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如何理解GWASManhattan plotQQ plot所传递信息

配图来源:GWAS Catalog ----/ START /---- 在GWAS研究,Manhattan plotQQ plot是最常画两类图,它们可以把跟研究性状(比如,基因型身高)显著相关基因位点清晰地展现出来...曼哈顿夜景 Q-Q plot(QQ图)虽然所用数据上面曼哈顿图一样,但是它要表达信息比起曼哈顿图来要丰富得多,而且在这两个图中更加能够体现GWAS结果好坏是QQ plot——它是GWAS研究更加重要质控图...其实,一直以来QQ plot是统计学分析常用图,在1968年Wilk.M.B这篇文章(doi:10.1093/biomet/55.1.1)就提出了如何绘制这样图已经它用途。...在GWAS分析,当我们通过曼哈顿图看到某些SNP表型性状(或者疾病)有着很强相关信号(比如,p-value < 10^-6甚至10^-8)时,依然不能直接认为这些位点就与表型显著相关。...那么现在问题就是,我们应该如何做才能够有效地判断出这个研究中所获得关联结果确实是与表型性状或者疾病相关呢? 这就是我们要用上QQ-plot地方了。

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Rstackunstack函数

我们用R做数据处理时候,经常要对数据格式进行变换。例如将数据框(dataframe)转换成列表(list),或者反过来将列表转换成数据框。...那么今天小编就给大家介绍一对R函数来实现这样功能。 这一对函数就叫做stackunstack。字面意思上来看就是堆叠去堆叠,就像下面这张图展示这样。...那么R里面这两个函数具体可以实现什么样功能呢?下面这张图可以帮助大家来理解。unstack就是根据数据框第二列分组信息,将第一列数据划分到各个组,是一个去堆叠过程。...一、unstack 下面我们来看几个具体例子 例如现在我们手上有一个数据框,里面的数据来自PlantGrowth 我们可以先看看PlantGrowth 内容,第一列是重量,第二列是不同处理方式...df = PlantGrowth unstacked_df = unstack(df) unstacked_df 结果如下,因为这里ctrl,trt1trt2样本刚好都是10个,所以这里结果看上去还像是一个数据框

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Rgrepgrepl函数

在日常数据分析过程,我们经常需要在一个字符串或者字符串向量查找是否包含我们要找东西,或者向量那几个元素包含我们要查找内容。...这个时候我们会用到R中最常用两个函数,grepgrepl。...其实grep这个函数也并非是R所特有的,在linux模式匹配也用grep这个函数,前面我就给大家简单介绍过☞Linux xargs grep zgrep命令。...我们先来看看grepgrepl这两个函数用法。 这两个函数最大区别在于grep返回找到位置,grepl返回是否包含要查找内容。接下来我们结合具体例子来讲解。...☞讨论学习Rgrepl函数 参考资料: ☞Linux xargs grep zgrep命令 ☞讨论学习Rgrepl函数

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如何 Python 列表删除所有出现元素?

本文将介绍如何使用简单而又有效方法, Python 列表删除所有出现元素。方法一:使用循环与条件语句删除元素第一种方法是使用循环条件语句来删除列表中所有特定元素。...具体步骤如下:遍历列表每一个元素如果该元素等于待删除元素,则删除该元素因为遍历过程删除元素会导致索引产生变化,所以我们需要使用 while 循环来避免该问题最终,所有特定元素都会列表删除下面是代码示例...具体步骤如下:创建一个新列表,遍历旧列表每一个元素如果该元素不等于待删除元素,则添加到新列表中最终,新列表不会包含任何待删除元素下面是代码示例:def remove_all(lst, item...= item]同样,我们可以使用该函数删除 Python 列表中所有出现元素:my_list = [1, 2, 3, 2, 4, 2, 5]my_list = remove_all(my_list,...结论本文介绍了两种简单而有效方法,帮助 Python 开发人员列表删除所有特定元素。使用循环条件语句方法虽然简单易懂,但是性能相对较低。使用列表推导式方法则更加高效。

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如何 Python 字符串列表删除特殊字符?

Python 提供了多种方法来删除字符串列表特殊字符。本文将详细介绍在 Python 删除字符串列表特殊字符几种常用方法,并提供示例代码帮助你理解应用这些方法。...方法一:使用列表推导式字符串函数我们可以使用列表推导式字符串函数删除字符串列表特殊字符。首先,我们定义一个包含特殊字符字符串列表。...示例代码下面是使用列表推导式字符串函数删除字符串列表特殊字符示例代码:def remove_special_characters(strings): special_characters =...示例代码下面是使用正则表达式删除字符串列表特殊字符示例代码:import redef remove_special_characters(strings): pattern = r"[^a-zA-Z0...希望本文对你理解如何 Python 字符串列表删除特殊字符有所帮助,并能够在实际编程得到应用。

