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gtsummary|巧合-绘制多种数据汇总表“神器”

晚上想起上午时候提示我没有tbl_summary函数,查到是gtsummary,习惯性看了下功能,这不是也可以绘制三线? 惊了,于是有了这篇分享。...1 下载R,数据 使用内置数据集演示 #install.packages("gtsummary") library(gtsummary) #查看内置数据集 head(trial) ?...可以看到连续型变量使用是中位数(四分位数),分类变量使用 个数(比例)。 但是不是缺点什么? 文献1,是不是会有分组?是不是会有总体描述?是不是会有P?是不是会有mean(sd) ?...() %>% # 添加P add_overall() %>% modify_header(label = "**Variable**") %>% # 标签列header bold_labels...test = list(all_continuous() ~ "t.test")) # 添加P 就可以根据需求,结合着使用就可以绘制文献 “Table1”了 !

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超强gtSummary ≈ gt + comparegroups ??

gtsummary是专门用来画表格,高度自定义多种选项,快速绘制发表级表格。可用于总结汇总数据集、多种模型等。 快速绘制描述性统计表格、基线资料(例如医学期刊常见1!) 。...自动识别常见回归模型,如逻辑回归和Cox比例风险回归,会在表格自动填充适当列标题(即优势比和风险比)。 高度自定义表格。字体字号、增加P,合并单元格等,通通支持自定义。...P外,还可以添加超多东西: 添加其他统计 修改表格细节选项: 修改表格细节 一个简单小例子: trial2 %>% tbl_summary(by = trt) %>% add_p(pvalue_fun...使用as_gt()函数转换为gt对象后们就可以使用gt函数了。...(pvalue_fun = ~style_pvalue(.x, digits = 2)) #修改P小数点 image-20220704181053665 交叉 可以非常方便绘制交叉,临床上我们喜欢叫列联

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生信爱好者周刊(第 2 期):生信境界与道路

文章 1、在ggplot2散点图中自动添加回归系数或回归方程、R2、P等 有时候使用ggplot2绘制散点图展示两组变量关系时,同时也做了一些描述二者关系统计,如相关性分析、回归分析等,并期望将相关系数或回归方程...、R2、P等也添加在ggplot2散点图中,该如何实现呢?...这些函数通常是对样板文件包装,或者添加了gt尚未内置功能。gt是惊人,确保去阅读官方文档。...主题 数据高亮 5、gtsummary[16] - 准备好演示数据总结和分析结果 gtsummary提供了一种优雅而灵活方法来使用R编程语言创建可发布分析和汇总表。...gtsummary总结了数据集、回归模型等等,使用了具有高度可定制功能合理默认。 6、mathpix[17] - 图片转公式神器 好用公式提取工具。支持拷贝到Word和LaTex。

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「R」表格可视化 10+ 指南【前篇】

❞ 表格和图区别: 表格:一般用来查询和比较单独,精确地展示数据。 图:一般用来反应数据集关系和整体形状。 表格用途分类 根据下图展示用途分类选择是否需要使用表格: ?...`gtsummary`[7] - 有用 gt 拓展。 以下是表格语法: ?...你可以通过向 gt() 传递数据来创建,其思想是通过管道逐步向 gt 添加层或更改。...注意下面我们使用 locations 参数标记要修饰表格列,而这里并不是指在数据位置(2:5),另外我们还可以使用 vars(name)(类似上面) 设定。...image-20201011222233762 使用 tab_header() 表格添加标题,利用 md() 或 html() 对文字进行修饰。

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生信爱好者周刊(第 28 期):华大Stereo-seq系列成果揭秘超高分辨率生命全景时空图谱

,揭示其在小鼠、斑马鱼、果蝇、拟南芥等模式生物应用成果,其中Cell文章详细介绍了Stereo-seq技术原理和细节。...3、Nature | slide-DNA-seq - 自带GPS测序技术 该研究推出slide-seq,可以在一个直径3毫米视野内,以10微米分辨率,对每不同位置聚苯乙烯珠子,添加对应空间位置条形码...在每个阵列,包含2万到4万个柱子,每个珠子,可以检测到DNA序列,约为165-421个。...4、2021年人工智能研究成果盘点 文章 1、GitHub,版本控制与协作[3] 本文介绍如何使用GitHub进行版本控制与协作。...conflicted提供了一种解决策略,一旦出现重名就报错,这样提示你一定要指定函数名。

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metabase数据分析利器

前言 在我们日常工作,经常会做一些数据图表数据分析工具、常见就是饼图、柱状、趋势图等. 在前端项目开发,vue中集成echarts、highcharts等图表库,相关开发也是比较容易....官方地址 https://www.metabase.com metabase可以帮助你把数据库数据更好呈现给更多人,数据分析人员通过建立一个”查询“(Metabase定义Question)来提炼数据...5.Question可以便捷地创建图表,Dashboards界面整洁美观 缺点: 1.Question每次只能对数据库一张进行查询,切换数据已有的查询选项会重置 2.填写了sql语句sql查询...需要设置连接数据库地址、设置定时扫描数据库配置 完成连接数据库后,展示了所有名字 在设置可以添加其他数据连接地址 创建问题 在首页点击"右上角 创建问题",可以创建一个问题图表...结语 其实在我们测试日常工作,经常有一些数据统计工作,比如版本质量报告、专项测试分析、接口测试监控、自动化执行监控.

