配图来源:GWAS Catalog ----/ START /---- 在GWAS研究中,Manhattan plot和QQ plot是最常画的两类图,它们可以把跟研究的性状(比如,基因型和身高)显著相关的基因位点清晰地展现出来...曼哈顿夜景 Q-Q plot(QQ图)虽然所用的数据和上面曼哈顿图的一样,但是它要表达的信息比起曼哈顿图来要丰富得多,而且在这两个图中更加能够体现GWAS结果好坏的是QQ plot——它是GWAS研究中更加重要的质控图...其实,一直以来QQ plot是统计学分析中的常用图,在1968年Wilk.M.B的这篇文章(doi:10.1093/biomet/55.1.1)就提出了如何绘制这样的图已经它的用途。...在GWAS分析中,当我们通过曼哈顿图看到某些SNP和表型性状(或者疾病)有着很强的相关信号(比如,p-value < 10^-6甚至10^-8)时,依然不能直接认为这些位点就与表型显著相关的。...那么现在的问题就是,我们应该如何做才能够有效地判断出这个研究中所获得关联结果确实是与表型性状或者疾病相关的呢? 这就是我们要用上QQ-plot的地方了。
我们用R做数据处理的时候,经常要对数据的格式进行变换。例如将数据框(dataframe)转换成列表(list),或者反过来将列表转换成数据框。...那么今天小编就给大家介绍一对R函数来实现这样的功能。 这一对函数就叫做stack和unstack。从字面意思上来看就是堆叠和去堆叠,就像下面这张图展示的这样。...那么R里面这两个函数具体可以实现什么样的功能呢?下面这张图可以帮助大家来理解。unstack就是根据数据框的第二列的分组信息,将第一列的数据划分到各个组,是一个去堆叠的过程。...一、unstack 下面我们来看几个具体的例子 例如现在我们手上有一个数据框,里面的数据来自PlantGrowth 我们可以先看看PlantGrowth 中的内容,第一列是重量,第二列是不同的处理方式...df = PlantGrowth unstacked_df = unstack(df) unstacked_df 结果如下,因为这里ctrl,trt1和trt2中的样本刚好都是10个,所以这里结果看上去还像是一个数据框
在日常数据分析的过程中,我们经常需要在一个字符串或者字符串向量中查找是否包含我们要找的东西,或者向量中那几个元素包含我们要查找的内容。...这个时候我们会用到R中最常用的两个函数,grep和grepl。...其实grep这个函数也并非是R所特有的,在linux中模式匹配也用grep这个函数,前面我就给大家简单介绍过☞Linux xargs grep zgrep命令。...我们先来看看grep和grepl这两个函数的用法。 这两个函数最大的区别在于grep返回找到的位置,grepl返回是否包含要查找的内容。接下来我们结合具体的例子来讲解。...☞讨论学习R的grepl函数 参考资料: ☞Linux xargs grep zgrep命令 ☞讨论学习R的grepl函数
方案 在一个新的 R 会话中使用 search() 可以查看默认加载的包。...#> [19] "package:datasets" "package:methods" #> [21] "Autoloads" "package:base" 以下提供的函数能够列出包中的函数和对象...showPackageContents <- function(packageName) { # 获取特定包所有内容的列表 funlist <- objects(packageName)...移除包含箭头 <- 的东西 idx <- grep("<-", funlist) if (length(idx) !...qr.resid qr.solve qr.X quarters quarters.Date quarters.POSIXt quit R_system_version R.home R.Version
