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来源于多个物种的单细胞转录组表达量矩阵如何处理

cellranger是一个常用的工具,特别适用于处理10x Genomics平台生成的数据。如果你的样品来源于人和鼠的混合细胞,你需要考虑到物种差异,以便在进行分析时正确识别和区分来源于人和鼠的细胞。...0 0 mm10---AC149090.1 0 0 虽然说是6379多个细胞...上面演示的是保留人类基因名字的矩阵,简单的修改过滤的逻辑就是保留小鼠基因的表达量矩阵进行后续的降维聚类分群啦。...也可以是物种+病毒 前面的PDX模型(Patient-Derived Xenograft Model)是来源于多个物种的单细胞转录组表达量矩阵的典型例子, 其实类似的案例还有很多,比如各种癌症都有对应的病毒...这个数据集是两个分组各自内部多个时间点,理论上可以做pseudo-bulk 分析,也是可以根据数据分析结果拿到一个独立的生物学故事。

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    TRICONEX 3636R 服务器中聚合来自多个来源的数据

    TRICONEX 3636R 服务器中聚合来自多个来源的数据图片在异构计算平台上节省资源和可普遍部署的应用程序在工业数据方面为工业4.0提供了新的世界。...容器应用程序是提供严格定义的功能的小软件模块,是自动化世界中聪明的数据管理的一个例子。Softing推出了一个新的产品系列,将容器技术用于西门子和Modbus控制器。...背后的想法如前所述,容器应用程序是具有精确定义的功能的软件模块,允许新的部署选项,为自动化技术带来许多好处。好处是运行在不同计算机平台上的低资源、通用的应用程序或软件的实际隔离、封装和可移植性。...这种方法的特别之处在于,容器像一种包含所有必需组件的虚拟机一样运行。这意味着它们可以独立于任何外部组件和现有环境运行。...下载后,容器应用程序可以在几秒钟内使用单个命令行进行部署,并且在生产级别提供了实现简单集中管理的优势。

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    同时使用多个相机流 — Android 相机介绍

    多个相机流的使用场景 一个相机应用可能希望同时使用多个帧流,在某些情况下不同的流甚至需要不同的帧分辨率或像素格式;以下是一些典型使用场景: 录像:一个流用于预览,另一个用于并编码保存成文件 扫描条形码:...每次请求对应多个目标 通过执行某种官方程序,多相机流可以整合成一个 CaptureRequest,此代码段表明了如何使用一个流开启相机会话进行相机预览并使用另一个流进行图像处理: val session...总结 这篇文章中,我们介绍了: 用单镜头的设备同时输出多个流 在单次拍照中组合不同的目标规则 查询并选择合适的输出格式,输出尺寸和硬件等级 设置并使用 SurfaceView 和 ImageReader...提供的 Surface 有了这些知识,现在我们可以创作一个相机 APP,可以显示和预览流,同时在单独的流中对传入帧进行异步分析。...---- 掘金翻译计划 是一个翻译优质互联网技术文章的社区,文章来源为 掘金 上的英文分享文章。

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    检查多个测序样本是否来源于同一个病人

    多组学分析大行其道的今天,同一个病人我们可以对其做多次不同技术的测序,比如TCGA计划就有不下8种数据: DNA Sequencing miRNA Sequencing Protein Expression...,样品弄混的事情可能很少发生,但是该做的质量控制仍然是必不可少的。...对小课题组来说,怀疑自己的多个样品是否来自于同一个病人就很正常不过了,比如大清早我就在群里看到了这样的问题: ?...germline的snp的相关性 这里借用一个队列研究,看中国人和高加索人,越南人的族群差异,方法描述如下: ? 理论上,不同地理区域的人之间的差异应该是要小于区域外的人。...细节知识点 SNP和SNV dbSNP 使用0,1,2这样的数值来编码野生型,杂合,纯合子位点 dendextend 其实,该文章进化树的形式展现结果并不好,如下: ?

