如何使用空列表初始化data.table列并对其进行循环？ - 腾讯云开发者社区

构造数据集下面是一个可重复的例子，构造两个数据集，一个是基于 data.frame 的列表，另一个是就要 data.table 的列表： x <- list( a = data.frame(r1...本质上是 data.table 体格的泛型函数不支持类似基础包中的操作。如何编写代码支持对上述数据集的连接操作？...如果 be_join 不为空，进行如下的循环：如果存在，则将这个子集和 to_join 按共同列合并如果不存在，使用循环位移一位，将当前 be_join 的第 2 个子集移动为第 1 个。...检查 be_join 第一个子集的列与 to_join 存在共同列等待循环结束我们可以查看结果： to_join[, c("r1", "r2", "r3", "r4", "r5")] #> r1...merge() 函数在进行连接操作时会输出有问题的结果，所以建议使用的小伙伴仔细检查结果。

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R语言学习笔记之——数据处理神器data.table

data.table 1、I/O性能： data.table的被推崇的重要原因就是他的IO吞吐性能在R语言诸多包中首屈一指，这里以一个1.6G多的2015年纽约自行车出行数据集为例来检验其性能到底如何，...data.table列索引列索引与数据框相比操作体验差异比较大，data.table的列索引摒弃了data.frame时代的向量化参数，而使用list参数进行列索引。...注意以上新建列时，如果只有一列，列名比较自由，写成字符串或者变量都可以，但是新建多列，必须严格按照左侧列名为字符串向量，右侧为列表的模式，当然你也可以使用第二种写法。...以上语法加入了新的参数.SDcols和.SD,咋一看摸不着头脑，其实是在按照carrier,origin,dest三个维度分组的基础上，对每个子块特定列进行均值运算。...SD, mean)则将各个子块的对应列应用于均值运算，并返回最终的列表。

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data.table包使用应该注意的一些细节

因此对于不是非常巨大的文件，建议设置为1，不要使用全部核心 fread中sep是自动检测的所以在循环读入文件的过程中，就算不同文件的分隔符不同，也可以循环一次性方便的读入；还有就算后续改变了文件的分隔符... as.matrix作用于data.table时会调用as.matrix.data.table，有一个rownames参数可以指定保留为行名的列矩阵转换成data.table时可以保留列名在...as.data.table函数中同样有一个rownames参数，设置为T可以将行名保留下来作为data.table的一列不建议set和for循环一起使用虽然set可以在内存上直接改变数值，但在R... 类似于集合运算，data.table中fintersect, fsetdiff, funion，fsetequal函数能对不同数据框的行求交集，差集，并集等可以直接对列按分隔符进行分割应用...tstrsplit函数可以将一列按照分隔符分成多列，函数返回的是一个列表，举例：DT[, c("c1", "c2") := tstrsplit(x, "/", fixed=TRUE)][]，将x列按照/

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R语言数据分析利器data.table包 —— 数据框结构处理精讲

将一个R对象转化为data.table，R可以时矢量，列表，data.frame等，keep.rownames决定是否保留行名或者列表名，默认FALSE,如果TRUE,将行名存在"rn"行中，keep.rownames...比：=还快，通常和循环配合使用至于这个操作究竟有多快，可以看一下(参照官方manual的命令），另外个人觉得最牛的三个函数是set(）,fread,和fwrite fread fread(input...(y)] #返回y列，返回data.table DT[, sum(y)] #对y列求和 DT[, ....(sum(y)), by=x] # 对x列进行分组后对各分组y列求总和 DT[, sum(y), keyby=x] #对x列进行分组后对各分组y列求和，并且结果按照x排序 DT[, sum(y)..., by=x][order(x)] #和上面一样，采取data.table的链接符合表达式 DT[v>1, sum(y), by=v] #对v列进行分组后,取各组中v>1的行出来，各组分别对定义的行中的

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For循环与向量化（Vectorization）

” 解决方法 For循环首先我们用R语言最底层的For循环进行函数的编写。我们定义向量长度为10000，重复运行1000次，测定计算其运行的中位数时长（为了防止极值对结果的影响）。...关于For循环和Vectorization的深入思考 Vectorization在更多包的拓展现在有很多的R包会对底层的一些函数进行优化，也即是对向量化的进一步优化，我们选择效率较为强大的data.table...，看看其对shift函数的优化情况。...总结通过上面的运行效率排序可以发现：我们也可以总结出以下两点：在R语言中一般意义上的数据操作，能够向量化尽量进行向量化，For循环尽量避免使用。...利用data.table进行数据操作有着比R本身向量化更好的效率表现，如果自身对效率的要求更高，可以利用更底层的语言接口进行编写。最后还有一点需要注意：向量化并不能解决一切问题。

