在R中,可以使用e1071软件包所提供的各种函数来完成基于支持向量机的数据分析与挖掘任务。请在使用相关函数之前,安装并正确引用e1071包。...在正式建模之前,我们也可以通过一个图型来初步判定一下数据的分布情况,为此在R中使用如下代码来绘制(仅选择Petal.Length和Petal.Width这两个特征时)数据的划分情况。...在使用第一种格式建立模型时,若使用数据中的全部特征变量作为模型特征变量时,可以简要地使用“Species~.”中的“.”代替全部的特征变量。例如下面的代码就利用了全部四种特征来对三种鸢尾花进行分类。...此外,kernel是指在模型建立过程中使用的核函数。针对线性不可分的问题,为了提高模型预测精度,通常会使用核函数对原始特征进行变换,提高原始特征维度,解决支持向量机模型线性不可分问题。...结果向量用一个向量表示,特征向量用一个矩阵表示。在确定好数据后还应根据数据分析所使用的核函数以及核函数所对应的参数值,通常默认使用高斯内积函数作为核函数。下面给出一段示例代码 ?
那么,在Java中,到底如何进行字符串拼接呢?字符串拼接有很多种方式,这里简单介绍几种比较常用的。 使用+拼接字符串 在Java中,拼接字符串最简单的方式就是直接使用符号+来拼接。...使用StringBuffer可以方便的对字符串进行拼接。...以上就是比较常用的五种在Java种拼接字符串的方式,那么到底哪种更好用呢?为什么阿里巴巴Java开发手册中不建议在循环体中使用+进行字符串拼接呢? ?...使用+拼接字符串的实现原理 前面提到过,使用+拼接字符串,其实只是Java提供的一个语法糖, 那么,我们就来解一解这个语法糖,看看他的内部原理到底是如何实现的。 还是这样一段代码。...因为StringBuilder天生就是设计来定义可变字符串和字符串的变化操作的。 但是,还要强调的是: 1、如果不是在循环体中进行字符串拼接的话,直接使用+就好了。
") library(dplyr) 测试的数据框: test <- irisc(1:2,51:52,101:102), 在R语言中,这行代码是对数据集 iris 进行子集选择的操作。...在dplyr包的filter()函数中使用时,它可以用于筛选数据框中匹配给定集合中任一值的行。这行代码的作用如下: filter(test, ...): 在test数据框中筛选行。...2.inner_join(test1, test2, by = "x")內连inner_join,取交集 在R中,inner_join(test1, test2, by = "x") 是一个使用 dplyr...y = test2:表示要与test2数据框进行semi-join操作,即保留test1中与test2匹配的行。 by = 'x':指定要根据哪个列进行匹配。在这里,使用列x来进行匹配。...y = test1:表示要与test1数据框进行anti-join操作,即从test2中删除与test1匹配的行。 by = 'x':指定要根据哪个列进行匹配。在这里,使用列x来进行匹配。
数据选取与简单操作: which 返回一个向量中指定元素的索引 which.max 返回最大元素的索引 which.min 返回最小元素的索引 sample 随机在向量中抽取元素 subset 根据条件选取元素...M 1 1 9 7 2 2 7 2 其中,all=T代表全连接,all.x=T代表左联结;all.y=T代表右连接 2、dplyr包 dplyr包的数据合并, 一般用left_join(x,y...命令是让这两个向量粘合在一起生成新的字符串向量,粘合后的新字符之间没有间隔。...相比来说,其他一些方法要好一些,有dplyr,sqldf中的union 5、sqldf包 利用SQL语句来写,进行数据合并,适合数据库熟悉的人,可参考: R语言︱ 数据库SQL-R连接与SQL语句执行...四、不等长合并 1、plyr包 rbind.fill函数可以很好将数据进行合并,并且补齐没有匹配到的缺失值为NA。
本文是笔者近期使用R语言的一个记录。...我们经常要对一个数据集做多步处理,如果用基础包里的功能也能实现,但是一旦需要调整处理的先后顺序,那就很麻烦,通常需要进行很大的改动。但是如果用dplyr包就可以轻松很多。...按行合并list中的向量 用dplyr包中的bind_rows函数实现 > lis <- list( + a=1:5, + b=2:6, + d=3:7 + ) > library(dplyr...[,4] [,5] [1,] 1 2 3 4 5 [2,] 2 3 4 5 6 [3,] 3 4 5 6 7 如何从字符串中提取特定值...<=pattern) 表示前面匹配,比如 (?<=a )\d+ 表示前面匹配了a和空格的数字。 最后 近期使用R语言的一些收获罗列于此,希望能对大家有所助益。
