目录 ⊙第一章：关于课程 ⊙第二章：单细胞RNA-seq简介 正文 处理原始scRNA-seq数据 3.1 FastQC 获得单细胞RNA-seq数据后，首先要做的就是检查已测序的读数的质量...对于此任务，今天我们将使用名为FastQC的工具。FastQC是一种用于测序数据的质量控制工具，可用于bulk和单细胞RNA-seq数据。FastQC将测序数据作为输入，并返回有关读取质量的报告。...幸运的是，我们今天已经为您安装了FastQC，因此我们将查看文档。将网页向下滚动到“示例报告”，然后单击“良好的Illumina数据”。...这给出了一个对于高质量Illumina的reads数据来说，理想的报告应该是什么样的例子。 现在让我们自己制作一份FastQC报告。...鉴于我们注意到FastQC报告中存在一些adapters污染，最好从我们的数据中trim掉adapters。 任务2：我们的数据中使用了哪种类型的adapters？
导读 我多次在学徒作业强调了 3大基因芯片产商里面，就Agilent公司的芯片比较难搞，比如Agilent芯片表达矩阵处理(学徒作业) 以及 oligo包可以处理agilent芯片吗，这个作业难度非常高...，不过我们生信技能树优秀讲师：小洁在繁重的授课压力下抽空整理了相关数据处理经验分享给大家，下面看她的表演： 本文讲的是aglient芯片原始数据的处理，参考资料是limma 的userguide文档。...GEO数据库下载的表达矩阵不符合预期，比如是空的，或者是有负值的，那我们就处理一下它的原始数据。aglient的芯片应用也很广泛，举个OSCC的栗子：GSE23558，跟着学习学习。...因为表达矩阵是处理过的，我们不要，所以只提取临床信息表格，从中获得分组信息。...这个原始数据下载，在GEO主页，可能对大家的网络有一点点要求，可以参考：下载GEO数据太慢？
双通道芯片有时候实验设计挺复杂的，agilent的原始数据数据处理在中文互联网上也不算常见。...本文借助limma的帮助文档，完成一篇使用agilent双色表达分析，研究肺鳞癌早期肿瘤发生和免疫逃避机制的nature的原始数据处理和文章复现。...RG <- read.maimages(txt, source="agilent",green.only = F) 原始数据读进来是一个「RGList」对象，由limma包产生。.../no_normalize_MAplot") #可以看到读入原始数据和画MAplot是限速步骤，因为122个样本量太大了，把读好的数据存成.Rdata方便日后取用 save(RG,GSE_number,...(low_normal_DEG) 结果还行 我们这篇推文就到此结束了，内容主要是agilent双色芯片的原始数据读入和预处理， 下周周五更新这篇文章的下集，准备给大家复现这篇文章的WGCNA及富集分析的结果
之前介绍了很多音频知识，最终我们还是希望能够在终端应用到我们的算法，本文主要介绍基础的在Android客户端如何处理我们的音频（wav）格式文件，主要介绍文件的读取，写入和播放。...后续再介绍如何进行stft等频域特征提取以及模型的infer方法~ 本文的wav处理基础类主要参考https://github.com/Jhuster/AudioDemo中的WavFileReader和...读取音频文件 读取音频文件中最主要的步骤是获取了byte[]数据后，我们需要转为float[]，因为通常我们的特征提取或者AI模型都是基于float进行的。...wav_path); } catch (IOException e) { e.printStackTrace(); } return m_reader; } // 获取音频数据...对获取后的音频处理进行一系列处理后，我们需要将处理后的float[]写入音频文件，同样我们需要进行一次float[]到byte[]的转换。
和图像处理一样，我们在进行音频任务的模型训练时，也需要对音频进行一些随机处理，作为训练数据的增广。本文主要介绍音频低音消除，音频增加噪声，音频变速。...低音消除 低音消除可以使用在训练过程中，使用librosa，根据frame_length和分贝数来进行低音片段的裁剪，代码如下 librosa.effects.trim(myrecording, top_db...=50, frame_length=256, hop_length=64) 也可以在数据预处理就将低音切除，我一般使用的webrtcvad检测出低音片段，然后删除低音片段。...这里一般可以随机生成一段白噪声，或者读取噪声文件（风，街道，敲键盘，嘈杂环境等），然后按一定比例加入到原始音频即可。...data = clip(-1,1) 音频变速 除了常用的剔除静音，mix数据来做增强，我们好可以通过对音频变速来对做数据扩展。
