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使用内存映射加快PyTorch数据集读取

本文将介绍如何使用内存映射文件加快PyTorch数据集加载速度 在使用Pytorch训练神经网络时,最常见与速度相关瓶颈是数据加载模块。...RAM利用率也是最低,但是使用内存映射文件可以改善这个流程。...最重要部分是在__init__中,我们将使用 numpy 库中 np.memmap() 函数来创建一个ndarray将内存缓冲区映射到本地文件。..._init_mmap中调用np.memmap(),所以这里我们对np.memmap() 做一个简单解释: Numpymemmap对象,它允许将大文件分成小段进行读写,而不是一次性将整个数组读入内存...使用函数np.memmap并传入一个文件路径、数据类型、形状以及文件模式,即可创建一个新memmap存储在磁盘上二进制文件创建内存映射。

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使用内存映射加快PyTorch数据集读取

来源:DeepHub IMBA本文约1800字,建议阅读9分钟本文将介绍如何使用内存映射文件加快PyTorch数据集加载速度。...RAM利用率也是最低,但是使用内存映射文件可以改善这个流程。...最重要部分是在__init__中,我们将使用 numpy 库中 np.memmap() 函数来创建一个ndarray将内存缓冲区映射到本地文件。..._init_mmap中调用np.memmap(),所以这里我们对np.memmap() 做一个简单解释: Numpymemmap对象,它允许将大文件分成小段进行读写,而不是一次性将整个数组读入内存...使用函数np.memmap并传入一个文件路径、数据类型、形状以及文件模式,即可创建一个新memmap存储在磁盘上二进制文件创建内存映射。

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裸机内存管理解析

概述 在计算机系统中,变量、中间数据一般存放在系统存储空间中,只有实际使用时候才将他们从存储空间调入到中央处理器内部进行计算。通常存储空间分为两类:内部存储空间和外部存储空间。...对于电脑来讲,内部存储空间就是电脑内存,外部存储空间就是电脑硬盘。而对于单片机来讲,内部存储就是 RAM ,随机存储器。外部存储可以理解为 flash ,掉电丢失。...该篇文章主题,内存管理,主要讨论是关于 RAM 管理。...静态区,栈我们我们在编写程序时候都会涉及到,定义一个全局变量,就存放在了静态区,在函数内部定义了一个局部变量,就存放在了栈,那堆呢?堆什么时候会使用到呢?假设现在有这样一个程序。...单片机如何进行分配内存 在上述介绍分配内存中,都是使用 malloc来进行分配内存,然后使用 free 来进行释放内存,但是针对于单片机 RAM 如此紧缺设备来讲,使用 C 标准库中内存管理函数是恰当

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Buddy 内存管理机制(上)

Buddy 简介 内存是计算机系统中最重要核心资源之一,Buddy 系统是 Linux 最底层内存管理机制,它使用 Page 粒度来管理内存。...上图是 Buddy 系统内部组织结构,本篇文章只关心未分配区域Free区域管理,下篇文章再来分析可回收区域管理。 一个系统内存总大小动辄几G几十G,不同内存区域也有不同特性。...大于 1 Page 内存分配大多发生在内核态,而用户态内存分配使用是缺页机制所以分配大小一般是 1 Page。...1 Page (Order = 0) 空闲内存优先释放到 PCP 中,超过了一定 batch 才会释放到 Order Freelist当中;同样 1 Page 内存也优先在 PCP 中分配。...Buddy 初始化 在内核启动过程中在 Buddy 初始化以前,系统使用一个简便 Memblock 机制来管理内存

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keras中model.fit_generator()和model.fit()区别说明

首先Kerasfit()函数传入x_train和y_train是被完整加载进内存,当然用起来很方便,但是如果我们数据量很大,那么是不可能将所有数据载入内存,必将导致内存泄漏,这时候我们可以用...callbacks: 一系列 keras.callbacks.Callback 实例。一系列可以在训练时使用回调函数。 详见 callbacks。...ValueError: 在提供输入数据与模型期望匹配情况下。...keras.utils.Sequence 使用可以保证数据顺序, 以及当 use_multiprocessing=True 时 ,保证每个输入在每个 epoch 只使用一次。...参数 generator: 一个生成器,或者一个 Sequence (keras.utils.Sequence) 对象实例, 以在使用多进程时避免数据重复。

