| sed 'y/ATCG/TAGC/'多行序列的反向互补：多行反向互补行与行之间的顺序也要颠倒过来！...，并分配给一个变量$0：代表整个文本行$1：代表文本行中的第1个数据字段（第1列）$NF：代表文本行中的最后一个数据字段awk默认的字段分隔符是任意空白字符（如：空格or制表符），也可以用-F参数自定义分隔符图片用...awk取出第9列?...SeparatorOFS：定义输出字段分隔符ORS：定义输出记录分隔符NF：数据文件中的字段总数，可以简单理解为列数NR：已处理的输入记录数，可以简单理解为行数如何确定是空格还是tab键 cat -A3.4...Data/example.gtf文件匹配feature为exon的行每一行第5列➖第4列即为exon的长度int只取整，如何进行四舍五入？+0.5
一个有趣的事情是，sort -u将获得与sort file.txt | uniq相同的结果。 Sort确实对数据科学家来说是一种很有用的小技巧：能够根据特定的列对整个CSV进行排序。...JOIN Join是一种简单的、准切向的SQL。最大的区别在于Join将返回所有列，匹配可能只发生在一个字段上。默认情况下，join将尝试使用第一列作为匹配键。...另一个值得注意的是-e标志，如果发现有字段丢失，它可以用来替换成其他值。...-l 打印匹配文件的名称 grep -v 倒序匹配 大杀器 Sed和Awk是本文两个最有用的命令。...计算那些第一列值为“something”的第三列之和。
大写变小写： 4. sed在某一行最后添加一个数字 5.打印1到100行含某个字符串的行 6.awk 中使用外部shell变量 7. awk 合并一个文件 8.把一个文件多行连接成一行 9.awk中gsub...http://ask.apelearn.com/question/493 把一个文件多行连接成一行 http://ask.apelearn.com/question/266 awk中gsub函数的使用...1.1 sed 选项参数 sed命令的选项(option)： -n ：只打印模式匹配的行 -e ：直接在命令行模式上进行sed动作编辑，此为默认选项 -f ：将sed的动作写在一个文件内，用–f filename...匹配字符或者字符串，’$1 ~ /oo/'表示第1个字段包含oo字符 == 等于，在和数字比较时候，若把比较的数字用双引号引起来，那么awk不会认为是数字，而会认为是字符，不加双引号会认为是数字 > 大于...= 不等于 && 并且 || 或者 awk以冒号为分隔符打印出多列数据 awk以分号为分隔符打印出指定格式 awk匹配多次条件，打印机输出 2.2 awk 条件操作符 ## 把/etc/passwd
cut命令逐行读入文本，然后按列划分字段并进行提取、输出等操作。...小结 cut的作用 一个强大文本处理工具，它可以将文本按列进行划分的文本处理。cut命令逐行读入文本，然后按列划分字段并进行提取、输出等操作。...根据分隔符分割后的列数 NR 已读的记录数, 也是行号 OFS 输出域分隔符 ORS 输出记录分隔符 RS 控制记录分隔符 $n $0变量是指整条记录。...截取某个文件中的列, 重点是按照列分割, 这个命令不适合截取文件中有多个空白字符的字段 sed： 增删改查数据. sed用于在文件中以行来截取数据进行增删改查 awk：截取分析数据....sort -t " " -k2n,2 sort.txt # -t " " 代表使用空格分隔符拆分列 # -k2n,2 代表根据从第2列开始到第2列结束进行数字升序, 仅对第2列排序 ?