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5个例子比较Python Pandas 和R data.table

让我们首先导入库并读取数据集。...data.table) melb <- fread("datasets/melb_data.csv") 示例1 第一个示例是关于基于数据集中的现有列创建新列。...我们还可以按升序或降序对结果进行排序。...我们使用计数函数来获得每组房屋的数量。”。N”可作为data.table中的count函数。默认情况下，这两个库都按升序对结果排序。排序规则在pandas中的ascending参数控制。...data.table中使用减号获得降序结果。示例5 在最后一个示例中，我们将看到如何更改列名。例如，我们可以更改类型和距离列的名称。

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R语言基因组数据分析可能会用到的data.table函数整理

包括两个方面，一方面是写的快，代码简洁，只要一行命令就可以完成诸多任务，另一方面是处理快，内部处理的步骤进行了程序上的优化，使用多线程，甚至很多函数是使用C写的，大大加快数据运行速度。...因此，在对大数据处理上，使用data.table无疑具有极高的效率。这里主要介绍在基因组数据分析中可能会用到的函数。...参数输入; stringsASFactors 是否转化字符串为因子; verbose 是否交互和报告运行时间； autostart 机器可读这个区域任何行号，默认1L,如果这行是空，...，不要其它的； drop 需要取掉的列名或者列号，要其它的； colClasses 类字符矢量，用于罕见的覆盖而不是常规使用，只会使一列变为更高的类型，不能降低类型； integer64...TRUE返回data.table，FALSE返回data.frame 可见1.8GB的数据读入94秒，读入文件速度非常快 fwrite 对数据框数据进行处理后，需要保存到文件，我们就可以使用

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R语言高级数据结构data.table

今天给大家介绍一个升级版的data.frame，其不仅可以存储不同数据类型还可以进行多列的并行运算。包的安装我们就不再赘述了（install.packages(“data.table”)）。...首先看下此格式数据的生成： fread 自带的读入数据的函数，可以直接将txt,csv读入并生成相应的data.table格式数据。...as.data.table 将R对象转化为data.table格式的数据，其对象可以为列表，向量，data.frame。...setDT(x) 其直接将R对象转化为data.table数据类型，从而不改变数据地址。...列的选取也发生了改变，其中引入了list的别名 .() 进行数据筛选： DT[,y] DT[,.(y)] ?

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R中的循环绘图

❝本节来介绍在 R中如何使用ggplot2结合for循环绘图并保存，下面通过一个案例来看具体操作 ❞ 加载R包 library(tidyverse) library(data.table) library...library(patchwork) 设置文件路径 file_name <- "loop_data.tsv" 读入数据 dat <- fread(file_name, sep="\t") 获取唯一的城市名称进行循环...cities = unique(dat$city) 创建一个空列表来保存创建的图 city_plots = list() 循环遍历并绘图保存 for(city_ in cities) { city_plots...paste0("plot_",city_,".pdf"), width =3.04, height =3.10, units = "in", dpi=300) } 上面我们将每一张图都单独输出了，下面来介绍如何将其全部组合起来

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R︱高效数据操作——data.table包（实战心得、dplyr对比、key灵活用法、数据合并）

data.table中，还有一个比较特立独行的函数：使用:=引用来添加或更新一列（参考：R语言data.table速查手册） DT[, c("V1","V2") := list(round(exp(V1...SD只能在位置j中使用。 .SDcols常于.SD用在一起，他可以指定.SD中所包含的列，也就是对.SD取子集。...—————————————————————— 实战一：在data.table如何选中列，如何循环提取、操作data.table中的列？...(x)] 还有 data$x 如果有很多名字很长的指标，data.table中如果按列进行遍历呢？ data[,1]是不行的，选中列的方式是用列名。...2016-11-28补充：留言区大神给了一个比较好的选中列的方式，其中主要就是对with的使用： data.table取列时，可以用data[,1,with=FALSE]取data的第一列

