文章目录 概述 常见的串行执行 使用&和wait改造 示例二 ? ---- 概述 我们知道shell中的命令都是串行执行的，如果想要充分利用服务器的资源，就需要些小技巧了。...假定业务上多个业务逻辑没有先后关系，每个脚本的执行时间也很长 ，推荐并行执行。 一般情况下,我们会把每个业务逻辑写到一个单独的脚本里，在服务器上逐一调用，每次都要手工去敲命令。...执行的时候去调用这个调用脚本，事实上linux会根据脚本中的顺序 串行去调用这些脚本，还不如自己在服务器上一个个的执行快呢，最起码手工逐个调用脚本还是并行的。...call_serial.sh 可知为【串行】 ---- 使用&和wait改造 在每个进程中使用&符号进行让脚本在后台运行，无需等待当前进程结束。...从执行结果来看，串行，每个进程都要耗时2秒，3个进程6秒处理完成 ---- 使用&和wait关键字来改造上上述脚本，使其并行执行 parallel.sh #!
一起来学shell bash编程（1） 回顾完之后，这次的推文主要学习如何在bash中写更好的loops，还有一些更加高级的shell bash编程知识。事不宜迟，开始今天的学习。...就是，我们尝试用模式描述我们想要的内容，然后让计算机填写该模式并输入完整命令。 GNU Parallel的极简介绍 GNU Parallel 是一个非常好用文件并行的工具。...GNU parallel的内容，可以查阅我之前的推文： 生信小技巧：并行运行的秘密 更加高级的shell编程 自带manual的bash脚本 一个好的脚本是应该自带说明manual的。...例如，一个脚本需要运行的参数，参数的使用说明等。 下面给大家一个模板例子： bash getdata.sh *** This script needs arguments to work!...-1000} 如何构建更复杂的脚本？
❞ 动动发财的小手，点个赞吧！ 简介 有些分析需要很长时间，因为它在单个处理器上运行并且有大量数据需要处理。如果数据可以分成块并单独处理，那么问题就被认为是可并行化的。...不能并行的情况 基因组组装并不是简单的可并行化，因为第一步需要将每个读数与其他读数进行对齐，以便找到哪些读数相似并且应该连接（组装）。...获取读取的子集会导致低质量的组装结果。 GNU 并行 我们用来并行化生物信息学问题的程序是 GNU 并行。它是“一种使用一个或多个计算节点并行执行作业的 shell 工具”。...GNU 并行可帮助您运行原本要按顺序一项一项或循环运行的作业。您可以查看 GNU Parallel 网站，以确定如何在集群上安装 Parallel 和/或了解如何使用它。...GNU 并行来更好地利用所有可用的 CPU。
如何创建Kubernetes Job 在本例中，我们将使用Ubuntu 容器来运行一个带有for循环的shell脚本，并根据你传递给容器的参数来呼应消息。...这个参数是一个数字，决定shell脚本循环应该运行多少次。 例如，如果你传递了参数100，那么shell脚本将呼应消息100次然后容器将会退出。...Step1：使用自定义的Docker镜像创建一个job.yaml文件，命令参数为100。100将会作为参数传递给docker ENTRYPOINT脚本。...例如，在一个job中如果你想要运行6个 pods，同时并行运行2个pods，你需要添加以下2个参数到你的job manifets中： completions: 6 parallelism: 2 以下是带有那些参数的...下面我们将介绍如何指定一个cron计划，你可以使用crontab生成器（https://crontab-generator.org/）来生成自己的时间计划。
linux命令行查看每个文件的空间大小在Linux命令行中，可以使用du命令来查看文件或目录的磁盘使用情况。...如果你想查看当前目录下每个文件的大小，可以使用以下命令：du -h --max-depth=1这里的参数解释如下：-h：以人类可读的格式显示（例如，KB、MB、GB）。...,是bash的内部命令。功能：使Shell读入指定的Shell程序文件并依次执行文件中的所有语句source命令通常用于重新执行刚修改的初始化文件，使之立即生效，而不必注销并重新登录。...2.sh filename 重新建立一个子shell，在子shell中执行脚本里面的语句，该子shell继承父shell的环境变量，但子shell新建的、改变的变量不会被带回父shell，除非使用export...使用parallel可以并行计算。
/bin/zsh Z Shell 是 Bash 扩展，带有数量庞大的改进。 Bash，Unix shell的一种，在1987年由布莱恩·福克斯为了GNU计划而编写。...$ script.sh word1 word2 word3 脚本文件内部，可以使用特殊变量，引用这些参数。...$0：脚本文件名，即script.sh。 1~9：对应脚本的第一个参数到第九个参数。 $#：参数的总数。 $@：全部的参数，参数之间使用空格分隔。...*：全部的参数，参数之间使用变量IFS值的第一个字符分隔，默认为空格，但是可以自定义。...script），会创建一个新的 Shell（这个 Shell 就是脚本的执行环境，Bash 默认给定了这个环境的各种参数）set 命令用来修改 Shell 环境的运行参数，也就是可以定制环境 #!