文本处理 本节将介绍Linux下使用Shell处理文本时最常用的工具： find、grep、xargs、sort、uniq、tr、cut、paste、wc、sed、awk； 提供的例子和参数都是常用的；...-n：指定每行显示的字段数 xargs参数说明 -d 定义定界符 （默认为空格 多行的定界符为 n） -n 指定输出为多行 -I {} 指定替换字符串，这个字符串在xargs扩展时会被替换掉,用于待执行的命令需要多个参数时...//替换每一行的第一处匹配的text 全局替换 sed 's/text/replace_text/g' file 默认替换后，输出替换后的内容，如果需要直接替换原文件,使用-i: sed -i 's/text...w+/[&]/g' $>[this] [is] [en] [example] 子串匹配标记 第一个匹配的括号内容使用标记 1 来引用 sed 's/hello\([0-9]\)/\1/' 双引号求值...sed通常用单引号来引用；也可使用双引号，使用双引号后，双引号会对表达式求值: sed 's/$var/HLLOE/' 当使用双引号时，我们可以在sed样式和替换字符串中指定变量； eg: p=patten
、tr、cut、paste、wc、sed、awk； 提供的例子和参数都是最常用和最为实用的； 对shell脚本使用的原则是命令单行书写，尽量不要超过2行； 如果有更为复杂的任务需求，还是考虑python...指定每行显示的字段数 xargs参数说明 -d 定义定界符 （默认为空格 多行的定界符为 ） -n 指定输出为多行 -I {} 指定替换字符串，这个字符串在xargs扩展时会被替换掉,用于待执行的命令需要多个参数时...,使用-i： seg -i 's/text/repalce_text/g' file 移除空白行： sed '/^$/d' file 变量转换 已匹配的字符串通过标记&来引用. echo this is...en example | seg 's/w+/[&]/g' $>[this] [is] [en] [example] 子串匹配标记 第一个匹配的括号内容使用标记 来引用 sed 's/hello([...0-9])//' 双引号求值 sed通常用单引号来引用；也可使用双引号，使用双引号后，双引号会对表达式求值： sed 's/$var/HLLOE/' 当使用双引号时，我们可以在sed样式和替换字符串中指定变量
本文将介绍Linux下使用Shell处理文本时最常用的工具：find、grep、xargs、sort、uniq、tr、cut、paste、wc、sed、awk； 提供的例子和参数都是最常用和最为实用的；...-n：指定每行显示的字段数 xargs参数说明 -d 定义定界符 （默认为空格 多行的定界符为 \n） -n 指定输出为多行 -I {} 指定替换字符串，这个字符串在xargs扩展时会被替换掉,用于待执行的命令需要多个参数时...,使用-i： seg -i 's/text/repalce_text/g' file 移除空白行： sed '/^$/d' file 变量转换 已匹配的字符串通过标记&来引用. echo this is...en example | seg 's/\w+/[&]/g'$>[this] [is] [en] [example] 子串匹配标记 第一个匹配的括号内容使用标记 \1 来引用 sed 's/hello...\([0-9]\)/\1/' 双引号求值 sed通常用单引号来引用；也可使用双引号，使用双引号后，双引号会对表达式求值： sed 's/$var/HLLOE/' 当使用双引号时，我们可以在sed样式和替换字符串中指定变量
本文将介绍Linux下使用Shell处理文本时最常用的工具：find、grep、xargs、sort、uniq、tr、cut、paste、wc、sed、awk； 提供的例子和参数都是最常用和最为实用的；...n：指定每行显示的字段数 xargs参数说明 -d 定义定界符 （默认为空格 多行的定界符为 ） -n 指定输出为多行 -I {} 指定替换字符串，这个字符串在xargs扩展时会被替换掉,用于待执行的命令需要多个参数时...，输出替换后的内容，如果需要直接替换原文件,使用-i： seg -i 's/text/repalce_text/g' file 移除空白行： sed '/^$/d' file 变量转换 已匹配的字符串通过标记...echo this is en example | seg 's/w+/[&]/g' $>[this] [is] [en] [example] 子串匹配标记 第一个匹配的括号内容使用标记 来引用 sed...'s/hello([0-9])//' 双引号求值 sed通常用单引号来引用；也可使用双引号，使用双引号后，双引号会对表达式求值： sed 's/$var/HLLOE/' 当使用双引号时，我们可以在sed
本文将介绍Linux下使用Shell处理文本时最常用的工具：find、grep、xargs、sort、uniq、tr、cut、paste、wc、sed、awk；提供的例子和参数都是最常用和最为实用的...：指定每行显示的字段数 xargs参数说明 -d 定义定界符 （默认为空格 多行的定界符为 ） -n 指定输出为多行 -I {} 指定替换字符串，这个字符串在xargs扩展时会被替换掉,用于待执行的命令需要多个参数时...d ";" filename cut 取的范围 N- 第N个字段到结尾 -M 第1个字段为M N-M N到M个字段cut 取的单位 -b 以字节为单位 -c 以字符为单位 -f 以字段为单位（使用定界符...输出替换后的内容，如果需要直接替换原文件,使用-i： seg -i 's/text/repalce_text/g' file 移除空白行： sed '/^$/d' file 变量转换 已匹配的字符串通过标记...来引用 sed 's/hello([0-9])//' 双引号求值 sed通常用单引号来引用；也可使用双引号，使用双引号后，双引号会对表达式求值： sed 's/$var/HLLOE/'当使用双引号时，我们可以在
