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R语言从入门到精通:Day5

3.R缺失标记、重编码和排除 几乎所有项目中,都存在缺失,在R缺失NA代替(前面我们已经见过了)。R语言提供了一个简单而重要函数is.na()来监测数据集中缺失。...下面是该函数一个使用实例。 ? 图6:使用is.na()函数 数据集leadership缺失NA位置都被标记上了TRUE。...或者,等我们后续课程专门讲解缺失插补操作。如果你数据只是存在很小一部分缺失,直接删除这些麻烦缺失是一个理想选择。R语言中提供了函数na.omit()来删除带有缺失(如图7)。...图7:函数na.omit()使用。 在R语言中很多数值函数都有一个na.rm=TRUE可选参数,比如函数sum()。这个参数可以在计算之前就移除缺失并使用剩余值计算(如图8)。 ?...如果要在数据添加行(或者理解为两个数据纵向合并),使用函数rbind(),要求两个数据有相同变量,不过顺序不必要相同。一般用于向数据添加新观测。

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python数据处理 tips

df.head()显示数据前5,使用此函数可以快速浏览数据集。 删除未使用列 根据我们样本,有一个无效/空Unnamed:13列我们不需要。我们可以使用下面的函数删除它。...inplace=True直接对数据本身执行操作,默认情况下,它将创建另一个副本,你必须再次将其分配给数据,如df = df.drop(columns="Unnamed: 13")。...first:除第一次出现外,重复项标记为True。 last:重复项标记为True,但最后一次出现情况除外。 False:所有副本标记为True。...()-,na换为null。...解决方案1:删除样本()/特征(列) 如果我们确信丢失数据是无用,或者丢失数据只是数据一小部分,那么我们可以删除包含丢失。 在统计学,这种方法称为删除,它是一种处理缺失数据方法。

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ggplot2--R语言宏基因组学统计分析(第四章)笔记

数据独立于其他组件,可以应用多个数据集 映射:映射目的是数据属性(通常是数字或分类)转换为几何或视觉属性;它用于指定几何属性变量(例如,x位置、y位置、颜色、形状、大小等) Stat:转换数据,...ggplot2第二个显著特性是它使用数据,而不是单独向量。因此,在使用该包创建绘图之前,如果数据是矢量,则需要将数据换为数据。...提供给gglot()本身或提供给各个geom以创建绘图所有数据都包含在数据。...公式可以是x~y,这表示绘图分割成变量x每个和变量y每个一列。实现facet_grid(x~y)函数生成一个矩阵,其中和列由x和y可能组合组成。公式可以是x~....~y+z))对两个变量执行刻面,两个变量都按列显示,绘图基于一个变量与另一个变量级别并排显示。这种可视化使得两个分类变量比较非常有效。

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Pandas Sort:你 Python 数据排序指南

和列都有索引,它是数据在 DataFrame 位置数字表示。您可以使用 DataFrame 索引位置从特定或列检索数据。默认情况下,索引号从零开始。您也可以手动分配自己索引。...如果您对缺失数据列进行排序,那么具有缺失行将出现在 DataFrame 末尾。无论您是按升序还是降序排序,都会发生这种情况。...Automatic 4-spd 1993 NaN [100 rows x 11 columns] 要改变这种行为,并有丢失数据第一次出现在数据,可以设置na_position到first...当您第一次开始分析数据并且不确定是否存在缺失时,这非常有用。 了解na_position参数.sort_index() .sort_index()也接受na_position。...默认情况下,此参数设置为last,NaN放置在排序结果末尾。要改变这种行为,并在你数据先有丢失数据,设置na_position到first。

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python对100G以上数据进行排序,都有什么好方法呢

和列都有索引,它是数据在 DataFrame 位置数字表示。您可以使用 DataFrame 索引位置从特定或列检索数据。默认情况下,索引号从零开始。您也可以手动分配自己索引。...如果您对缺失数据列进行排序,那么具有缺失行将出现在 DataFrame 末尾。无论您是按升序还是降序排序,都会发生这种情况。...Automatic 4-spd 1993 NaN [100 rows x 11 columns] 要改变这种行为,并有丢失数据第一次出现在数据,可以设置na_position到first...当您第一次开始分析数据并且不确定是否存在缺失时,这非常有用。 了解na_position参数.sort_index() .sort_index()也接受na_position。...默认情况下,此参数设置为last,NaN放置在排序结果末尾。要改变这种行为,并在你数据先有丢失数据,设置na_position到first。

