首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

R包|数据IO界的瑞士军刀rio

有人曾统计[1],rio包之前,为了满足数据导入需要,大概需要学习的R包和其对应的数据文件类型如下: readr包 - text files(如csv, tsv, fwf文件) haven包 - SPSS...rio支持相当多的数据格式,安装好R包以后,通过install_formats()来安装所有支持格式。...如果数据导入遇到问题,可能需要查看rio包背后使用的是什么包的什么函数来进行数据导入,并根据情况在用import()读取数据添加对应参数。 不成功的导入例子可以查看引用[1]。...2 import_list 针对多对象文件,可以采用import_list()来读取文件,并保存为list。文件格式可以为Excel工作簿、.Rdata、Zip或HTML。...而如果我们使用import_list()来读取数据,结果将为一个列表。

1.2K30

从零开始的异世界生信学习 R语言部分 04 文件的读写与认知

读取ex1.txt ex1 <- read.table("ex1.txt") #列名不能正确表示,并且内容的数值变为了字符串 ex1 <- read.table("ex1.txt",header =...("soft.txt",data.table = F) #读取速度更快,参数较少,可以直接读取问题文件 # rio包,包括import以及export函数 library(rio) #不能读取问题文件..., wf1 <-import("wf1.xlsx") #读取xlsx文件 wf <- import_list("wf.xlsx") #可以吧多个sheet文件的excel文件导入成列表模式 a = import...("abc.mp4",format = "\t") #加上format=参数可以打开问题文件读取xlsx文件的优秀函数 b = import_list("jimmy.xlsx") b$Sheet1...csv文件 图片 补充知识 矩阵如何生成 # 1.由数值型数据框转换 m1 = as.matrix(iris[,1:4]) # 2.由向量改变维度而来 m2 = matrix(rnorm(18),nrow

1.3K40
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

Day05 生信马拉松-文件的读写

文件读取1.1 R读取文件格式图片1.2 .txt文件读取常见错误:read.table("ex1.txt"), read.table函数默认header = F,因此会自动加列名"V1","V2...= F) 表格文件读入到R中就得到一个data.frame,R对data.frame的修改不会同步到表格1.4 读取非工作目录下的文件read.csv("import/gene.csv") import...为工作目录下的子文件夹名,不要漏了“/”拓展内容工作目录内创建一个文件夹dir.create("文件夹名")1.5 读取上一级文件load(.....数据框列数据缺失图片错误解决方式soft <- read.table("soft.txt",header = T,fill = T),会出现原有确实数据位置的错列图片正确使用:soft2 <- read.table...= F3.2 rio包的使用library(rio)#读取 import的文件必须要写对后缀soft = import("soft.txt")#读取多工作簿的excells2 = rio::import_list

18720

Day4-5 R语言代码

(2)在数据框类型数据的行取子集、导入TXT文件,注意一下数值型数据的行/,有没有藏着字符型数据。马虎了就会影响后续数据处理。...2、读取各种类型文件 (1)TXT文件,建议使用read.delim()函数,因为它的一些默认参数比read.table()适用范围更广; (2)csv文件 1)“check.names = F”...3)一定要要经常查看自己的数据是否读取正确; (3)xlsx文件,建议使用rio包里面的函数 library(rio) #读取 ex1 = import("ex1.txt") #读取多工作簿的excel...ls2 = rio::import_list("ls.xlsx") #导出为普通表格文件 export(iris,file = "iris.csv") #导出列表 ls = split(iris,iris...3、libraryR包error, ‘ ’ 里面的内容经常就是依赖包的名字,需要重点关注。

21820

Learn R 函数和R

分隔符 常见的分隔符:逗号、空格、制表符(\t) 将表格文件读取R语言中 read.table() #读取txt格式 read.csv()#读取csv格式 文件的导出 不要覆盖原文件 代码可重复 数据可重现...data/ex1.txt") #同样把文件保存到当前目录的文件夹(Rdata 自己建立的文件夹) >save(test,file="Rdata/xxx.Rdata") #当前一个文件想要调用另一个文件夹的...要把整个都改为数字型 "40" "20" "51" "46" "38" "49" R语言可以读取文件格式 ###通用格式 csv. xls. txt. tsv. json. pdf. spss....read.table()智能版 >a=data.table::fread("soft.txt",data.table = F)#读取很智能,不会导致窜列 #### 4.rio包 可以读取任何形式,但有问题的文件仍有问题...,根据文件的后缀读取,特殊 >import() >import_list() >export() >rio::export(a,file="a.xlsx") >b=rio::import("a.xlsx

