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知识图谱项目前端可视化图论库——Cytoscape.js简介

知识图谱项目是一个强视觉交互性的关系图可视化分析系统,很多模块都会涉及到对节点和关系的增删改查操作,常规的列表展示类数据通过表格展示,表单新增或编辑,而图谱类项目通常需要关系图(力导向图:又叫力学图、力导向布局图,是绘图的一种算法,关系图一般采用这种布局方式)去展示,节点和关系的新增编辑也需要前端去做一些复杂的交互设计。除此之外还有节点和关系的各种布局算法,大量数据展示的性能优化,节点动态展开时的局部布局渲染,画布的可扩展性,样式的自定义等等诸多技术难点。目前国内使用最多的两个已开源的前端可视化框架:阿里的AntV、百度的Echarts对于关系图的支持都比较弱,不能完全满足项目中的需求。

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Network在单细胞转录组数据分析中的应用

面向单细胞的技术革命,让我们得以进入新的研究层面,但也对传统的分析方法提出了一系列的挑战。单细胞技术正在弥补分子生物学和组织生物学之间的鸿沟,进入高通量时代以来,这项技术所揭示的不是单一元素的信息,而是在单细胞层面揭示某种系统关系:DNA,RNA,ATAC等。我们知道,在系统中,关键要素除了来自元素本身(基因,转录本等生物小分子)之外,还来自元素之间的关系。虽然作为领域起源的社会网络分析可以追溯到20世纪30年代,图论可以上溯几个世纪,但网络科学的迅速崛起与普及只是近几十年的事情。目前,基因调控网络,生物代谢与信号转导网络,蛋白质互作网络作为基本的生物分子网络(Biological molecular network )已经在生物信息分析中得到广泛的应用。

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