本文将介绍如何使用简单而又有效的方法,从 Python 列表中删除所有出现的元素。方法一:使用循环与条件语句删除元素第一种方法是使用循环和条件语句来删除列表中所有特定元素。...具体步骤如下:遍历列表中的每一个元素如果该元素等于待删除的元素,则删除该元素因为遍历过程中删除元素会导致索引产生变化,所以我们需要使用 while 循环来避免该问题最终,所有特定元素都会从列表中删除下面是代码示例...具体步骤如下:创建一个新列表,遍历旧列表中的每一个元素如果该元素不等于待删除的元素,则添加到新列表中最终,新列表中不会包含任何待删除的元素下面是代码示例:def remove_all(lst, item...= item]同样,我们可以使用该函数来删除 Python 列表中所有出现的元素:my_list = [1, 2, 3, 2, 4, 2, 5]my_list = remove_all(my_list,...结论本文介绍了两种简单而有效的方法,帮助 Python 开发人员从列表中删除所有特定元素。使用循环和条件语句的方法虽然简单易懂,但是性能相对较低。使用列表推导式的方法则更加高效。
Python 提供了多种方法来删除字符串列表中的特殊字符。本文将详细介绍在 Python 中删除字符串列表中特殊字符的几种常用方法,并提供示例代码帮助你理解和应用这些方法。...方法一:使用列表推导式和字符串函数我们可以使用列表推导式和字符串函数来删除字符串列表中的特殊字符。首先,我们定义一个包含特殊字符的字符串列表。...示例代码下面是使用列表推导式和字符串函数删除字符串列表中特殊字符的示例代码:def remove_special_characters(strings): special_characters =...示例代码下面是使用正则表达式删除字符串列表中特殊字符的示例代码:import redef remove_special_characters(strings): pattern = r"[^a-zA-Z0...希望本文对你理解如何从 Python 中的字符串列表中删除特殊字符有所帮助,并能够在实际编程中得到应用。
更多好文请关注↑ 问: 我想从字符串中删除前缀/后缀。例如,给定: string="hello-world" prefix="hell" suffix="ld" 如何获得以下结果?...如果模式与 parameter 扩展后的值的开始部分匹配,则扩展的结果是从 parameter 扩展后的值中删除最短匹配模式(一个 # 的情况)或最长匹配模式(## 的情况)的值 ${parameter...如果模式与 parameter 扩展后的值的末尾部分匹配,则扩展的结果是从 parameter 扩展后的值中删除最短匹配模式(一个 % 的情况)或最长匹配模式(%% 的情况)的值。...e "s/$suffix$//" o-wor 在sed命令中,^ 字符匹配以 prefix 开头的文本,而结尾的 匹配以 参考文档: stackoverflow question 16623835...在Bash中如何将字符串转换为小写 在shell编程中$(cmd) 和 `cmd` 之间有什么区别 如何从Bash变量中删除空白字符 更多好文请关注↓
在 Linux 系统中,有时我们需要删除空的文件和目录。空文件和目录不包含任何内容,它们可能是我们意外创建的或者是不再需要的。...本文将详细介绍如何在 Linux 中删除空文件和目录,同时提供多个实际示例,以便您能够轻松地完成这个任务。...以下是删除非空目录的示例:删除名为 mydir 的非空目录及其内容:rm -r mydir删除位于 /tmp 目录下名为 testdir 的非空目录及其内容:rm -r /tmp/testdir删除当前目录下所有以...请确保您选择正确的目录并备份重要的数据。结论通过本文的指导,您已经学会了如何删除 Linux 中的空文件和目录。无论是删除空文件还是空目录,您都可以使用 rm 命令和 rmdir 命令来轻松完成任务。...对于非空目录,您可以使用 rm 命令的递归参数 -r 或 -rf。请牢记,在删除文件和目录时要小心谨慎,并确保您选择正确的文件和目录。
