指定每个观测值的权重: Subset...，其中epsilon 表示收敛的容忍度，maxit表示迭代的最大次数，trace 表示每次迭代是否打印具体信息； Model: 逻辑值，指定是否返回“模型框架”，默认值为TRUE: Method;指定用于拟合的方法...，“glm.ft”表示用于拟合，“model.frame"表示可以返回模型框架； X:逻辑值，指定是否返回“横型矩阵”，默认值为FALSE: Y:逻辑值，制度是否能够返回响应变量，默认值为TRUE; Contrasts...<-performance(pred2,'tpr','fpr') > plot(perf,col=2,type="l",lwd=2) > f=function(x){ y=x;return(y)} >
5的元素的位置，第3与第5是大于5的 [1] 3 5 2、subset()函数 subset()函数是返回符合条件的元素，但是会忽略NA值。...>6) [1]7,10 3、ifelse()函数 ifelse(x,a,b)函数判断元素x是否符合条件，如果符合，返回a，如果不符合返回b，其中x为逻辑值 > X <- 1:10 > YX%%2==0,1,0) #如果为偶数，返回1，奇数返回0（X %% 2 == 0：这里的%%是取模运算符，用来计算X中每个元素除以2的余数。...ifelse(X %% 2 == 0, 1, 0)：对于X中的每个元素，如果它能被2整除（即X中的偶数），则Y中的对应位置为1；如果它不能被2整除（即X中的奇数），则Y中的对应位置为0。）...> Y [1] 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 进阶版 sample()函数在R中用于随机抽样。 c(5,6)是一个向量，包含两个元素：5和6。这是抽样的总体或池。
导语 GUIDE ╲ 曼哈顿、QQ 和火山图是用于可视化高维数据分析结果的流行图形方法 。...背景介绍 对于一些研究领域，如GWAS、EWAS研究，常常会用到曼哈顿图可视化基因组中与表型相关的潜在感兴趣区域、QQ图表示观察到的检验统计量的分布假设、火山图是针对其效应大小、优势比或对数倍数变化绘制的...今天小编给大家介绍的这个R包manhattanly，整合了这几种常用的绘图方式，可以方便的进行分析可视化！...x和y坐标 plotData subset, snp = "SNP", gene = "GENE")[["data"]] # 注释最小的 p 值 annotate...::layout(annotations = list( list(x = xc, y = yc, text = paste0(annotate$SNP,"","GENE: "
导言： 较早之前就听说R是一门便捷的数据分析工具，但由于课程设计的原因，一直没有空出足够时间来进行学习。...最近自从决定本科毕业出来找工作之后，渐渐开始接触大数据行业的技术，现在觉得是时候把R拿下了；用了3天时间，除了对R先有一个大概认识之外，也着手敲指令。...由于计算机专业的底子还不错，而且先后接触过不下10种编程语言，感觉R语言入门上手还是挺简单的。下面是自己汇总的一些简单入门代码供大家参考，感兴趣的朋友也可逐行敲打测试。 1....介绍变量、顺序结构、分支结构、循环结构、函数使用、获取帮助等知识 1 #---这是注释--- 2 #R变量类型及赋值 3 x x) 4 y R提供了极其灵活的方式，访问、修改、向量、列表、数据框等数据结构，以及R中很多重要、常用的数据分析函数 1 #3-1访问向量元素 2 3 x x) 4 print
，由简单到复杂，是很有帮助的....对于机器学习中的一个课程，其包含不同难度的子集. 相比较于随机采样，从最简单的样本开始学习，然后逐渐到最复杂的样本. 这样，机器在遇到很复杂的样本前，能够建立对特定概念的坚实基础....课程的数据子集数量是由子集参数设定的....对于计算机视觉领域的应用，每个向量表示一张图像. 具有较高分布密度值的课程样本子集，其在特征空间内，所有的图像彼此很接近，即图像间具有较强的相似性....def fit_predict(self, X, y=None): """ 对 X 进行 curriculum clustering， 并返回聚类后的标签
R和统计，R语言和统计是一对兄弟，相互难以离开呀！ 这里记录下这本书里我之前不了解的内容，欢迎一起交流！向量的模式作者写了个函数来干这件事，我学习下，登上巨人的肩膀。...我的理解，这个是相当于motif，计数最多的元素的意思。...mode x) { temp x) names(temp)[temp == max(temp)] } 3.5 在R中进行多元相关分析 为避免单个变量的负面影响...runif(n=20, min=0,max=20) ymin=0,max=20) par(new=TRUE) plot(ecdf(x), do.points=FALSE,...2.Z检验（UsingT包中的simple.z.test）：比较样本均值与整体数据集均值以及标准偏差。
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