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Linux进阶 03 文本处理三驾马车

先记录下来以后要多看看~1 grep1.1 定义grep是一种强大的文本搜索工具,它能使用正则表达式匹配模式搜索文本,并把匹配的行打印出来1.2 格式grep options pattern file1.3...,可以先把需要查询的几个关键词写入一个文档,然后使用grep -f参数进行文档中的关键词查询1.4 正则表达式是对字符串操作的一种逻辑公式,就是用事先定义好的一些特定字符及这些特定字符的组合,组成一个“...查找example.fq文件以@开头的行example.fq文件一共有4000行每4行为一个单位,一共有1000个单位如何从这1006行@开头的行中滤掉@开头的质量行?...怎么知道这6行以@开头的质量行的位置?...| sed 'y/ATCG/TAGC/'多行序列的反向互补:多行反向互补行与行之间的顺序也要颠倒过来!

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如何使用`grep`命令在文本文件中查找特定的字符串?

如何使用grep命令在文本文件中查找特定的字符串? 摘要 在这篇技术博客中,我将详细介绍如何使用grep命令在文本文件中查找特定的字符串。...引言 在日常工作中,我们经常需要在文件中查找特定的字符串,以便进行分析、调试或修改。而grep命令正是为此而生。它提供了丰富的搜索选项和灵活的使用方式,可以满足各种需求。...例如,要匹配以字母开头的单词,可以使用如下命令: grep "^[a-zA-Z]" file_name 这将匹配以字母开头的所有行。...QA环节 Q: 如何在多个文件中搜索? A: 可以同时指定多个文件名进行搜索,grep会逐一搜索每个文件并打印匹配的结果。 Q: 如何逆向搜索(排除匹配的行)?...,您现在应该已经了解了如何使用grep命令在文本文件中查找特定的字符串。

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    从零开始的异世界生信学习 linux部分 linux 基础---学习笔记-3 Linux三剑客 grep,sed,awk

    三个适用的命令—grep,sed,awk 1.grep 一种强大的文本搜索工具,它能使用正则表达式匹配模式搜索文本,并把匹配的行打印出来 格式:grep options pattern file 常见参数...,再按照文件查找 -i:忽略大小写 2 正则表达式简述 是对字符串操作的一种逻辑公式,就是用事先定义好的一些特定字符、及这些特定字符的组合,组成一个“规则字符串”,这个“规则字符串”用来表达对字符串的一种过滤逻辑...^ 行首 ##cat readme.txt | grep '^T' 查找以T开头的行 $ 行尾 ##cat readme.txt | grep ')$' 查找以)结尾的行 ....,一般用来对文本进行增删改查(对打印到标准输出流中的文件进行处理) sed 以行为单位处理 用法:sed -options 'script' file(s) 常见参数:## [-optioons]...| sed '2,$ y/ACGT/TGCA/' | rev 使用sed命令取多行序列的反向互补序列 head Data/example.fa | sed '1d' | sed '2,$ y/ACGT

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    Linux三剑客之grep,awk,sed命令必知必会

    linuxmi@linuxmi:~/www.linuxmi.com$ grep -v "linuxmi" linuxmi.txt 匹配以某个字符串开头的所有字段,例如,输出所有以单词“sat”开头的字段...“ $”正则表达式表示行的结尾,可用于匹配以特定字符串结尾的行。在本例中,我们注意匹配以“ 0”结尾的行。...它不需要任何编译,并且用户可以使用数字函数,变量,字符串函数和逻辑运算符。 它使您能够以语句形式编写简单有效的程序,以在文件中搜索特定模式,并在找到匹配项时执行操作。...当使用' awk '时,我们将花括号括起来。 模式和动作都形成规则,整个awk程序都用单引号引起来。 如何在Linux中使用AWK命令 默认情况下,Awk命令用于打印文件的内容。...,请指定以数字开头的数字和'g'来表示文件的全部或其余部分。