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基础知识 | R语言数据管理之缺失

R语言数据管理之缺失 在做任何数据分析第一步,是根据个人需求创建数据集,存储数据结构是多样,包括向量,矩阵、数据、因子以及列表等。...最近在处理一波量大数据,在运行程序过程,因为前期数据处理错误却出现各种bug,经过检查数据集发现是数据管理问题,为了巩固R语言基本数据管理,特地重新基础知识。...[1] 327 04 编码某些数值为缺失 编码某些数值为缺失是很有必要,在数据处理过程,能够通过na.omit()函数删除某个所在。...data_province2就是通过给data_province1Hubei赋值为缺失,而后用na.rm()移除缺失所得。...,学R初心就是为了绘制实验过程产生数据图,然而随着深度学习,会发现,R语言数据分析也很重要,常常会在绘制图形过程,因为数据存在格式不统一,字符或者缺失等原因导致绘图失败。

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R语言新神器visdat包(一代码看穿整个数据集)

这是一个非常简单,功能却非常强大包 介绍 (1)visdat目的是 vis_dat通过数据变量类显示为绘图,并使用vis_miss简要查看缺失数据,帮助数据可视化。...vis_compare()可视化相同维度两个数据之间差异 vis_expect()可视化数据满足某些条件成立数据 vis_cor()在一个漂亮热图中可视化变量相关性 vis_guess...如果数据不含有任何缺失数据: vis_miss(mtcars) ? (3) vis_compare()对比数据差异 vis_compare()可以显示两个相同大小数据差异。...(6)vis_guess()函数 用来猜测数据每个单元格是什么类型数据。...当在超过1000数据上使用它时,请考虑这一点。

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R In Action |基本数据管理

4.3 变量重编码 1)连续变量修改为一组类别; 2)误编码替换为正确; 3)基于一组条件进行逻辑判断变量; 4)逻辑运算: != 不等于; == 严格等于(慎用); !...1)leadership$age[leadership$age == 99] <- NA within()可以认为是数据版本with(),每一都设置为缺失,然后按条件赋值(字符型变量,还不是有序因子...4.5 缺失 R字符型缺失与数值型数据使用缺失符号是相同。缺失以符号NA(Not Available,不可用)表示。...[leadership$age == 99] <- NA 需要在分析之前所有的缺失数据正确标记为缺失,才能不影响分析过程。...sum(leadership$q5, na.rm=TRUE) 4.5.4 函数na.omit()可以移除所有含有缺失观测()。

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数据分析 R语言实战】学习笔记 第三章 数据预处理 (下)

3.3缺失处理 R缺失NA表示,判断数据是否存在缺失函数有两个,最基本函数是is.na()它可以应用于向量、数据等多种对象,返回逻辑。...(salary)) [1] 4 另一个判断缺失函数是complete.cases(),它同样返回逻辑向量,但与is.na()相反:缺失为FALSE,正常数据为TRUE,利用它来选取无缺失数据非常方便...最后一表示各个变量缺失样本数合计。 程序包VIM提供了在R探索数据缺失情况新工具,实现缺失模式可视化 > library(VIM) > aggr(data) ?...by指定合并依据(相同或列) by.x by.y分别为第一个数据和第二个数据要连接列名 all, all.x, all.y逻辑,默认为FALSE。...,其每个水平行在新数据集中成为一列,从而把长格式数据换为短格式。

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Python探索性数据分析,这样才容易掌握

每个 CSV 文件转换为 Pandas 数据对象如下图所示: ? 检查数据 & 清理脏数据 在进行探索性分析时,了解您所研究数据是很重要。幸运是,数据对象有许多有用属性,这使得这很容易。...当基于多个数据集之间比较数据时,标准做法是使用(.shape)属性检查每个数据行数和列数。如图所示: ? 注意:左边是行数,右边是列数;(、列)。...请注意:“Maine” 在 2018 年 ACT 数据中出现了两次。下一步是确定这些是重复还是数据输入不正确引起。我们将使用一种脱敏技术来实现这一点,它允许我们检查满足指定条件数据。...我方法如下图展示: ? 函数 compare_values() 从两个不同数据获取一列,临时存储这些,并显示仅出现在其中一个数据集中任何。...这种类型转换第一步是从每个 ’Participation’ 列删除 “%” 字符,以便将它们转换为浮点数。下一步将把除每个数据 “State” 列之外所有数据换为浮点数。

