首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布

基础公共数据库介绍

目前生物信息学研究者已经开发了2000多个分子生物学数据库,几乎覆盖了生命科学的各个领域,大致可分为五类:基因组数据库、核酸序列数据库、蛋白质序列数据库、生物大分子(主要是蛋白质)三维结构数据库以及根据生命科学不同研究领域的实际需要...本期推文将介绍三综合类公共数据库NCBI、EMBL和IMG。...NR其实是一个以核酸序列为基础的交叉索引,将核酸数据和蛋白数据联系起来。NR中的记录都给出了相应的氨基酸序列(通过已知或可能的读码框推断而来),对于很多序列还给出了在专门蛋白数据库中的序列号。...三数据库数据而成,目前包含UniProtKB(有Swiss-Prot和TrEMBL两个库)UniRef、UniParc等几个部分。...三核酸数据库(EMBL-Bank/GenBank/DDBJ)中注释的编码序列都被自动翻译并加入该数据库中,同时收录来自PDB数据库以及Ensembl、Refeq和CCDS基因预测的序列。

5.3K20

数据库基础知识:数据库中的约束和三范式

一.数据库中的范式: 范式, 英文名称是 Normal Form,它是英国人 E.F.Codd(关系数据库的老祖宗)在上个世纪70年代提出关系数据库模型后总结出来的,范式是关系数据库理论的基础,也是我们在设计数据库结构过程中所要遵循的规则和指导方法...,以下就是对这三个范式的基本介绍: 第一范式(1NF): 数据表中的每一列(字段),必须是不可拆分的最小单元,也就是确保每一列的原子性。...二:数据库中的五约束: 数据库中的五约束包括: 1.主键约束(Primay Key Coustraint) 唯一性,非空性; 2.唯一约束 (Unique Counstraint)唯一性,可以空,但只能有一个...详细介绍: (1)[外键约束 (Foreign Key Counstraint) ] 1.设置外键的注意事项: ①:只有INNODB的数据库引擎支持外键,修改my.ini文件设置default-storage-engine...=INNODB; ②:外键与参照列的数据类型必须相同。

99670
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

数据库基础

持久化操作:保存到数据库 主键:用户表里的id,唯一标识 外键:另一个表里引用的用户id,外键 下载mysql 配置环境 更改密码:a12345678 Navicat Premium for Mac的破解教程...local/mysql/bin/mysqladmin 启动mysql mysql // 更换密码: mysqladmin -u root -p password 登录: mysql -u root -p 数据库操作...;是结束符 1.创建数据库 create database mysql_0219; 2.查看所有数据库 show databases; 3.使用数据库 use mysql_0219; 4....删除数据库 drop database mysql_0219; 5.查看数据库状态 status (注意编码:utf-8) 表的创建与管理: 1.创建表 create table t_user1(...导出数据库里对应的表: mysqldump -u root -p mysql_0219 t_user>mysql_0219_user.sql; 恢复 create database mysql_back

63430

数据库基础

3.数据操纵功能数据库管理系统提供数据库操作语言(DML),用户可以使用它操作数据,实现对数据库的基本操作,如增删改查。...4.数据库的事务管理和运行管理数据库在建立、运用、维护时由数据库管理系统统一管理和控制,确保事务的正确运行,保证数据的安全性、完整性、多用户对数据的并发使用以及发生故障后的系统恢复。...5.数据库的建立和维护功能数据库的建立和维护功能包括数据库初始数据的输入、转换功能、数据库的转储、恢复功能,数据库的重组织功能和性能监视、分析功能等。这些功能一般是由一些实用程序或管理工具完成的。...数据库系统(DBS)是指在计算机系统中引入数据库后的系统,一般由数据库数据库管理系统(及其应用开发工具)、应用系统、数据库管理员和最终用户构成。...要么为参照的主码值)和用户自定义完整性3、 关系模型的优缺点优点(1)建立在严格的数学概念的基础上:有关系代数作为语言模型,有关系数据理论作为理论基础(2)关系模型的概念单一。

60820

数据库基础

数据库基础 数据库被分为关系型数据库和非关系型数据库 使用Mysql是基于关系型数据库 而SQL全名 Structured Query Language(结构化查询语言)本质上是一种语言,MySQL才是数据库本身...而不从数据库删除数据本身。...主键 每一张数据库表都可以有一个主键(primary key),主键最大的作用就是用来标识数据数据就像我们人,名字可能会重复,生日可能会一样,但是身份证号是肯定每个人都不一样的,身份证号就是社会体系辨别我们每个人谁是谁的键...这四个行为最常见的用途能够在使用SQL数据库与网站的API端口时发现。...* FROM table_name ORDER BY field_name; 排序默认按照升序排序,对于int,double而言,是从小到,对于varchar而言,是从字母A到Z,对于 datetime