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    Linux基础——正则表达式

    简单的说,正则表示式就是处理字符串的方法,它是以行为单位来进行字符串的处理行为,正则表示式通过一些特殊符号的辅助,可以让使用者轻易的达到搜寻/删除/取代某特定字符串的处理程序。...^[A-Z]..$ 搜索行以A至Z的一个字母开头,然后跟两个任意字母,然后跟一个换行符的行。将找到第5行。...,它能使用正则表达式搜索文本,并把匹配的行打印出来....$ ls -l|grep '^d' 通过管道过滤ls -l 输出的内容,只显示以 d 开头的行。 $grep 'test' d* 显示所有以d 开头的文件中包含 test 的行。...使用 BEGIN 语句设置计数和打印头。BEGIN 语句使用在任何文本浏览动作之前,之后文本浏览动作依据输入文本开始执行。END 语句用在 awk 完成文本浏览动作后打印输出文本总数和结尾状态标志。

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    linux学习第二十六篇:正则介绍,grep,sed,awk命令

    只要我们使用的工具支持表示这种思想那么这个工具就可以处理正则表达式的字符串。...14:defwerfgdsgf [root@xie-02 grep]# grep -v '^#' inittab |grep -v '^$' //去除所有空行和以 ‘#’ 开头的行 defwerfgdsgf...截取文档中的某个段,-F:指定输入分隔符 [root@xie-02 awk]# awk -F ':' '{print $1}' test.txt //截取以:分割的第一段(不会更改文件内容) root...用 ‘:’ 作为分隔符,查找第一段为 ‘root’ 的行,并把该段的 ‘root’ 换成 ‘toor’ (可以连同sed一起使用) ? 用 ‘:’ 作为分隔符,打印最后一段 ?...用sed打印1到100行包含某个字符串的行 sed -n ‘1,100{/abc/p}’ 1.txt awk用print打印特殊字符,在awk中使用脱义字符\是起不到作用的,要使用‘“ ”’组合

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    秒懂 Linux 三剑客:awk、sed、grep 的超实用操作示例

    正则表达式 正则表达式(Regular Expression)是一种文本模式,包括普通字符(例如,a到z之间的字母)和特殊字符(称为"元字符"),可以用来描述和匹配字符串的特定模式。...匹配换行符以外的任意字符一次 ^hello 匹配以hello开头的行 hello$ 匹配以hello结尾的行 [0-9] 匹配0-9的任意一个字符 [a\|b] 匹配a或b中的任意一个字符 \ 转义符,...即grep可以从单个或多个文本中以行为单位抓取一定的内容。这个内容为某一特定的字符模式,也就是我们上面所说的正则表达式,或是普通的单一字符或字符串。...` sed '2s/GCTA/XXXX/' seq.fasta #5.删除行 #用法:删除以`>`开头的行 sed '/^>/d' seq.fasta #6.打印匹配行 #用法:打印包含`CTAG`的行....插入行 #用法:在以`>`开头的行前插入一行 sed '/^>/i\# Header starts here' seq.fasta #9.替换多行文本 #用法:将第2至4行的内容替换为`NNNN` sed

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    linux常用命令

    与 -f 一起使用 -f:依据 -d的分隔字符将一段信息分割成为数段,用 -f 取出第几段的意思 -c:按照字符截取 -b:按照字节截取 例子1: 首先看PATH变量: [root@localhost...以h或r开头的 grep '^[hr]' /etc/passwd 不是以h和r开头的 grep '^[^hr]' /etc/passwd 不是以h到r开头的 grep '^[^h-r]' /etc/...-i:用sed的修改结果直接修改读取数据的文件,而不是由屏幕输出。 动作: a:追加,在当前行后添加一行或多行。 c:行替换,用c后面的字符串替换原数据行。...i:插入,在当前行前插入一行或多行。 p:打印,输出指定的行。 s:字符串替换,用一个字符串替换另外一个字符串。...也就是说,如果某一行开头的hello被替换成hi,就打印它。

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    shell脚本扩展「建议收藏」

    简单的说,正则表示式就是处理字符串的方法,它是以行为单位来进行字符串的处理行为, 正则表示式通过一些特殊符号的辅助,可以让使用者轻易的达到搜寻/删除/取代某特定字符串的处理程序。...^[A-Z]..$ 搜索行以A至Z的一个字母开头,然后跟两个任意字母,然后跟一个换行符的行。将找到第5行。...$ ls -l | grep ‘^d’ 通过管道过滤ls -l输出的内容,只显示以d开头的行。 $ grep ‘test’ d* 显示所有以d开头的文件中包含test的行。...的第二行前增加“XXXXX”字样的新行 如果要同时新增多行,则每行之间要用反斜杠\来进行新行的添加 4、取代行:c命令 c的后面可以接字符串,这些字符串可以取代n1,n2之间的行 5、打印:p命令...,填充域,0则表示所有域,1表示第一个域, 思考题:如何打印所有记录(以/etc/passwd中的内容为例) 例4:搜索/etc/passwd有root关键字的所有行 这种是pattern(模式)的使用示例

