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R优雅的绘制物种冲积图

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近有朋友问R绘制冲积图的代码,其本质仍然是条形图只是添加了样本间的连线;案例要求按列计算每个样本的相对丰度跟往常有所不同。...下面小编就来简单介绍一下代码 ❞ 加载R包 library(tidyverse) library(ggsci) library(magrittr) library(reshape) library(RColorBrewer...,read_tsv("group.xls"),by=c("name"="sample")) 绘制冲积图 ggplot(plot, aes(name, value, alluvium = Genus,...size = 11, color = "black"), # 设置x轴标题的边距、大小,颜色为黑色 axis.title.y = element_text(margin = margin(r...= unit(0.1, "cm"), # 设置图例水平间距为0.1厘米 legend.box.background = element_blank() # 设置图例框背景为空白 ) 绘制组间冲积图

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如何在R绘制热力地图

地图绘制思路: ① 绘制需要展示的地图,获取地图对象,获取每个区域的名字以及顺序; ② 每个区域的名字和顺序后面,加上我们需要展示的数据以及经纬度; ③ 根据数据的大小,设置每个区域展示的颜色的深浅...,获取地图对象,获取每个区域的名字以及顺序; m <- map("state"); m$names #第二步,每个区域的名字和顺序后面,加上我们需要展示的数据以及经纬度; data <- read.csv...text(data$x, data$y, data$name, cex = 0.6) 绘制好的地图: ?...二、地图上增加热力地图 热力地图: 以特殊高亮的形式,显示数据地理分布情况的图形。...,设置为显示数值的大小 inches 缩放比例,将圆形的大小缩放到合适程度 add 是否追加到图形地图上增加图形,需要设置为TRUE bg 图形的背景色 代码实现: library

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r语言求平均值_r语言计算中位数

大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君 R的统计分析通过使用许多内置函数来执行的,这些函数大部分是R基础包的一部分,并且它们将R向量与参数一起作为输入,并在执行计算后给出结果。...平均值是通过取数值的总和并除以数据序列的值的数量来计算,函数mean()用于R中计算平均值,语法如下: mean(x, trim = 0, na.rm = FALSE, ...)...当我们提供trim参数时,向量的值进行排序,然后从计算平均值删除所需数量的观察值,例如,当trim = 0.3时,每一端的3个值将从计算删除以找到均值。...好啦,来综合看下实例: 输出结果为: 数据系列的中间值被称为中位数,R中使用median()函数来计算中位数,语法如下: median(x, na.rm = FALSE) 参数描述如下: x...R没有标准的内置函数来计算众数,因此,我们将创建一个用户自定义函数来计算R的数据集的众数。该函数将向量作为输入,并将众数值作为输出,来分别看下实例: 输出结果为: 好啦,本次记录就到这里了。

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使用 Pandas Python 绘制数据

这非常方便,你已将数据存储 Pandas DataFrame ,那么为什么不使用相同的库进行绘制呢? 本系列,我们将在每个库制作相同的多条形柱状图,以便我们可以比较它们的工作方式。...我们使用的数据是 1966 年至 2020 年的英国大选结果: image.png 自行绘制的数据 继续之前,请注意你可能需要调整 Python 环境来运行此代码,包括: 运行最新版本的 Python...本系列文章,我们已经看到了一些令人印象深刻的简单 API,但是 Pandas 一定能夺冠。...要在 x 轴上绘制按年份和每个党派分组的柱状图,我只需要这样做: import matplotlib.pyplot as plt ax = df.plot.bar(x='year') plt.show(...) 只有四行,这绝对是我们本系列创建的最棒的多条形柱状图。

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RR 的基本图形绘制

接下来示例,我们绘制一项探索类风湿性关节炎新疗法研究的结果。数据已经包含在随vcd包分发的Arthritis数据框。...(请确保使用前已经安装vcd包,使用命令install.packages("vcd")) 简单条形图 若height是一个向量,则它的值就确定了各条形图的高度,并将绘制一幅垂直的条形图。...关节研究,变量Improved记录了对每位接受了安慰剂或药物治疗的病人的治疗结果: > library(vcd) 载入需要的程辑包:grid > library(grid) > counts <-...par()函数能够让你对R的默认图形作出大量修改,这里只给出一个示例: par(mar=c(5, 8, 4, 2)) # 增加y边界大小 par(las=2) # 旋转条形的标签...mpg_dis_plot.png 点图 点图提供了一种简单水平刻度上绘制大量有标签值的方法。

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R-三维散点图绘制绘制

如果我们将气泡图的三维数据绘制到三维坐标系[1],通常称其为三维散点图,即用在三维X-Y-Z图上针对一个或多个数据序列绘出三个度量的一种图表。...有关散点图前几部分系列可见(可跳转): 趋势显示的二维散点图 分布显示的二维散点图 气泡图 R scatterplot3d包的scatterplot3d()函数、rgl包的plot3d()[2]函数、...加入第四个变量 上图可以看出三者之间的关系,但是如果要加入第四个变量(Petal.Width)该怎么绘制到三维散点图中? 方法一:可以将变量Petal.Width映射到数据点颜色。...参考资料 [1] R语言数据可视化之美: https://github.com/EasyChart/Beautiful-Visualization-with-R [2] plot3d(): http:/...: https://www.r-graph-gallery.com/3-r-animated-cube.html

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R 中使用 sf 和 ggplot2 绘制河流地图

本教程,我们将深入探讨重建此地图的具体细节。我们将使用全球河流分类 (GloRiC).GloRiC对世界野生动物基金会HydroSHEDS的全球河流网络进行监督分类,以全球层面创建河流覆盖类型。...后者SQL用户是众所周知的。在此上下文中,如果满足条件,它会根据宽度列分配一个值。 # 2....相反,包使用 s2 库的球面几何运算符。我们的例子,这会破坏代码,因为某些河流线具有无效的球形几何图形。 一个快速的解决方法是通过sf::sf_use_s2(FALSE)关闭此功能。...本教程,我们将使用世界等距圆柱投影来展平地图。因此,我们首先定义此投影,然后转换坐标。 # 3....本教程,您学习了如何导入河流空间文件以及如何在 R 制作欧洲的炫酷河流地图。随时检查完整代码这里,克隆存储库并根据需要重现、重用和修改代码。

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R语言绘制双标图

大家介绍一个可视化PCA的双标图(biplot),顾名思义也就是一个图中包含了的两个坐标系,其主要应用在物种分析。今天跟大家介绍下此图R语言中的绘制。...首先我们看下在R语言中实现双标图的绘制所需要的包ggbiplot和GGEBiplotGUI。...两个包各自有各自的优势,GGEBiplotGUI绘制的图形界面比较简化,但是包含多种绘制形式;ggbiplot借用了ggplot2的优势可以使得图像更加美化,但是呢,绘制形式比较单一。 ?...把各个方向上距离最远的点用直线连接起来,构成一个多边形,通过中心对每条边做垂线,将双标图分为几个扇区,品种扇区分布就构成了下图: 从上图我们可以看出:哪些品种在哪些地点表现好 ? 3....从上面的例子我们也可以看出,虽然此包包含了的很多样式的绘制,但是最为可以拿得出手的科研图来说,还是有点太过简单了,接下来我们看下一个更加美观的双标图的绘制包ggbiplot。

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