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R语言之 ggplot 2 和其他图形

想象有一张空白画布,在画布上我们需要定义可视化数据(data),以及数据变量到图形属性映射(mapping)。 下面使用数据 mtcars 作图。...例如,在上图中,我们变量 am 映射到颜色,但具体使用哪种颜色是 ggplot2 自动选择。如果想自己设定颜色,就需要使用标度(scale)函数了。...但有时候我们希望观察相对比例,这可以通过参数 position 设为“fill”来实现,结果如下图所示。...其他图形 2.1 金字塔 金字塔是一种背靠背式条形,常用于展示研究人群的人口结构,所以也称为人口金字塔。...下面以 epiDisplay 包里数据 Oswego 为例绘制金字塔,这里需要用到数据两个变量 age 和 sex。

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ggplot2|发散性“正负”

前面介绍了一些ggplot绘图,ggplot2|从0开始绘制直方图,ggplot2|从0开始绘制箱线图,ggplot2|从0开始绘制折线图,这次介绍一下当数据为发散性正负值时候,几种比较合适展示方式...一 载入数据并处理 library(ggplot2) # 使用mtcars数据 data("mtcars") # 保留car name ,新建一列 mtcars$car_name <- rownames...# 改为因子,能够保持原顺序 mtcars$car_name <- factor(mtcars$car_name, levels = mtcars$car_name) 注:改为因子使图形按照原顺序输出...二 Diverging bars Diverging bars是一种可以同时处理负值和正值条形。...三 Diverging Lollipop Chart Lollipop Chart与上述类似,而是使用 geom_point 和 geom_segment 来获得想展示

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R语言 | 条形绘制

本次内容介绍条形绘制,包括基本条形、簇状条形、频数条形、堆积条形、百分比条形。 下次介绍如何对条形着色、调整条形宽度和间距、添加数据标签等内容。...1绘制基本条形 演示数据 以gcookbook包中pg_mean数据为例。...我们可以通过fill参数改变填充色,colour为条形添加边框线。这里我填充色更改为亮黄色,边框线为黑色。注意,颜色要用""引起来哦!...输出图片 3 绘制堆积条形 演示数据 同上,以gcookbook包中cabbage_exp数据为例,该数据包含两个分类变量Cultivar和Date和一个连续变量Weight。...演示数据ggplot2包中diamonds数据为例。

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原创 | R基础及进阶数据可视化功能包介绍

R 作为入门级编程语言,被经常运用在数据整理、数据可视化、以及机器学习中。 本篇文章主要介绍在R中如何可视化数据 (基础+进阶)。 R绘图原理 使用R绘图,我们需要在脑海中明确几个必要元素。...在拥有空白画布基础上,我们可以使用R自带可视化功能语句plot()来描绘散点图、折线图、柱状等,辅助用户用于观察整个数据潜在趋势。...这些语句都可以被灵活使用,使可视化图表在原有基础上达到理想效果。...我们将使用R Studio中自带数据mpg来进行ggplot2可视化演示根据R绘图原理,我们需要在ggplot2一个图表拆分成若干个子元素并进行叠加绘制。...与ggplot2相似,我们首先需要生成静态图表 在生成静态图表基础上,动及为多张静态按一定规则堆在了一起。这里规则便是我们提到,按照声明变量,比如:时间或类别顺序

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ggplot2 |legend参数设置,图形精雕细琢

学习了ggplot2|详解八大基本绘图要素后,就可以根据自己需要绘制图形。前面也给出了一些ggplot2绘制生信分析基本图形例子pheatmap|暴雨暂歇,“热”来袭!!!...,ggplot2-plotly|让你火山“活”过来,ggplot2|扩展包从0开始绘制雷达ggplot2| 绘制KEGG气泡ggplot2|绘制GO富集柱形ggplot2|从0开始绘制PCA...ggplot2|ggpubr进行“paper”组合并,本文介绍一些对legend细节操作来完成图形“精雕细琢”。...载入R包和数据 mtcars数据作为示例数据 library(ggplot2) #查看数据 head(mtcars) mpg cyl disp hp drat...因子变量cyl和gear映射为点颜色和形状,qsec决定点大小。

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56-R可视化-5-ggplot2基石三部曲之基础二

也正因其代表不同图层,因此也可以利用新图层对旧图层进行叠加(或覆盖)。 先后顺序 但也正和图层叠加一样,R中ggplot 叠加也有先后顺序,后来图层会覆盖在原来图层上。...因此若我们希望自定义y,需要将其改为 identity 。否则会报错。...图层存在先后顺序,后来图层越靠近顶层。 ggplot2 无法借助循环直接批量绘图映射在同一层面上,可以借助列表先存储这些绘图,再使用拼图函数将它们拼接在同一画面上。...练习题 6-2 #练习6-2 # 1.尝试写出下图代码 # 数据是iris # X轴是Species # y轴是Sepal.Width # 是箱线图 library(ggplot2) test =...尝试在此图上叠加点, # 能发现什么问题? 点覆盖在箱线图上。后设定图层在靠近顶层位置。