：用函数即可解决，因为当前后台任务的提示信息只会在当前shell显示，而函数 {} 创建了子shell/bash，所以不会在当前shell显示提示信息。...总结： 解决问题的关键在于 {} 和 () 的区别，外加 set +m： {} 是匿名函数，创建了子 shell 来执行命令 () 是在当前shell下创建了子进程来执行命令 set +m 关闭后台任务控制信息显示...后记： 当然了也有很多第三方的工具和库也可以解决这个问题，比如 Ansible、puppet 等自动化运维管理工具，还有GNU的paralle程序等，但都没有这个方便和易于理解。...questions/305933/preventing-bash-from-displaying-done-when-a-background-command-finishes-execut [3] Bash脚本实现批量作业并行化.../article/p-3006344.html [7] 如何利用多核CPU来加速你的Linux命令 — awk, sed, bzip2, grep, wc等 http://www.vaikan.com/
Read More tokio master分支正在切换到std::future #tokio Read More Reddit 讨论 parallel：Rust实现的类GNU Parallel的工具...GNU Parallel，它是一个shell工具，可以在一台或多台计算机上并行的执行计算任务，一个计算任务可以是一条shell命令或者一个以每一行做为输入的脚本程序。...GNU Parallel会把输入分块，然后通过管道并行执行 parallel aljabar: 基于 const generics 实现的n维线性代数库 #const #LinearAlgebra 不过目前是实验性的...最初的挑战是： 可行的云渲染需要大量使用低开销，高性能的语言。...自成立以来，构建和维护此服务一直很困难，我们的初始生产版本包括： 复杂的CUDA层; 成千上万的C++代码来准备和运行渲染; C库上的C++包装器; C封装在C++库上; Cython为渲染器提供可调用的接口以进行集成
基本的交换机、路由器概念及实现原理要知道。 4、Shell脚本编程基础 掌握Shell基本语法结构，能编写简单的脚本即可。...6、Shell脚本编程进阶 Shell脚本是Linux自动完成工作的利器，必须得熟练编写，所以得进一步学习函数、数组、信号、发邮件等。...7、Python开发基础 Shell脚本只能完成一些基本的任务，想要完成更复杂些的任务，比如调用API、多进程等。就需要学高级语言了。 Python是运维领域使用最多的语言，简单易用，学它准没错！...GPL是GNU的通用公共许可证（GNU General Public License，GPL），即“反版权”概念，是GNU协议之一，目的是保护GNU软件可以自由的使用、复制、研究、修改和发布。...同时GRUB可以引导Linux系统分区上的不同内核，也可用于向内核传递启动参数，如进入单用户模式。
BPMN标准 BPMN（业务流程建模符号）：通过使⽤用简单的图形符号将业务流程转换为可视化图形，让业务流程建模变得简单化、图形化，负责的建模过程变得可视化。...启动事件的类型（流程在消息到达时启动，在指定的时间间隔后启动，等等），定义了流程如何启动，并显示为启动事件中的小图标。在XML中，类型由子元素声明来定义。...这是由到达抛出信号事件时的发送处理器来决定的。...image.png 脚本任务 脚本任务（script task）是自动执行的活动。当流程执行到达脚本任务时，会执行相应的脚本。...Mule百度百科 决策任务 待查找资料 Send event task Shell任务 Shell任务（Shell task）可以运行Shell脚本与命令。