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「R」数据操作（三）：高效的data.table

使用下面命令进行安装： install.packages("data.table") 载入包： library(data.table) #> #> 载入程辑包：'data.table' #> The...这样挺麻烦的，因此data.table包提供了对列进行原地赋值的符号:=，例如product_stats开始是这样的： product_stats #> id material size weight...对数据进行分组汇总 by是data.table中另一个重要参数（即方括号内的第3个参数），它可以将数据按照by值进行分组，并对分组计算第2个参数。...("model", "vehicle"), mean_quality] #> [1] 6 对大数据集使用键进行搜索，能够比迭代使用逻辑比较快得多，因为键搜索利用了二进制搜索，而迭代在不必要的计算上浪费了时间...(year = year(date))] } 这里我们使用.SD[[x]]提取x列的值，这跟通过名字从列表中提取成分或元素相同。

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R-语言学习-230910

R语言包括S3对象和s4对象。s3 包括基本数据结构：向量矩阵数据框数组列表。s4 包括层级结构由s3组成。数据框本质：长度相等的向量按照列的方式排列。c是列 r是行。...rbind cbind merge是合并列表：分量的提取用[[]]s4对象提取白色括号提取（点击绿色箭头）matrix要求向量类型相同，数据框没有要求复制data.table包可以读取文本文件。...sapply函数对列表内部做一个循环。gene symbol最好不用作列名，因为其有空格，容易报错。标准的表达矩阵一般列名是样本名，行名是基因名。预后效果是生存率。...通过使用 palette 函数，您可以选择不同的调色板来自定义图形的颜色方案。...例如，您可以使用 palette("rainbow") 来设置彩虹色调色板，或使用 palette("heat.colors") 来设置热色调色板。可以把颜色复制到代码中。图片

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好强一个Julia！CSV数据读取，性能最高多出R、Python 22倍

不过，Julia自2009年出现以来，凭借其速度、性能、易用性及语言的互操性等优势，已然掀起一股全新的浪潮。最近，便有人使用Julia、Python和R对于CSV读取速度进行了基准测试。...之后使用他们分别读取了8个不同真实数据集。那么，测试的结果又是如何呢？让我们来一起看下。同构数据集的性能首先从同构数据集开始进行性能测试。...区别在于，其每一列是存在缺失值的。 ? Pandas需要300毫秒。单线程中，CSV.jl比R快1.2倍，而多线程相比，CSV.jl则快约5倍。...这些列是异构的，其数据值类型有：String、Int、Float、Missing。 ? Pandas需要119秒才能读取此数据集。单线程data.table读取大约比CSV.jl快两倍。...Julia对Python进行了足够的改进，可以保证在接下来的5-10年内进行转换，并以相同的方式将Python抛在后面。 ?

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R语言数据框、矩阵、列表的创建、修改、导出

函数可以避免此前的错误adata.table = F)class(a)#但其不会有行名，且其会有一个data.table的数据结构多出来，可以设置data.table...(df1)colnames(df1)数据框取子集"$"取子集df1$gene为对数据框df1列名的向量取子集*输入df1$后按tab键可以输出待选的列名mean(df1$score) #对取出的向量可以进行运算坐标取子集...c列#再次注意%in%不会发生循环补齐，因其不是等位运算# 练习3-2# 1.统计内置数据iris最后一列有哪几个取值，每个取值重复了多少次table(iris[,ncol...的区别（提示：数据结构）m并写出用户使用该函数的代码...="y.Rdata")class(y)# $不支持矩阵，因此不能在这里使用class(y[,1])mean(as.numeric(y[,1]))#矩阵只允许一种数据类型，单独更改一列的数据类型没有意义，

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Python语言程序设计之三--列表Li

matrix[row].append(value) # 直接迭代列表，访问其元素并输出 for row in matrix: for...然后创建一个空列表matrix。关键在于后面的for循环。这个循环将items列表里的数据循环添加到matrix中，创建一个二维列表。它是如何做到的呢？...从控制台读取9个元素，如何将它们分配到3行3列的列表中呢？思路是，首先我们创建一个列表lst，然后每循环一次，将这个列表lst添加到矩阵matrix中，这样就是一个二维列表了。...由于items中第0、3、6个元素是矩阵matrix的第一列，所以对于每一行来说，循环起始的位置应该是：i * 3 ，然后终止于 i * 3 + 3。...m*n 矩阵乘以n*p矩阵是m*p矩阵， # 所以result的行是m1的行result的列是m2的列 # 先初始化每行元素，再将该行添加到result中 ###########

