在本文中，将展示如何创建自己的 RAG 数据集，该数据集包含任何语言的文档的上下文、问题和答案。 检索增强生成 (RAG) 1 是一种允许 LLM 访问外部知识库的技术。...自动从文档生成 RAG 评估数据样本的工作流程。图片由作者提供 自动生成 RAG 数据集的基本工作流程从从文档（例如 PDF 文件）读取我们的知识库开始。...生成问答上下文样本 使用 OpenAI 客户端和我们之前创建的模型，我们首先编写一个生成器函数来从我们的文档中创建问题和答案。...实验结论 从文档集合中自动创建 RAG 评估数据集非常简单。我们所需要的只是 LLM 生成器的提示、LLM 评委的提示，以及中间的一些 Python 代码。...要更改我们的 RAG 评估数据集的语言，我们只需将 LLM 提示从英语翻译成另一种语言。 如果生成的数据样本不足以满足我们的用例，我们可以尝试修改提示。
p=16788 问题重现 软件：R语言 环境：windows 问题描述：我有一个XML文档文件。文件的一部分如下所示： 创建一个具有ID，name 列的R数据框。...请注意，name和ID应包含变量的所有级别。 解决方案 假设这是正确的taxlots.shp.xml文件： CO Copiers XML格式的数据很少以允许该...最好提取列表中的所有内容，然后将列表绑定到数据框中： data <- xmlParse("ProductSubcategory.xml") xml_data <- xmlToList(data
p=16788 问题重现 软件：R语言 环境：windows 问题描述：我有一个XML文档文件。文件的一部分如下所示： 创建一个具有ID，name 列的R数据框。...请注意，name和ID应包含变量的所有级别。 解决方案 假设这是正确的taxlots.shp.xml文件： COCopiers XML格式的数据很少以允许该...<- xmlToDataFrame(getNodeSet(data,"//SubCategory")) ---- 最受欢迎的见解 1.如何解决线性混合模型中畸形拟合(SINGULAR FIT)
NIfTI-1数据格式与ANALYZE格式基本相同，但提供了一些改进：将header和图像信息合并到一个文件（.nii）中，将348个字节固定的header重新组织为更相关的类别。...此外，它还允许从3D数组生成等值面。它具有STL、PLY和OBJ文件的导入/导出功能，支持二进制和ASCII格式。...qMRI包支持从多参数映射（MPM）MRI采集中估计定量弛豫度图像，包括自适应平滑。 Simulation neuRosim包允许用户生成fMRI时间序列或4D数据。...它创建了一些高级函数，只需提供少量参数即可快速生成数据，并提供了多种函数来定义激活和噪声。对于更高级的用户，可以使用低级函数和操作参数。...ERP），并将多个数据集的ERP存储在类似数据框的对象中，以便可以使用熟悉的R建模框架进行统计分析（线性模型，(M)ANOVA）。
REC（飞利浦 MRI 扫描格式），ANALYZE（Mayo 医疗成像）以及 NRRD（近乎原始光栅数据）和 MNIC 格式。...这些附加的特征有助于 Minc2 处理大量的复杂数据集。 从研究论文中得到的一些关于这几个格式的对比： ?...这些数组能够被写成 NIFTI 的文件，同时还加上一个可选的头部扩展，这个头文件包含原始 DICOM 文件的所有元数据。...总结 我们可以看到，目前已存在几种用于存储医疗图像并且可以用在深度学习中的文件格式。我们的目标是使用最佳的文件格式，该格式能够让我们得到卷积神经网络（CNN）所需的所有特征，以实现准确的预测。 ?...相关链接：从数据结构到Python实现：如何使用深度学习分析医学影像 原文链接：https://medium.com/@taposhdr/medical-image-analysis-with-deep-learning-iv
刘C等[20]利用卷积神经网络（CNN）从与认知衰退相关的大脑区域提取图像特征，然后将这些特征与使用支持向量机（SVM）分类器的非图像数据相结合。...MRI到PET生成网络最初在一个包含配对MRI和PET图像的综合数据集上进行训练。这种训练使得网络能够在没有PET数据的情形下，从MRI扫描中生成PET数据。...判别器推动生成器创建真实的PET图像，并学习如何从MRI中提取特征并将它们转化为PET特征，涵盖广泛的数据集。因此，即使只有MRI数据可用，也可以利用两种模态的特征。...判别器促使生成器生成逼真的正电子发射断层扫描（PET）图像，并学会如何从磁共振成像（MRI）中提取特征，并将它们转换为PET特征，涵盖广泛的数据集。...这些数据集被划分为2,274对训练集和569对验证集。最初以DICOM格式存储的3D图像，使用MRIcron转换为NIfTI格式，以便更容易处理数据。