最近没有什么新文章可写了, 把以前的笔记拿来整理下, 做成文章以保持活跃度... 从JavaScript数组中删除元素是开发人员经常遇到的常见编程范例。...使用splice删除一个元素() 这个方法是在卸下,更换,和/或添加数组中的元素的通用方式。它与其他语言中的splice()函数类似。基本上,你采取一个数组并有选择地删除它的一部分(又名“拼接”)。...splice()函数的输入是要开始的索引点和要删除的元素数。 另外,请记住,数组在JavaScript中是零索引的。...该移位()命令将删除阵列和的第一个元素的unshift()命令将一个元素添加到数组的开始。...如果你需要进行大量的过滤,使用filter()方法可能会清理你的代码。 结论 归结起来,在JavaScript中从数组中删除元素非常简单。
部分场景中,我们会希望删除远程仓库(比如GitHub)的目录或文件。...具体操作 拉取远程的Repo到本地(如果已经在本地,可以略过) $ git clone xxxxxx 在本地仓库删除文件 $ git rm 我的文件 在本地仓库删除文件夹 $ git rm -r...我的文件夹/ 此处-r表示递归所有子目录,如果你要删除的,是空的文件夹,此处可以不用带上-r。...提交代码 $ git commit -m"我的修改" 推送到远程仓库(比如GitHub) $ git push origin xxxxxx 补充: git rm 查看git rm的说明文档: $ git...-n, --dry-run 演习 -q, --quiet 不列出删除的文件 --cached 只从索引区删除 -f, --force 忽略文件更新状态检查 -r 允许递归删除 --ignore-unmatch
索引数据框中的某一列 df$A可以索引数据框df中列名为A的列的所有值。那么假如列名是一个R对象怎么做?...分别指定为x轴和y轴)指定绘图属性,但如果列名字是一个R对象呢?...这一情况常发生于自定义函数时。 library(ggplot2) ggplot(data=df, aes(x=A, y=B)) + geom_point() 如下:就需要使用sym和!!...看新的例子中,xvariable="A";xvariable_en <- sym(xvariable)转换为了symbol;aes(x=!!xvariable_en)等同于直接写aes(x=A)。...兜兜转转,2步转换把想传的值传进去了。 # 注意sym和!!
概述 在这个实例中,我们将会演示如何删除在 Java 中定义的 List 的第 1 个元素。...List,我们来演示在 ArrayList 中删除第一个元素,然后确定删除后的 List 不再包含有任何一句删除的元素了。...这是因为 ArrayList 在 List 中是使用 Array(数组)的,当我们使用删除方法的时候,ArrayList 将会重新将剩余的元素进行拷贝。...结论 在本文中,我们对如何对 List 中的第一个元素进行删除进行了说明和讨论。 并且针对 List 接口的 2 个实现来分别了解了不同的时间复杂度。... 中进行下载和编译。
VC2008下添加和删除常见的消息响应函数有两种方法:自动和手动。 ...· 3.在消息列表框中,选择需要添加的消息。 · 4.这样就可以在代码框中看到,OnCreate已经添加了。 想要删除的话再到消息框中选删除就可以了。 ...二、VC2008中手动添加或删除消息响应函数 可以参照CSDN博主kivcare这篇博客:Vc2008中如何为视图类添加消息响应,他的方法是手动添加消息响应函数,删除的话就是逆过程了...手动删除消息响应函数需要删掉三个地方,以删除菜单响应函数为例时包括以下三个部分: 1、头文件中的定义,如afx_msg void OnDialogModel(); ...CMyboleView::OnDialogModel()函数的定义实现部分: 看来以后得多使用一下VS2008这套工具,可以通过学习MFC和Win32应用程序多加练习。
作者个人研发的在高并发场景下,提供的简单、稳定、可扩展的延迟消息队列框架,具有精准的定时任务和延迟队列处理功能。...写在前面 最近,有小伙伴出去面试,面试官问了这样的一个问题:如何查询和删除MySQL中重复的记录?相信对于这样一个问题,有不少小伙伴会一脸茫然。那么,我们如何来完美的回答这个问题呢?...今天,我们就一起来探讨下这个经典的MySQL面试题。 问题分析 对于标题中的问题,有两种理解。第一种理解为将标题的问题拆分为两个问题,分别为:如何查询MySQL中的重复记录?...如何删除MySQL中的重复记录?另一种理解为:如何查询并删除MySQL中的重复记录? 没关系,不管怎么理解,我们今天都要搞定它!! 为了小伙伴们更好的理解如何在实际工作中解决遇到的类似问题。...这里,我就不简单的回答标题的问题了,而是以SQL语句来实现各种场景下,查询和删除MySQL数据库中的重复记录。