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在Bash如何字符串删除固定前缀后缀

更多好文请关注↑ 问: 我想从字符串删除前缀/后缀。例如,给定: string="hello-world" prefix="hell" suffix="ld" 如何获得以下结果?...如果模式与 parameter 扩展后开始部分匹配,则扩展结果是 parameter 扩展后删除最短匹配模式(一个 # 情况)或最长匹配模式(## 情况)值 ${parameter...如果模式与 parameter 扩展后末尾部分匹配,则扩展结果是 parameter 扩展后删除最短匹配模式(一个 % 情况)或最长匹配模式(%% 情况)值。...e "s/$suffix$//" o-wor 在sed命令,^ 字符匹配以 prefix 开头文本,而结尾 匹配以 参考文档: stackoverflow question 16623835...在Bash如何将字符串转换为小写 在shell编程$(cmd) `cmd` 之间有什么区别 如何Bash变量删除空白字符 更多好文请关注↓

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如何删除 Linux 空文件目录?

在 Linux 系统,有时我们需要删除文件目录。空文件目录不包含任何内容,它们可能是我们意外创建或者是不再需要。...本文将详细介绍如何在 Linux 删除空文件目录,同时提供多个实际示例,以便您能够轻松地完成这个任务。...以下是删除非空目录示例:删除名为 mydir 非空目录及其内容:rm -r mydir删除位于 /tmp 目录下名为 testdir 非空目录及其内容:rm -r /tmp/testdir删除当前目录下所有以...请确保您选择正确目录并备份重要数据。结论通过本文指导,您已经学会了如何删除 Linux 空文件目录。无论是删除空文件还是空目录,您都可以使用 rm 命令 rmdir 命令来轻松完成任务。...对于非空目录,您可以使用 rm 命令递归参数 -r 或 -rf。请牢记,在删除文件目录时要小心谨慎,并确保您选择正确文件目录。

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如何删除 Linux 空文件目录?

在 Linux 系统,有时我们需要删除文件目录。空文件目录不包含任何内容,它们可能是我们意外创建或者是不再需要。...本文将详细介绍如何在 Linux 删除空文件目录,同时提供多个实际示例,以便您能够轻松地完成这个任务。...以下是删除非空目录示例:删除名为 mydir 非空目录及其内容:rm -r mydir删除位于 /tmp 目录下名为 testdir 非空目录及其内容:rm -r /tmp/testdir删除当前目录下所有以...请确保您选择正确目录并备份重要数据。结论通过本文指导,您已经学会了如何删除 Linux 空文件目录。无论是删除空文件还是空目录,您都可以使用 rm 命令 rmdir 命令来轻松完成任务。...对于非空目录,您可以使用 rm 命令递归参数 -r 或 -rf。请牢记,在删除文件目录时要小心谨慎,并确保您选择正确文件目录。

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如何优雅Array删除一个元素

最近没有什么新文章可写了, 把以前笔记拿来整理下, 做成文章以保持活跃度... JavaScript数组删除元素是开发人员经常遇到常见编程范例。...使用splice删除一个元素() 这个方法是在卸下,更换,/或添加数组元素通用方式。它与其他语言中splice()函数类似。基本上,你采取一个数组并有选择地删除一部分(又名“拼接”)。...splice()函数输入是要开始索引点删除元素数。 另外,请记住,数组在JavaScript是零索引。...该移位()命令将删除阵列第一个元素unshift()命令将一个元素添加到数组开始。...如果你需要进行大量过滤,使用filter()方法可能会清理你代码。 结论 归结起来,在JavaScript数组删除元素非常简单。

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如何在git删除指定文件目录

部分场景,我们会希望删除远程仓库(比如GitHub)目录或文件。...具体操作 拉取远程Repo到本地(如果已经在本地,可以略过) $ git clone xxxxxx 在本地仓库删除文件 $ git rm 我文件 在本地仓库删除文件夹 $ git rm -r...我文件夹/ 此处-r表示递归所有子目录,如果你要删除,是空文件夹,此处可以不用带上-r。...提交代码 $ git commit -m"我修改" 推送到远程仓库(比如GitHub) $ git push origin xxxxxx 补充: git rm 查看git rm说明文档: $ git...-n, --dry-run 演习 -q, --quiet 不列出删除文件 --cached 只索引区删除 -f, --force 忽略文件更新状态检查 -r 允许递归删除 --ignore-unmatch

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VC2008如何为MFC应用程序添加删除消息响应函数

VC2008下添加删除常见消息响应函数有两种方法:自动手动。     ...· 3.在消息列表框,选择需要添加消息。 · 4.这样就可以在代码框中看到,OnCreate已经添加了。 想要删除的话再到消息框中选删除就可以了。          ...二、VC2008手动添加或删除消息响应函数             可以参照CSDN博主kivcare这篇博客:Vc2008如何为视图类添加消息响应,他方法是手动添加消息响应函数删除的话就是逆过程了...手动删除消息响应函数需要删掉三个地方,以删除菜单响应函数为例时包括以下三个部分:             1、头文件定义,如afx_msg void OnDialogModel();            ...CMyboleView::OnDialogModel()函数定义实现部分:            看来以后得多使用一下VS2008这套工具,可以通过学习MFCWin32应用程序多加练习。

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【MySQL】面试官:如何查询删除MySQL重复记录?

