随着生物信息学的发展，R语言在数据分析和绘制图形上都有着十分重要的优势。尤其是现在大部分科研绘图，都使用R语言来完成的。...本次绘图所使用的R包：ggplot2和ggpointdensity ggplot2是R语言绘制图形一个十分重要也是非常基础的一个包，使用ggplot2再加上R自带的base画图基本可以完成所有图形的绘制...ggpointdensity是这次绘制密度散点图的包。...1.获取和设置工作路径 使用setwd()和getwd()来获取和设置自己的工作路径。...2.安装包和导包 安装包install.packages("ggpointdensity")和install.packages("ggplot") 导包library(ggplot2)和library(
密度图和直方图 sunqi 2020/8/3 Density Plot Density Plot：也称作核密度图 函数和参数 geom_density() color, size, linetype:...颜色、大小和线的类型 fill：填充 alpha：透明度 绘图 # 需要的包 library(ggplot2) theme_set( theme_classic() + theme(legend.position...aes(color = sex)) + # 这个函数很熟悉吧 scale_color_manual(values = c("#868686FF", "#EFC000FF")) # 更改线的颜色和填充颜色和垂直线...=ls()) # 需要的包 library(ggplot2) theme_set( theme_classic() + theme(legend.position = "top") )...结束语 核密度图和直方图一般在论文中使用的很少，这也就注定是一个数据探索阶段的绘图，所以修的再漂亮也没什么用 love&peace
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近VIP群内有朋友询问火山图的绘制方法，那么本节就来详细介绍在R中如何使用「ggplot2绘制火山图」，小编添加了详细的注释希望各位观众老爷能够喜欢。...("data.xls", header = TRUE, sep = "\t") 数据清洗 plot_data % janitor::clean_names() %>% # 使用...表示显著性阈值为 0.05 geom_hline(yintercept = -log10(0.05), linetype = "dashed") + # 添加垂直虚线，x 轴截距为 log2(0.5) 和..."ns" = "grey"), labels = c('down 1245', 'ns 12578', "up 981")) + # 设置 x 轴的刻度和范围...scale_x_continuous(breaks = c(seq(-10, 10, 2)), limits = c(-10, 10)) + # 设置 x 轴和 y 轴的标签 labs(x
如何将下图中的左图（低配版）转化为右图（高配版， x，y 轴分离）。 低配版条形图 首先，构造一个数据集作为样例，读者可以根据自己的数据进行调整即可。假设 y 是分类变量，x 是连续型变量。...绘制条形图，简单调整柱子的宽度以及加上 x，y 轴标题。...这里的细节调整包括：使用 ggthemes 包中的 theme_tufte() 主题，viridis 包的 scale_fill_viridis() 离散配色。...注意：这里将柱子按照类别进行填充，当然你也可以使用另一个变量进行填充（下面会给例子）。...当然这种技巧也可以使用其他图形中。读者如有需求，可以自行探索。
前言 在前几天对数据分析师与算法工程师进行岗位对比分析的文章中，我们使用了密度分布图和箱线图对薪资水平与学历对薪资的影响进行了分析，那么早起就对这两种图形的绘制方法进行解析，也借着这个机会讲一下我最喜欢的绘图包...：ggplot2 密度分布图 在频率分布直方图中，当样本容量充分放大时，图中的组距就会充分缩短，这时图中的阶梯折线就会演变成一条光滑的曲线，这条曲线就称为总体的密度分布曲线。...这条曲线排除了由于取样不同和测量不准所带来的误差，能够精确地反映总体的分布规律，密度分布图其实就是密度分布曲线的填充。 原文的的密度分布图的绘制软件为R，为啥不用Python？...ggplot2，并设置x轴，此时图形长这样?...结束语 以上就是使用R绘制漂亮的密度分布图过程，我已将原始数据放在公众号后台回复招聘获取，感兴趣的读者可以利用原始数据自己使用python进行处理得到我们需要的数据格式再绘制，最后留一个问题，怎样绘制学历关于薪资的箱线图
