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OptaPlanner规划引擎的工作原理及简单示例(1)

在之前的文章中,已介绍过APS及规划的相关内容,并对Optaplanner相关的概念和一些使用示例进行过介绍,接下来的文章中,我会自己做一个规划小程序 - 一个关于把任务分配到不同的机台上进行作业的小程序,并在这个小程序的基础上对OptaPlanner中更多的概念,功能,及使用方法进行讲解。但在此之前,我需要先讲解一下OptaPlanner在进行规则运算的原理。所以,本文是讲述一些关于寻找最优解的过程中的原理性的内容,作为后续通过示例深入讲解的基础。但这些原理知识不会涉及过分深奥的数学算法,毕竟我们的目标不是写一个新的规划引擎出来,更不是要研究各种寻优算法;只是理解一些概念,用于理解OptaPlanner是依据什么找出一个相对优解的。以便在接下来的一系列文章中,可以快速无障碍地理解我所讲解的更细化的OptaPlanner功能。

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OptaPlanner规划引擎的工作原理及简单示例(2)

在前面一篇关于规划引擎OptaPlanner的文章里(OptaPlanner规划引擎的工作原理及简单示例(1)),老农介绍了应用OptaPlanner过程中需要掌握的一些基本概念,这些概念有助于后面的内容的理解,特别是关于将约束应用于业务规则上的理解。承上一文,在本篇中将会减少一些理论,而是偏向于实践,但过程中,借助实际的场景对一些相关的理论作一些更细致的说明,也是必要的。本文将会假设我们需要对一个车间,需要制定生产计划.我们为生产计划员们设计一套智能的、自动的计划系统;并通过OptaPlanner把这个自动计划系统开发出来。当然,里面的业务都是经过高度抽象形成的,去除了复杂的业务规则,仅保留可以体现规划引擎作用的一些业务需求。因此,这次我们只用一个简单的小程序即可以演绎一个自动计划系统,来呈现规划引擎OptaPlanner在自动计划上的魅力。

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Cell 深度| 一套普遍适用于各类单细胞测序数据集的锚定整合方案

自北京大学汤富酬教授(当时为英国剑桥大学格登研究所(Gurdon Institute) Azim Surani实验室博士后)等人于2009年在Nature Methods上发表首个单细胞测序(single cell sequencing)方案以来【1】,这项革命性技术已历经十年的飞速发展;分子生物学、微流控(microfluidics)技术和纳米技术等关联技术的长足进步催生了数十种全新的单细胞测序方案,使测序细胞数目呈现指数级增长 (生信宝典注:指数级增长的转折点是郭国骥老师的工作)(下图)【2】。同时,通过谷歌搜索趋势分析可以发现,对单细胞测序这一词条的相对搜索频率在全球范围内一直呈稳定上升趋势,甚至在2018年超过了同样仅有十余年应用史的重要分子生物学测序方法——染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)(下图)。

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J. Chem. Inf. Model. | 预测蛋白质-肽相互作用:基于深度学习技术的基准测试和与对接的比较

今天为大家介绍的是来自Michel F. Sanner团队的一篇论文。深度学习(DL)方法在预测蛋白质结构方面取得的准确性进展,以及它对结构生物学产生了深远影响。AlphaFold2是一个DL方法,已经在预测蛋白质-肽相互作用方面进行了评估,结果显示其性能显著优于RoseTTAfold和传统的对接方法PIPER-FlexPepDock。随后,新的AlphaFold2模型专门用于预测多聚体组装,此外新的从头开始折叠模型OmegaFold也已经发布。作者评估了这些新的DL折叠模型在对接蛋白质-肽相互作用时的成功率,并将其与他们的最新专注对接软件AutoDock CrankPep (ADCP) 进行了比较。评估使用相同的数据集和性能度量标准来进行。

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对于语言模型的推理问题,一步步来会更好

今天为大家介绍的是来自Openai研究团队的一篇提高语言模型推理能力的论文。近年来,大型语言模型在进行复杂多步推理方面的能力有了显著提升。然而,即使是最先进的模型仍然经常产生逻辑错误。为了训练更可靠的模型,作者可以采用结果监督或过程监督两种方法。结果监督为最终结果提供反馈,而过程监督则为每个中间推理步骤提供反馈。考虑到训练可靠模型的重要性以及人工反馈的高成本,仔细比较这两种方法非常重要。最近的研究已经开始比较这两种方法,但仍然存在许多问题。Openai进行了关于这个问题的研究,发现对于训练模型解决具有挑战性的MATH数据集中的问题,过程监督明显优于结果监督。

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Nature Medicine | 基于群体学习的分散式人工智能在癌症组织病理学中的应用