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Zabbix 6.0 升级完全指南!

有没有自定义模块或补丁? 最好方式就是复制当前 Zabbix 实例,然后在测试环境测试升级。 是否所有 Zabbix 组件都提供了所需软件?...现在密码结尾空格不会被删除。 未使用映射将被删除。 由于审计日志设计发生变化,已存在审计日志记录将被删除。...历史和趋势数据通常很大,只备份配置数据就很快。 如果有时候需要从备份执行恢复,则需要手动重新创建历史和趋势。 备份 Zabbix 配置文件。...例子:MySQL 数据库备份(忽略历史和趋势): mysqldump -uroot -p --single-transaction --ignore-table=zabbix.history --ignore-table...答: 会,所有的模板会继续工作。但是对触发语法所做更改都会自动应用到你现有的模板。 问: 迁移过程需要多长时间? 如何评估停机时间?

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创建现代npm最佳实践

在这节课,我们使用现代最佳实践(截至2022年)一步一步地创建一个npm。首先学习如何创建一个npm,这样你就可以熟悉构建和发布一个到 npm 注册。...如何发布 npm 一旦你有了一个npm项目和一个npm账户,你就可以把你npm发布到公开官方npmjs注册上,让其他人可以使用。...然而,你可能在想 "我如何在另一个项目中使用npm进行测试?" 让我们来看看。 测试 包上传完成后,除了单元测试外,我们还要测试在另一个项目引入我们使用情况,看看是否像我们所期望那样。...将秘密名称设置NPM_TOKEN,其是你在前面步骤检索到 回到项目中,进入package.json文件,像下面这样添加一个release键。...采用以下命令,并将NPM_TOKEN=和GH_TOKEN=设置使用您各自令牌。然后在你终端复制并运行完整命令,看看一切是否运行正常。你会看到进程被记录在终端输出

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P4:编写协议无关处理器

我们以下将会以如何使用P4配置交换机来添加一个新分层次标签为例,讲解以上三个目标。 第一章 介绍 软件定义网络(SDN)给予网络运营者对他们网络进行可编程控制能力。...第三章 一门编程语言 我们使用上述抽象转发模型来定义一门语言,用以表达交换机将如何被配置,数据如何被处理。本文主要目标是提出这门P4编程语言。...图 3-1 二层/三层交换TDG依赖图 第四章 P4语言示例 我们通过深入地测试一个简单例子来探索P4。...提取出来首部区域被送入“匹配 – 动作”进行处理。 P4把状态机直接描述成从一个首部到下一个首部过渡转移集合。每一个过渡转移可能会被当前首部触发。...P4基本动作包括: 1.Set_field:将首部某一特定区域设置特定,支持带掩码设置; 2.Copy_field:将一个首部区域拷贝到另一首部区域中; 3.Add_header:添加一个有效特定首部

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使用R语言TCseq分析基因表达时间趋势并划分聚类群

使用TCseq分析基因表达时间趋势并划分聚类群 上一篇介绍了如何使用Mfuzz包在具有时间序列特点转录组、蛋白质组数据中分析基因或蛋白表达时间趋势,并将具有相似表达模式基因或蛋白划分聚类。...本篇主要通过一个涉及时间序列蛋白质组学数据集,简单演示如何在R语言中使用TCseq分析蛋白质表达时间趋势,并根据时间表达模式相似性实现聚类过程。...加载TCseq,将上述数据读取到R,转换为矩阵类型后,直接作为聚类函数timeclust()输入。...,例如 claster 2,直接在作图结果输入下标选取 p[2] 如上示例,基于模糊c均值聚类(timeclust()参数algo='cm')原理对蛋白质表达时间序列进行了聚类。...等问题,可以参考前文“使用Mfuzz分析基因表达时间趋势并划分聚类群”提示,它们工作过程差不多。

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时间序列数据分析与预测之Python工具汇总

具体可以参考该文章:时间序列定义、均值、方差、自协方差及相关性、一文解读时间序列基本概念 数据通常绘制为图表上一条线,x 轴为时间,y 轴每个点。...使用 Statsmodels 进行时间序列预测 Statsmodels 是我们在数据可视化工具一节已经提到一个。但是,这是一个更相关预测。基本上,这个提供了一系列统计模型和假设检验。...它还包括时间序列描述性统计,例如自相关、偏自相关函数和周期图,以及 ARMA 或相关过程理论性质。 Statsmodels[8] 描述了如何使用 Statsmodels 开始使用时间序列。...它可用于单变量和多变量时间序列找到最佳时间序列预测模型。此外,AutoTS 本身会从数据清除任何缺失或异常值。...显示了一些指标,例如 GitHub 星数、发布年份、支持功能等。