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如何通过R语言制作BBC风格精美图片

在BBC数据团队开发了一个R包,以ggplot2内部风格创建可发布出版物图形,并且使新手容易到R创建图形。 例如: ? 加载所有所需R语言包 通常在R中创建图表需要安装和加载某些软件包。...以下代码显示了在标准图表制作工作流程中应如何使用bbc_style()。 这是一个非常简单折线图示例,使用了来自gapminder包数据。...,使用legend.margin为图例设置负左边距会容易。...左对齐标签添加到条形 如果您想为条形添加左对齐标签,只需根据数据设置x参数,而是直接使用数字值指定y参数。y的确切值取决于数据范围。...image.png 修改柱状柱子顺序 有时,您需要以不按字母顺序或按大小重新排序方式对数据进行排序。

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day4 呦呦鹿鸣——R for data science阅读笔记之ggplot()

使用 ggplot2 可视化单个变量分布&两个或多个变量之间关系。...::penguinglimpse(penguins)View(penguins)开始可视化使用ggplot()第一个参数:在图形中使用数据第二个参数:mapping:如何数据集中变量映射到绘图视觉属性...,在aes()中定义使用geom_形状()定义一个几何图形,表示数据几何对象形状:bar-条形;line-折线图;boxplot-箱线图;point-点对于有缺失值数据,散点图内没有显示,但有报错...默认值为FALSE,即表示warning;更改为TRUE,即静默warning加一个变量物种 species作为图例,用不同颜色和形状标识(兼顾色盲群体需求)geom_point(aes(color...calls简洁 ggplot2 代码表达式ggplot(penguins, aes(x = flipper_length_mm, y = body_mass_g)) + geom_point

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ggplot2 图形排版:patchwork 包简单入门

在前面我们学习了基础绘图系统和 ggplot2 绘图系统图形排版组合,具体可见下面推文。 1....看下 patchwork 包介绍:主要供 ggplot2 用户使用,无论组合图形多么复杂,确保 ggplot 图形对齐。 1....在排版组合图形前需要将一个个 ggplot2 图形传递给一个参数,比如说上面的 p1,p2 等,然后使用这些参数来排版组合图形。 首先可以使用简单+号运算符来图形排在一起。...p1 + p2 如上图所示,两个图形边边角角是对齐。 p1 + p2 + p3 默认情况下,排版按方形排列,按行顺序来填充图形。...除了用+号运算来排版图形外,还可以使用/号来排版。 p1 / p2 p1 | (p2 / p3) p1 | p2 | (p3 / p4) 还可以按 ABCD 顺序添加图形标签。

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R可视乎|分面一页多

双变量数据可视化可能对于我们比较简单, 但是如果变量是三个或者更多,怎么在一幅图一起显示呢?今天我们就来讨论这个问题,解决方案有两种。 1.数据介绍 使用R包自带mpg数据,前几行展示如下。...所以我们还可以通过其他参数来引进更多属性,但是越多就显得越复杂。看下面这个,但是可读性不是很高。 ? 3.使用分面 我们可以图片按照第三个属性进行分面处理。...ggplot2分面有两种方式,分别使用 facet_wrap 或 facet_grid 函数。...shrinks:也和坐标轴刻度有关,如果为TRUE(默认值)则按统计后数据调整刻度范围,否则按统计前数据设定坐标。 as.table:和小排列顺序有关选项。...去除条子框以及改变条子位置 加入参数:strip.position = "top"(默认),可改为其他(见上面参数详解)并加入themestrip.placement="outside"就可以去除条子框了

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生信技能树R语言学习直播配套笔记

x,y顺序 x == y # x和对应位置y相等吗 交集、并、差 x = c(1,5,3,4) y = c(5,12,24,3) intersect(x,y) [1] 5 3 union(x,y...3.a行名改为flower1,flower2…flower5。...## 以y为模板,对X顺序进行排序,然后选择xid列给y列名:match()函数 # match(colnames(y),x$file_name) # x[match(colnames(y),...语法 ggplot2特殊语法:列名不带引号 属性设置 映射:根据数据某一列内容分配颜色 手动设置:把图形设置为一个或N个颜色,与数据类型无关 实战 #1.入门级绘图模板:作图数据,横纵坐标 ggplot...,画出这个,如果不变换表,是无法成功 长表变成短表,变化操作如下 library(tidyr) library(tibble) library(dplyr) dat = t(exp) %>% as.data.frame

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MSLTNet开源 | 4K分辨率+125FPS+8K参数量,怎养才可以拒绝这样模型呢?