本文介绍由英国利兹大学圣詹姆斯医学研究所、德国国家肿瘤疾病中心的Jakob Nikolas Kather住院医师团队发表在Nature Medicine的研究成果。作者展示了群体学习(SL)在5000多名患者的千兆像素组织病理学图像的大型多中心数据集中上的成功应用。作者表明,使用SL训练的人工智能(AI)模型可以直接从结直肠癌H&E染色的病理切片上预测BRAF突变状态和微卫星不稳定性。作者在北爱尔兰、德国和美国三类患者人群中训练AI模型,并在来自英国的两个独立数据集中验证了预测性能。数据显示,经过SL训练的AI模型优于大多数本地训练的模型,并与在合并数据集上训练的模型表现相同。此外,作者展示了基于SL的AI模型是数据高效的。未来,SL可用于训练分布式AI模型,用于任何组织病理学图像分析任务,从而无需数据传输。

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Improved Object Categorization and Detection Using Comparative Object Similarity

由于在现实世界中物体的固有长尾分布,我们不太可能通过为每个类别提供许多视觉示例来训练一个目标识别器/检测器。我们必须在目标类别之间共享视觉知识,以便在很少或没有训练示例的情况下进行学习。在本文中,我们证明了局部目标相似信息(即类别对是相似的还是不同的)是一个非常有用的线索,可以将不同的类别联系在一起,从而实现有效的知识转移。关键洞见:给定一组相似的目标类别和一组不同的类别,一个好的目标模型应该对来自相似类别的示例的响应比来自不同类别的示例的响应更强烈。为了利用这种依赖于类别的相似度正则化,我们开发了一个正则化的核机器算法来训练训练样本很少或没有训练样本的类别的核分类器。我们还采用了最先进的目标检测器来编码对象相似性约束。我们对来自Labelme数据集的数百个类别进行的实验表明,我们的正则化内核分类器可以显著改进目标分类。我们还在PASCAL VOC 2007基准数据集上评估了改进的目标检测器。

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【译】OptaPlanner开发手册本地化: (0) - 前言及概念

在此之前,针对APS写了一些理论性的文章;而对于OptaPlanner也写了一些介绍性质,几少量入门级的帮助初学者走近OptaPlanner。在此以后,老农将会按照OptaPlanner官方的用户手册的结构,按章节地对其进行翻译,并成型一系列的操作说明文章。在文章中,为了降低对原文的理解难度,有些地方我不会直接按原文档的字面翻译,而是有可能加入一些我自己的理解,或添一些解释性的内容。毕竟英语环境下的思维和语言表达方式,跟中文或多或少会有差别的,所以如果全部按字面翻译,内容就非常生硬,可读性差,解程难度较大。我认为应该在理解了作者原意的基础上,再进一步以中文方式的表达,才算是真的的本地化。记得老农还是少农时,学习开发技术,需要阅读一些外国书箱的翻译本时,印象最深的是候捷老师的书,尽管《深入浅出MFC》,砖头厚度的书,硬是被我翻散了线,MFC尽管真的晦涩难懂,但候老却能把Windows的消息机制及MFC中整个个宏体系,系统地通俗地描述出来,令读者不需要花费太多精力去理解猜测书中字面的意义,大大降低的VC++中MFC的学习门槛。但老农毕竟只是一个一线开发人员,不是专业的技术资料翻译人才,不可能有候老师的专业水平,因此,我也只可尽我所能把内容尽量描述得通俗一些,让读者尽量容易理解,花费更少的时间掌握这些知道要点。

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罗格斯大学华人团队开源OpenAGI平台:语言模型是AGI的入口,领域专家模型不可或缺

---- 新智元报道   编辑:LRS 【新智元导读】语言模型是打开AGI大门的关键钥匙。 人类所具有的智能,可以将一些最基础的能力,通过某种组合变成一种复杂能力,并可以用来解决复杂的、多步骤的任务。 这种能力对人工智能(AI)的发展来说同样重要,在迈向最终的通用人工智能(AGI)的过程中,除了开发大规模智能模型外,如何让这些模型具有「利用各种特定领域专家模型以解决复杂任务的能力」也同样重要。 在大型语言模型(LLMs)上取得的最新进展让我们看到了语言模型强大的学习和推理能力,有望成为未来AGI的接口

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大数据理论篇 - 通俗易懂,揭秘分布式数据处理系统的核心思想(一)

为了分享对大规模、无边界、乱序数据流的处理经验 ,2015年谷歌发表了《The Dataflow Model》论文,剖析了流式(实时)和批量(历史)数据处理模式的本质,即分布式数据处理系统,并抽象出了一套先进的、革新式的通用数据处理模型。在处理大规模、无边界、乱序数据集时,可以灵活地根据需求,很好地平衡数据处理正确性、延迟程度、处理成本之间的相互关系,从而可以满足任何现代数据处理场景,如:游戏行业个性化用户体验、自媒体平台视频流变现、销售行业的用户行为分析、互联网行业实时业务流处理、金融行业的实时欺诈检测等。

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