本文目的：使用 AudioRecord 和 AudioTrack 完成音频PCM数据的采集和播放，并读写音频wav文件 准备工作 Android提供了AudioRecord和MediaRecord。...PCM表示的是音频文件中随着时间的流逝的一段音频的振幅。Android在WAV文件中支持PCM的音频数据。 WAV WAV，MP3等比较常见的音频格式，不同的编码格式对应不通过的原始音频。...为了方便传输，通常会压缩原始音频。 为了辨别出音频格式，每种格式有特定的头文件（header）。 WAV以RIFF为标准。RIFF是一种资源交换档案标准。RIFF将文件存储在每一个标记块中。...PCM打包成WAV PCM是原始音频数据，WAV是windows中常见的音频格式，只是在pcm数据中添加了一个文件头。...2CH 不定 量化数据 AudioRecord AudioRecord可实现从音频输入设备记录声音的功能。得到PCM格式的音频。
lumiR 通过智能读取所有版本的 Illumina BeadStudio 软件的原始数据来初始化 LumiBatch 对象，并且 lumiR.batch 方法旨在读取一批数据文件。...3 使用案例 图2 显示数据处理流程图。用于预处理的R源代码如图3所示。...总之，lumi 包提供了LumiBatch类的基础框架和相关方法来构建 Illumina 从原始数据开始到功能分析的工作流程。...三、 以GSE67936为例的原始数据处理 可以看到是illumina磁珠的表达量芯片，一共有168个样品。...Supplementary files 中有一个RAW原始数据的压缩包和一个non-normalized为标准化数据的压缩包。这个示例数据中的RAW.tar不可用，存储的平台的注释信息。
导读 我在生信技能树和生信菜鸟团都系统性总结过常见GEO数据库的芯片处理技巧，但是也有一些小众芯片我懒得去研发它的流程。...但是我们生信技能树R语言之统计可视化讲师小洁却可以拿一整年的时间为学员们专心解决各式各样的疑难杂症，前面她已经分享了：aglient芯片原始数据处理，相信大家都获益良多，今天再来一个小众芯片：gpr格式的芯片原始数据处理...我们生信技能树前面已经分享过CEL格式的芯片原始数据处理方法：你要挖的公共数据集作者上传了错误的表达矩阵肿么办（如何让高手心甘情愿的帮你呢？）。...最近复现文章时，发现了一些.gpr格式的x芯片原始数据，查了一下，发现是双色芯片处理产生的文件，是用Genepix软件得到的，比较古老的东西。总结一下gpr格式的原始数据怎样处理。...1.R包和文件准备 limma的userguide文档里提到了gpr文件处理的代码，没有找到相应的数据。
在工作中，有时候我们更新一个表数据的时候，需要更新的数据来自其他查询出来的结果，这个时候sql怎么写？ 如下： 将tb_option表中name 和valued的值进行互换 ?
这里的音频设备可以是连接到 Android 手机的耳机 , 音箱 , 也可以是内置的 麦克风 话筒等 ; ② 虚拟音频设备 : 音频设备还可以是用软件虚拟出来的音频设备 ; 这里的音频设备 是 AAudio...AAudio 音频设备获取 ---- 音频设备获取 : ① 获取方法 : 在开发时 , 调用 AudioManager 的 getDevices() 方法 , 可以获取当前连接到 Android 系统上的...并且 符合指定的 flag 参数标准 的可用音频设备 ( 如将耳机插入 Android 手机 , 就会获取到耳机音频设备 ) ; public AudioDeviceInfo[] getDevices...AAudio 音频设备 ID 标识 ---- 音频设备 ID : ① 唯一标识 : Android 的音频设备都有一个独一无二的 ID 标识 ; ② AAudio 与 音频设备绑定 : 使用该 ID 标识...音频流时 , Android 会检查该音频流方向 与 音频设备的音频流方向是否一致 ; VII .