1.4K00

《高效R语言编程》5-高效输入输出

使用rio包的import()能导入各种格式的数据,避免加载特定格式库的麻烦。 对于高效导入大文本文件使用readr或data.table与read.table()相当。...rio包可以处理的格式包含:.csv, .feather, .json, .dta, .xls, .xlsx和谷歌在线表格。其无需指定可选的format参数,另外可以网络下载数据。...基础RstringAsFactors=TRUE才会将字符不转化为因子,而fread()和read_csv()函数默认返回字符型。...R自带的文件格式:Rds和Rdata save()为Rdata是应用最广泛的,函数功能类似save.img()和save.imge()。...saveRDS()函数应用相对较少,作者推荐这个,保存R对象更加简洁,readRDS()更加灵活,结果对象可赋值任何名字。使用这个是个好习惯,强制指定对象名字。

1.5K20

「Workshop」第四十二期 R文件读写

rio package rio是一个比较简单,但是又非常强大的一个数据读写包,这个包的特点是:根据文件的拓展名推断文件的类型,然后调用不同的包来读写数据,目前支持的文件类型 主要使用的函数有: import...","tbl","tibble","data.table" which 当我们需要从含有多个数据对象的文件读取数据可以指定这个参数;比如file是一个压缩的文件夹,可以使用该参数来指定需要读取文件...;如果是一个excel表格(含有多个子表格),可以使用which指定读取的表格;如果是一个Rdata文件也可以指定需要读取的对象 当我们一个文件夹下有多个文件,可以使用import_list函数来一次性读入...x 数据框或者矩阵 file 保存的文件名 format 保存的文件格式(文件拓展名);file和format至少要指定一个 也可以使用export将多个对象输出到一个文件(excel和Rdata):...*函数相比,readr包的read_*函数的特点有: 更快 读入的数据类型是tibbles,不会将字符变量转化为因子;可以自动的解析常见的时间格式 base R读取数据可能会继承一些操作系统的行为或者环境变量

75550

2023.4生信马拉松day5-文件读写

③ sublime打开(适用于大文件) ④ R语言打开 #1.读取ex1.txt ex1 <- read.table("ex1.txt") 注:文件读取R语言里数据框的来源之一;表格文件读到R语言之后得到一个数据框...一般用read.table()读取txt文件,用read.csv()读取表格文件;非要交叉使用的话读取文件需要限定好参数; 读取失败的两种表现:报错/意外的结果 -(1)报错:no such file.../导出文件R包 如果一个数据用read.table读取有问题的话换一个函数或许会更方便,可选函数/包: 图片 应用实例: a=data.table::fread("",data table = F)...#rio包可以方便地处理excel文件,是R语言处理excel最好的函数 library(rio) aabb = list(a=a,b=b) export = (aabb, "aabb.xlsx") test...= import_list ("aabb.xlsx")

1.1K60

安装读取的Excel的包

安装过程 总览 readxl软件包使Excel到R的数据获取变得容易。...“) #> [1]” /Users/jenny/Library/R/3.6/library/readxl /extdata/clippy.xls” read_excel() 读取xls和xlsx文件,并从扩展名检测格式...文章 这些文章解释了广泛的主题: 单元格和列类型 图纸几何:如何指定要读取的单元格 readxl工作流程:遍历多个选项卡或工作表,隐藏一个csv快照 我们还提供了一些重点文章,这些文章解决了全球电子表格提出的特定问题...编写Excel文件:示例文件datasets.xlsx,datasets.xlsopenxlsx(和Excel)的帮助下创建的。openxlsx提供“编写,样式化和编辑工作表的高级界面”。...它比openxlsx简约得多,但是简单的示例上,它的速度似乎快两倍,并且可以写入较小的文件。 非表格数据和格式设置:tidyxl专注于Excel导入尴尬和非表格数据。