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大栅格数据如何更快运算

(2)分块运算还是超过内存使用mmap_array数组运算 如果分块运行还是超过内存大小,这个时候就需要考虑将分块数据中间数据存在硬盘中,等需要时候再去读取。...mmap_array:mmap_array 是一个内存映射文件 (memory-mapped file) 数组,它是 numpy.memmap一个实例。...这种数组数据存储在磁盘上一个文件中,而不是直接存储在内存中。numpy.memmap 主要优点是,它允许您处理比可用内存更大数据集,因为数据只在需要时才从磁盘加载到内存中。...比如我在运行过程中,就遇到CPU只占用了10%出头,但内存已经爆了。 有没有办法既提高CPU运行速度,也内存,还能提高运算速度?可以,使用多线程。...使用多线程,但如何才不能爆内存了?可以通过调整分块大小,分块越小,内存占用越小,能带动线程数量越多。 但是分块大小不是越小越好,会有一个阈值。

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从Caffe2到TensorFlow,十种框架构建相同神经网络效率对比

▲目标 本文目标是如何使用 10 个最流行框架(在一个常见自定义数据集上)构建相同神经网络——一个深度学习框架罗塞塔石碑,从而允许数据科学家在不同框架之间(通过转译而不是从头学习)发挥其专长。...为方便对比,上文中实例(除了 Keras使用同等水平 API 和同样生成器函数。我在 MXNet 和 CNTK 实验中使用了更高水平 API,在该 API 上使用框架训练生成器函数。...该实例中速度提升几乎微不足道,原因在于整个数据集作为 NumPy 数组在 RAM 中加载,每个 epoch 所做唯一处理是 shuffle。...使用 Keras 时,选择匹配后端框架 [NCHW] 排序很重要。CNTK 首先使用通道运行,我错误地将 Keras 配置为最后使用通道。...偏差初始程序可能会改变(有时包含任何偏差)。 不同框架中梯度截断和 inifinty/NaNs 处理可能会不同。

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·深度学习使用生成器加速数据读取与训练简明教程(TensorFlow,pytorch,keras

[开发技巧]·深度学习使用生成器加速数据读取与训练简明教程(TensorFlow,pytorch,keras) 1.问题描述 在深度学习里面有句名言,数据决定深度应用效果上限,而网络模型与算法功能是不断逼近这个上限...数据读取一般方式使同一放到一个数组里面去,在一些小数据上这样处理可以,但是在一些数据量比较多数据集上就会有很大问题了: 占用太大内存,我们在训练网络时,一般采取minibatch方法,没必要一下读取很多数据在使用切片选取一部分...笔者在开发过程中,在使用大规模数据集(上百万条音频数据)时就遇到了这些问题。首先全部读取到内存内存空间肯定不够用,再者读取耗时累加就会超过好几天。...如何在深度学习应用生成器 2.1如何在TensorFlow,pytorch应用生成器 在TensorFlow,pytorch应用生成器时可以直接应用 for e in Epochs: for x...,y in xs_gen(): train(x,y) 2.1如何keras应用生成器keras使用生成器要做些小修改 def xs_gen_keras(data,batch_size):

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从Caffe2到TensorFlow,十种框架构建相同神经网络效率对比

目标 本文目标是如何使用 10 个最流行框架(在一个常见自定义数据集上)构建相同神经网络——一个深度学习框架罗塞塔石碑,从而允许数据科学家在不同框架之间(通过转译而不是从头学习)发挥其专长。...为方便对比,上文中实例(除了 Keras使用同等水平 API 和同样生成器函数。我在 MXNet 和 CNTK 实验中使用了更高水平 API,在该 API 上使用框架训练生成器函数。...该实例中速度提升几乎微不足道,原因在于整个数据集作为 NumPy 数组在 RAM 中加载,每个 epoch 所做唯一处理是 shuffle。...使用 Keras 时,选择匹配后端框架 [NCHW] 排序很重要。CNTK 首先使用通道运行,我错误地将 Keras 配置为最后使用通道。...偏差初始程序可能会改变(有时包含任何偏差)。 不同框架中梯度截断和 inifinty/NaNs 处理可能会不同。

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Keras之fit_generator与train_on_batch用法

关于Keras中,当数据比较大时,不能全部载入内存,在训练时候就需要利用train_on_batch或fit_generator进行训练了。...补充知识:tf.keras中model.fit_generator()和model.fit() 首先Kerasfit()函数传入x_train和y_train是被完整加载进内存,当然用起来很方便...callbacks: 一系列 keras.callbacks.Callback 实例。一系列可以在训练时使用回调函数。 详见 callbacks。...keras.utils.Sequence 使用可以保证数据顺序, 以及当 use_multiprocessing=True 时 ,保证每个输入在每个 epoch 只使用一次。...参数 generator: 一个生成器,或者一个 Sequence (keras.utils.Sequence) 对象实例, 以在使用多进程时避免数据重复。