54930

MySQL基础数据库基础

✨个人主页: 北 海 所属专栏: MySQL 学习 操作环境: CentOS 7.6 阿里云远程服务器 软件版本: MySQL 5.7.44 1.数据库概念 1.1.什么是数据库 数据库是按照数据结构来组织...中,称为 内存数据库 / 主存数据库,比如 Redis 就是这种存储模式 磁盘数据库数据存储在 磁盘 中,在 持久化保存 上有明显优势,但 IO 次数势必会增多,为了提高自己的存储效率,磁盘数据库...,其他涉及操作的数据存储在 内存 中,直接进行运算,为了防止数据丢失,内存数据库 通常会定期将数据转存到磁盘中,确保持久化存储 磁盘数据库和内存数据库都是数据库管理系统的存储方式,它们各自有自己的特点和适用场景...,但对于小型项目和原型开发非常有用 MySQL 风靡全球的重要原因之一就是 免费,深受广大开发者的喜爱 2.数据库基本操作 2.1.连接数据库 首先是连接数据库,可以这样操作 注意: 连接数据库前需要确保...,不过实际并没有这么简单,比如表结构需要慎重创建,符合 三范式;查询数据时,需要配合各种筛选条件进行查询,如 where 子句、聚合条件、多表查询等;MySQL 中还提供了高效的数据管理机制,比如 索引

16250

数据库基础

1 范式化设计 1.1 第一范式(1NF)无重复的列 定义 所谓第一范式(1NF)是指数据库表的每一列都是不可分割的基本数据项,同一列中不能有多个值,即实体中的某个属性不能有多个值或者不能有重复的属性...上面这张表就不符合第一范式,有重复的列,应该将 name-age 拆分成 name 和 age 两个列 1.2 第二范式(2NF)属性完全依赖于主键 定义 第二范式(2NF)是在第一范式(1NF)的基础上建立起来的...第三范式(3NF)要求一个数据库表中不包含已在其它表中已包含的非主关键字信息。...因此,数据库名、 表名、字段名,都不允许出现任何大写字母,避免节外生枝。...说明:如果预计三年后的数据量根本达不到这个级别,请不要在创建表时就分库分表。 【参考】合适的字符存储长度,不但节约数据库表空间、节约索引存储,更重要的是提升检 索速度。

58540

Mysql 数据库(二)——数据库基础

那我们怎么查看 某个数据库中的 表呢? 1.查看我们有哪些数据库 ? 2.选中我们想要查看的数据库 ? 3.查看数据库中的表 ?...三、数据库操作 1.显示当前的数据库 mysql> show databases; ? 2.创建数据库 mysql> create database [数据库名] ? ?   ...展示数据库与 创建数据库 在上一节课中我们已经具体的讲过了,我们重点来看 删除数据库 3.选中数据库/使用数据库 use [ 数据库名 ]   要想对数据库进行更具体的操作 (建表、查询、…)就需要先确定是针对那个数据库进行的...出现 Database changed 则选中成功.当前的数据库已经被选中,后续的操作都是针对这个数据库来展开的. 4.删除数据库 4.1语法 drop database [数据库名]; ?...说明:   数据库删除后,内部看不到对应的数据库,里边的表和数据全部被删除. 我们对这个数据库进行简单的删除操作… 我们在这个数据库中新建了一个 rain7 的数据库 ?

2K31

MySQL数据库基础

1、数据库基本概念 1.1 数据库简介 数据库,简而言之可视为电子化的文件柜——存储电子文件的处所,用户可以对文件中的数据运行新增、截取、更新、删除等操作。...1.2 数据库结构模型 数据库类型的区分主要参照的是数据结构模型,而常用的数据结构模型有很多: 层次模型 网状模型 关系模型 1.3 关系型数据库 关系型数据库,是指采用了关系模型来组织数据数据库,...非关系型数据库(NoSQL):redis、memcache、mongodb 2、数据库管理系统 数据库管理系统(Database Management System,简称DBMS)是为管理数据库而设计的电脑软件系统...,一般具有存储、截取、安全保障、备份等基础功能。...简单一句话,数据库管理系统是为了我们更方便的使用数据库而诞生的。

25730

MySQL数据库基础

数据库概念 1.1 数据库是干嘛的? 1.2 数据库数据结构是啥关系? ​1.3 两种类型的数据库 2....MySQL数据库 2.1 MySQL数据库概念 2.2 MySQL基本操作 2.2.1 建立数据库 2.2.2 查看数据库 2.2.3 选中数据库 2.2.4 删除数据库 2.3 MySQL数据类型...数据库概念 1.1 数据库是干嘛的? 数据库的功能就是用来组织数据,组织很多很多的数据。...这些数据通常都是存储在外存(磁盘) 数据库提供的核心功能,也就是针对数据的增删改查~ 1.2 数据库数据结构是啥关系? 1. 数据库是一个软件/程序 2....数据结构是一个学科~ 数据库这个软件内部也应用到了很多的数据结构~ 数据库数据是保存在外存中的 1.3 两种类型的数据库 关系型数据库: 对于数据的约束比较严格~~例如,都是使用”表”这样的结构来存储的

