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Python转录组学分析框架:Omicverse安装以及差异分析

您可以在scverse官网上找到我们。 安装前准备 OmicVerse可以通过condapypi进行安装,不过您需要先安装pytorch 为避免潜在依赖冲突,建议在conda环境中安装。...平台 在不同平台上,最合适安装方法有所不同。 Windows:我们建议安装wsl子系统,并在wsl子系统中安装conda以配置omicverse环境。...Linux:我们可以选择安装anacondaminiconda,然后使用conda来配置omicverse环境。 Mac Os:我们建议使用miniforgemambaforge进行配置。...Apple Silicon前提条件 在装有Apple SiliconMac上安装omicverse只能使用本机版本Python。...创建一个conda环境conda create -n omicverse python=3.8 激活您环境conda activate omicverse 首先安装PyTorch: conda

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MLX vs MPS vs CUDA:苹果新机器学习框架基准测试

在本文中,我们将对这些新方法进行测试,在三种不同Apple Silicon芯片和两个支持cudagpu上和传统CPU后端进行基准测试。 这里把基准测试集中在图卷积网络(GCN)模型上。...这个模型主要由线性层组成,所以对于其他模型也应该得到类似的结果。 创造环境 要为MLX构建环境,我们必须指定是使用i386还是arm架构。...conda-forge conda activate mlx 如果检查你env是否实际使用了arm,下面命令输出应该是arm,而不是i386(因为我们用Apple Silicon): python...这意味着eval()通常用于在更新后实际计算模型参数。...我们测试平台是一个2层GCN模型,应用于Cora数据集,其中包括2708个节点和5429条边。 对于MLX, MPS和CPU测试,我们对M1 Pro, M2 Ultra和M3 Max进行基准测试。

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WWDC20中iOS改变

PencilKit为iOS应用程序提供了一个绘图环境,该环境可以从Apple Pencil或用户手指中获取输入,并将其转换为您在iOSmacOS中显示高质量图像。...4.Catalyst Catalyst是能够将iOS应用程序引入macOS基础架构,这些年,很多iOSapp开始尝试跨平台开发,事实上,Catalyst也在不断改进,今年也将更多iOS库或者对应功能加入到...后,以后设备都将用自研 Apple Silicon ARM 芯片,特别是mac端,故如何为 Apple Silicon 重新编译 MacOS App,如何构建通用架构 App,以及让这些 App 启动更快...,性能更好并支持平台未来发展是需要我们关注,这里apple给出了一个移植用例,可以作为一个通用参考。...同时引入了一个属性CLAccuracyAuthorization,是一个枚举类型,指定精确度。.fullAccuracy是 iOS 14 之前版本默认值,代表高精度。.

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MLX vs MPS vs CUDA:苹果新机器学习框架基准测试

在本文中,我们将对这些新方法进行测试,在三种不同Apple Silicon芯片和两个支持cudagpu上和传统CPU后端进行基准测试。 这里把基准测试集中在图卷积网络(GCN)模型上。...这个模型主要由线性层组成,所以对于其他模型也应该得到类似的结果。 创造环境 要为MLX构建环境,我们必须指定是使用i386还是arm架构。...conda-forge conda activate mlx 如果检查你env是否实际使用了arm,下面命令输出应该是arm,而不是i386(因为我们用Apple Silicon): python...这意味着eval()通常用于在更新后实际计算模型参数。...我们测试平台是一个2层GCN模型,应用于Cora数据集,其中包括2708个节点和5429条边。 对于MLX, MPS和CPU测试,我们对M1 Pro, M2 Ultra和M3 Max进行基准测试。

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MLX vs MPS vs CUDA:苹果新机器学习框架基准测试

在本文中,我们将对这些新方法进行测试,在三种不同Apple Silicon芯片和两个支持cudagpu上和传统CPU后端进行基准测试。 这里把基准测试集中在图卷积网络(GCN)模型上。...这个模型主要由线性层组成,所以对于其他模型也应该得到类似的结果。 创造环境 要为MLX构建环境,我们必须指定是使用i386还是arm架构。...conda-forge conda activate mlx 如果检查你env是否实际使用了arm,下面命令输出应该是arm,而不是i386(因为我们用Apple Silicon): python...这意味着eval()通常用于在更新后实际计算模型参数。...我们测试平台是一个2层GCN模型,应用于Cora数据集,其中包括2708个节点和5429条边。 对于MLX, MPS和CPU测试,我们对M1 Pro, M2 Ultra和M3 Max进行基准测试。

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XGB-1:XGBoost安装及快速上手

应用场景: 分类问题:邮件分类(垃圾邮件/非垃圾邮件)、图像识别等。 回归问题:房价预测、股票价格预测等。 排序问题:搜索引擎结果排序、推荐系统等。...模型训练:使用xgboost库中XGBClassifierXGBRegressor进行模型训练。 模型评估:使用交叉验证等方法评估模型性能。...支持平台包括Linux(x86_64、aarch64)、Windows(x86_64)和MacOS(x86_64、Apple Silicon)。...每个平台二进制软件包功能: Conda 可以使用Conda包管理器安装XGBoost: conda install -c conda-forge py-xgboost Conda应该能够检测到机器上是否存在...如果遇到问题,请尝试明确指定变体: # 仅CPU conda install -c conda-forge py-xgboost-cpu # 使用NVIDIA GPU conda install -c