如何计算一维和二维的最高密度区域和以一个协变量为条件的单变量密度函数核估计以及多模态回归?小编今天给大家推荐的一个超强工具即可解决上述问题。...详细内容如下： R-hdrcde包介绍 R-hdrcde包样例样式 R-hdrcde包介绍 R-hdrcde包为最高密度区域和条件密度估计(Highest Density Regions and Conditional...Density Estimation)的缩写，主要用于计算和绘制高密度估计函数，更多详细内容可参考：R-hdrcde介绍[1] R-hdrcde包样例样式 这一小节小编主要介绍R-hdrcde包优秀的计算和绘图函数...，这些函数主要用于估计和绘制最高密度区域和条件密度估计。...总结 今天推送了一篇简单的用于计算和绘制最高密度区域和条件密度估计的优秀工具-R-hdrcde，希望可以帮助到大家，更多案例可参考官方网址~~ 参考资料 [1] R-hdrcde介绍: https://
这次我们将只使用3个库：httr通过GET函数检索数据;tidyverse 和 sf 用于空间分析和数据整理。...边界框 在我们用ggplot2做魔术之前再走几步。我们的目标包括欧洲和中东，因此我们希望确保我们主要占领欧洲。我们通过制作一个边界框来做到这一点。让我们使用 WGS84 坐标定义边界框的参数。...我们首先绘制河流线，并根据定义的宽度根据类和宽度分配特定颜色。 由于我们的目标是将视野缩小到欧洲，因此我们使用coord_sf根据预定义的边界框设置纬度和经度限制。...我们将使用蓝色阴影来绘制我们的河流类。此外，我们将大小限制定义为从 0 到 0.3 的数值范围。我鼓励你玩这个范围，看看你会得到什么。...好吧，这就是女士们和先生们！在本教程中，您学习了如何导入河流空间文件以及如何在 R 中制作欧洲的炫酷河流地图。随时检查完整代码这里，克隆存储库并根据需要重现、重用和修改代码。
上一篇教程介绍了绘制完整地图的方法：R 语言绘制十段线地图，给特定省份填色，今天我们将继续探索分省市地图的绘制。 本文的所有代码以及数据可以在公众号后台回复 [中国地图绘制] 免费获得。...library(rgdal) library(ggplot2) library(maptools) library(mapproj) library(ggsn) library(readxl) library...然后，使用 left_join() 合并数据。...有时候需要绘制一个区域的地图，比如：长三角、京津冀等，绘图方法和单个省份一样，只是需要将多个省份的数据存储在一个文件中。...合并数据 小编使用的是 xlsx 格式的数据，因为可以创建多个 sheet，调用起来比较方便。
约翰·霍普金斯大学提供了一份数据集，使用这份数据集我们可以绘制一幅气泡地图展示这些确诊患者的分布，代码比较简单： 首先导入我们需要的几个 R 包： library(ggplot2) library(sf...worldmap % st_transform(crs = 4326) 把疫情数据读取进来并根据经纬度坐标把这个数据框转换成 sf 对象，同样使用...colnames% st_as_sf(coords = c("long", "lat"), crs = 4326) -> con_df 最后绘制地图...Novel Coronavirus (COVID-19) Cases, provided by JHU CSSE\nhttps://github.com/CSSEGISandData/COVID-19\n绘制...❝本文的附件和代码可以从知识星球下载：https://t.zsxq.com/iEYVjqr ❞
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来随意绘制一张组合图，数据为R内置数据，图表无实际意义，整个过程仅参考。希望对各位观众老爷能有所帮助。...目前此文档(2023+2024)「已经更新上传了150+案例文档」，每个案例都附有相应的数据和代码，并配有对应的注释文档，方便大家学习和参考。可到小编的「淘宝店铺-R语言数据分析指南」下单购买。