29610

数据库基础概念

为什么有数据库? 与传统数据的记录不同,数据库数据记录的载体发生了改变,将数据记录的载体变为磁盘。...2017年互联网1天的交易数据1.82ZB(人类从文字记载开始,所有的文字记载,转为电子格式) 数据库基础 信息系统产生了海量的数据,需要有位置将数据存储起来,数据库就是用来存储、查询海量数据的管理系统...关系型数据库的发展,大致可以分为理论奠基、SQL标准、商用成型、多家发展等几个阶段。 Codd《用于大型共享数据库的关系模型》,提出了关系和关系运算的概念,后来成为关系型数据库的标准。...关系型数据库 指采用了关系模型来组织数据数据库,以行列的形式来存储数据,方便用户的理解,在关系型数据库中一系列的行和列称为表一组表组成数据库。...(单库的表容量是固定:可以进行分库分表的操作),可以将关系型数据库理解为二维数据表格模型,而一个关系型数据库是由二维表及其之间的关系组成的数据的组织。

31110

数据库基础笔记

一致性 一致性是指在事务开始之前和事务结束以后,数据库的完整性约束没有被破坏。这是说数据库事务不能破坏关系数据的完整性以及业务逻辑上的一致性。...保障机制(也从两方面着手):数据库层面会在一个事务执行之前和之后,数据会符合你设置的约束(唯一约束,外键约束,check约束等)和触发器设置;此外,数据库的内部数据结构(如 B 树索引或双向链表)都必须是正确的...持久性 这是最好理解的一个特性:持久性,意味着在事务完成以后,该事务所对数据库所作的更改便持久的保存在数据库之中,并不会被回滚。...五约束   1、主键约束(Primay Key Coustraint) 唯一性,非空性   2、唯一约束 (Unique Counstraint)唯一性,可以空,但只能有一个   3、检查约束 (...物理模型: 定义:逻辑模型对应到具体的数据模型的机器实现。 实质:物理模型是对真实数据库的描述。

36310

Oracle数据库基础

Oracle数据库是一种对象关系型数据库,在关系型数据库基础上,引入了一些面向对象的特性。...2.Oracle体系结构数据库:只有一个数据库实例:后台运行的一个进程表空间:逻辑存储单位数据文件:物理存储单位用户:面向用户管理,都会对应一个表空间,向表空间中添加数据,都是保存到数据文件中3.数据库用户用户...权限:SYSDBA:数据库管理员权限(打开数据库服务器、关闭数据库服务器、管理功能、备份数据库、恢复数据库、日志归档、会话限制。)...SYSOPER:数据库操作员权限(打开数据库服务器、关闭数据库服务器、备份数据库、恢复数据库、日志归档、会话限制。)NORMAL:普通用户权限。...注:sysdba拥有最高系统权限,sysoper主要用来启动、关闭数据库。【小结】oracle数据库是关系型数据库中较为复杂的一种,用过oracle数据库后,绝大多数数据库都是很容易上手的。

86410

数据库基础

uniCloud云数据库介绍 uniCloud是nosql非关系型数据库,提供了一个JSON格式的文档型数据库数据库中每条记录都是一个JSON格式的文档。...uniCloud云数据库基础服务阿里云和腾讯云提供,它们的数据库大体相同,但有细微差异。比如阿里云的数据库是mongoDB4.0,腾讯云则使用自研的文档型数据库(兼容mongoDB 4.0版本)。...字段的基础数据类型 记录内的字段基础数据类型有以下几种: String:字符串 Number:数字 Object:对象 Array:数组 Bool:布尔值 GeoPoint:地理位置点 GeoLineStringLine...JS基础的同学一看就明白,个别少见的我们会在后面的实战中用上就能学会,这里不再赘述。...,返回的数据按照createtime字段的值由到小排列 db.collection("users").orderBy("createtime","desc").get(); 如果需要对嵌套字段排序,

1.7K30

【MySQL】数据库基础

数据库基础 一、什么是数据库 存储数据用文件就可以了,为什么还要弄个数据库呢?...——数据库,它能更有效的管理数据。...三、服务器,数据库,表关系 1. 简单使用数据库 在描述 服务器,数据库,表之间的关系 前,我们先简单使用一下数据库建立一个数据库并建立一张表结构;其中 SQL 的语法我们先不管,后面会逐一介绍。...(1)查看数据库 首先我们先登录 mysql,可以使用指令:show databases; 查看当前数据库的服务器中的数据库,如下: 那么这些数据库都在哪呢?...数据库服务器 所谓安装数据库服务器,只是在机器上安装了一个数据库管理系统程序,这个管理程序可以管理多个数据库,一般开发人员会针对每一个应用创建一个数据库; 为保存应用中实体的数据,一般会在数据库中创建多个表

9310
领券