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R语言︱数据集分组、筛选(plit – apply – combine模式、dplyr、data.table)

介绍一种按照日期范围——例如按照周、月、季度或者年——对其进行分组的超简便处理方式：R语言的cut()函数。...：对每个小片断独立进行操作； combine：把片断重新组合。...##按照已有的类别数据，分类 g进行分组 ##例2：对矩阵分组（按列） m列实际上是“SELLERID.CLIENT”，我们需要把它拆分成两列并调换顺序才行。...在使用data.table时候，需要预先布置一下环境： datadata.table(data) 如果不布置环境，很多内容用不了。

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精准的文献复现—seurat对象添加细胞亚群meta信息

metadata信息中，以便之后直接用其细胞命名检查分群情况的时候，因为已经添加了细胞亚群信息，但是由于作者前期过滤了一部分细胞，最后只有187,399cells，所以需要去除NA部分。...stringsAsFactors = F) library(Seurat) library(ggplot2) library(clustree) library(cowplot) library(dplyr) library(data.table.../GSE234933_raw/rds/", pattern = ".rds") # 创建一个空的列表来存储Seurat对象 seurat_list <- list() # 循环读取每个rds文件的数据并创建...(cell) meta2 % column_to_rownames("sample_barcode") ###两种方法可以添加细胞亚群信息，文章中给出的subclustering那列...「这样得出的结果去如果继续复现后续分析就会更方便一点，虽然上次的推文也进行了细胞亚群细分，但是不同的人对亚群细分的认知还是存在差异的。」

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HashMap的源码解析

前言今天学习了基于JDK1.8的HashMap的源码，主要从如下几个方面来阐述，HashMap的数据结构，HashMap如何支持动态扩容，HashMap的散列函数是如何实现的，并且如何防止散列冲突，...（散列表使用的是桶数组，其实就是一个容量为N的普通数组A[0..N-1]。...例如put新键值对，但是对某个key对应的value值覆盖不属于结构变化。其扩容主要分为如下两步：创建一个新的两倍于原容量的数组。循环将原数组中的数据移到新数组中。...这里假设负载因子 loadFactor=1，即当键值对的实际大小size 大于 table的实际大小时进行扩容。...：在这里插入图片描述如上所示主要有如下几个步骤：首先判断散列表是否为空，为空的话则先初始化数组。

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从一件数据清洗的小事说起

村长，数据科学、指弹吉他及录音工程爱好者，浙大金融学博士在读，在data.table包和MongoDB的使用上有较多经验。...怎么说呢，大姐，我知道你是大佬的邪教粉，但是你真的对力量一无所知。“For循环很慢”只是一种很不科学的说法，就好比有人说CD的音质硬是要比Hi-res音轨要好，Win7的兼容性比Win10好。...实际上，for循环“只会在不恰当使用时”降低性能。然而大佬毕竟是大佬，用科学的态度做了实验并给出了结论： ?...相较之下，data.table则通过把数据处理中最常见的“选取行”、“修改列”、“分组”三大操作通过dt[i,j,by]的语法统一了一起来。...关于如何学习data.table包，大家可以查看本公众号前几期的文章。R语言的data.table包是一个被大多数人远远低估的存在，在这里想强烈推荐给大家！！

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人工智能大模型的好处之任意数据结构的转换

这里有两种方法来做到这一点，并且将原始的列表元素名称作为新数据框的一个列。...方法1：使用 data.table 包的 rbindlist 函数首先，确保安装并加载了data.table包： install.packages("data.table") # 如果尚未安装 library...(data.table) 然后，使用rbindlist函数将列表转换为数据框： # 假设 mylist 是你的列表 mylist <- list( vec1 = c(1, 2, 3), vec2...在这个例子中，Reduce函数迭代地将列表中的向量组合（通过cbind）成一个单一的数据框，names(mylist)用于获取列表元素的名称并设置为新数据框的列名。...如果你已经在使用data.table包进行数据处理，那么使用rbindlist可能是一个更直接的选择。如果你希望使用基础R的功能，那么Reduce和cbind是一个很好的选择。

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「r」dplyr 里的 join 与 base 里的 merge 存在差异

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data.table包使用应该注意的一些细节

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