一.控制好词频和密度 一个是词频，也就是关键词出现的次数。一个是关键词的密度，也就是关键词出现次数除以页面可见文字的总词数。...比如电脑和计算机是同义词，可以在页面中交叉出现。...“SEO方法”，而不是把“SEO”和“方法”分开，分别出现在页面上。...页面重要位置不仅要完整匹配出现“SEO优化论坛”六个字，建议“SEO优化”和“论坛”也可以分别单独（不连在一起）出现几次。...六.语义分析 算法和人很不一样的地方是，人可以直接理解词的意思、文章的意思，算法不能理解。人看到“苹果”这两个字就知道指的是那个圆圆的、有汁的挺好吃的水果，搜索引擎却不能从感性上理解什么是苹果。
图形展示 图形解读 ❝此图使用经典的企鹅数据集进行展示，在散点图的基础上按照分组添加拟合曲线及回归方程与R,P值，后使用ggExtra添加密度曲线与数据分布直方图，使用已有R包进行绘制非常的方便，此图大概有以下几点注意事项...❞ stat_poly_line 是一个在 ggplot2 图形中添加多项式回归线的函数。这个函数直接计算多项式回归模型，并将拟合线添加到图形上。它允许指定多项式的阶数，即回归方程中最高次项的次数。...geom_smooth是一个更通用的函数，用于在 ggplot2 图形中添加平滑曲线或拟合线。它支持多种平滑方法，包括局部回归（loess）、光滑样条（smooth spline）和线性模型。...theme_classic() 添加密度曲线 ggMarginal(p, type = "densigram", groupColour = TRUE, groupFill = TRUE,...过程仅供参考；有需要学习时间可视化的朋友，欢迎到小编的「淘宝店铺」 「R语言数据分析指南」购买「2023年度会员文档」同步更新中「售价149元」，内容主要包括各种「高分论文的图表分析复现以及一些个性化图表的绘制
之前 跟SCI学umap图| ggplot2 绘制umap图，坐标位置 ，颜色 ，大小还不是你说了算 介绍过DimPlot的一些调整方法。...如果想实现多个基因的话，将目标基因和UMAP 的坐标提取出来使用ggplot2绘制即可 或者 使用scCustomize 包中的多基因联合密度图 ，如下。...然后用Plot_Density_Joint_Only()函数即可以同时绘制多个基因的联合密度图 ，可以不限于2个基因 。...| 关于标题，坐标轴和图例的细节修改，你可能想了解 ， ggplot2|theme主题设置，详解绘图优化-“精雕细琢” ，和ggplot2 |legend参数设置，图形精雕细琢 5 批量绘制 当有多个基因需要绘制时候...和 选择展示的图片 来绘制CNS级别的主图。
这部分我会通过一个实战案例，教会你如何使用Excel来绘制甘特图，从而来管理项目，并自动生成项目进度报表。 我们可以根据项目需求用Excel做下面的项目管理文档。...这部分主要是为了方便全局看到项目信息和人员任务安排信息，帮助最大化利用人员时间和效率，降低资源浪费 每周你可以把项目进度文档发给各个相关的人员，每个人可以看到整体项目的进度，和各自当前的工作任务。...整个文档做起来难度并不是很大，做完之后能够多次重复使用，大大的提升了使用的愉悦度和效率。 下面我教你如何用Excel做出这样的项目管理文档。 4.如何用Excel做甘特图？ 1）如何制作项目计划表？...2）甘特图如何制作？...5.模板下载 前面我们学习了面对复杂问题，如何使用Excel制作甘特图和自动报表来推进项目进度。 我希望你也能亲自跟着前面的步骤实践一遍。 怎样用 Excel 做数据分析？
forestploter/ggforestplot等多个R包： 画一个好看的森林图 用更简单的方式画森林图 R语言画森林图系列3 R语言画森林图系列4 R语言画误差线的5种方法 虽然写的很详细，有亚组和没亚组的都包括了...，但是base r的语法对于新手来说确实很难理解，不如ggplot2系列清晰易懂，而且各种空格/NA等占位符的使用也不好理解。...所以今天介绍下如何使用ggplot2画森林图，相比于之前介绍的森林图画法，主要是数据不复杂，只要在图层上改改细节即可。 但是对于零基础的人来说，依然是有难度的！...) library(patchwork) p2+p4+p5+p1+p3+plot_layout(widths = c(0.1,0.05,0.05,0.1,0.1)) 这颜值已经算是不错了，但是和之前的相比还是有些差距...最后大家思考一个问题：多因素回归的森林图和亚组分析的森林图是一样的吗？
