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全方位对比:Python、Julia、MATLAB、IDL 和 Java (2019 版)

测试用例分为四类: 循环和向量化 字符串操作 数值计算 输入 / 输出 每个测试都足够“简单”,可以任何一种语言快速编写,旨在解决以下问题: 非连续内存位置访问 递归函数使用 循环或向量化利用...海量文件打开 任意长度字符串操作 矩阵乘积 迭代求解使用 等等 源文件包含在以下目录中: 复制代码 C\ Fortran\ IDL\ Java\ Julia\ Matlab\ Python...该测试用例旨在测量语言访问连续内存位置速度,并查看每种语言如何处理循环和向量化。 表 CPA-1.0: Xeon 节点使用循环复制矩阵元素所用时间。...利用多核处理器使用 Python 处理 NetCDF 文件所用时间。...输入 / 输出: 虽然有些语言运行测试速度比其他语言快,但在本地 Mac 不是处理器节点运行测试的话,可以获得最大性能提升。因为处理器节点使用机械硬盘,而 Mac 是固态硬盘。

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GFN-xTB编译与API使用

同时,我发现低版本Intel编译器(13版)无法通过。必须去官网取得较新版本Intel编译器,学生用户可以带edu信箱申请免费版本。 meson是Python系一个程序构建软件。...到这里,我们可以开始编译了,按照Github介绍,执行如下代码: export FC=ifort CC=icc CXX=icpc meson setup build_intel --optimization...编译好可执行文件、库文件(libxtb.so,libxtb.a)build_intel目录下。 2. API使用 GFN-xTB 明确支持作为一个库连接在别的程序,作为一个计算引擎。...subroutine gfn2_calculation(iunit,env,opt,mol,gfn,pcem,wfn,hl_gap,energy,gradient) iunit: fortran 文件...编译时候,把libxtb.a拷到函数所在文件下,记住xtb库函数所在位置。

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xmake v2.3.8 发布, 新增 Intel C++Fortran 编译器支持

项目源码 官方文档 入门课程 新特性介绍 Intel C++ 编译器支持 这个版本,我们对 Intel 系列 C++ 编译器做了全平台支持,包括 windows icl 以及 linux/macOS...Fortran 编译器,也就是 ifort,我们也只需要切换到对应 ifort 工具链即可使用。...$ xmake f -p mingw -a arm64 $ xmake 另外,远程依赖包自动编译集成,现在带有 cmakelists 第三方库,即使是 mingw 平台,xmake 也能自动编译集成进来直接使用..."zlib~xxx") 模式使得能够支持同时安装带有多种配置同一个包,作为独立包存在 #977: 改进 find_mingw windows 探测 #978: 改进工具链flags顺序 改进...XCode工具链,支持macOS/arm64 Bugs修复 #951: 修复 emcc (WebAssembly) 工具链windows支持 #992: 修复文件锁偶尔打开失败问题

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Linux下安装Intel oneAPI

公众号安装教程里常说“Intel全家桶”指的是Intel Parallel Studio XE,里面集成了C/C++/Fortran语言编译器(分别是icc、icpc、ifort)、MKL数学库及各种高效调试工具...若有的读者不需要ifort编译器,可以直接安装Base Toolkit,本文介绍步骤也就用不上了。 若读者想卸载机子Parallel Studio XE,请勿直接rm -rf。...安装完后,个人用户需~/.bashrc文件里写环境变量,而root用户可以/etc/profile.d/目录下新建一个文件,例如intel_compiler.sh,在里面写环境变量: ....简单测试 作为测试,我们这里最新版Intel编译器编译一下量化软件GAMESS。编译和安装教程请阅读《GAMESS编译教程》。笔者实际测试时是2020-Sep-30(R2)版本GAMESS。...安装完后,gamess/目录下打开runall文件,将第一处si.msg.chem.iastate.edu改为本机名(若不知道本机名,命令行执行hostname可显示)。接着执行 .