System V Release 4，或者称为SVR4，是最成功的版本，成为一些UNIX共同特性的源头， 例如“SysV 初始化脚本”（/etc/init.d），用来控制系统启动和关闭， System...V Interface Definition（SVID）是一个System V如何工作的标准定义。...其开发目标是提供更优秀的框架以表示 系统服务间的依赖关系，并依此实现系统初始化时服务的并行启动， 同时达到降低Shell的系统开销的效果，最终代替现在常用的System V与BSD风格init程序。...systemd启动脚本包以方便用户，使用户能“开箱即用” Chakra GNU/Linux，在2012.10的光盘映像档发布后默认使用systemd。...Debian GNU/Linux，在2014年的技术委员会的init系统投票中决定在Debian 8“Jessie”中以Linux为核心的版本转换到systemd[16]。
详情及变更请参照: Linux 编译安装 GCC 4.9 GCC4.9发布啦，本脚本在之前4.8的基础上做了稍许改进，更新 PS：4.9.0 开始支持C++1y特性 GCC 4.9 的大致变更如下，...（包含新的继承类型分析模型、直接调用转为非直接调用和本地符号别名等） Feedback优化（包含对c++内联函数性能分析的改进、函数排序等） 支持OpenMP 4.0[并行计算] C、C++、Fortran...Cilk Plus(C和C++的数据与任务并行处理插件) C11原子操作、线程本地存储 C++1y 返回类型检测、lambda函数默认参数支持、可变长度数组、[[deprecated]]属性支持、数字分隔符支持...支持POSIX的shell或GNU bash POSIX或SVR4的 awk工具 GNU binutils gzip 版本1.2.4及以上 （可由GNU镜像列表 http://www.gnu.org...用以友好打印stdc++的stl容器 在执行 install.sh 脚本前安装 ncurses-devel 和 python-devel， 用于编译gdb和开启python功能 安装完成后，把[GCC
MATLAB 是一种广泛使用的专有软件，用于执行数值计算。它有自己的编程语言，可以实现数值算法。 GNU MCSim 一个模拟和数值积分包，具有快速蒙特卡罗和马尔可夫链蒙特卡罗能力。...它带有自己的编程语言，可以交互使用。 LabPlot是一个基于KDE平台的数据分析和可视化应用程序。 MFEM是一个免费的、轻量级的、可伸缩的c++有限元方法库。...，旨在为自动化实验和过程中的机器学习操作编写脚本。...Ch，一种基于C/ c++的商用解释语言，带有计算数组，用于科学的数值计算和可视化 APMonitor: APMonitor是一种数学建模语言，用于以微分和代数方程的形式描述和求解物理系统的表示。...mlpack是一个用于机器学习的开源库，它提供了一个简单且一致的API，同时利用c++语言特性来提供最大的性能和灵活性 NCAR命令语言是专门为科学数据分析和可视化而设计的一种解释语言。
如果我们能够将这些作业并行执行，那么就可以提高作业处理速度，节省时间和精力。 GNU Parallel提供了一种简单、灵活和高效的方式来并行执行命令行作业。...我们将演示如何使用Parallel来加速命令行作业、控制并行度和资源利用率，并提供一些使用Parallel的最佳实践和建议。...您可以使用其他选项来控制并行度和资源利用率，例如--jobs选项来指定要并行执行的作业数量，--load选项来指定要使用的系统负载等等。 Parallel还支持使用{}符号来动态生成参数。...如果您想要使用Parallel来并行执行命令行作业，那么您只需要将要执行的命令和参数传递给Parallel即可。Parallel会自动将参数分成多个块，并并行地处理它们。...缺点 学习曲线较陡： GNU Parallel的使用需要一定的学习曲线，特别是在使用高级功能时。这需要您花费一些时间和精力来学习和掌握。
任何其他文件都是使用命令行工具下载或生成的。 8.2 串行处理 在深入研究并行化之前，我将简要讨论串行循环。...8.3.1 GNU Parallel 简介 请允许我介绍一下parallel，这是一个命令行工具，允许您并行化和分发命令和管道。这个工具的美妙之处在于，现有的工具可以原样使用；它们不需要修改。...但是，您可以使用parallel将其并行化。Docker 图像包含一个名为pbc的工具。...8.3.1 GNU Parallel 简介 请允许我介绍一下parallel，这是一个命令行工具，允许您并行化和分发命令和管道。这个工具的美妙之处在于，现有的工具可以原样使用；它们不需要修改。...但是，您可以使用parallel将其并行化。Docker 图像包含一个名为pbc的工具。