本节课涉及到的R包主要有三个:stringr、dplyr、tidyr 课前准备工作: options("repos" = c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn...str_length(x) length(x) 2. str_split(字符串,"拆分符号") 拆分字符串 图片 -(1)拆分之后成为了了列表,列表的每个元素对应原来的每个元素拆分的结果 -(2)列表使用不方便...,且容易出错; ——设置彩虹括号,可以在多层嵌套时看清楚哪个括号和哪个括号是一对: options -- code -- display --use rainbow parentheses -(3)用管道符...语句控制一段代码的运行;且使用if语句,后面大括号里的代码可以折叠; 实例:用if(F){}注释掉暂时不想运行但以后还可能运行的代码(运行时把F改为T即可);直接删掉的话下次想用就得重新写;用#号大段大段注释不能折叠...如何挑出30个数里最大的五个 -(1)排序 -(2)取最后五个 图片 3.向量/列表的隐式循环-lapply() 对列表/向量中的每个元素实施相同的操作 lapply(1:4,rnorm) #批量画图
你可以在查询miRNA靶基因的时候限定使用哪些预测软件(如下图红圈所示),这样得到的结果就是多个预测软件预测结果的交集。...那么我们怎么利用R代码来对miRNA预测结果取交集呢? 我们知道一般在R里,对向量取交集,直接用intersect函数就可以了。...a","b","c") b=c("b","c","g") intersect(a,b) #[1] "b" "c" a=1:4 b=3:7 intersect(a,b) #[1] 3 4 那么如果想对R里面的数据框取交集该如何操作呢...下面给大家介绍三种对R数据框取交集的方法 方法一、我们将各列的信息合并成一个字符串,然后取交集 #将各列的信息用_连接起来 combine1=apply(df1,1,function(x) paste...(x,collapse = "_")) combine2=apply(df2,1,function(x) paste(x,collapse = "_")) #查看合并后的字符串向量1和字符串向量2的交集
全文并非是对数据整理的实操整理,主要整理在数据整理/清洗中常用的R包介绍 library(tidyr) library(dplyr) library(stringr) library(tibble) 1...(x) # 引号内的单个字母/数字/符号数量 length(x) #检测向量内的元素数 1.2 字符串拆分 str_split(x," ") #直接拆分后会变成list的子集 class(str_split...(x," ")) x2 = str_split(x," ")[[1]];x2 #向量长度仅为1,因此用[[1]] x2为字符型向量 ################################...#判断x2中T开头的字符串,输出逻辑向量 str_ends(x2,"e") #判断x2中e结尾的字符串,输出逻辑向量 1.5 字符串替换 x2 str_replace(x2,"o","A") #每个元素里面只替换第一次出现的目标字符...") #列出工作目录下以.R结尾的文件 file.create("douhua.txt") #用代码创建文件 file.exists("douhua.txt") #某文件在工作目录下是否存在 file.remove
7次,3重复3次) #rep(x,times)重复x,times次;使用each=来重复x元素each次;rep(c(1,2,3),2)得到1 2 3 1 2 3;rep(c(1,2,3),each=2...R11中;row.names=F 表示不把行名称读进去;sep="\t" 表示以tab(制表符\t)为分隔符 remove(list = ls()) #清除全部对象,即用ls()列出全部对象名,用一个...", stringsAsFactors = F) #指的是读入的数据中的字符串数据是否要变成属性数据,stringsAsFactors=FALSE就是不变 成属性数据,按字符串读入。...比如‘sex’变量有Fale,Female两种,可以只当做字符串,也可 作为属性变量。..." = "Journal")) #merge 函数类似于 Excel 中的 Vlookup,可以实现对两个数据表进行匹配和拼接的功能;by.x,by.y:指定依据哪些行合并数据框,默认值为相同列名的列
tibble 是一种简单数据框,它对传统数据框的功能进行了一些修改,其所提供的简单数据框更易于在 tidyverse 中使用。 多数情况下,我们会交替使用 tibble 和数据框这两个术语。...可以通过 tibble() 函数使用一个向量来创建新 tibble。...可以在 tibble 中使用在 R 中无效的变量名称(即不符合语法的名称)作为列名称。例如, 列名称可以不以字母开头,也可以包含特殊字符(如空格)。...等其他 R 包中使用这些变量,也需要使用反引号。...tribble() 是定制化的,可以对数据按行进行编码:列标题由公式(以 ~ 开头) 定义,数据条目以逗号分隔,这样就可以用易读的方式对少量数据进行布局: tribble( ~x, ~y, ~z,
今天是R语言与Python综合系列的第一篇,就聊一聊两者在常用字符串输出上的差异。 为了方便统一案例图片的风格,今天统一在jupyter编辑器中编辑(R和Python)。...paste和paste0都可以完成单个向量字符串的连接以及两个向量间的匹配。...我们可以看到,在拼接单个向量为字符串的过程中,paste和paste0两个函数并无太大区别,因为不涉及匹配参数sep。...通常情况下,我们使用paste和paste0做向量间的匹配情况比较多,这种情况多见于遍历网页,遍历日期等。...另一种方式可以使用字典进行字符传递。 print("I'm %(name)s.