我们在请求网络的时候都是使用各种框架，或者是 Android SDK 为我们提供的网络请求类。但是你知不知道原始的网络请求包是什么样的呢？或许你说这有什么作用，我会使用框架就好了。...类似于: 其中协议规定了 POST 提交的数据必须放在请求体内，但是并没有规定，请求体内提交的数据要用什么编码方式...，这个是由开发者来自己来决定的。...但是虽然我们可以自己来决定什么编码方式，但是数据发送出去，还是要服务器解析的。一般的开发语言，比如：php、Python、java 等等，他们的网络有关的 API 都内置了自动解析常见的数据类型。...所以我们还是要根据规范和开发语言的需求来。 下面来介绍常用的请求头的编码方式 application/x-www-form-urlencoded 这种方式是 POST 请求中提交数据最常见的方式了。
前言 本章主要讲述如何通过Android OpenSL 实现录制 PCM 音频数据。开发流程回顾可以看下笔者前面发布过的文章。...开发准备 1.在Android studo下面建立工程，在使用OpenSL ES的API之前，首先需要引入CMakeLists.txt里面添加依赖库和链接库，代码如下： find_library( #...SHARED native-lib.cpp ) OpenSL ES 录制 PCM 音频数据流程主要有如下： 1、 新建native-lib.cpp文件，...然后引入头文件 #include #include 声明SLObjectItf接口类型的引擎接口对象engineObject...OpenGL ES录制pcm功能，文章最后会附送上demo链接，demo生成的pcm数据会保存在 /Android/data/com.pengjie0668.opensles.demo/cache/temp.pcm
文章目录 一、 AAC 音频格式解析 二、 FLV 音频数据标签解析 1. 分析 FLV 格式中的 AAC 音频格式数据 2. AAC 音频特殊配置 3....分析 FLV 格式中的 AAC 音频格式数据 分析 FLV 格式中的 AAC 音频格式数据 : 下图中的第 2 个音频数据标签 , 存储了音频特殊配置 , 之后的 AAC 音频数据标签都是普通的音频采样数据...AAC 音频数据标签 AAC 音频数据标签 : 该标签中封装实际的音频采样 , AAC 格式的 ; 0x00017494 : 08 00 00 13 00 00 85 00 0x0001749c...第 1 字节 AF 数据解析 第 1 字节 AF 数据解析 : 前 4 位表示音频格式 , 之后的 2 位表示采样率 , 之后的 1 位表示采样长度 , 最后一位表示音频类型 ; ①...音频数据类型 音频数据类型 : ① 音频解码配置信息 : 前两位是 AF 00 , 指导 AAC 数据如何解码 ; ② 音频采样信息 : 前两位是 AF 01 , 实际的 AAC 音频采样数据 ;
因此，在本篇主要会讲解以下内容： 音频编辑项目的整体结构 音频裁剪方法的流程实现 获取音频文件相关信息 计算裁剪时间点对应文件中数据的位置 写入wav文件头信息 写入wav文件裁剪部分的音频数据 下面是音频裁剪效果图...通过它可以启动音频编辑服务AudioTaskService，并发送具体的编辑操作给它。 AudioTaskHandler，音频编辑任务处理器。...AudioTaskService接受到的intent任务都交给它去处理。这里具体处理裁剪，合成等操作。 AudioEditUtil， 音频编辑工具类。提供裁剪，合成等音频编辑的方法。...处理，根据不同的Intent action，调用不同的处理方法 /** * */ public class AudioTaskHandler { public void handleIntent...接下来就是将裁剪部分的音频数据写入到文件中了。
场景 如果你的业务场景对声音有特殊要求，需要开发者对声音做一些定制化处理；目前TRTC SDK提供发送自定义采集音频数据的接口，开发者可以自定采集音频数据，然后复用 trtc的编码功能，目前6.3.7版本...2、AudioRecord 采集到的音频数据不会回调给开发者，开发者需要启动一个线程每隔一段时间去读取音频数据。...，sdk不打开麦克风采集，只是将声音数据上行，将音频数据广播给房间里的其他用户； image.png 示例二 推采集好的pcm音频文件 1、注意文件需要是48000采样率的单声道pcm文件； 2、将pcm...塞入您自定义采集和处理后的音频数据，请使用单声道的48000 PCM 声音数据。...目前还不支持其他数据类型，后续会支持更多的音频采集类型； TRTCAudioFrame参数说明 参数 类型 说明 data byte[] pcm 音频数据 sampleRate int 音频采样率 channel