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R 数据整理(三:缺失NA 处理方法汇总)

> is.na(c(1,2,3,NA,'sdas')) [1] FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE # 我们可以直接用which 获取TRUE 所在index 但是,这个函数并不能很好使用在数据...其会返回一个矩阵,对应缺失会在对应位置返回一个TRUE,如果这时候通过which 获取,其只会返回一个坐标,这是因为数据经过is.na 后返回一个矩阵,而矩阵坐标关系和向量又非常微妙,其本质也就是向量不同排列...我们都知道,布尔实际就是0和1,我们可以利用这个特性,获得那些经过is.na 后,和不是0 ,那就代表其存在表示TRUE(NA数据了: > rcmat[!...(X$X1)),] X1 X2 1 A 1 2 B NA 3 C 3 4 D 4 5 E 5 replace_na() 这个函数我很喜欢,可以指定列NA换为指定数值:..."A" "B" "C" "D" "E" "0" > replace_na(X$X2,6) [1] 1 6 3 4 5 6 fill() 不同于drop_na 直接暴力删除,fill 非常贴心缺失换为其所在列上一数值

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【生信技能树培训笔记】R语言基础(20230112更新)

(m) #矩阵转换成数据数据结构 a b c1 1 4 72 2 5 83 3 6 9重点:数据或举证转置之后,其数据结构都是矩阵。...重点与Tips:数据按照逻辑取子集,TRUE对应/列留下,FALSE对应/列丢掉。用于取子集逻辑向量,与原集对应即可,不必一定由原集生成。...:描述:两个数据按照共同列或名称进行合并。...默认all=FALSE,表示只取共同列或相同内容进行合并,当指定all=TRUE时,取两个数据中指定行列并集进行合并,任一表缺失,则用NA填充。...> NA5 tony group2 4.5也可分别指定按照哪个数据数据为标准进行取值(即指定数据数全部取,另一数据数据取与之交集。)

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干货:用Python加载数据5种不同方式,收藏!

现在,在手动检查了csv之后,我知道列名在第一,因此在我第一次迭代,我必须将第一数据存储在 col, 并将其余存储在 data。...为了检查第一次迭代,我使用了一个名为checkcol 布尔变量, 它为False,并且在第一次迭代为false时,它将第一数据存储在 col ,然后checkcol 设置 为True,因此我们处理...数据列表并将其余值存储在 数据列表。...由于数据量很大,我们仅打印了前5。 利弊 使用此功能一个重要方面是您可以文件数据快速加载到numpy数组。 缺点是您不能有其他数据类型或数据缺少。 3....只需添加另一个 dtype 参数并将dtype 设置 为None即可,这意味着它必须照顾每一列本身数据类型。不将整个数据换为单个dtype。 ? 然后输出 ? ?

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教你几招R语言中聚合操作

在R语言中提供了几种实现数据聚合常用函数,它们分别是基于stats包aggregate函数、基于sqldf包sqldf函数以及基于dplyr包group_by函数和summarize函数。...数值聚合 aggregate(formula, data, FUN, ..., subset, na.action = na.omit) x:指定待分组聚合数值型数据,可以是向量也可以是数据...variable3作聚合统计; data:指定需要分组统计数据或列表; subset:通过可选向量指定data数据子集用于分组聚合; na.action:指定缺失处理办法,默认为删除缺失;...(file = file.choose()) # 字符型订单日期Order_Date转换为日期型 sales$Order_Date <- ymd(sales$Order_Date) # 统计历史数据每天交易额...,是否字符型变量转换为因子型变量,默认为FALSE; row.names:bool类型参数,是否保留数据名称,默认为FALSE; dbname:如果数据源来自于MySQL等数据库,该参数用于指定数据集所对应数据库名称

