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基于TF-IDF和KNN模糊字符匹配优化

当涉及模糊字符匹配时通常采用FuzzyWuzzy。FuzzyWuzzy库基于Levenshtein距离方法,广泛用于计算字符相似度(距离)分数。但为什么不应该使用它呢?答案很简单:太慢了。...原因是将每个记录与数据所有其他记录进行比较。随着数据大小增加,执行模糊字符匹配所需时间将成倍增加。这种现象被称为二次时间复杂度。...二次时间复杂度表示一种算法,其性能与输入数据平方大小成正比 TF-IDF then KNN TF-IDF思想是,它将是数据文档表示形式,而最匹配候选对象选择是使用KNN(K Nearest Neighbor...#Example RoomType 示例1是英文,基于RoomType Kaggle数据数据如下。...实际中文模糊字符匹配还要进一步工作: 分为标准对象级,比如国内全部机场名称列表。

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数据结构与算法(九)——字符匹配算法

它是一种比较简单字符匹配算法,也正是因为其简单易用性,所以该算法也是在日常开发中最常见字符匹配算法。...,然后继续比较后续字符; ② 若不相等,指针后退重新开始匹配,从主下一个字符(i = i - j + 2)起再重新和模式第一个字符(j = 1)比较; (3)上述遍历匹配完了之后,如果j > matchString.length.../ 原始字符回退到开始遍历位置下一个位置 j = 1; // 模式匹配字符回退到初始位置 } } // 判断是否匹配成功 if (j > matchLength)...实际上,S[i+1]是上一个S[i]去掉最高位数据之后其余m-1位字符乘以26进制再加上最后一个字符得到。...= 4时候发现不匹配,那么此时主索引i是不需要回退,模式索引j需要回退到next[j]位置。

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数据结构- 模式匹配算法:BF和 KMP算法

2) 依此类推,直至t 中每个字符依次和s一个连续字符序列相等,则称模式匹配成功,此时t第一个字符在s 中位置就是t 在s中位置,否则模式匹配不成功。...即尽量利用已经部分匹配结果信息,尽量让i不要回溯,加快模式滑动速度。 需要讨论两个问题: ①如何由当前部分匹配结果确定模式向右滑动新比较起点k?...next[n] k值仅取决于模式本身而与相匹配无关。...P(j)’ 此时可把next函数值问题看成是一个模式匹配问题,整个模式即是主又是模式, 而当前匹配过程中,已有: Pj-k+1 = P1, Pj-k+2...注意: (1)k值仅取决于模式本身而与相匹配无关。 (2)k值为模式从头向后及从j向前两部分最大相同子长度。 (3)这里两部分子可以有部分重叠字符,但不可以全部重叠。

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java数据结构之字符模式匹配算法

java中String提供了很多字符处理方法其中就包括子匹配。 今天就来介绍一下字符匹配算法。...分为两种:一种为朴素模式匹配算法(简称BF算法),改进模式匹配算法(简称KMP算法)。 下面首先来介绍一下BF算法中心思想: 这是一种带有回溯匹配算法,简称BF算法。...实现过程是从主S第一个字符开始和模式T第一个字符开始比较,若相等则继续比较二者后续字符;否则从主第二个字符开始和模式T第一个字符进行比较,重复上述过程,直至S或者T中所有的字符比较完毕。...BF算法实现(): package string; public class StringModel { public int BF(char S[],char T[]){//BF字符匹配算法...O(m+n),最坏情况下时间复杂度为O(m*n); KMP算法时间复杂度为O(m+n)。

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. | 基于匹配分子对分析先导物成药性优化专家系统OptADMET

基于此,作者提出了一个基于匹配分子分子优化指南,并构建了一个高质量、全面的公共化学转化平台(https://cadd.nscc-tj.cn/deploy/optadmet/)。...基于这个庞大而可靠规则数据库,OptADMET能够识别出理想子结构转化规则并高效地指导任何查询分子多参数优化。...OptADMET相较于其他现有方法具有明显优势,因为它是来自基于实验数据匹配分子对分析(MMPA),这为指导结构修饰提供更可靠指导。...(2)生成分子结果:计算完成后,OptADMET展示所有匹配项及相关统计。界面显示原始分子信息、生成分子分布图、属性区间统计表等,并且提供PDF报告和详细信息选项。...该案例研究使用OptADMET平台,通过输入先导化合物SMILES和选择‘[Toxicity]hERG’属性,在计算过程中匹配了45个转化规则,生成了200多个分子