它可以处理从任意数量的参与者那里收集的原始dMRI数据，并且还与来自HCP和英国生物样本库等公共数据集的预处理文件兼容。此外，友好的图形用户界面允许用户配置他们的处理管道，而无需任何编程。...它旨在处理从场强为 1.5 T 或更高的 MRI 扫描仪采集的数据，并且与单壳和多壳 dMRI 数据兼容，除了需要 T1 加权图像外，还包括 b0 图像和超过 6 张扩散加权图像。...将 DICOM 转换为 NIfTI。DCP可以将DICOM和NIfTI格式作为输入文件进行处理。输入文件的组织方式应使每个主题都有一个单独的文件夹。...在此文件夹中，应有用于容纳 DICOM或NIfTI格式的DTI和T1文件的不同子文件夹。当将NIfTI图像用作输入文件时，将跳过格式转换步骤。...在此文件夹中，应有用于容纳 DICOM 或 NIfTI 格式的DTI 和 T1 文件的不同子文件夹。当将NIfTI图像用作输入文件时，将跳过格式转换步骤。
比如说，一个8比特的光栅可以有256个从0到255数值不等的图像深度 光度表示解释了像素数据如何以正确的图像格式（单色或彩色图片）显示。...这样就可以研究实验操作究竟是如何影响大脑的MRI信号的 FMRI数据预处理 数据预处理步骤包括：可视化（Visualization）、去伪影（Artifact removal）、时间配准（Slice...同时NIfTI也可使用独立的图像文件（.img）和头文件（.hdr） DICOM和NIFTI间的区别 DICOM和NIFTI之间最主要的区别在于NIFTI中的原始图像数据是以3D图像的格式储存的，而...这就是为什么在一些机器学习应用程序中NIFTI比DICOM更受欢迎，因为它是3D图像模型。处理一个单个的NIFTI文件，与处理上百个DICOM文件相比要轻松得多。...NIFTI的每一张3D图像中只需储存两个文件，而在DICOM中则要储存更多文件。
三、BraTS2023-MET数据集 BraTS 2023 脑转移数据集包含在标准临床条件下从各个机构获得的未接受治疗的脑转移 mpMRI 扫描的回顾性汇编。...该数据集由多参数 MRI (mpMRI) 扫描组成，其中包括以下系列：对比前 T1 加权 (t1w)；对比后 T1 加权 (t1c)；T2 加权 (t2w)；T2 加权流体衰减反转恢复 (t2f)。...所有数据集均采用标准化预处理，包括将 DICOM 文件转换为 NIfTI 格式、共同配准到同一解剖模板 (SRI24)、重采样为统一的各向同性分辨率 (1mm3) 以及颅骨剥离。...转换为 NIfTI 格式会从DICOM头文件中删除所有受保护的健康信息 (PHI)，并且头骨剥离有助于防止患者潜在的面部识别。...3、图像预处理，对步骤2的原始图像进行像素值（1，99）截断，然后采用均值为0，方差为1的方式进行归一化处理。然后将数据分成训练集和验证集，对训练集做5倍数据增强处理。
对于仅使用MRI的模型，还在每个全连接层之前加入了一个批次归一化层。 图像配准、强度归一化和MRI体积分割 从所有数据集的MRI扫描获得NIFTI格式。...卷积神经网络模型开发 创建了一个3D CNN来进行阿尔茨海默病和正常认知病例的分类，并将其结果与FCN模型进行了比较。CNN模型是在与FCN模型相同的数据分割上进行训练、验证和测试的。...在ADNI验证数据集上性能最好的CNN模型被用于预测测试数据集上的阿尔茨海默病状态。 ? 补充图3.三维卷积神经网络（CNN）示意图。...t-SNE方法获取高维数据并创建该数据的低维表示，从而可以很容易地可视化。...FCN结合MLP，直接从MRI数据或从MRI数据和现成的非影像数据的组合中预测阿尔茨海默病状态。
之前整理的数据相关内容 数据的模态有 Clinical Data(临床数据) Genetic(基因数据) MRI PET BIOSPECIMEN(生物样本) 各模态数据的内容、特点 Clinical...完整的临床数据集可以作为逗号分隔值(CSV)文件批量下载 基因数据 内容： 受试者的基因分型和测序数据，数据格式：CSV，VCF，BAM 基因分型数据： APOE Genotyping -- CSV...保存vcf的FORMAT列的原始形式，类型为str 现下载了一个较小的文件，数据量为：39.5 M(不知道当时是怎么找到的了)，里面的信息以条为单位，其中前十记录表现为： Record(CHROM=gi...内容： 原始、预处理和后处理的图像文件，FMRI和DTI 数据格式： MRI(structural, diffusion weighted imaging, perfusion, and resting...下载的数据： 单个图片大小：3.44 M 格式： NiFTI 尺寸： 91 * 109 * 91 使用Mango可直接显示图片，效果如下 ?