在两个基准数据实验表明,作者MSLTs在定量和定性方面都优于最先进曝光校正方法。如图1所示,在ME数据性能比较结果。...4 Experiments Dataset and Metric 数据。作者在两个基准数据上评估作者MSLT网络:ME数据和SICE数据。 ME数据。...该数据包含17,675个训练图像,750个验证图像和5,905个测试图像。 SICE数据。该数据随机划分为412、44和100个序列作为训练、验证和测试。...模块数量 如何开发双边网格网络中层次特征分解(HFD)模块 高频层校正如何影响作者MSLT和MSLT+ 所有实验都在ME数据上进行。...如何在HFD模块中设计使用SFE模块? CFD模块中特征分离顺序影响。 1) 高频层校正中参数共享如何影响作者MSLT性能?

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R数据科学|第十一章内容介绍

使用forcats处理因子 因子在 R 中用于处理分类变量。从历史上看,因子远比字符串容易处理。因此,R 基础包中很多函数都自动字符串转换为因子。...,那么会将按字母顺序排序数据作为水平: factor(x1) #> [1] Dec Apr Jan Mar #> Levels: Apr Dec Jan Mar 若想让因子顺序与初始数据顺序保持一致...,那么可以使用 levels() 函数: levels(f2) #> [1] "Dec" "Apr" "Jan" "Mar" 实例练习 选取forcats::gss_cat数据,该数据是综合社会调查数据一份抽样...,利用这个数据来说明处理因子时经常遇到一些问题: gss_cat #> # A tibble: 21,483 × 9 #> year marital age race rincome #> <int...默认情况下,ggplot2 会丢弃没有任何数据那些水平,你可以使用以下代码来强制显示这些水平: ggplot(gss_cat, aes(race)) + geom_bar() + scale_x_discrete

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跟着NBT学做:样本地理信息

其代码和数据都已经在其github[1]免费分享,按下图操作即可全部打包。下载缓慢朋友也可在公众号回复「20220902」获得压缩包。...函数详解 map_data() map_data()[2]是ggplot2一个函数,用于map包中数据转换为适合ggplot2绘图框架。...(names(arrests)) # arrests列名改为小写 arrests$region <- tolower(rownames(USArrests)) # USArrests行名转换为小写并作为新增一列保存为...data:同ggplot2 stat:使用统计转换 position:位置调整 rule:可选evenodd或winding,如果要绘制带孔多边形,这个参数定义了如何解释孔坐标,示例[5]。...group=region 此时你应该明白,地图数据group是有意义,决定了连线先后顺序,在其他地图包中也有该顺序

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ggplot2|绘制GO富集柱形

生信分析中经常会得到一些基因,然后做GO富集分析,达到对基因进行注释和分类目的。 本文利用R语言ggplot2包,从头带您绘制可发表级别的GO富集分析结果。...一 载入数据和R包 利用各种生信工具得到富集分析结果,数据列可能不一致,但关键几列都有。...二 对上述GO结果绘制基础bar 参照之前ggplot2使用方法,更改geom即可绘制简单bar,按照GO_category分组颜色 ggplot(data=data, aes(x=GO_term...可看出和文献中差距较大,体现在以下几个方面: A:标题,坐标轴“业余”; B:GO_category顺序未按照输入文件,相同GO_category没在一起; C:横坐标label太长,重叠在一起。...三 “细节”调整GO结果bar 3.1 坐标轴调整策略 #GO_term设定为factor即可按照顺序输出 GO_term_order=factor(as.integer(rownames(data

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R语言ggplot2分组箱线图添加误差线简单小例子

ggplot2 更改图例顺序 箱线图添加误差线这个自己老是记不住,每次作图都得现查,今天推文记录一下实现代码,方便自己以后查看。...首先是示例数据 示例数据还是使用鸢尾花数据 部分如下 image.png 收下是读取数据 df<-read.csv("iris.csv") head(df) 宽格式转换为长格式 reshape2...ggplot(data = dfa, aes(x=Species,y=value,fill=Species))+ geom_boxplot() image.png 添加误差线 这里使用是...如果不加这两个参数,效果如下 image.png 这里还有一个疑问是 箱线图中间线好像是中位数,如何把这个线更改为平均值呢?...暂时没有想明白 今天推文示例数据和代码可以直接留言20210929获取 欢迎大家关注我公众号 小明数据分析笔记本 小明数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化简单小例子

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