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    shell学习教程(超详细完整)

    中,^则是匹配字符串的开始 ^tux匹配以tux开头的行 $ 匹配行尾,awk中,$则是匹配字符串的结尾 tux$匹配以tux结尾的行 ....“这是一张成绩单”(只会执行一次) #第二个动作会打印文件的第二字段和第六字段 END END也是awk保留字,不过刚好和BEGIN相反。...“Sc”字符,则打印第六字段数据 85.66 这里要注意在awk中,使用“//”包含的字符串,awk命令才会查找。...-h | awk '/sda[O-9]/ { printf $1 "\t" $5 "\n"}’ #查询包含有sda数字的行,并打印第一字段和第五字段 1.2.5 awk 内置变量 awk内置变量...插入多行时,除最后一行外,每行末尾需要用“”代表数据未完结。num表示第几行 d ; 删除,删除指定的行。 p : 打印,输出指定的行。 s : 字串替换,用一个字符串替换另外一个字符串。

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    linux实战(一)

    实例 $ ls -l | grep '^a' 通过管道过滤ls -l输出的内容,只显示以a开头的行。 $ grep 'test' d* 显示所有以d开头的文件中包含test的行。...也就是说,如果某一行开头的test被替换成mytest,就打印它。 $ sed 's/^192.168.0.1/&localhost/' example &;符号表示替换换字符串中被找到的部份。...这里大概给出awk中的一些学习目录如下: print和printf awk中同时提供了print和printf两种打印输出的函数。 其中print函数的参数可以是变量、数值或者字符串。...以下几个是gawk专用的,不适合unix版本的awk。 \Y 匹配一个单词开头或者末尾的空字符串。 \B 匹配单词内的空字符串。 \< 匹配一个单词的开头的空字符串,锚定开始。...{print $1}输出第一列 显示多行 显示/etc/passwd的账户和账户对应的shell,显示时账户与shell之间以tab键分割 #cat /etc/passwd |awk -F ':'

    2.2K10

    Linux 文本处理三剑客应用

    gle" gogle google 匹配分支选择行: 使用|匹配两个或多个分支选择,从特定分支内选择不同的关键词匹配查询 [root@localhost ~]# ls alert lyshark rui...#打印,输出指定的行 a #追加,在当前行后添加一行或多行 i #插入,在当前行前插入一行或多行...\ 换行符,一次插入多行数据 [root@localhost ~]# sed '2a hello \ ←在第二行下面,插入一段话,用\隔开 > my name is lyshark \ > age...,只能通过 -e 写多条操作语句,用 ; 或回车分隔 通过使用grep命令定位到指定行,然后使用sed替换无用字符串,最后实现IP地址的过滤....~ B 判断字符串A中是否不包含能匹配B表达式的字符串 在进行实验之前,首先创建lyshark.log测试文件,后续使用该文件练习过滤.

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    学习笔记0411----正则三剑客之sed、awk

    大写变小写: 4. sed在某一行最后添加一个数字 5.打印1到100行含某个字符串的行 6.awk 中使用外部shell变量 7. awk 合并一个文件 8.把一个文件多行连接成一行 9.awk中gsub...= 不等于 && 并且 || 或者 awk以冒号为分隔符打印出多列数据 awk以分号为分隔符打印出指定格式 awk匹配多次条件,打印机输出 2.2 awk 条件操作符 ## 把/etc/passwd...1到100行含某个字符串的行 sed -n ‘1,100{/abc/p}’ 1.txt 6.awk 中使用外部shell变量 a=2; echo “a?️...如何把相同段的内容弄到一行? 以/etc/passwd为例,该文件以":"作为分隔符,分为了7段。...a’’‘s"}’ awk ‘BEGIN{print “a"s”}’ 注意:使用print打印单引号的时候,需要注意使用双引号引起来,在使用单引号引起。