R基础字符串处理函数 nchar paste strsplit tolower toupper casefold chartr gsub sub substr substring grep grepl...regexpr R包stringr 字符串处理学习思路 拼接 对应拼接,如 (‘a’,’b’)+(‘c’,’d’) → (‘ac’,’bd’) 多拼为一,如 (‘a’,’cd’,’m’)...替换 提取} 拼接->{多拼为一 对应拼接} 替换->{根据位置 根据pattern(正则表达式)} 提取->{根据位置 根据pattern(正则表达式)}}") R语言字符串合并与拆分...针对向量 strsplit #针对字符串向量(拆分) str_split #针对字符串向量(拆分)stringr包内函数 paste #针对向量合并 针对数据框 unite...# 两步合成一步 strsplit(a,split="-") # 拆分 strsplit(a,split="-\\d-",fixed=F) # 使用正则表达式拆分 # 使用|或来按照两种形式拆分 q
生信技能树学习之R语言的综合应用 一、玩转字符串 图片 x <- "The birch canoe slid on the smooth planks." x [1] "The birch canoe...##是用来返回向量中元素的个数 返回值1 1.2.字符串拆分 str_split(x," ") ### 以空格为分隔符,拆分开。...需要对列表取子集后,才能进行下一步计算,取子集代码是第二句,返回结果是向量,结果如下: [1] "The" "birch" "canoe" "slid" "on" "the...T") ### 是否以T开头 str_ends(x2,"e") ### 是否以e结尾 1.5.字符串替换 x2 str_replace(x2,"o","A") ###在一个引号里面...") #列出工作目录下以.R结尾的文件 file.create("douhua.txt") #用代码创建文件 file.exists("douhua.txt") #某文件在工作目录下是否存在 file.remove
R语言中,select函数用于选择数据框中的列,可以使用列名或者向量来指定要选择的列。...,进行更加复杂的筛选操作。...输入类型:str_to_lower()仅适用于字符向量或字符串标量,而tolower()可以应用于所有字符数据类型,例如字符向量、字符串标量、因子等。...(1000) %>% names() #注释在R语言中,head()和tail()函数用于查看数据框或向量的前几行或后几行。..." "9_anwser.R" file.create("douhua.txt") #用代码创建文件 ## [1] TRUE file.exists("douhua.txt") #某文件在工作目录下是否存在
玩转字符串1.检测字符串长度str_length(x)length(x)# 字符的个数2.字符串拆分str_split(x," ") # 把42个字符 按照“空格”拆分成八个字符串class(str_split...(x," ")str_remove_all(x," ")玩转数据框arrange,数据框按照某一列排序sort是给向量排序的library(dplyr)arrange(test, Sepal.Length...else2, ifelse(,,ifelse)在ifelse里加一个ifelse补充 case_when练习题1.加载deg.Rdata,根据a、b两列的值,按照以下条件生成向量x:load("deg.Rdata...30个数里最大的5个head 取头几个tail 取尾巴的几个还没做思考题:如何跳出一个表达矩阵里方差最大的1000个基因思考题:取出大于1的所有行向量/列表的隐式循环-lapplylapply(list...") #列出工作目录下以.R结尾的文件file.create("douhua.txt") #用代码创建文件file.exists("douhua.txt") #某文件在工作目录下是否存在file.remove
4.1.1 安装R、RStudio和R包 R提供一个基于命令行的统计框架,RStudio作为IDE,所有统计分析和图形可以使用它进行。...4.1.2 设置工作目录(略) 4.1.3 RStudio进行数据分析 4.1.3.1 RStudio基本特征 更加用户友好(略) 4.1.3.2 RStudio数据展示 这部分是如何利用RStudio...,升序,可以认为x[order(x)]=sort(x) ifelse()R语言是向量化的,ifelse()可以遍历所有因子并避免使用循环,根据前面我们知道,循环调用函数次数超级多的话会让时间明显变长。...字符串分隔strsplit()strsplit("5_15_dryst","_") 模式匹配grep()和替代gsub()正则表达式了,最常用的是grep(模式,字符串), sub(模式,替代,字符串)...正则表达式中,R语言的通配符$,*等,如果匹配它们需要用"\",如果匹配“\”,得上“\\”了。其他的还是和别的语言一致的。 ?