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在搭载 M1 及 M2 芯片 MacBook设备上玩 Stable Diffusion 模型

本篇文章,我们聊了如何使用搭载了 Apple Silicon 芯片(M1 和 M2 CPU) MacBook 设备上运行 Stable Diffusion 模型。...十一月末,为 Apple Core ML Tools 开源项目[2]贡献代码主要工程师之一,正式发布了一个开源项目:apple/ml-stable-diffusion[3]。...快速准备 MacOS 上 Python 运行环境 在完成 Conda 安装之后,我们就可以用它来快速创建不影响本地机器环境(MacOS),只和项目关联干净 Python 运行环境了。...当然,默认创建好之后,并不会直接切换到创建好环境,我们还需要使用命令,来完成环境切换。...,接下来在遇到需要 Rust 编译,下载依赖包时候,速度也会变飞快。

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Macbook(M1版)用户看过来,.net 6 Preview 6支持Apple Silicon for macOS

Visual Studio 2022可以使用专门为.NET 6开发Visual Studio工具,.NET MAUI中开发、C应用程序热重新加载、WebFormsWeb Live预览,以及IDE...查看.NET特性讨论。 # x64仿真更新 我们已经完成了添加对Apple Silicon for macOS和Arm64 for Windows支持。...剩下就是支持macOS、Apple Silicon和Windows Arm64上x64仿真。...这是Apple Silicon一项要求,也是其他操作系统一项重要安全措施。 此特性具有异常名称,它应该被读为“写独占执行”。...注意:W^x实现在除Apple Silicon以外所有环境中都具有与.net6启动回归,它将作为.NET7一部分解决。由于操作系统支持此场景,Apple Silicon实现没有这种回归。

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在搭载 M1 及 M2 芯片 MacBook 设备上玩 Stable Diffusion 模型

本篇文章,我们聊了如何使用搭载了 Apple Silicon 芯片(M1 和 M2 CPU) MacBook 设备上运行 Stable Diffusion 模型。...十一月末,为 Apple Core ML Tools 开源项目贡献代码主要工程师之一,正式发布了一个开源项目:apple/ml-stable-diffusion。...设备安装 Python 环境管理工具 在《用让新海诚本人惊讶 AI 模型制作属于你动漫视频》这篇文章中,我分享过关于“使用 Conda 简化 Python 程序环境准备工作”,正巧年底 Conda...conda create -n coreml_stable_diffusion python=3.8 -y 等待上面的命令执行完毕,我们指定名为 coreml_stable_diffusion 环境就初始化好啦...当然,默认创建好之后,并不会直接切换到创建好环境,我们还需要使用命令,来完成环境切换。

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两年内转型Apple Silicon,和英特尔说「拜拜」

---- 智元报道 来源:外媒 编辑:Priscilla 【智元导读】苹果公司在WWDC 2020上首次宣布从英特尔过渡到Apple Silicon计划,苹果CEO蒂姆·库克预计过渡时间需要两年...明年晚些时候,搭载Apple Silicon全新Mac Pro也会以更小巧尺寸推出。...也就是说,Apple Silicon和Intel两个平台产品线会并行。 不用多说,苹果自家芯片驱动Mac Pro会更小巧。 外形尺寸大概是现在Mac Pro一半,使用相同设计语言。...Apple SIlicon:又一变革 其实在苹果推出Apple Silicon之前,Mac曾经经历过两次变革了。 首先是PowerPC架构。 后来,转向了英特尔处理器。...渲染四个4K Apple ProRes视频流Final Cut Pro,跑起来也毫不费力。 苹果推出Apple Silicon,就是「榨干每一瓦性能」。 称霸世界上笔记本电脑和台式机。

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Android Studio Arctic Fox (2020.3.1) Beta 版发布

预览将获得和应用相同运行环境 (权限、资源)。...Accessibility Scanner (无障碍扫描器) 将报告与无障碍相关问题,并为一些常见问题 (缺少内容描述,对比度过低等) 推荐修复方法。...2020.3 平台版本 ,其中有许多新功能,调试器互动提示,欢迎屏幕,以及大量代码编辑器增强功能,可以加快您工作流程。...Apple Silicon 支持预览 - 对于那些在 Apple Silicon (arm64) 硬件上使用 MacOS 用户,Android Studio Arctic Fox 提供了对这种架构预览支持...由于这是一个针对 arm64 架构预览版,您需要在 Android Studio 下载存档页 中寻找 Mac (Apple Silicon) 并单独下载该版本。