GNU Parallel[1] 是一个用于加速生信分析不可或缺的一个工具。它允许你非常简单地对命令并行化处理。下面我将介绍一些如何使用它以及如何将它应用于生信。...这是并行化的本质：不是所有的任务都会花费相同的时间，所以有的结束的早，有的结束的晚，因此输出顺序并不一致。我们可以使用 -k 选项强制程序执行“先入先出”准则。...使用 ::: 传递参数 使用 ::: 指定并行指定的命令参数（列表来源）。...组合 你可以组合 ::: 和 ::: 来添加额外的参数，然后它们会生成所有可能的组合。...： 你必须导出 export 所有并行化函数中使用到的变量，例如上面的 genome。
shell版本： Q1 为什么 用这个方式实现？ 因为在真实环境中 一般方式： 首先通过脚本,excel等工具,（很多公司也是excel完成事情） 可以快速验证，出结果....利用strom等大数据分析平台，通过写对应的jobs来统计指标。 第一题 问： 从一亿个数据中找出 出现次数最多的前10个值？...parallel very easy to use as GNU parallel is written to have the same options as xargs 分析 初步估算：日志存储空间...思路回到题目1和题目2 分析 可以参考 shell如何实现多线程>> 可以简化成下面请看 parallel seq 1 10 |parallel -j10 “sleep 1;echo...{}” //10秒的任务 变成1秒完成 参考 情景linux—shell如何实现多线程 理解Linux系统负荷 关键字：shell 并发
我们用 它来测量应用代码的一些属性，包括： • 存储器的使用 • 函数调用的执行时间 • 函数调用的频度 • 指令的使用 剖析可以静态运行 （不执行软件程序），也可以动态运行 （在实际或虚拟的处理器上运行软件应用的时候运行...Studio (XPS）) - XPS 捕捉 PS 和外设的数据，包括配置设置、寄存器存储地址映射 和用来初始化 PL 的硬件位流。...配置数据被保存在 一个 XML 文件和其他 INIT 文件中，这些文件可以用在软件设计工具中来推断编译器参数、定义JTAG设置、创建和配置BSP库，以及自动做一些其他硬件相关的操作[2]。...Platform Studio ISE Design Suite EDK Xilinx Platform Studio 把配置数据保存在一个 XML 文件和其他 INIT 文件中，这些文件可以用在软件设计工具中来推断编译器参数...11.3.4 微处理器调试器 XMD 是一个命令行驱动的 JTAG 调试器，可以用来下载、调试和验证程序。它带有一个 Tcl 界面，支持任务重复操作的脚本。
Posix 多进程 进程通过fork()原语进行创建，使用kill()原语进行销毁，也可使用exit()原语自我撤销。执行fork()的进程是新创建进程的父进程。...pthread_mutex_init来初始化锁,pthread_mutex_lock是用来获取锁，pthread_mutex_unlock是用来释放锁，并且这2个是相互互斥的加锁和解锁原语 Posix...提供的原子操作来保护这些最小化资源。...并发编程工具的选择 在能解决问题的前提下，并发编程工具选择最简单的一个,如果可以尽量使用串行编程，如果达不到要求，使用shell脚本来实现并行化。...如果shell脚本的fork/exec开销太大，可以使用GNU C的fork和wait原语。如果这些原语开销太大，可以使用Posix线程库原语，选择合适的锁机制或者原子操作
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