下面我介绍Linux下使用Shell处理文本时最常用的工具： find、grep、xargs、sort、uniq、tr、cut、paste、wc、sed、awk； 提供的例子和参数都是最常用和最为实用的...-n：指定每行显示的字段数 xargs参数说明 -d 定义定界符 （默认为空格 多行的定界符为 \n） -n 指定输出为多行 -I {} 指定替换字符串，这个字符串在xargs扩展时会被替换掉,用于待执行的命令需要多个参数时...以字段为单位（使用定界符） eg: cut -c1-5 file //打印第一到5个字符 cut -c-2 file //打印前2个字符 8、paste 按列拼接文本 将两个文本按列拼接到一起...第一个匹配的括号内容使用标记 \1 来引用 sed 's/hello\([0-9]\)/\1/' 双引号求值 sed通常用单引号来引用；也可使用双引号，使用双引号后，双引号会对表达式求值： sed...打印每一行的第二和第三个字段： awk '{print $2, $3}' file 统计文件的行数： awk ' END {print NR}' file 累加每一行的第一个字段： echo
,所以只能使用shell自己的通配符来进行匹配了.首先我们先来学习一下基础的正则表达式吧,下面是我们常用的正则语法,我会给每一个语法,举一个小例子,下面我们开始学习吧.实例1： 使用 * 实现匹配前一个字符出现...--complement 选项提取指定字段之外的列,(打印除了第2列之外的列)[root@localhost ~]# cat lyshark.logID NAME AGE Gender...常用例子◆实例1： 使用awk格式化输出第二列和第三列的内容[root@localhost ~]# cat lyshark.logID NAME AGE Gender Mark1...指定搜索： 正则搜索第2列NAME字段,包含XDL的行,并打印出AGE列对应的值[root@localhost ~]# cat lyshark.logID NAME AGE Gender...中调用脚本,对于小的单行程序来说,将脚本作为命令行自变量传递给awk是非常简单的,而对于多行程序就比较难处理.当程序是多行的时候,使用外部脚本是很适合的.首先在外部文件中写好脚本,然后可以使用awk的-
-v 排除匹配结果 -n 显示匹配行与行号 -i 不区分大小写 -c 只统计匹配的行数 -E 使用egrep命令 --color=auto 为grep过滤结果添加颜色 -w 只匹配过滤的单词 -o 只输出匹配的内容...#完整匹配，字符串精确匹配，整个单词 grep -E "^#|^$" /tmp/test_grep.txt #过滤掉空白和注释行 sed字符流编辑器 注意sed和awk使用单引号...sed的内置命令字符用于对文件进行不同的操作功能，如对文件增删改查 sed常用内置命令字符： sed的内置命令字符 解释 a append，对文本追加，在指定行后面添加一行/多行文本 d Delete...参数： 参数 解释 -F 指定字段分割 -v 定义或修改awk内部变量 案例： awk的条件 NR表示行号，NR==5表示第五行 awk后面内容请使用单引号，双引号有特殊解析 awk 'NR==2,NR...打印出NR行号，$1第一列 $3第三列 $NF最后一列，注意$0表示整行 awk的替换查找函数，gsub() awk '{gsub("bin","BIN",$0);print $0}' test_grep.txt
a [\]text1 在指定行后面追加文本,支持使用\n实现多行追加 i [\]text 在行前面插入文本 c [\]text 替换行为单行或多行文本 w /path/somefile 保存模式匹配的行至指定文件...' /test.txt 3、sed删除命令 sed '3d' test.txt #删除前三行 sed '2,6d' test.txt #删除多行 sed '/test/d' test.txt #删除test.../wang/ {print $1 $3}' test.txt #显示有wang行的第一列和第三列内容 awk '/wang/ {print $1 "," $3}' test.txt #同上 文件空行进行排除...~/^#|^$' 文件 总结：awk命令中符号1,2,3 ：取第几列信息NF ：取最后一列(NF-n) ：取倒数第n列 正则表达式与操作符 awk同sed一样也可以通过模式匹配来对输入的文本进行匹配处理...awk支持的正则表达式元字符 图片 BEGIN {} 在awk执行命令前做什么事情 BEGIN模块在awk读取文件之前就执行，BEGIN模式常常被用来修改内置变量ORS，RS，FS，OFS等的值