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R语言之 dplyr 包

1.使用 filter( ) 和 slice( ) 筛选 函数 filter() 可以基于观测筛选数据一个子集。第一个参数是数据名,第二个参数以及随后参数是用来筛选数据表达式。...下面的命令数据按照变量 bwt 从小到大进行排序后显示: arrange(birthwt, bwt) # 默认升序 在上面的输出,第 6 和第 7 变量 bwt 都是 1588,在这种情况下如果还想将数据按照第二个变量排序...例如,下面的命令数据按照变量 bwt 从小到大排序,在 bwt 取值相等情况下再按照第二个变量 age 从小到大排序。...我们可以用函数 as_tibble( ) 传统数据换为 tibble,也可以用函数 as.data.frame( ) tibble 转换成传统数据。..., NA, wt), # 变量wt0和大于99变成NA ht = ifelse(ht == 0 | ht > 300, NA, ht) # 变量ht0和大于300变成

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十、文件读写

./ 表示上一级文件夹,按tab键import就会出现,再按tab就能找到gene.csv文件 # 工作目录隔壁(上一级(桌面)另一个下级文件夹import)gene.csv 2.文件导出 数据导出...导出为csv write.csv(soft,file = "soft.csv") ###右上角环境刚好出现了一个soft.csv文件,并且刚好与数据soft内容一样, 6).soft保存为...save(soft,file = "soft.Rdata") ###load结果是让Rdata变量出现在环境 rm(list = ls()) ###上一步刚把文件保存,soft.Rdata...mean(y[,1]) [1] NA Warning message:In mean.default(y[, 1]) : 参数不是数值也不是逻辑:回覆NA y[,1] GSM1 GSM2..."49" [1] NA Warning message:In mean.default(y[, 1]) : 参数不是数值也不是逻辑:回覆NA ###转换不成功,y是矩阵,字符型矩阵。

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R 数据整理(七:使用tidyr和dplyr处理数据 2.0)

,后续参数是条件,这些条件是需要同时满足,另外,条件取 缺失观测自动放弃,这一点与直接在数据下标中用逻辑下标有所不同,逻辑下标中有缺失会在结果 产生缺失。...dplyr 包 distinct() 函数可以对数据指定若干变 量,然后筛选出所有不同,每组不同仅保留一。...2.4 drop_na 效果和na.omit 一样,但是高级之处在于,其可以指定列,对数据某列存在NA 直接删除: > library(tidyr) > drop_na(X,X1) X1 X2...nest 与unnest 对于数据,我们可以使用split 数据按某列拆分为多个数据,并储存在列表。...nest 和 unnest 函数,可以数据保存在 tibble ,可以保存在 tibble 数据合并为一个大数据

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Github项目推荐 | visdat - 数据初步探索性可视化工具

vis_dat最初受到csv-fingerprint启发,通过使用vis_dat数据变量类显示为带有vis_dat绘图,并使用vis_miss简要查看丢失数据模式,vis_dat帮助你可视化数据并...visdat 六大特点如下: vis_dat()数据可视化,显示列类别,并显示缺少数据。 vis_miss()只显示缺失数据,并允许对缺失进行聚类并重新排列列。...vis_miss()类似于mi包missing.pattern.plot。 然而不幸是,missing.pattern.plot已经不再出现在mi包(截至2016年2月14日)。...vis_compare()将相同维度两个数据之间差异可视化 vis_expect()数据某些条件成立位置可视化 vis_cor()在一个漂亮热图中对变量相关性可视化 vis_guess(...)数据各个类earch可视化 你可以在“using visdat”小节查看更多关于visdat信息。

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R语言函数含义与用法,实现过程解读

数据(data frame): 是一种与矩阵相似的结构,其中列可以是不同数据类型。可以把数据看作一种数据"矩阵",它每行是一个观测单位,而且(可能)同时包含数值型和分类变量。...强制转换为向量:as.vector(),或者直接c(). 解线性方程和求矩阵逆,奇异分解与行列式见; 六  列表和数据 6.1 列表 列表是由称作组件有序对象集合构成对象。...逻辑和因子在数据中保持不变,字符向量将被强制转化为因子,其水平是字符向量中所出现; 4 数据作为变量向量结构必须具有相同长度,而矩阵结构应当具有相同大小。...数据使用惯例 1 每个独立,适当定义问题所包含所有变量收入同一个数据,并赋予合适、易理解、易辨识名称; 2 处理问题时,当相应数据挂接于位置2,同时在第1层工作目录下存放操作数值和临时变量...此时文件要符合特定格式: 1 第一应当提供数据每个变量名称; 2 每一(除变量名称)应包含一个标号和各变量

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