作者个人研发在高并发场景下,提供简单、稳定、可扩展延迟消息队列框架,具有精准定时任务延迟队列处理功能。...写在前面 最近,有小伙伴出去面试,面试官问了这样一个问题:如何查询删除MySQL重复记录?相信对于这样一个问题,有不少小伙伴会一脸茫然。那么,我们如何来完美的回答这个问题呢?...今天,我们就一起来探讨下这个经典MySQL面试题。 问题分析 对于标题中问题,有两种理解。第一种理解为将标题问题拆分为两个问题,分别为:如何查询MySQL重复记录?...如何删除MySQL重复记录?另一种理解为:如何查询并删除MySQL重复记录? 没关系,不管怎么理解,我们今天都要搞定它!! 为了小伙伴们更好理解如何在实际工作解决遇到类似问题。...这里,我就不简单回答标题问题了,而是以SQL语句来实现各种场景下,查询删除MySQL数据库重复记录。

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如何在 Linux 系统防止文件目录被意外删除或修改

有个简单又有用命令行工具叫chattr(Change Attribute 缩写),在类 Unix 等发行版,能够用来防止文件目录被意外删除或修改。...在这篇简短教程,我们一起来看看怎么在实际应用中使用 chattr 命令,来防止文件目录被意外删除。...Linux防止文件目录被意外删除修改 默认,chattr 命令在大多数现代 Linux 操作系统是可用。...防止文件目录被意外删除,但允许追加操作 我们现已知道如何防止文件目录被意外删除修改了。接下来,我们将防止文件被删除但仅仅允许文件被追加内容。...删除这个属性,执行下面这个命令: 针对文件: $ sudo chattr -R -a file.txt 针对目录: $ sudo chattr -R -a dir1/ 现在,你可以想平常一样删除或修改这个文件目录了

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如何通过命令查看python所有内置函数内置常量

参考链接: Python帮助help函数 如何通过命令查看python所有内置函数内置常量 举例python版本:  利用python语句输出python所有内置函数及内置常量名: ...     'str',      'sum',      'super',      'tuple',      'type',      'vars',      'zip'] 大写字母开头是...python内置常量名,小写字母开头是python内置函数名。...进一步查看内置函数用法可以:      # help(内置函数名)     help(list) ps: 本人热爱图灵,热爱本聪,热爱V神,热爱一切被梨花照过姑娘。...以下是我个人公众号,如果有技术问题可以关注我公众号来跟我交流。 同时我也会在这个公众号上每周更新我原创文章,喜欢小伙伴或者老伙计可以支持一下! 如果需要转发,麻烦注明作者。十分感谢!

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如何通过命令查看python所有内置函数内置常量

参考链接: Pythonid函数 如何通过命令查看python所有内置函数内置常量 举例python版本:  利用python语句输出python所有内置函数及内置常量名:     ...     'str',      'sum',      'super',      'tuple',      'type',      'vars',      'zip'] 大写字母开头是...python内置常量名,小写字母开头是python内置函数名。...进一步查看内置函数用法可以:      # help(内置函数名)     help(list) ps: 本人热爱图灵,热爱本聪,热爱V神,热爱一切被梨花照过姑娘。...以下是我个人公众号,如果有技术问题可以关注我公众号来跟我交流。 同时我也会在这个公众号上每周更新我原创文章,喜欢小伙伴或者老伙计可以支持一下! 如果需要转发,麻烦注明作者。十分感谢!

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R语言建模入门:如何理解formulay~.y~x:z含义?

背景:2019年某月末日,三路人开局,兴趣所致组建了“花儿少年”:一个有组织、有纪律R语言入门交流学习组织。自此,开启了一段小白&大师成长史。...01 — 如何理解formulay~.y~x:z含义? y~. y~x:z 是一个简单formula。~ : 是formula运算符,但它们与通常理解数学运算符存在一定差距。...以下是formula其他一些运算符含义: ~ :~连接公式两侧,~左侧是因变量,右侧是自变量。 + :模型不同项用+分隔。注意R语言中默认表达式带常数项,因此估计 只需要写y~x。...- :-表示模型移除某一项,y~x-1表示模型移除常数项,估计是一个不带截距项过原点回归方程。此外,y~x+0或y~0+x也可以表示不带截距项回归方程。...(←是大写i不是小写L) y~x+I(z^2)含义: y~x+z^2含义: (因为z没法自己交互) 那么,y~x+w+zy~x+I(w+z)有什么区别呢?

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