简介 平常在各种R语言群里，总会遇到关于安装R包的问题，例如：搭载在github上的R包，由于网速（外网）原因而无法下载该怎么办？...这里小编分享下平常逼不得已才使用的“下三滥”方法——直接下载包，通过本地安装。 网上好多解决方案都是基于R gui的，但现实中使用Rstudio这个IDE会更多些。...接下来以gmm包在Rstudio下安装为例： 教程 使用bing搜索该包，找到相应网站[1]。 关键词：R包名称+R，或者可以再加上CRAN。 ?...搜索技巧：R包名称+R 找到Downloads板块，下载对应的压缩包 这里以mac为例 ?...如果直接使用install.packages("")或者devtool包下载无效，则可以使用这种方法。
包确实不存在，或者包的目录下有乱七八糟的文件 包不存在说明下载有问题，可能是私服没有，或者网络有问题，没下载完整等等。...乱七八糟的文件可能是一个或多个，目录下面，除了pom.xml和jar包，其他的文件都可以删除，或者pom.xml和jar包也可以删除，让maven再去下载一次也没问题。 2....(参数三) -Dversion=version(参数四) -Dpackaging=jar 例如，增加commons-io-2.3.jar，参数一是下载本地的jar路径，pom.xml配置如下所示，...\conf\settings.xml, line 1, column 1 因为他使用了maven工具中conf的settings.xml配置文件，我实际使用的settings.xml，是在其他路径下，但是尝试加...Final Memory: 4M/15M [INFO] ------------------------------------------------------------------------ 此时本地
将本地jar包添加至本地Maven仓库 一、介绍 在平常开发过程中，常常会遇到网络卡顿，导致下载不了maven的依赖jar，这时候就需要拿到同事的jar包，自己导入到本地的仓库中。...如下进行使用 二、使用 将本地jar包放一个合适的位置，接着打开cmd黑窗输入下面这段代码，即可加入至本地的maven仓库 mvn install:install-file -DgroupId=com.banmoon.test...3.4.0.jar 其中里面的参数代表含义如下 -DgroupId：对应groupId -DartifactId：对应artifactId -Dversion：对应version 如此上述添加成功后
文章目录 1、问题描述 2、maven仓库手动添加本地jar包 1、问题描述 今天在导入阿里云视频点播相关的Jar包的时候死活导入不进来 由于阿里云有好多jar包并没有开源，我们只能下载源码然后自己导入...Jar包 我现在演示将下图中圈起来的这个Jar包手动添加到本地maven仓库 2、maven仓库手动添加本地jar包 语法如下 mvn install:install-file -Dfile=jar...包的位置(参数一) -DgroupId=groupId(参数二) -DartifactId=artifactId(参数三) -Dversion=version(参数四) -Dpackaging=jar...1.1.0.jar" -DgroupId=com.alibaba.otter -DartifactId=canal.client -Dversion=1.1.0 -Dpackaging=jar 去本地仓库查看
前面我们介绍了MSKCC和Broad研究所的网页工具可以帮助我们探索TCGA数据库的多个癌症的多组学数据，见： 通过R包cgdsr链接cbioportal来探索TCGA等公共数据 通过R包RTCGAToolbox...所以我们也推送了两个离线解决方案吧，首先是使用R包RTCGA把TCGA数据本地化。...包，使用标准安装代码即可： if (!...R包里面获取表达量信息，另外的3个函数（heatmapTCGA，kmTCGA，pcaTCGA）出图都还凑合，后面我们会一一介绍。...首先需要使用expressionsTCGA和mutationsTCGA从本地R包里面获取表达量信息，然后使用前面 提到了有3个函数（heatmapTCGA，kmTCGA，pcaTCGA）可以进行统计可视化
union(x, y, ...)整合出现在x数据框中或y数据框中的，去除了两个数据框中重复的部分，想要保留重复的话使用union_all() ?