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05.记录合并&字段合并&字段匹配1.记录合并2.字段合并3.字段匹配3.1 默认只保留连接上部分3.2 使用左连接3.3 使用右连接3.4 保留左右表所有数据

1.记录合并 将两个结构相同数据合并成一个数据框。 函数concat([dataFrame1, dataFrame2, ...]) ?...屏幕快照 2018-07-02 21.47.59.png 2.字段合并 将同一个数据框中不同列合并成新列。 方法x = x1 + x2 + x3 + ...合并数据以序列形式返回。...df = df.astype(str) #合并成新列 tel = df['band'] + df['area'] + df['num'] #将tel添加到df数据tel列 df['tel']...函数merge(x, y, left_on, right_on) 需要匹配数据列,应使用用一种数据类型。...返回值:DataFrame 参数 注释 x 第一个数据框 y 第二个数据框 left_on 第一个数据框用于匹配列 right_on 第二个数据框用于匹配列 import pandas items

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Briefings in Bioinformatics | 基于SMILES药物分子表征深度模型和数据增强策略研究

作者利用深度模型,从分子SMILES表示中学习面向分子性质预测特征,从模型以及数据两个方面提出优化策略以提高预测能力。...实验结果表明,文章所提出方法能够显著提升模型预测性能,使得基于SMILES表征分子性质预测模型在11个常用评测集合上(包括分类和回归两类任务)达到或超过SOTA水平。...然而对于特定分子性质,设计或选择合适指纹/描述符,需要一定知识以及实验积累。而且大多数基于特征工程分子表征都针对特定任务进行了优化,缺乏通用性。...分子SMILES表征作以简便方式编码分子所有组成和结构信息,被广泛应用于化学信息学中分子结构存储。然而由于高昂获取成本,目前生物活性相关数据标注十分稀缺。...这极大限制了基于SMILES深度神经网络模型学习与预测能力,导致基于SMILES模型无法达到传统模型以及基于分子模型效果。

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我问你这篇保熟不?! -- 做服务端开发,不懂网络层,真的可以吗?

也就是说,在这个中,主要包括目的MAC地址(对应路由器接口MAC地址)、源MAC地址(主机甲MAC地址)、以太网类型字段、数据包、校验序列五分内容。...这五个步骤执行完毕之后,IP路由选择过过程前期工作就算完成了。下面才是网际协议IP路由选择步骤。 第六步:在主机甲所在冲突域中每台网络设备都将接收这些位并重新合并数据。...如果目的方硬件地址也是匹配,那么路由器将会查看这个以太网类型字段,以了解在网络层上采用了什么协议,然后路由器就会抽出数据包,把其余部分内容丢弃。...后来我学聪明了,我把手上钱做了一下分组,一分钱用来生活开支,一分钱用来改善生活,提升自我,一分钱用来谈恋爱,一分钱用来储蓄,这几部分各不相干,哪天要是生活开支钱花完了,那就吃土呗,也不去动其他部分钱...(address mask),地址编码是一1和10组成,而1个数就是网络前缀长度。

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. | 由数据和知识驱动基于结构分子生成模型

此外,许多蛋白质只有很少或没有已知配体分子,对于这些蛋白,基于配体DGMs不能用来生成分子。在蛋白质结合口袋内生成新配体分子基于结构DGMs有望克服基于配体方法缺点,并且越来越受到关注。...尽管基于结构深度生成模型(DGMs)可以基于蛋白质口袋条件生成新分子结构,但仍存在许多挑战性问题,总结如下。首先,由已知实验蛋白质-配体复合结构组成现有数据集较小,不足以训练生成模型。...其次,当前基于结构DGMs仍然是一种数据驱动方法;越来越多观点认为,将领域知识或规则引入深度学习模型可以有效解决数据不足、鲁棒性差和可解释性差问题。...受到上述挑战启发,作者提出了一个由数据和化学知识驱动基于结构分子生成框架,命名为PocketFlow。...为了比较目的作者还计算了CrossDocked2020数据分子属性,该数据集包含约13,000个真实、类药物分子配体与蛋白质口袋结合。

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算法数据结构 | 只要30行代码,实现快速匹配字符KMP算法

所以早期时候字符匹配是一个难题,既然是难题那么显然就会有很多人来研究,也因此出了很多成果,很多大牛发表了字符匹配算法,其中KMP算法由于效率很高、实现复杂度低被应用得最广。...到这里,我们就知道KMP算法是用来字符匹配。 比方说我们有两个字符,A是:I hate learning English. B是hate learning,很明显B是A字符。...上图中上面的是A,下面的是B,我们在匹配过程当中发现B前面几位都匹配上了,而在最后一位匹配失败。按照常规做法,我们应该是移动到下一个位置从头开始匹配。...但是这是非常浪费,因为我们观察下可以发现失败位置ABC和B开头ABC是可以构成匹配。 ?...我们之前失败时候判断是以C结尾ABCDABC和B匹配,在这一次匹配失败之后,我们可以继续尝试匹配其他以C结尾前缀,比如ABC。这样我们就可以从中间状态开始,而节省了许多次不必要枚举。