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    使用awk和正则表达式过滤文本或字符串 - 详细指南和示例

    当我们在 Linux 中运行某些命令来读取或编辑字符串或文件中的文本时,我们经常尝试将输出过滤到感兴趣的特定部分。这就是使用正则表达式派上用场的地方。 什么是正则表达式?...如何在Linux中使用awk过滤工具 在下面的示例中,我们将重点关注 awk 的元字符。 由于没有给出模式,下面的示例打印文件 /etc/hosts 中的所有行。...让我们看一个案例来演示这一点,采用正则表达式 t*t,它表示匹配以下行中以字母 t 开头并以 t 结尾的字符串: this is tecmint, where you get the best good...使用带有 set [ 字符 ] 的 awk 以集合[al1]为例,这里awk将匹配文件/etc/hosts中一行中包含字符a或l或1的所有字符串。...awk '/[al1]/{print}' /etc/hosts 下一个示例匹配以 K 或 k 开头后跟 T 的字符串: # awk '/[Kk]T/{print}' /etc/hosts 指定范围内的字符

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    史上最全的 Linux Shell 文本处理工具集锦,快收藏!

    -0 rm 4 xargs 命令行参数转换 xargs 能够将输入数据转化为特定命令的命令行参数;这样,可以配合很多命令来组合使用。...指定每行显示的字段数 xargs参数说明 -d 定义定界符 (默认为空格 多行的定界符为 ) -n 指定输出为多行 -I {} 指定替换字符串,这个字符串在xargs扩展时会被替换掉,用于待执行的命令需要多个参数时...filename cut 取的范围 N- 第N个字段到结尾 -M 第1个字段为M N-M N到M个字段 cut 取的单位 -b 以字节为单位 -c 以字符为单位 -f 以字段为单位(使用定界符) eg:...使用不带参数的print时,会打印当前行; echo -e "line1 line2" | awk 'BEGIN{print "start"} {print } END{ print "End" }'...for(i=0;i<10;i++){print $i;}for(i in array){print array[i];} eg: 以逆序的形式打印行:(tac命令的实现) seq 9| awk '{lifo

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    三剑客命令

    "*.txt" |xargs cp -t /tmp find /home -type f -name "*.txt" -exec mv {} /tmp \; 元字符 功能 意思 ^ 匹配行首 表示以某个字符开头...$ 匹配行尾 表示以某个字符结尾 ^$ 空行的意思 表示空行的意思 ....-w 匹配整个单词 -E 使用ERE,相当于egrep -F 相当于fgrep,不支持正则表达式 找出123开头的行grep "^123" 文件找出456结尾的行grep "456 系统的正则符号 基础正则符号...'script' inputfile 选项 -n 不输出模式空间内容到屏幕,即不自动打印 -e 多点编辑 -f /PATH/SCRIPT_FILE: 从指定文件中读取编辑脚本 -r 支持使用扩展正则表达式...a [\]text1 在指定行后面追加文本,支持使用\n实现多行追加 i [\]text 在行前面插入文本 c [\]text 替换行为单行或多行文本 w /path/somefile 保存模式匹配的行至指定文件

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    Linux Shell 文本处理工具集锦

    0 rm xargs 命令行参数转换 xargs 能够将输入数据转化为特定命令的命令行参数;这样,可以配合很多命令来组合使用。...-n:指定每行显示的字段数 xargs参数说明 -d 定义定界符 (默认为空格 多行的定界符为 \n) -n 指定输出为多行 -I {} 指定替换字符串,这个字符串在xargs扩展时会被替换掉,用于待执行的命令需要多个参数时...filename cut 取的范围 N- 第N个字段到结尾 -M 第1个字段为M N-M N到M个字段 cut 取的单位 -b 以字节为单位 -c 以字符为单位 -f 以字段为单位(使用定界符) eg:...使用不带参数的print时,会打印当前行; echo -e "line1\nline2" | awk 'BEGIN{print "start"} {print } END{ print "End" }...for(i=0;i<10;i++){print $i;} for(i in array){print array[i];} eg: 以逆序的形式打印行:(tac命令的实现) seq 9| \ awk

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