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量化计算工具包parsec共享

代码可以含时密度泛函理论计算局部体系光学特性. 对于团簇, 可以进行从头分子动力学计算. 代码目前还不支持并行计算. 懂的人自然懂,不懂的人吗!*看星星一灿明。...我自然会讲一点你能听懂知识,过冷水从网上下载下来这个程序包,程序包使用很麻烦,对编程不是很精通根本无法成功启动该程序包,本着独乐乐不如众乐乐精神给有缘人分享一下正确使用该程序包方法。...parsec程序包是fortran语言基于Linux写Windows系统运行肯定是需要移植。...6.将原有的ifort编译器改成gfortran,因为intel编译器要钱,使用免费 修改前 ? 修改后 ?...大家在下载网上共享资源时,很多时候资源都是有缺陷或者是需要灵活处理灵活处理过程中就是掌握知识过程中,接下来很长一段时间,过冷时将会和大家一起学习如何将Error 转变成Success!。

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离线安装量子化学软件Dalton

本文主要介绍如何离线安装Dalton。 安装前提:cmake>=3.1。机子需装有C、C++和Fortran编译器,BLAS和LAPACK数学库。...笔者撰文时是cmake 3.21、Intel 2019 update 5(内含icc, icpc和ifort编译器和MKL数学库),这些前提都满足。...此处笔者编译不是MPI版本,而是利用了MKL库OpenMP版,适用于节点内并行,适合单个节点核数比较多情况。-j16表示16核并行编译,读者请根据自己机子实际情况修改。...若读者发表工作中使用了fch2dal,请记得引用MOKIT,引用格式程序目录下README.md文件中Citation部分有写。...(2)高斯算出-1381.35962681 a.u.通过肉眼观察fch文件轨道可以发现其对应电子组态3d84s1,但元素周期表明明是3d74s2,如何算出想要电子组态呢?

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结构方程模型 SEM 多元回归和模型诊断分析学生测试成绩数据与可视化

library(dplyr) #用于清理数据 library(Hmisc) #相关系数显着性 然后,我们将使用 Fortran 读入数据文件并稍微清理数据文件。...请注意,创建第一个相关矩阵使用选项“pairwise”,该选项对缺失数据执行成对删除。这通常是不可取,因为它删除了变量,而不是整个案例,因此可能会使参数估计产生偏差。...注意第二个图,如果残差是正态分布,我们会有一条平坦线而不是一条曲线。 使用多元回归来显示系数如何是残差函数 现在,让我们看看系数是如何作为残差函数。我们将从之前回归中构建 T1 系数。...plot(T1,T2, T4, 3d(model) #使用我们先前模型来绘制一个回归平面 使用相关矩阵多元回归 现在我们将展示如何使用相关矩阵进行回归。...如果你想对提供相关和/或协方差矩阵现有论文做额外分析,但你无法获得这些论文原始数据,那么这就非常有用。 #从你电脑文件中调入相关矩阵。

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自动做多参考态计算程序MOKIT

GVB和CASSCF精度上通常仅是定性正确,定量差强人意,若需要高精度结果或与实验值对比,需要进一步做多参考态(multi-reference)方法计算。...编译MOKIT需要Fortran编译器(默认ifort)和f2py编译器,运行时还需要一些基本python库。笔者推荐安装Intel编译器全家桶和Anaconda Python,省事。...若想使用gfortran编译器,请自行打开Makefile文件将前几行gfortran相关注释激活(去掉#号),并注释ifort相关语句。 在运行automr前我们还需修改GAMESS源代码。...但是支持mokit{}中写force关键词输出CASSCF解析梯度。用户也可以算完文件(手动)添加关键词做结构优化。 5....(4)automr程序输入文件无需人为指定活性空间,但使用发表文章时必须写出活性空间大小,及初始轨道如何得到。不讲明这些细节多参考态计算是没有意义