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数据场景下基于php实现压缩字符方法

在大数据驱使下,数据量越来越多,以内容为王时代更是让数据表越大越膨胀,导致读取数据表时返回数据变慢,访问内容页速度也相应变慢。如果能在保持内容不变,对内容进行压缩无疑也是一种网站优化。...倘若每条内容长度都被压缩到之前百倍千倍之后,整体数据表就减少了几G、几十G存储,读取数据时返回数据速度也会提升。以下分享php压缩数据方法,希望给需要人带来帮助。.../** * 判断字符是否base64编码 */ function func_is_base64($str) { return $str == base64_encode(base64_...func_is_base64($str)) { return gzuncompress(base64_decode($str)); } return $str; } 压缩方法除了

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Bioinformatics|MolFeSCue:基于小样本对比学习增强有限和不平衡数据分子性质预测

MolFeSCue主干是由大规模预训练模型构成。该体系结构提供了一个灵活基础,可适应各种预训练范例,包括但不限于基于序列模型和基于模型。...首先,使用RDKit将分子结构转换为分子图,输入基于图神经网络模型进行处理。随后,它们可能会使用更小、特定于任务标记数据集进行微调,以使它们能力适应特定任务。...MolFeSCue结合基于序列和基于预训练模型,因为它们在捕获潜在分子模式方面具有独特和互补优势。基于序列预训练分子模型类似于NLP中基于Transformer模型。...它们有效地捕获了分子数据中固有的序列特征。MolFeSCue集成了预训练分子模型ChemBERTa,以利用基准数据集中顺序模式。...ChemBERTa基于Transformer架构专门设计用来表示SMILES编码字符分子基于模型擅长于破译分子拓扑结构和内在性质。

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VLookup及Power Query合并查询等方法在大量多列数据匹配效率对比及改善思路

那么,在数据量较大,需要批量进行数据匹配查找情况下,是否有办法进行适当改善,以提高数据匹配查找效率呢?...以下用一个例子,分别对比了四种常用数据匹配查找方法,并在借鉴PowerQuery合并查询思路基础上,提出一个简单公式改进思路,供大家参考。...: 4、Power Query合并查询,按常规表间合并操作如下图所示: 五、4种方法数据匹配查找方法用时对比 经过分别对以上4中方法单独执行多列同时填充(Power Query数据合并法单独执行数据刷新...在思考这些问题时候,我突然想到,Power Query进行合并查询步骤,其实是分两步: 第一步:先进行数据匹配 第二步:按需要进行数据展开 也就是说,只需要匹配查找一次,其它需要展开数据都跟着这一次匹配而直接得到...七、结论 在批量性匹配查找多列数据情况下,通过对Index和Match函数分解使用,先单独获取所需要匹配数据位置信息,然后再根据位置信息提取所需多列数据,效率明显提升,所需匹配提取列数越多,

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Nat Commun|基于图神经网络迁移学习在多保真度数据分子性质预测

为了增强从预训练任务中有效学习分子表示性能,作者提出了一种基于神经网络分子图自适应读出方法。结果表明,所提出方法优于现有的迁移学习策略。...图1 基于图神经网络多保真度数据迁移学习结构图 图神经网络中标准读出函数(即求和、求平均和求最大值)没有任何参数,因此不适合于迁移学习。...结果 作者将基于图神经网络多保真度数据迁移学习与一些具有代表性方法进行了比较。...基于分子表示迁移学习因其高效和广泛适用性而备受关注,未来,可探索将更多分子表示学习模型应用于上述迁移学习框架,例如可以提供不确定性估计高斯过程模型等。...而基于变分图自编码器架构在分子生成任务中广泛应用,本文提出图神经网络迁移学习框架不仅可用于分子性质预测,也有潜力用于分子生成。

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Methods | 利用深度学习进行基于生物物理学和数据驱动分子机制建模