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    在线识别图片来源原理 选择好的在线识别图片来源程序

    如今已是数字化时代,彩色的图片越来越多的图片进入到日常生活中。有很多的时候,大家可能会并不清楚一张图片的来源,这就需要用到一些在线识别图片来源的程序。那么在线识别图片的来源的程序是如何工作的?...在众多的识别程序中,如何去选择好的识别程序呢?项目就来为大家简单介绍一下。 image.png 一、在线识别图片来源的原理 首先,在线识别图片的程序或程序主要是依托大数据来进行处理的。...通过算法模拟出该图片每种颜色所在的位置及其占比。最后就是在数据库中查询图片及其链接的网站地址。这样就实现了在线识别图片、图片查询来源的工作。...二、选择在线识别图片来源的程序的指南 一款好的图片识别程序关键就是要看数据库是否庞大。只有巨大的数据库才会有大量的识别材料,只有庞大的识别材料才会让用户查找图片来源的过程更加可靠、准确。...以上就是为大家带来的关于在线识别图片来源的原理,以及一些好的识别图片来源程序的选择方法。优质的图片识别程序并不少,只要精挑细选一下就可以找到好的程序。

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    脚本开发和场景运行的检查点

    部门培训自用&分享 脚本开发检查点 序号规则要素内容使用范围审查结果“否”的理由“免”的理由规则建议是否免1是否考虑了实时的思考时间√ 2是否有做关键的检查√ 3是否已经正确的参数化...√ 4数据文件是否完整,如用户名、密码是否完整√ 5是否完成了关联 √ 6是否考虑了错误异常处理 √ 7是否设置了多循环的运行√ 8脚本是否添加注释√...9是否定义了事务和子事务√ 10是否定义了集合点 √ 11是否使用block技术来模拟特定的用户行为,比如数据依赖性 √ 场景设计检查点 序号规则要素内容使用范围审查结果...“否”的理由“免”的理由规则建议是否免1场景类型是否合理√ 2RTS设置是否合理√ 3Schedule是否同时按场景和脚本组来合理设计√ 4场景的集合点策略是否合理√

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    怎样控制namenode检查点的发生频率

    secondarynamenode节点定期访问namenode来进行镜像文件和编辑日志的备份,那么这个频率怎样修改呢?...本实验是在《基于Hadoop0.20.2版本的namenode与secondarynamenode分离实验》这篇文章所提及的试验所做的(见 http://www.linuxidc.com/Linux/2015...-02/113642.htm),所以对于验证分离后的正确效果本篇给出截图证明 修改secondarynamenode节点的core-site.xml文件fs.checkpoint.period配置参数,...保存后重启集群或者单独启动secondarynamenode节点 进入fs.checkpoint.dir所设置的目录secondaryname下会看到 ,出现了current等目录和文件(证明《基于hadoop0.20.2...版本的namenode与secondarynamenode分离实验》这篇文章中的实验成功) 并且我们会看到每隔2分钟,目录的创建时间就会改变,如: 这说明修改secondarynamenode节点的检查点频率成功

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    常见的世界地图数据来源

    师姐这周没有鸽,鼓掌,呱唧呱唧呱唧 咳咳,进入正题,之前我写过“矢量数据来源”和常见的栅格数据来源的推文(点击图片可直接跳转) 分享的是国内的常见的数据获取,包括“行政边界”、“DEM”、“土地利用...”......最近清理电脑内存有点多,看着总是不爽,毕竟我是“龙” (上下文仅有三毛钱关系) 这次呢,分享一些常见世界地图的数据来源 - 01 - DIVA-GIS http://swww.diva-gis.org...大兄弟,咱专注世界行政边界各个等级数据的收集整理和分析,这虽然是是个永无止境的工程,但是咱愿意并专一” 同样可以按照你需要的国家局部下载,也提供全球集合数据,目前提供最新版本数据是3.6版本,之前的还有...你可以根据比例尺不同选择数据,点红色框框内的带有文字的色块就可以跳转 不光是比例尺度上的特色,数据类型也比较有特色,他以主题的形式分为三种类型:Cultural Vector Data(文化矢量数据...上述网站也不要tizi,就是浏览器下载的时候有点慢,我发现我的读者下载数据比我有套路,毕竟我只会傻瓜式下载 字数好像还有点不够,再来一个,上面介绍的三个主要是世界的极大范围的常规数据,下面这个主要是区域性的不咋地常规数据