<<endl; return -1; } return 0; } 三.编码循环体 1.PCM文件的存储结构 音频采样格式可以分为packed和planar两类...以packed格式保存的采样数据，各声道间按照采样值交替存储；以planar格式保存的采样数据，各个采样值按照不同声道连续存储 下面以8bit为例展示planar和packed格式是如何保存音频采样数据的...左声道0 右声道0 左声道1 右声道1 左声道2 右声道2 左声道3 右声道3 planar: 左声道0 左声道1 左声道2 左声道3 右声道0 右声道1 右声道2 右声道3 2.读取PCM音频采样数据... 由于我们代码里设置了采样格式为fltp，即planar格式，而输入的PCM音频采样数据是packed格式的，因此我们需要将packed格式转化为planar格式进行保存： //io_data.cpp...fread(frame->data[ch]+i*data_size,1,data_size,input_file); } } return 0; } 3.编码音频采样数据
import cv2 from Car import * 每踢一球，就判断输的那一方是否还有机会。...为了在代码中使用OpenCV，首先需要import相关的库： 返回结果=cv2.idft(原始数据) # "commit": "Sign in", yTrain = trainData[:,0] 6.5...本节源码 执行结果： 直方图均衡化处理 #执行以下python脚本 img = cv2.imread('water_coins.jpg') 'User-Agent...上述这几步，都可以用python实现自动处理，那就简单多了。...原始内容： 告诉 GM(geometry manager) 有一个控件产生了。
[tophat2+cufflinks转录组测序实例——原始数据的获取] (http://www.biocoder.cn/content/62/) 我们在NCBI上获取的数据 要想把下载的原始数据以sra...格式结尾的文件给tophat2识别并进行比对，就要将sra格式解压为fastq格式 SRA toolkit 代码如下 fastq-dump --split-files SRR5399538.sra 将...4个sra文件分别解压为fastq文件 2.利用bowtie2建立参考基因组的索引 代码如下 bowtie2-build GCA_000009725.1_ASM972v_genomic.fna GCA_...000009725.1_ASM972v1_genomic 建立后的索引文件如图 ?
文章目录 一、音频帧概念 二、AudioStreamCallback 中的音频数据帧说明 Oboe GitHub 主页 : GitHub/Oboe ① 简单使用 : Getting Started...| 关闭 Oboe 音频流 | 重新配置 Oboe 音频流属性 ) 博客中介绍了 如何开始 Oboe 音频流播放 , 以及 播放完毕后的收尾工作 ; 在 【Android 高性能音频】Oboe 开发流程...采样大小 是 样本位数 与 声道数 乘积 ; 下面的代码是 【Android 高性能音频】Oboe 开发流程 ( Oboe 完整代码示例 ) 博客中的 Oboe 音频流创建时 的代码 , 设置 Oboe...类型 ; 上述 1 个音频帧的字节大小是 2\times 2 = 4 字节 ; 二、AudioStreamCallback 中的音频数据帧说明 ---- 在 Oboe 播放器回调类 oboe::...numFrames 乘以 8 字节的音频采样 ; 在 onAudioReady 方法中 , 需要 采集 8 \times numFrames 字节 的音频数据样本 , 并将数据拷贝到 void
文章目录 一、使用 Adobe Audition 录制音频 二、在 Melodyne 中打开录制的音频 三、Melodyne 对音频素材的操作 四、Melodyne 音频分析算法 一、使用 Adobe...Audition 录制音频 ---- 参考 【音频处理】使用 Adobe Audition 录制电脑内部声音 ( 启用电脑立体声混音 | Adobe Audition 中设置音频设备 | Adobe Audition...内录 ) 博客进行内录 ; 二、在 Melodyne 中打开录制的音频 ---- 将上述录制完毕的音频直接拖动到 Melodyne 软件的空白处 , 可以自动打开该音频 , 同时自动分析该音频的音高...---- Melodyne 对音频素材进行了如下分析 : 转换成音符 : 录制的素材 , 被 Melodyne 转为单个波形 , 以音符的形式显示在对应音高位置上 , 横轴是时间 , 纵轴是音高 ,...Melodyne 会自动选择正确的算法 , 如果选择的算法不对 , 可以随时在此处更改音频分析算法 ; 选择 " 重置检测到打击模式 " , 所有的音符都会被设置到相同的音高 ;
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