2K41

比Open更适合读取文件的Python内置模块

mode 文件读取模式,fileinput 有且仅有这两种读取模式r和 rb。 默认使用 mode='r' 如果文件是二进制的,可以使用mode='rb' 模式。...标准输入读取 若input()不传任何参数,fileinput 默认会以 stdin 作为输入源。 运行stdinput.py后,在编译器输入内容,程序会自动读取并再打印一次。...最后一个文件的最后一行被读取之后,返回此文件该行的行号。 读取单个文件 与批量读取文件一样,只需要在参数files传人一个文件即可。...如果在创建对象未传入字段名称,则首次访问时或文件读取第一条记录时会初始化此属性。...Excel 应用程序,然后才是工作簿 books 和工作表 sheets,xlwings 需要安装有 Excel 应用程序的环境xlwings 可以读取 .xls 和 .xlsx 文件

4.6K20

【数据业务】几招教你如何R获取数据进行分析

【IT168 编译】本文是《R编程语言》中一个系列的第二部分。第一部分,我们探索如何使用R语言进行数据可视化。第二部分将探讨如何R语言中获取数据并进行分析。  ...文件读取数据   理想情况下,数据是可以储存在文件系统的。这些数据必须可读或写,用以识别当前目录中储存的文件。   ·目录设置   首当其冲的就是设置工作目录。   ...·读取文本文件   包含在文本文件的数据可以R会话使用扫描命令读取。   记住使用选项what= " "扫描命令,这表明输入的字符将带有数据类型属性。   ...对于这个session,我已经创建了textsample.txtfile文件,它可以R会话读取。...  可以使用显示R的数据集的命令data()将可用数据集置入R

2.1K50

1. spring5源码 -- Spring整体脉络 IOC加载过程 Bean的生命周期

Spring源码的整体脉络梳理 Spring IoC是一个容器, Spring Ioc维护了许多Bean 那这些bean是如何被注册到IoC的呢?...context = new AnnotationConfigApplicationContext(); context.getBean("***"); } 这段代码实现的功能是, 读取当前文件所在目录及其子目录文件...其中图纸的时候, 画一张就给工厂给一张, 这样效率太低了. 我们可以画了n张, 一起给工厂. 所以, 设计图纸这块是一个容器, 存放多张图纸 后面,如果我还想定制一个橱柜店....Spring是如何解决循环依赖的问题的呢? 设置出口. 比如A构造的过程, 那么设置一个标记, 正在构造....然后构造B, B构造的过程应用了A, 这时候, 有趣构造A, 然后发现A正在构造, 那么, 就不会再次构造A了. 后面还会详细讲解Spring是如何解决循环引用的.

38730

spring5源码 -- IOC容器设计理念和核心注解的作用

Spring源码的整体脉络梳理 Spring IoC是一个容器, Spring Ioc维护了许多Bean 那这些bean是如何被注册到IoC的呢?...context = new AnnotationConfigApplicationContext(); context.getBean("***"); } 这段代码实现的功能是, 读取当前文件所在目录及其子目录文件...其中图纸的时候, 画一张就给工厂给一张, 这样效率太低了. 我们可以画了n张, 一起给工厂. 所以, 设计图纸这块是一个容器, 存放多张图纸 后面,如果我还想定制一个橱柜店....Spring是如何解决循环依赖的问题的呢? 设置出口. 比如A构造的过程, 那么设置一个标记, 正在构造....然后构造B, B构造的过程应用了A, 这时候, 有趣构造A, 然后发现A正在构造, 那么, 就不会再次构造A了. 后面还会详细讲解Spring是如何解决循环引用的.