有个简单又有用的命令行工具叫chattr(Change Attribute 的缩写),在类 Unix 等发行版中,能够用来防止文件和目录被意外的删除或修改。...在这篇简短的教程中,我们一起来看看怎么在实际应用中使用 chattr 命令,来防止文件和目录被意外删除。...Linux中防止文件和目录被意外删除和修改 默认,chattr 命令在大多数现代 Linux 操作系统中是可用的。...防止文件和目录被意外删除,但允许追加操作 我们现已知道如何防止文件和目录被意外删除和修改了。接下来,我们将防止文件被删除但仅仅允许文件被追加内容。...删除这个属性,执行下面这个命令: 针对文件: $ sudo chattr -R -a file.txt 针对目录: $ sudo chattr -R -a dir1/ 现在,你可以想平常一样删除或修改这个文件和目录了
参考链接: Python中的帮助help函数 如何通过命令查看python中的所有内置函数和内置常量 举例python版本: 利用python中的语句输出python中的所有内置函数及内置常量名: ... 'str', 'sum', 'super', 'tuple', 'type', 'vars', 'zip'] 大写字母开头的是...python的内置常量名,小写字母开头的是python的内置函数名。...进一步查看内置函数的用法可以: # help(内置函数名) help(list) ps: 本人热爱图灵,热爱中本聪,热爱V神,热爱一切被梨花照过的姑娘。...以下是我个人的公众号,如果有技术问题可以关注我的公众号来跟我交流。 同时我也会在这个公众号上每周更新我的原创文章,喜欢的小伙伴或者老伙计可以支持一下! 如果需要转发,麻烦注明作者。十分感谢!
参考链接: Python中的id函数 如何通过命令查看python中的所有内置函数和内置常量 举例python版本: 利用python中的语句输出python中的所有内置函数及内置常量名: ... 'str', 'sum', 'super', 'tuple', 'type', 'vars', 'zip'] 大写字母开头的是...python的内置常量名,小写字母开头的是python的内置函数名。...进一步查看内置函数的用法可以: # help(内置函数名) help(list) ps: 本人热爱图灵,热爱中本聪,热爱V神,热爱一切被梨花照过的姑娘。...以下是我个人的公众号,如果有技术问题可以关注我的公众号来跟我交流。 同时我也会在这个公众号上每周更新我的原创文章,喜欢的小伙伴或者老伙计可以支持一下! 如果需要转发,麻烦注明作者。十分感谢!
背景:2019年的某月末日,三路人开局,兴趣所致组建了“花儿少年”:一个有组织、有纪律的R语言入门交流学习组织。自此,开启了一段小白&大师的成长史。...01 — 如何理解formula中y~.和y~x:z的含义? y~. 和 y~x:z 是一个简单的formula。~和 : 是formula中的运算符,但它们与通常理解的数学运算符存在一定的差距。...以下是formula中其他一些运算符的含义: ~ :~连接公式两侧,~的左侧是因变量,右侧是自变量。 + :模型中不同的项用+分隔。注意R语言中默认表达式带常数项,因此估计 只需要写y~x。...- :-表示从模型中移除某一项,y~x-1表示从模型中移除常数项,估计的是一个不带截距项的过原点的回归方程。此外,y~x+0或y~0+x也可以表示不带截距项的回归方程。...(←是大写的i不是小写的L) y~x+I(z^2)的含义: y~x+z^2的含义: (因为z没法和自己交互) 那么,y~x+w+z和y~x+I(w+z)有什么区别呢?
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