,stringi和stringr可以通过正则表达式更新脏字符串,assertive和assertr包可以在数据分析项目的一开始进行数据完整性的校验。...使用broom::tidy()广泛应用于模型数据,并以标准数据框格式返回模型输出。使用变量名非标准化求值更高效,见R语言 dplyr传递参数_自由 平等~忠诚 奉献-CSDN博客[2]。...正则表达式 R与stringr分别使用grepl()和str_detect()来进行,我比较喜欢基础R的,不知你喜欢安装包还是用基本的。...使用dplyr高效处理数据 这个包名的意思是数据框钳,相比基础R的优点是运行更快、与整洁数据和数据库配合好。函数名的部分灵感来自SQL。 ?...unlist()函数的作用,就是将list结构的数据,变成非list的数据,即将list数据变成字符串向量或者数字向量的形式。
如何使用管道操作符优雅的书写R语言代码 列表是R里面最为自由、最为包容和灵活的数据对象,是R与外部非结构化数据通讯的唯一窗口,所以熟悉列表操作,是进阶R语言的必经阶段。...,这个字符串中末尾有一个“;”分割的两个浮点数值分别代表维度和经度,而且每一个文化遗产该项都是如此,也就是说符合模式匹配的需求,仔细观察最后的那两个数值间的模式。...原数书作者也是通过正则匹配的经纬度信息,不过使用的预留关键词,而是分了较多步骤,使用正则表达式做字符串清洗的过程就是这样,有无数种方式任你选择,只要达到目的即可,在目标达到的情况下,适当的选择自己熟悉并高效的方式...可视化: 两个表格刚好有经纬度信息,还有遗产类别信息,可以借助这些信息进行可视化呈现,原书中使用maps包做的地图,我个人用惯了ggplot2,所以直接套用了老代码。...——爬取小姐姐的秒拍MV 教你如何优雅的用R语言调用有道翻译 2017年的第一周,你吸了多少雾霾?
从今天起试一试先听课之后再跟着课件整理笔记的方法~1 玩转字符串——stringr1.1 str_length 字符串的长度区分字符型向量/字符串/字符y = c("jimmy 150","nicker...140","tony 152")y:字符型向量"jimmy 150":字符串,一个引号内的所有东西引号内的单个字母/数字/符号称为字符x 0,"+",ifelse(i<0,"-","0"))3.2 for循环语句3.2.1 对向量中的每一个元素进行循环对...") #列出工作目录下以.R结尾的文件 $表示以……结尾dir(pattern = ".R") file.create("douhua.txt") #用代码创建文件file.exists("douhua.txt...") #某文件在工作目录下是否存在file.remove("douhua.txt") #用代码删除文件file.exists("douhua.txt") #删掉了就不存在啦## 可以批量的新建和删除f
1.1 如何导入? 如何用函数批量导入文本,并且能够留在R的环境之中?循环用read.table,怎么解决每个文本文件命名问题? list函数能够有效的读入,并且存放非结构化数据。...还有一些字符型会出现乱码的标点等,详见博客:R语言︱文本(字符串)处理与正则表达式 2.2 二级清洗——去内容 如图1 ,msg,对文档进行二级清洗,比如清楚全英文字符、清除数字等。...其他关于主键合并的方法有,dplyr包等,可见博客:R语言数据集合并、数据增减 3.2 词库之间相互匹配 1、集合运算(%in%/setdiff())——做去除数据 在2.3的三级停用词清理的过程中,...2、left_join——词库匹配打标签 以上%in%较为适合做去除数据来做,因为可以生成布尔向量,作为过渡。但是如何连接词库,并且匹配过去标签呢。...,一些没有匹配到的NA, 用[is.na(testterm$weight),]来进行删除。
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