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    【赵渝强老师】Spark的容错机制:检查点

    Spark通过检查点Checkpoint的方式,将RDD的状态写入磁盘进行持久化的保存从而支持容错。...如果在检查点之后有节点出现了问题,Spark只需要从检查点的位置开始重新执行lineage就可以了,这样就减少了开销。设置checkpoint的目录,可以是本地的文件夹,也可以是HDFS。...视频讲解如下:建议在生产系统中采用具有容错能力、高可靠的文件系统作为检查点保存的目的地。1、使用本地目录作为检查点目录这种模式需要将spark-shell运行在本地模式上。...下面的代码使用了本地目录作为RDD检查点的目录(1)设置检查点目录。...下面的代码使用了HDFS目录作为RDD检查点的目录(1)设置检查点目录。

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    hasLayout IE浏览器bug的来源

    HTML5学堂:IE6浏览器曾经“坑”了一代又一代的前端工程师,了解浏览器兼容问题的同时,抱着“理科思维”的我们,必然会去思考为何IE6会这么“坑”,所以,我们来说说IE6浏览器bug的根源-haslayout...很多的ie下的css bug都与其息息相关。在ie中,一个元素要么自己对自身的内容进行计算大小和组织,要么依赖于父元素来计算尺寸和组织内容。...这个时候可以尝试触发父容器及其中的子容器的haslayout属性,通常可以通过加上zoom: 1;来调试。直到找到了产生问题的元素,再进行针对性的修正。最好的办法是对这个元素设置尺寸属性。...但是,有时不便指定尺寸属性的情况下,就只能寻找替代方案了。对于ie7 ,最好的办法是设置最小高度属性为0;这个技术是无害的,因为0本来就是这个属性的初始值。而且没有必要对其他浏览器隐藏这个属性。...display 启动haslayout的值:inline-block 取消hasLayout的值:其他值 width/height 启动hasLayout的值:除了auto以外的值 取消hasLayout

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    Celery 用来处理工作流和多个队列

    Celery 是一个与django很好地集成的异步任务队列。在这篇文章中,我不会写一篇关于如何设置和使用 celery 的教程,已经有很多文章了。...我将讨论我在我从事的一些项目中使用的 celery 的一些高级功能。...一种方法是在没有 celery 的情况下编写 cron 作业,但这将是同步的。每个产品都会阻塞线程,直到它完成。...因此,可扩展的解决方案是为每种报告类型创建单独的队列。但是这种方法也有一个问题。如果没有针对特定报告类型的任务,运行这些队列是一种资源浪费。因此,根据业务用例使用第一种方法还是第二种方法是一种权衡。...要根据报告类型运行多个队列,您需要使用此芹菜配置 CELERY_BROKER_URL = "redis://localhost:6379" # if your broker # is different

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    不同数据来源的生存分析比较

    对比2015.11.1的TCGA数据,最新的TCGA数据,GOBO数据三种数据来源的CCR1,CCL23两种基因在乳腺癌病人中的生存分析。...于是想重复一下,这篇文献的数据来源是GOBO,一个乳腺癌的专属数据库,所以我一开始选择了调用TCGA的数据,但是很可惜这个结果的癌症种类特异性是比较强的,试了几种癌症都没有这么显著的结果,要么就是相反的结果...不过在曾老师的指引之下我顺便探索了一下不同数据来源的生存分析结果会有什么不同。...两个数据来源都是和老版本TCGA数据库的结果有些许的差别,但大致的趋势是一致的。 GOBO 最后再用文献的数据来源试试。...总结 三种数据来源的结果大体趋势一致,但是显著性和一些细节上有差别。

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    推理与统计:推理的来源是什么?

    有文章提到chatgpt已经具备了复杂的推理能力,按照自己以前对这些大模型的了解,是不太相信的,那不过就是从训练数据提炼出来的观点,本质是一种统计的运算。...网文说,chatgpt的推理能力很可能是来源于代码的学习,代码确实可能是学习逻辑的最佳训练集了,如果他从海量的代码里,学习到了逻辑运算的模式,再加上大模型本身所学到的知识,如果融合在一起,是不是就是产生推理能力了呢...简单点说,“1”这个概念可能是大量的数据在大脑中训练得到的,人类的学习模式可能是大量的无监督学习+少量的有监督学习,而大模型显然也是这个套路。...但是显然,目前基于冯诺依曼架构的机器计算显然比人脑生物计算的能耗要高出许多,不过这样的理解是不是正确的呢,毕竟我们的人脑发展成今天的样子也是经过三十多年才成今天的样子。...话又说回来,推理的来源是不是也是统计?这么理解是不是也是可行的。