54430

Python干货 | 遥感影像拼接

在上一篇推文中,我展示了如何使用Python结合Landsat制作遥感影像图(Python干货 | 制作遥感影像图)。...Fig.1 World Reference System 某些遥感影像的应用场景,如果我们关注的区域正好处于两景影像的交界处,如下图中的象山港,那我们就需要将影像拼接起来才可以使用。...import rasterio as rio import gdal 先介绍一下我们实现两组遥感影像拼接的思路,首先选取两景相邻的影像,分别得到他们的空间范围,再得到两景组合到一起之后的空间范围,使用gdal...新建一个tif文件(数据中转用),分别得到原来两景影像在新建的tif文件的起始位置,将对应的数据写入新的tif文件,即实现镶嵌拼接。...其中还有两处关键处理,一是如何去除重叠区域的无效信息,二是重叠区域的数据如何选择。希望各位看官能从代码里面找到答案。 2.动起手来 得到输入影像的四个角点。

1.6K10

数据驱动框架(Apache POI – Excel)

我们可以将数据保留在excel工作表,并在测试脚本中使用它们。让我们看看如何通过从Excel文件读取测试数据来创建数据驱动的UI自动化框架。...如何使用Apache POISelenium创建数据驱动框架?...Selenium的Excel 读取和写入数据”中学到了如何使用Apache POIExcel文件读取和写入数据,然后将与测试数据相同的数据集传递给Selenium测试。...但是该脚本Excel文件读取数据,将数据写入Excel文件,将数据传递给Selenium操作的所有动作都发生在该类的main方法。如果我们仅编写一个或两个测试用例,则该格式是可以接受的。...此外,文件读取/写入数据的操作应分开进行,并且可以作为实用程序使用。 请按照下面提到的步骤创建一个基本的数据驱动框架,该框架将用于自动执行“学生注册表“。

23010

读取Excel文件

,于是通过度娘等方法找到了Android读取Excel表格文件的一种方法,记录一下。 闲话一下Excel工作簿和工作表的区别: 工作簿包含有工作表。...工作簿可以由一张或多张工作表组成,一个工作簿就是一个EXCEL表格文件。 好了,开始读取表格文件吧。...前提 首先,我们假设需要读取的表格文件名字为test.xls, 位于assets根目录下。 所需Jar包 这里为了能读取到Excel表格文件,我们要添加一个第三方Jar包jxl。...book = null;//Excel工作簿对象 2.以流的方式读取我们内置assets目录下的表格文件 inputStream = context.getAssets().open("test.xls..."); 3.将上一步的输入流读取成一个文件,方便后续使用 File tempFile = new File(context.getCacheDir(), "test.xls");//临时文件,第二个参数为文件名字

2.3K40

JAVA的POI操作Excel

1.1Excel简介 一个excel文件就是一个工作簿workbook,一个工作簿可以创建多张工作表sheet,而一个工作表包含多个单元格Cell,这些单元格都是由列(Column)行(Row)组成...行则使用数字表示,例如;A3 表示第三行第一列,E5表示第五行第五列。 ? 1.2 POI工具包 JAVA操作Excel的有两种比较主流的工具包: JXL 和 POI 。...: //读取excel文件 FileInputStream inputStream=new FileInputStream("d:\\工作簿.xls");...api文档我们了解到: HSSFWorkbook 和 XSSFWorkbook 都实现了Workbook接口; HSSFSheet 和 XSSFSheet 实现了Sheet接口; HSSFRow 和...如;处理03和07版本的excel文件利用统一的接口就可以做到分析两个版本的excel数据。 POI同时读入03和07版本的excel。 方法一:判断文件的名称后调用对应版本的读入方法。

1.2K20

用Python手撕一个批量填充数据到excel表格的工具,解放双手!

开始设计GUI界面,要明确我们需要实现什么功能,可以先设计出图纸,再动手去写代码!本文根据需求,最后得出以下GUI界面图纸: ?...GUI界面按钮和框的一些功能: 通过打开文件按钮选择数据文件或者输入框输入数据文件文件路径,但只支持csv、xlsx、xls格式的文件,并把数据文件的列标题传入选择或输入数据列标题框。...通过打开模板按钮选择模板文件或者输入框输入模板文件的路径,只支持xlsx和xls格式的文件,并把模板表格的空白单元格坐标传入选择或输入单元格坐标框。...打开模板按钮只要实现的是传入模板文件,以及获取模板表格的空白表格坐标;其中,之所以使用openpyxl打开模板文件,是因为后面是openpyxl进行填充数据的。...安装后命令行窗口cd到文件所在的文件目录,最后用下面命令进行打包。 pyinstaller -F -w 名称.py 打包可能会报错: ?

1.7K30
领券