问题 你想安装和使用一个 R 包。...这里主要介绍如何用命令行来安装 R 包，如下所示： install.packages("reshape2") # reshap2为包名 在一个新 R 线程中使用该包之前，你必须先导入它。...如果想要将所有已安装的软件包更新为可用的最新版本，使用以下命令： update.packages() 如果你在 Linux 系统上使用 R ，管理员可能已经在系统上安装了一些 R 包，由于普通用户没有更改权限...其他 导入包也可以使用require()函数。下表显示了 R 包安装相关的命令及描述。...，显示所有已安装的包中具有新版本的包 new.packages 返回一个矩阵，包含所有已安装的新包 download.packages 下载一系列R包到本地目录 install.packages 从资源库下载安装一系列
Luarocks是一个Lua包管理器，基于Lua语言开发，提供一个命令行的方式来管理Lua包依赖、安装第三方Lua包等，社区比较流行的包管理器之一，另还有一个LuaDist，Luarocks的包数量比LuaDist...，为了方便管理，我们可以使用openresy官方的opm，或者lua的包管理工具luarocks，只不过opm的包数量还不是太多，用的较多的还是luarocks，现在只能期待opm社区不断的发展壮大了。...luarocks install package --tree=path 还可以指定你安装的包的存放路径。...安装rapidjson包 rapidjson 是有名的开源c++ json库，其类java的API使得其易于使用，然而对于rapidjson中的setInt，setString等等setXXX的函数，以及...getInt, getString等等getXXX的函数，作者觉得太过于繁琐，想到如果能将这些set和get封装起来，仅仅使用一个函数接口来调用，那么代码将会显得很简洁，维护起来也容易多了。
OpenInstall_v1.1.0.jar -DgroupId=OpenInstall -DartifactId=OpenInstall -Dversion=1.1.0 -Dpackaging=jar 这样就将jar发布到本地...命令说明： mvn install:install-file -Dfile=这儿是jar包的完整名字 -DgroupId=这儿随便取名，比如为A ，但是maven依赖在引用时要用这个名字
然而有些情况需要引入本地的 Jar 包，比如： 1、有些二方包合作开发者由于没有权限等原因暂时无法打到公司的maven仓库中，为了不影响开发进度，你可以引入本地的 Jar 包。...2、由于某个三方包不在公司的maven 仓库，但是必须要用。 3、使用某个三方库有BUG，在源码上修复后打包，没法传中央仓库，本地使用。...二、方法 simple-retry4j-1.1.2.jar 文件 2.1 添加到本地仓库 2.1.1 命令方式 1、通过 cd 命令进入到该 jar 包所在文件件。...com.github.chujianyun simple-retry4j 1.1.2 项目中使用就可以用上述依赖引入该 jar 包。...2.2 依赖 libs 文件夹下的 jar文件 参加另外一篇博文《将本地Jar包导入Maven项目的4种方式》 三、总结 本文难度不大，重要的是提醒大家开发时开动脑筋，不要被一些小困难阻塞住任务，影响开发进度
在Maven项目中使用本地JAR包有两种方法： 1、使用system scope org.richard${project.basedir}/lib/my-jar.jar system scope引入的包，...在使用jar-with-dependencies打包时将不会被包含，可以使用resources将本地包打进jar-with-dependencies ...2、将jar包安装到本地repository中 mvn install:install-file -Dfile=my-jar.jar -DgroupId=org.richard -DartifactId...=my-jar -Dversion=1.0 -Dpackaging=jar 3、添加 in project repository，在新机器上执行时就不用运行mvn install:install-file
有的时候，包怎么都无法安装，可能是因为受制于网络，如github；也可能是某些玄学问题，只好将R 的源文件下载下来，自行本地安装。...中进行安装，使用本地的源码文件。...我们尝试在R 中操作一下。...) [1] "facets-master.zip" [2] "pctGCdata-master.zip" R中安装本地包： install.packages("...library/facets’ 这里参考：https://www.jianshu.com/p/c63450e91a8c 发现是没有文件gfortran，简单查了一下这是一个非常古老的1956 年就开始使用的编程语言