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    获取来源IP地址的正确姿势

    每次和客户对接,我都花很长的时间跟对方的技术人员解释如何正确地获取来源IP地址,但是每家公司的情况都有所差别,没有一个标准方法。...XFF的工作机制是,每经过一层代理,由代理服务器,把tcp报文中的Source IP,添加到XFF的末尾,多个IP以逗号分隔。...前面提到了,来源IP是保留IP的情况,其实大多数是由于业务系统直接以TCP报文中的remote address作为来源IP使用了。而这个IP,一般是企业自己的反向代理服务器。...此外,某些CDN服务商,会有自己定制化的Header字段,情况比较多,建议结合具体的情况来决定如何获取用户的来源IP。...那么其实只要获取XFF中倒数第三个IP,作为来源IP即可。 一种参考方式如下: 在反向代理(Nginx)上配置,增加Real-IP字段: ? 业务系统中,获取来源IP的代码如下(Java示例): ?

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    解决多个io流需要关闭而重复嵌套try-catch-finally的问题

    问题如图: 相信大多数人都见过如此状态,流多了需要层层关闭,需要层层加上try-catch,为保证下一个流能关闭又要加上finally,烦人!!...如果第一个流关闭的时候异常,那么第二个流close()就不可达,执行不到 这和并列写没区别,如下: finally{     try{           is.close();           os.close...();   // 第一个流关闭出异常第二个流关闭就不可达,执行不到,等于没关     } catch(Exception e) {     } } 那怎么办呢?...不是不能写,而是这种写法是错误的,这种情况下应该把try-catch放在for循环里面,这样才能保证循环会依次关闭流 正确写法1: public static void close(Closeable....,也不会影响到其他流的关闭,finally{...}里面的东西是要执行完的

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    课程笔记6--fMRI的噪音来源

    BOLD fMRI包含多种来源的噪音,与设备本身和被试本身相关 噪音的来源 -系统内自由电子的热运动 -磁场和其梯度的不稳定性 -头动及其对磁场的交互影响 -生理影响:心跳、呼吸,co2浓度 这些噪声如何在数据内出现...-高频的spikes -图像的伪影和畸变 -低频的漂移和周期性的波动 如何减少噪音和伪影的影响 在获取过程中: -我们需要高质量的控制以确保扫描器本身工作很正常 -合理安排实验的序列 -我们还可以用一些特殊的序列...所有fmri的数据都有一些伪影,在做数据分析的时候如果遇到严重的伪影问题是很难处理的,所以我们需要在数据获取的时候就尽量避免。...蓝色的代表真实的高频信号,红色的点代表采样 ? 为了避免这个现象,我们需要至少比信号的频率快两倍的采样频率,如果我们采样的更快,测的的信号的变化方式也更接近原始的信号。...转载声明: 作者:李竞捷 链接:https://zhuanlan.zhihu.com/p/22221789 来源:知乎 著作权归作者所有。

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    ViewWizard 查看弹出窗口来源的小工具

    在你的电脑被安装上了各种国产软件全家桶之后,各种各样的广告弹窗也就随之而来了。与网页广告不同的是,这些桌面弹窗有时无法判定来源软件,让人十分头疼。...比如下面这个来自网友的例子: 虽然提供了关闭按钮,但它如果不定时的弹出也会让人非常恼火,最重要的是我们不知道究竟是什么软件引发了这个弹窗。...不过有了 ViewWizard 窗口信息查看精灵这款绿色软件之后,定位窗口来源变得易如反掌。只要广告窗口还未关闭,我们便可以对他进行寻根溯源。...在找到问题的根源之后,就可以通过更改设置或者卸载软件的方式来解决问题了。不过某些软件不得不保留却又不支持禁止弹窗的话,可以尝试使用各种国产管家软件提供的弹窗拦截,在工具箱中基本都可以找到。...新增的多项功能对于普通用户并没有什么作用。点我下载

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