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MicroMamba 安装与注意事项

Doing so may break mamba and conda installation. 对于 mamba 和 conda , base 环境旨在保存它们依赖关系。...这意味着 base 环境完全是空。micromamba 配置略有不同,即默认情况下将在 MAMBA_ROOT_PREFIX 环境变量下创建所有环境和缓存。...脚本安装 如果您使用是 macOS、Linux Windows 上 Git Bash,则有一种简单安装方法 micromamba。只需在您喜欢 shell 中执行安装脚本即可。...其实,这就等同于我们直接去 https://github.com/mamba-org/micromamba-releases/releases 下载对应平台二进制文件,或者 tar.bz2 文件,然后解压缩.../micromamba shell init -s zsh -p ~/micromamba source ~/.zshrc 现在您可以激活基本环境并安装软件包,创建其他环境

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Mac M1 上 丝滑跑 Docker

我试了下,确实没有合适 mysql 镜像。 由于QEMU有时无法运行容器,因此在 Apple Silicon计算机上运行基于Intel容器可能会导致崩溃。...我们建议您在Apple Silicon计算机上运行 ARM64 容器。与基于Intel容器相比,这些容器还更快并且使用内存更少。 ping从容器内部到 Internet 连接无法正常工作。...2.2 启动容器 打开界面,会提示没有容器正在运行,客户端提示执行以下命令启动一个容器。...2.3 Intel & Apple 我们打开活动监视器,可以看到打开 docker 进程既有 Apple 架构,也有 Intel 架构,比如桌面 UI 用是 Intel 架构,但 Docker...核心应用程序用 Apple 架构,说明虽然有部分用 Intel 架构,但核心还是 Apple 架构,不影响使用。

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M1 和 Docker 谈了个恋爱

我试了下,确实没有合适 mysql 镜像。 ? 由于QEMU有时无法运行容器,因此在 Apple Silicon计算机上运行基于Intel容器可能会导致崩溃。...我们建议您在Apple Silicon计算机上运行 ARM64 容器。与基于Intel容器相比,这些容器还更快并且使用内存更少。 ping从容器内部到 Internet 连接无法正常工作。...要测试网络,我们建议使用curlwget。 当TCP流半关闭时,用户有时可能会遇到数据丢失情况。...2.3 Intel & Apple 我们打开活动监视器,可以看到打开 docker 进程既有 Apple 架构,也有 Intel 架构,比如桌面 UI 用是 Intel 架构,但 Docker...核心应用程序用 Apple 架构,说明虽然有部分用 Intel 架构,但核心还是 Apple 架构,不影响使用。

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《Docker极简教程》--Docker环境搭建--在Mac上搭建Docker环境

在Mac上搭建Docker环境,可以提供一个可靠容器化开发和部署平台。下面将详细介绍在Mac上搭建Docker环境步骤、注意事项和常见问题解决方法。...二、注意事项 在Mac上搭建Docker环境时,需要注意以下事项: 系统要求:Mac需要满足一些要求,macOS Mojave(10.14)更高版本、具有足够内存和CPU资源。...Apple Silicon芯片支持:如果Mac是基于Apple Silicon芯片(M1芯片),请确保下载适用于Apple SiliconDocker Desktop版本,并按照官方指南进行安装和配置...如果需要容器能够访问主机上服务(localhost上Web服务器),可以将容器连接到主机网络。具体配置方法可以参考Docker官方文档使用Docker Compose进行配置。...如果遇到无法启动容器访问容器内部网络问题,请确保防火墙允许Docker相关流量通过。

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M1 和 Docker 谈了个恋爱...

我试了下,确实没有合适 mysql 镜像。 由于QEMU有时无法运行容器,因此在 Apple Silicon计算机上运行基于Intel容器可能会导致崩溃。...我们建议您在Apple Silicon计算机上运行 ARM64 容器。与基于Intel容器相比,这些容器还更快并且使用内存更少。 ping从容器内部到 Internet 连接无法正常工作。...2.2 启动容器 打开界面,会提示没有容器正在运行,客户端提示执行以下命令启动一个容器。...2.3 Intel & Apple 我们打开活动监视器,可以看到打开 docker 进程既有 Apple 架构,也有 Intel 架构,比如桌面 UI 用是 Intel 架构,但 Docker...核心应用程序用 Apple 架构,说明虽然有部分用 Intel 架构,但核心还是 Apple 架构,不影响使用。

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Apple M1 芯片目前对开发者来说未必是好事

苹果近日推出首款自研 Apple M1 芯片,收到了很多用户欢迎,但随着这些用户拿到真机,很多问题暴露出来。 有用户发现,除了 AMD64架构之外,其他大多数架构都无法在 ARM 上运行。...并且有一部分工具和库属于开源项目,因此由此带来维护需求增长,将成为沉重额外负担,导致某些贡献者直接放弃为 Mac 平台上提供支持。...ARM 架构不支持 Windows 一个不太好消息是 ARM 架构是绝对支持不了 Windows 。 如果开发者想在新款 Mac 上测试自己 Windows 应用。...当然,你也许可以进行重新编译及交叉编译,但永远无法还原其真实运行状态。另外,如果你应用在生产环境中发生问题,也无法仅凭二进制文件容器镜像在自己笔记本上进行调试。...参考资料:www.reddit.com/r/docker/comments/jpzt43/docker_for_mac_on_apple_silicon_keynote/

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