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GAMESS简易编译教程

最后编译完后会生成gamess.00.x可执行文件 (6)选择编译器,填ifort(这也是绝大多数人选择),然后按Enter确认。...如果没装Intel编译器,可以阅读《Linux下安装Intel oneAPI》 (7)填写ifort版本号,笔者是Intel 2019,因此写19;若读者安装是Intel oneAPI 2021,...make modules其实就是编译Fortran代码各种module,这些通常会被多个代码文件共享,因此最终多核并行编译前,需要先编译module。...如果要用DFT的话用户需要自己添加泛函名称,而此处我们是UHF,不需要修改自动生成文件。...这个例子展示了当我们GAMESS中碰到SCF不收敛时,除了去翻程序手册添加帮助收敛关键词外,还可直接fch2inp小程序从高斯fch文件传轨道给GAMESS。

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f2py:连接 FORTRAN 和 Python 桥梁

f2py 是用来连接 fortran 和 python python 包,可以将 fortran 源程序转换为 python 可用程序(windows下转换为*.pyd格式文件,linux下转换为...更为重要是,如果已经有了 fortran 程序,可以省下很多编写相应 python 程序时间。...关于其优点不再多说,安装部分不再赘述,主要说一下如何使用 Windows 如果直接使用 f2py 进行程序转换,很可能会出现问题。当然,如果你已经配置好环境了的话是没问题。...由于 f2py 使用需要用到 c/c++ 编译器,fortran 编译器,因此,使用之前要安装相应编译器。...当然在编写可转换 fortran 程序时很容易出错,下一次讲一下常见错误,以及如何看错误并解决之。

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第一门编程语言

但更令她吃惊是这里软件技术,她知道了一种叫 FORTRAN 东西,竟能用接近自然语言代码编写程序,能将数学公式直接写到代码里!它编程效率比机器码汇编不知高了多少倍。...别小看这点容量,当时上面要存操作系统(DOS)、编辑器(ED)、FORTRAN 编译器,编写代码也存放在这张软盘上。...作为程序员,编写一个带图形界面的程序才是一件炫酷事。为了满足 Windows程序开发,微软推出了 Visual Basic 语言,这门语言上手简单,通过拖拽控件就能完成用户界面设计。...所以我工作后使用第一门编程语言实际是 Visual Basic。 学习了一门编程语言,但从没派上实际用场,是不是白学了呢?...在后来工作中,我陆续学习过不下十门编程语言,基本都是随学随,查查手册、查查资料,就可以上手。 你第一门编程语言是什么?有什么特别的记忆?欢迎留言区讨论。

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CMake 秘籍(五)

本示例将展示如何使用ExternalProject达到相同效果。最后一个示例将介绍一个将在第 4 个示例中重复使用示例,即安装超级构建,第十章,编写安装程序。...过去,大多数科学软件都是 Fortran 编写,而现在,C、C++和解释型语言——尤其是 Python——正占据主导地位。...本章中,我们将展示如何将用不同编译型(C、C++和 Fortran)和解释型(Python)语言编写代码集成到一个可移植和跨平台解决方案中。...第三章配方 4,检测 BLAS 和 LAPACK 数学库,第三章,检测外部库和程序,展示了如何检测 Fortran 编写 BLAS 和 LAPACK 线性代数库,以及如何在 C++代码中使用它们...本食谱中,我们将专注于后一种例,并演示如何使用 CMake 帮助下 Cython 将 C/C++和 Python 接口。

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CMake 秘籍(二)

Linux 和 Windows ,它分别评估为"Linux"和"Windows"。现在我们知道,如果我们需要在特定操作系统执行特定 CMake 代码,该如何操作。... Windows 系统,你会看到Hello from Windows!;其他操作系统将产生不同输出。...本食谱中,我们任务将是链接到这些库,并展示如何无缝地使用用不同语言编写库,考虑到上述调用约定。...然而,编写一个完全全面的 find-module 远非易事;有许多难以发现边缘情况,我们寻找 Unix 和 Windows 平台上 ZeroMQ 库文件时展示了这样一个例子。...您可以项目网站上找到更多信息:mwoehlke.github.io/cps/ 第十章《编写安装程序》中,我们将讨论如何通过使用前述讨论中概述第一条路径,即在项目旁边提供自己 CMake 发现文件

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