在Shell编程工具中，四剑客工具的使用更加的广泛，Shell编程四剑客包括：find、sed、grep、awk，熟练掌握四剑客会对Shell编程能力极大的提升。...总的来说，SED高级命令可以分为三种功能： N、D、P：处理多行模式空间的问题； H、h、G、g、x：将模式空间的内容放入存储空间以便接下来的编辑； :、b、t：在脚本中实现分支与条件结构。...D；$d’ jfedu.txt 合并上下两行，也即两行合并： sed ‘$!...AWK内置变量详解： FS 分隔符，默认是空格； OFS 输出分隔符； NR 当前行数，从1开始； NF 当前记录字段个数； $0 当前记录； $1~$n 当前记录第n个字段（列）。...，它能使用正则表达式搜索文本，并把匹配的行打印出来。
，不会默认输出 如果没有定义匹配条件默认是匹配所有数据行，awk隐含循环，条件匹配多少次动作就会执行多少次 工作原理（2）: 逐行读取文本，默认以空格或tab键为分隔符进行分隔，将分隔所得的各个字段保存到内建变量中...sed命令常用于一整行的处理，而awk比较倾向于将一行分成多个””字段”然后再进行处理。awk信息的读入也是逐行读取的，执行结果可以通过print的功能将字段数据打印显示。...awk从文件上读取资料时,将根据Rs的定义把资料切割成许多条记录，而awk一次仅读入一条记录,以进行处理。...的行号在追加当有多个文件时 awk ‘BEGIN{RS=”:”}{print $0}’ zz ##打印出以冒号换行输出 awk ‘BEGIN{ORS=” “}{print $0}’ zz ##把多行合并成一行输出...$3:$4三元运算符，如果第3个字段的值大于等于第4个字段的值，则把第3个字段的值赋给max，否则第4个字段的值赋给max awk -F “:” ‘$7~”bash”{print $1}’ zz
Linux 系统中文本处理有多种不同的方式，系统为我们提供了三个实用命令，来实现对行列的依次处理功能，grep命令文本过滤工具，cut列提取工具，sed文本编辑工具，以及awk文本报告生成工具，利用这三个工具可以灵活的过滤截取任何系统文本内容...2,5 lyshark.log NAME Mark WR 100 LC 90 LY 88 通过使用 --complement 选项提取指定字段之外的列,(打印除了第...要进行多行操作时,只能通过 -e 写多条操作语句,用 ; 或回车分隔 通过使用grep命令定位到指定行,然后使用sed替换无用字符串,最后实现IP地址的过滤....,awk格式化输出文本的第二列和第三列的内容....指定搜索：正则搜索第2列NAME字段,包含XDL的行,并打印出AGE列对应的值.
' m.txt 处理多行文本：修改后的文本有多行时，以换行符\n分割，或者使用\强制换行 sed -n '2cXX\nYY' m.txt sed -n '2cXX\nYY YY' m.txt 利用sed...常用命令选项： -F：指定分隔符，可省略 默认为空格或Tab位 -f：调用awk脚本进行处理 -v：调用外部shell命令 awk内置变量，有特殊含义，可直接使用 FS：保存或设置字段分隔符，例如FS...=“:” $n:指定分割的第n个字段，如$1,$3分别表示第1，第3列 $0:当前读入的整行文本内容 NF：记录当前处理行的字段个数，列数 NR：记录当前已读入行的数量，行数 FNR：保存当前处理行在原文本内的序号...~/bin$/' /etc/passwd 对第6个字段做~匹配 awk -F: ‘$7!.../etc/passwd文件的第7列，存为a1.txt,去重保存在a2.txt 基本用法awk '!
'2i drink tea' 第二行后面加入两行字 使用\可以一次加多行，每一行之间都必须要以反斜杠 \ 来进行新行标记 nl testfile |sed '2a drink tea or \ >...'{print $1}' /tmp/hosts #指定.作为行分隔符 OFS 保存的是输出字段的分隔符（列分隔符），默认为空格 awk -v OFS="-" '{print $1,$2}' /tmp...第2列:"$2}' /tmp/hosts 正则 awk 可以使用正则 搜索 passwd 文件，以:分隔，输出以 a 字母开头的所有行 [admin@ datas]$ awk -F ':' '/...值和关键字都存储在内部的一张针对key/value应用hash的表格里。...1 语文 90 1 数学 40 1 英语 59 2 语文 95 2 数学 80 2 英语 52 3 语文 89 4 数学 29 (1)使用 awk 命令行，根据学号汇总查询每个学生的总成绩
1.sed基本用法 a.sed命令解析 概述：sed是流式编辑器，非交互式的基于模式匹配过滤及修改文本，可实现对文本的输出删除复制替换剪切等各种操作 命令格式解析： 格式1：前置命令 |sed 选项 ‘...-f：使用sed脚本 -e：可以指定多个处理动作 -r：启用扩展的正则表达式，当与其他选项使用时应作为首个选项 -{}：可组合多个命令，以分号分割 定址符：用来指定处理的起止行，省略定址符时默认逐行处理全部文本...m.txt sed '2cXX' m.txt 处理多行文本：修改后的文本有多行时，以换行符\n分割，或者使用\强制换行 sed -n '2cXX\nYY' m.txt sed -n '2cXX\nYY...，可直接使用 FS：保存或设置字段分隔符，例如FS=“:” $n:指定分割的第n个字段，如$1,$3分别表示第1，第3列 $0:当前读入的整行文本内容 NF：记录当前处理行的字段个数，列数 NR：记录当前已读入行的数量...$/{print $1,$7}' /etc/passwd awk -F: '$6~/bin$/{print $1,$6}' /etc/passwd 对第6个字段做~匹配 awk -F: ‘$7!
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