所提出的网络在三个权威的MRI脑肿瘤基准数据集和一个自有的数据集上进行了评估，并在 BraTS 2020 数据集上实现了94.4%的Dice分数，从而建立了多个新的性能基准。 1....这启发作者模块从病变图像中提取丰富的全面信息。 多尺度Transformer。虽然CNN已经有效利用了多尺度特征表示，但在视觉Transformer中这一潜力尚未被充分探索。...所有的 BraTS 多模态扫描均以 NIfTI 文件（.nii.gz）形式提供，并包含以下内容：I）原始T1加权扫描（TiN），II）对比增强T1加权扫描（T1C/T1CE，也称为T1Gd），III）T2...该数据集包括来自194名胶质瘤患者的T1c和T2 MRI图像，并由高级放射学家对整个肿瘤进行了标注。由于作者的模型是2D的，因此作者将每个3D MRI图像切成多张2D切片。详细情况参见表2。...这归因于私有数据集包含的模态数和肿瘤特征较少，限制了模型学习最优特征的能力。 Comparisons 提出的A4-Unet模型遵循了标准的CNN分割网络设计范式。
二、CuRIOUS2022任务 包括两项任务： 任务 1：术中超声中的脑肿瘤分割 任务 2：术中超声中的切除腔分割 三、CuRIOUS2022数据集 对于每个临床病例，提供的数据是：术前 3T MRI...成像数据以 MINC-2 和 NIFTI-1 格式提供，分割以 NIFTI-1 格式提供。所有图像、MRI、iUS 和分割都在同一个参考空间中。...大小，并采用均值为0，方差为1进行归一化，将数据划分成训练集（20例）和验证集（3例），其中训练集进行10倍数据增强。...0.213x0.213x0.213，对图像进行缩放固定到160x160x160大小，并采用均值为0，方差为1进行归一化，将数据划分成训练集（20例）和验证集（3例），其中训练集进行10倍数据增强。...0.213x0.213x0.213，对图像进行缩放固定到160x160x160大小，并采用均值为0，方差为1进行归一化，将数据划分成训练集（20例）和验证集（3例），其中训练集进行10倍数据增强。
放射学图像有6种主要格式--DICOM（医学数字成像和通信），NIFTI（神经影像信息技术），PAR / REC（飞利浦MRI扫描仪格式），ANALYZE（梅奥医学影像），NRRD（近原始光栅数据） ）...这些是您可以在扫描仪或医院PACS（图片存档和通信系统）之外预期的文件格式。它包括文件格式和网络通信协议，该协议使用TCP / IP在能够以DICOM格式接收图像和患者数据的实体之间进行通信。...DICOM文件由标题和同一文件（* .dcm）中的图像数据组成。标题的大小取决于提供的标题信息量。标题包含诸如患者ID，患者姓名，模态和其他信息的信息。它还定义了包含多少帧以及哪些分辨率。 ?...首先，我们看下包的安装： install.packages("oro.dicom") 接下来我们依次从数据的读取，保存，展示来进行解析此包： 1....通过这些数据我们就可以对多期的DICOM文件进行校准，对应起来。
有急性症状的患者不能遵守屏气指令，导致图像质量下降和分析不准确。 在这个挑战数据是真实的心脏 MRI 数据集，包括具有不同呼吸运动水平的极端情况。...这样的 CMR 扫描大约需要 40 分钟。志愿者接受培训以在采集过程中保持心率稳定。预处理：我们不对 CMR 图像进行预处理，除了从 DICOM 文件到 NIFTI 文件的匿名化和导出。...任务 2：具有呼吸运动伪影的CMR图像分割 数据：扫描仪：西门子 3T MRI 扫描仪 (MAGNETOM Vida)。...这样的 CMR 扫描大约需要 40 分钟。志愿者接受培训以在采集过程中保持心率稳定。预处理：我们不对 CMR 图像进行预处理，除了从 DICOM 文件到 NIFTI 文件的匿名化和导出。...具有严重运动伪影的图像从该任务中被丢弃并且不被分割。训练数据可用，而验证和测试用例对参与者不可用。允许公开可用的数据。但必须提供数据来源。 指标：骰子分数和 95% Hausdorff 距离。