但是当数据量大且分布比较集中的时候就没那么容易确定数据的分布了，这时候可以通过绘制密度或是热力图直观获取数据分布情况。...python中的 matplotlib 库中提供了 hexbin 函数绘制密度图，但是我还是更喜欢 R 语言中绘制密度图的方式，比如自带的 smoothScatter 函数以及 ggplot2 中的 geom_bin2d...和stat_bin2d函数。...上述函数利用核密度估计生成用颜色密度来表示点分布的散点图。...利用美国历年的龙卷数据，绘制美国龙卷风的分布图，直接上代码： library(maps) library(ggplot2) library(ggmap) data <- read.csv('1950-
最近要绘制伦敦区地图，查阅了很多资料后最终选择使用bokeh包以及伦敦区的geojson数据绘制。...bokeh是基于python的绘图工具，可以绘制各种类型的图表，支持geojson数据的读取及绘制地图。...在对数据进行处理之前，先看如何绘制英国地图。...f: geo_source = GeoJSONDataSource(geojson=f.read()) # 设置一张画布 p = figure(width=500, height=500) # 使用...找到了很多关于地图的数据和工具，比如上文中提到的highmap数据集，以及DataV.altas，这个工具可以可视化地提取中国区域的地图数据，但感觉比起自己找数据，画中国地图还是pyecharts来得实在
如：使用 ggplot2 绘制单个和多个省份地图；R 语言绘制十段线地图，给特定省份填色；今天小编将介绍如何比较各个省份及其区县的详细数据，本文参考《R 语言数据可视化之美》[1]。...导入 R 包 安装并加载所需的 R 包： library(rgdal) library(ggplot2) library(dplyr) library(grid) library(RColorBrewer...读者可以使用自己的数据进行替换。数据形式如下： ##字段 NAME99 是各个县的中文名。...# ProCode文件包含省份编号和名称 ProCode <- read.csv("PcCode.csv") ProCode$ID<-as.character(ProCode$ID) for (i in...使用 ggplot 及facet_wrap()分面函数来完成图形绘制。
关于QueenSono QueenSono是一款针对ICMP协议的数据提取工具，该工具基于Golang开发，并且只依赖于ICMP协议不受监控这一事实实现其功能。...工具安装 从源码安装 广大研究人员可以直接使用下列命令将该项目源码克隆至本地，并安装好该工具所需的依赖组件： git clone https://github.com/ariary/QueenSono.git...所有的命令和工具参数都可以使用“—help”来查看。...工具使用样例1：发送包携带“ACK” 在这个例子中，我们将发送一个大型文件，并查看接收到数据包之后的回复信息： 在本地设备上，运行下列命令： $ qsreceiver receive -l 0.0.0.0...KEY> 参数解释： —encrypt：使用加密交换，它将生成公钥/私钥。
关于XLMMacroDeobfuscator XLMMacroDeobfuscator一款针对XLM宏的安全工具，该工具可以帮助广大研究人员提取并解码经过混淆处理的XLM宏（Excel 4.0宏）。...该工具可以使用一个内部XLM模拟器来解析宏文件，而且无需完整执行目标宏代码。 当前版本的XLMMacroDeobfuscator支持xls、xlsm和xlsb格式。...该工具使用了xlrd2、pyxlsb2和其自带的解析器来相应地从xls、xlsb和xlsm文件中提取单元数据以及其他信息。 你可以在xlm-macro-lark.template查看XLM语法。...XLMMacroDeobfuscator可以在任意操作系统上运行，并正常来相应地从xls、xlsb和xlsm文件中提取和解析XLM宏文件，而无需安装Microsoft Excel。...模拟器安装 首先，我们需要使用pip下载和安装XLMMacroDeobfuscator： pip install XLMMacroDeobfuscator 接下来，我们可以使用下列命令安装最新的开发版本
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