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R语言广义线性混合模型GLMMs在生态学应用可视化2实例合集|附数据代码

library(ggplot2) ggplot geom_smooth函数在ggplot2默认不支持lmer模型,你可能需要手动计算预测添加到数据框,或者使用其他(如ggeffects...lrt.obs:保存观察到似然比检验统计量。 进行1000次模拟,每次: 使用模拟似然比检验统计量来估计p。 最终,代码返回了一个p,该基于参数自助法估计,用于评估随机效应是否显著。...abline函数在直方图上添加了一条垂直于x轴线,线位置lrt.obs,线颜色橙色,线宽3。这通常用于在直方图上标识某个特定观察或阈值。...在此设置,已知存在测试效果,因此每个阳性测试都是真正阳性,每个阴性测试都是 II 类错误。可以根据步骤 3 成功和失败次数计算测试功效。 教程 本教程使用包含数据集。...这两项分析从我们原始模型 1 开始,该模型已有 10 年研究时间。 添加更多组 我们可以像_x _添加额外一样 _g _添加额外级别 。

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时间序列预测全攻略(附带Python代码)

在这个简单例子,很容易看到一个向前数据趋势。但是它表现不是很直观。所以我们可以使用一些技术来估计或对这个趋势建模,然后将它从序列删除。...两种方法得到结果一样。 在这里一个重要问题是如何确定“p”和“q”。我们使用两个坐标来确定这些数字。我们来讨论它们。 、自相关函数(ACF):这是时间序列和它自身滞后版本之间相关性测试。...部分自相关函数(PACF):这是时间序列和它自身滞后版本之间相关性测试,但是是在预测(已经通过比较干预得到解释)变量后。如:滞后5,它将检查相关性,但是会删除从滞后1到4得到结果。...这是因为我们将第一个月份取滞后,一月前面没有可以减去元素。将差分转换为对数尺度方法是这些差值连续地添加到基本。一个简单方法就是首先确定索引累计总和,然后将其添加到基本。...你可以在头脑使用之前输出结果进行回算,检查这些是否正确。接下来我们将它们添加到基本。为此我们将使用所有的创建一个序列作为基本,并添加差值。

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听说你还不会画表格?!我给你汇总好了全部方法~~

,这里小编主要介绍3个优秀表格制作,分别为R-DT、R-gt和R-sjPlot,其他表格绘制工具小编也会在这一部分结尾处汇总。...,下面小编再汇总列出其他优秀第三方R,小伙伴们可自行选择学习哈~如下: R-gtsummary R-kableExtra R-formattable R-reactable R-flextable...R-可视化+表格”混搭“ 这一部分小编主要介绍如何在可视化绘制(ggplot2体系) 添加表格内容,用以更加生动展现数据价值。...内容如下: ggpubr R-ggpubr之前推文(统计绘图 | 一行代码教你绘制顶级期刊要求配图)也介绍其绘制科研图表方便些,这次推文则重点介绍其绘制表格函数,当然还是可以和ggplot2图表对象一起展示...Example Of ggpubr::ggtexttable() make table you want 更多其他案例大家可参考:R-ggpubr表格绘制[4] ggpmisc R-ggpmisc绘制表格函数

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Linux下 iptables 超详细教程和使用示例

Mangle Mangle用于指定如何处理数据。它能改变TCP头中QoS位。...因此,新规则将追加到链尾。 一般而言,最后一条规则用于丢弃(DROP)所有数据。如果你已经有这样规则了,并且使用-A参数添加新规则,那么就是无用功。...可以使用协议名(如tcp),或者是协议(比如6代tcp)来指定协议。...本节主要介绍如何更改链策略,以改变链行为。 1. 默认链策略 /!\警告:请勿在远程连接服务器、虚拟机上测试!...本节在上一节基础上,以SSH和HTTP所使用端口例,教大家如何在默认链策略为DROP情况下,进行防火墙设置。在这里,我们将引进一种新参数-m state,并检查数据状态字段。

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全了!!表格可视化制作技巧大汇总~~

,这里小编主要介绍3个优秀表格制作,分别为R-DT、R-gt和R-sjPlot,其他表格绘制工具小编也会在这一部分结尾处汇总。...,下面小编再汇总列出其他优秀第三方R,小伙伴们可自行选择学习哈~如下: R-gtsummary R-kableExtra R-formattable R-reactable R-flextable...R-可视化+表格”混搭“ 这一部分小编主要介绍如何在可视化绘制(ggplot2体系) 添加表格内容,用以更加生动展现数据价值。...内容如下: ggpubr R-ggpubr之前推文(统计绘图 | 一行代码教你绘制顶级期刊要求配图)也介绍其绘制科研图表方便些,这次推文则重点介绍其绘制表格函数,当然还是可以和ggplot2图表对象一起展示...Example Of ggpubr::ggtexttable() make table you want 更多其他案例大家可参考:R-ggpubr表格绘制[4] ggpmisc R-ggpmisc绘制表格函数

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