三、BraTS2023-MEN数据集 BraTS 脑膜瘤挑战赛的 MRI 数据由美国主要学术医疗中心提供。...所有 MRI 脑膜瘤 MRI 研究均在术前和治疗前进行，如果视野中包含一个或多个放射学或病理学上与脑膜瘤一致的肿瘤，则纳入研究。...包含任何放射学或病理学上与脑膜瘤不相符的颅内肿瘤的 MRI 研究被排除在外。...mpMRI系列的预处理包括从DICOM到神经影像信息技术倡议（NIfTI）图像文件格式的转换；将单个图像系列（T1 加权、T2 加权等）共同配准到 SRI24 图集空间，包括均匀 1 mm3 各向同性重采样...3、图像预处理，对步骤2的原始图像进行像素值（1，99）截断，然后采用均值为0，方差为1的方式进行归一化处理。然后将数据分成训练集和验证集，对训练集做5倍数据增强处理。
因此，为了理解如何从K空间中的数据变换 得到图像空间中的数据，必须首先理解傅立叶变换。 10. MRI与fMRI 解析： （1）MRI扫的是大脑的结构图像，也叫T1权重图像。...虽然它的空间分辨率比较低， 但是时间分辨率很高，可以在很短的时间内扫出一叠功能图像。这样就可以研究实验操作究竟是如何影响大脑的MRI 信号的。 11....在fMRI的早期，Analyze格式最常用的格式，但现在逐渐被 NIfTI格式所取代。Analyze格式主要不足就是头文件不能真正反映元数据。 16....NIfTI格式 解析：标准NIfTI图像的扩展名是.nii，包含了头文件及图像资料。...由于NIfTI格式和Analyze格式的关系，因此NIfTI格式 也可使用独立的图像文件（.img）和头文件（.hdr）。
因此，挑战赛集中在获取精确且连接的脑血管分段上，这些分段密集地覆盖了从每个图像的主供血动脉分支的血管。 人脑通过大脑中的血管接收营养和氧气。...小血管的病理学，即介观尺度，是脑血液供应的脆弱组成部分，可导致严重的并发症，如脑小血管疾病 （CSVD）。随着 7T MRI 系统的进步，可以达到更高的空间图像分辨率，从而可以在大脑中可视化此类血管。...通过结合自动预分割和大量手动调整，生成了使用 7T MRI 获取的飞行时间 （ToF） 血管造影的注释数据集。...三、SMILE-UHURA Challenge 2023数据集 该数据由具有 16 位表示的 NIfTI 卷组成，图像分辨率为 0.227x0.227x0.227mm，由介入神经放射科医生使用 GE INNOVA...数据库中的每张图像都包括从颈内动脉 （ICA） 分支的脑动脉的手动分割。两位在神经血管解剖学和 X 射线图像方面经验丰富的研究人员使用 3DSlicer 界面仔细描绘和交叉检查了这些图像。
马萨诸塞州道路数据集是卫星标注图像，从航空图像中分割道路是一项具有挑战性的任务。...首先简单介绍一下代码的功能： 创建原始数据的文件夹Task120_MassRoadsSeg以及子文件夹imagesTr、imagesTs、labelsTs、labelsTr。.../road_segmentation_ideal路径内的有训练集training和测试集testing两个文件夹，数据集文件夹内有输入图像input和标签output两个文件夹，分别提取到每个数据的名称...下载数据集、修改文件路径并创建nnUnet能识别的文件夹 # download dataset from https://www.kaggle.com/insaff/massachusetts-roads-dataset...创建原始数据的文件夹Task120_MassRoadsSeg以及子文件夹imagesTr、imagesTs、labelsTs、labelsTr。 4.
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