图2可微编程融合了基于原理和数据驱动建模 数据先验 生物学中大多数建模涉及对不完整、有噪声、异构数据分析。...,这些方程可以合并到可微程序中。...蛋白质结构预测 蛋白质结构预测目标是构建将蛋白质序列(离散符号可变长度字符)映射到蛋白质三级结构(三维坐标的可变长度序列)模型。最近基于ML方法利用了机械(生物物理)先验和模式识别。...更好方法是将局部扭转角转换为三维蛋白质坐标,作为建模过程分,使用能够最大化蛋白质数据库中预测坐标和已知坐标之间一致性参数。...设计一个定制损失函数,还可以实现对蛋白质结构数据进行更复杂处理,因为蛋白质结构数据经常会丢失(无序)侧链原子和序列延伸,这是因为非结构域是蛋白质功能分。

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RSLO:自监督激光雷达里程计(实时+高精度,ICRA2022)

,但是激光雷达由于自身数据稀疏性和信噪比问题会给运动估计鲁棒性带来比较大挑战,如下图,即使是两相邻激光雷达点云,也会由于动态物体和错位带来一个误匹配,这种误匹配对于激光雷达里程计是非常致命...基于建图模块和更多训练数据,所提出系统甚至可以实时高效地与有监督方法竞争。...,必然不是绝对港行,为了缓解这种困境,可以将激光雷达扫描视为一系列子区域,并假设只有一分子区域对应于具有良好测量条件静态对象从而可以满足绝对刚性假设。...L是之前投票环节预测分数。 3.不确定性感知建图 激光雷达点云噪声和稀疏特性限制了基于里程计精度。传统方法通过累积之前扫描来建图场景,并通过扫描到地图匹配进一步优化自我运动估计。...但是非刚性部分和噪声测量会导致之间不一致,现实生活中这是普遍存在,所以传统方法并不总是可靠。所以可以将上述基于学习点协方差估计和发现代表性结构提供先验信息合并到建图模块中来解决这个问题。

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J Cheminform|DeepGraphMolGen:一种多目标的计算策略,图卷积和强化学习方法,用于生成具有理想性质分子

相反,近年来最先进方法,包括功能树变分自动编码机和图卷积策略网络等,使用分子图形表示而不是SMILES字符,并在分子生成中获得了100%有效性。基于图形方法具有相当大效用。...对于分子生成,作者使用强化学习来完成这项任务,因为它允许作者使用奖励函数来合并分子约束和期望性质。...数据集中具有较大Ki值分子未被正确标记(使用~1000等标记),但是使用鲁棒损失函数则可以直接合并这些值。...显然,可以使用任何其他权重作为奖励函数分,因此选择权重只是说明性。对于本实验,作者用多巴胺数据随机分子初始化过程,该多巴胺数据原子数低于25,TE专家数据集为ZINC。 ? 图6....目前基于分子生成方法比基于文本编码有许多优点,特别是它必然产生有效分子。正如Coley和其同事强调那样,这种方法仍然保留了2D方法任何固有限制,因为它们不编码3D信息。

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. | 探索稀疏化学空间化学语言模型新策略

编译| 赖乐珊 审稿| 李芬 今天给大家介绍来自不列颠哥伦比亚大学和阿尔伯塔大学联合发表一篇文章。该文章系统地评估并优化了基于循环神经网络在低数据环境中分子生成模型。...1 介绍 目前人类已经探索出了大量分子,即便如此,这些分子在广阔化学空间中也仅仅占一小分,就目前医学实践与无限可能性来说,更有效化学空间导航(分子发现)方法或能帮助解决人类面临各种紧迫挑战。...基于 RNN (图 1b) SMILES 字符模型表现较优,本文将其称为化学语言模型( CLM)。 CLM因为其“逆向设计”(生成需要特性分子可行性引起了人们兴趣。...此外,整合多个指标后在数据集超过100万个分子后模型性能继续提高,说明CLM 首先学会产生有效 SMILES,然后才学会匹配目标分子结构和物理化学特性。...自引用嵌入字符 (SELFIES) 是基于 Chomsky type-2 语法完全不同表示,其中每个 SELFIES 字符指定一个有效化学图 。

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将截断字符或二进制数据是什么意思_截取字符

今天做数据库练习时候,往一个student表中在新建查询中用T-Sql语句插入一条记录。...insert into student values (‘090120′,’陈冬’,’男’,19,’信息系’,’1234567′) 系统老显示:将截断字符或二进制数据,语句已结束。...…………………… 原因:找到student表,查看表数据类型,才知道在定义ssex时,把ssex数据类型定义为:char(1)。而‘男’这个字符要占用2个字节。故所输入字符过长。...解决方法:把student表中ssex数据类型改为:char(2)。 成功! 版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。...如发现本站有涉嫌侵权/违法违规内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除。

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