我们很多时候都很好奇作者的r包是如何写出来的，手痒的时候就想学习一下源码，顺便改一 问题来源 为什么要写今天这个推文呢？...起因是因为我想使用seurat自带函数画热图，奈何这个图不是那么好看 DoHeatmap(pbmc,features = features,draw.lines = FALSE ) 于是，我想自己手动改一下这个热图...github上：https://github.com/satijalab/seurat/tree/release/5.0.2 依次单击 master - Tags - v5.0.2，下载zip并解压到本地...函数在visualization.R 和mixscape.R都出现了，感觉是visualization.R定义了DoHeatmap函数。...我们接下来使用r，打开两个文件看一下看一下 file.edit('~/gzh/seurat_codes_learning/seurat-release-5.0.2/R/mixscape.R') file.edit
using 加载R包 using函数是我写在$HOME/.Rprofile中的函数，因此每次打开R就能使用。...using的功能是一次加载多个包，并且使用了suppressPackageStartupMessages函数，因此不会显示加载包过程中的信息。...使用pak管理R包，可以从Bioconductor、CRAN、Github、本地、URL安装R包，解决了R包安装需要多个不同R包去安装的问题。...除了本地安装使用local_install函数，其他几种安装方式都是用pkg_install函数 install.packages("pak") using(pak) CRAN pak::pkg_install...", "NMF")) pak删除R包 pkg_remove("CytoTRACE") pak查寻依赖包 只能查CRAN 或 Bioconductor的包的依赖 pak::pkg_deps("tibble
注：现在大部分时间我们都在使用 tidyr 提供的长宽格式转换工具，比 reshape2 包提供的操作更容易理解。 熔解与铸造 reshape库用一个直观的模型来描述如何操作数据表。...使用例子 我们用一个例子来看一下熔解与铸造究竟是怎么回事，以体会reshape2包的有用之处。...# 使用数据展示 head(airquality) ## Ozone Solar.R Wind Temp Month Day ## 1 41 190 7.4 67 5...# 导入包 library(reshape2) md <- melt(airquality, id=c("Month", "Day")) head(md, 20) ## Month Day variable...铸造 dcast()读取已熔解的数据，并使用你提供的一个公式和一个可选的整合数据的函数将其重铸。
安装 在R或者Rstudio交互界面输入： source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("RTCGAToolbox") Windows下...我安装时发现XML包可能需要单独安装。 如果你是Linux系统，而且XML包一直安装不上，请仔细查看错误信息。...安装RTCGA工具包。...voom包和limma包的函数做这个功能分析。...函数默认只会画出100个上调和下调基因地热图，我们可以使用hmTopUpN和hmTopDownN参数进行调整。
调出函数library() require()内置基础包basedatabase：存放数据集utils：工具函数grDevices：绘图相关graphics：R绘图函数stats：与统计相关的函数methods...：一般定义方法和类splinesstats4tcltk试例help(package"R包名称") #查看R包详情信息library(help="R包名称")ls(package:R包名称) #列出包中所有函数...data（package=R包名称）#列出包中包含的所有数据集detach(package:R包名称) #移除R包remove.package(R包名称) #卸载R包R包批量迁移installed.package...() #显示所有已安装R包
基本函数使用mutate(mtcars,gpm=1/mpg) #新增一列select(m,'mpg')select(m,1) #按序列号或数字筛选filter(m,gear > 3) #筛选行arrange
介绍 R是一种流行的开源编程语言，专门研究统计计算和图形。它广泛用于开发统计软件和执行数据分析。R社区以不断为特定研究领域添加用户生成的包而闻名，这使其适用于许多领域。...在本教程中，我们将讨论如何安装devtools并使用它直接从GitHub安装R包。...第2步 - 安装devtools包 通过devtools，我们将能够直接从GitHub，BitBucket，本地文件安装和构建软件包，并从CRAN安装特定版本。...由于在这种情况下只允许SSH流量，我们将添加端口4040并在完成后检查状态。...cat /usr/local/lib/R/site-library/shiny/DESCRIPTION 结论 在本教程中，我们直接从GitHub安装了最新的Shiny软件包，并学习了如何从CRAN重新安装其稳定版本
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