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干货:Linux 文件系统与持久性内存介绍

这会产生两种重要后果:使用最新技术无法运行仅包含持久内存系统,因此无法实现完全非易失性内存,必须混合使用传统 RAM 和 NVDIMM。...完全写入新数据后,BTT 将以原子方式更新其内部映射结构,使新写入数据可供应用程序使用。...参考来源:如何在英特尔® 架构服务器上仿真持久性内存 3.4.3 使用memmap内核选项 pmem驱动程序允许用户基于直接访问文件系统(DAX)来使用EXT4和XFS。...12G':保留4GB内存,从12GB到16GB。有关详细信息,请参阅如何为系统选择正确memmap选项。...memmap选项 为memmap内核参数选择值时,必须考虑起始地址和结束地址代表可用RAM

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教程 | 如何使用Keras、Redis、Flask和Apache把深度学习模型部署到生产环境?

试想以下情况: 不能将敏感数据移到外网内部项目 指定了整个基础架构必须留在公司内项目 需要私有云政府组织 处于「秘密模式」创业公司,需要在内部对其服务/应用程序进行压力测试 在这种情况下,如何将你深度学习模型迁移到生产环境中呢...想要了解如何使用 Keras、Redis、Flask 和 Apache 将自己深度学习模型迁移到生产环境,请继续阅读。...如果你加载超过了服务器承受(也许你批大小太大,同时你 GPU 内存用完了并开始报错),你应该停止服务器,然后使用 Redis CLI 清除队列: $ redis-cli > FLUSHALL 之后...总结 在本文中,我们学习了如何使用 Keras、Redis、Flask 和 Apache 将深度学习模型部署到生产。 我们这里使用大多数工具是可以互换。...我们向服务器提交了 500 个图像分类请求,每个请求之间有 0.05 秒延迟——我们服务器没有分阶段(phase)(CNN 批大小超过满负载 37% 左右)。

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一招检验10大深度学习框架哪家强!

目标 本文目标是如何使用 10 个最流行框架(在一个常见自定义数据集上)构建相同神经网络——一个深度学习框架罗塞塔石碑,从而允许数据科学家在不同框架之间(通过转译而不是从头学习)发挥其专长。...为方便对比,上文中实例(除了 Keras使用同等水平 API 和同样生成器函数。我在 MXNet 和 CNTK 实验中使用了更高水平 API,在该 API 上使用框架训练生成器函数。...该实例中速度提升几乎微不足道,原因在于整个数据集作为 NumPy 数组在 RAM 中加载,每个 epoch 所做唯一处理是 shuffle。...使用 Keras 时,选择匹配后端框架 [NCHW] 排序很重要。CNTK 首先使用通道运行,我错误地将 Keras 配置为最后使用通道。...偏差初始程序可能会改变(有时包含任何偏差)。 不同框架中梯度截断和 inifinty/NaNs 处理可能会不同。

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keras doc 5 泛型与常用层

函数参数是: generator:生成输入batch数据生成器 val_samples:生成器应该返回总样本数 max_q_size:生成器队列最大容量 nb_worker:使用基于进程多线程处理时进程数...:生成器队列最大容量 nb_worker:使用基于进程多线程处理时进程数 pickle_safe:若设置为True,则使用基于进程线程。...如果指定该参数,将不会使用任何激活函数(即使用线性激活函数:a(x)=x) weights:权值,为numpy arraylist。...如果指定该参数,将不会使用任何激活函数(即使用线性激活函数:a(x)=x) weights:权值,为numpy arraylist。...如果指定该参数,将不会使用任何激活函数(即使用线性激活函数:a(x)=x) weights:权值,为numpy arraylist。

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使用LSTM预测比特币价格

加载内存损害 或者你认为这样就可以完成了,但生活很少会让你这样顺心。我第一次尝试这样做时候我机器停了下来,然后给我反馈了一个内存错误。...你看,这个问题来自于使用比特币数据集每分钟都有记录,所以数据集是相当大。归一化时,有大约100万个数据窗口。并将所有这100万个窗口加载到Keras并开始训练耗时极长。...那么如果你没有100GRAM的话怎样训练这些数据呢(就算你有这么大RAM,如果这个数据增长到100倍,添加更多RAM显然不太可行)?这时我们要用到Keras fit_generator()函数!...我们需要做是创建一个生成器,创建一批windows,然后将其传递给Keras fit_generator()函数。...通过使用h5py库,我们可以轻松地将整齐并且归一化数据窗口保存为秒级以下IO访问numpy数组列表。

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keras doc 4 使用陷阱与模型

本文摘自http://keras-cn.readthedocs.io/en/latest/ Keras使用陷阱 这里归纳了Keras使用过程中一些常见陷阱和解决方法,如果你模型怎么调都搞不对,或许你有必要看看是不是掉进了哪个猎人陷阱...卷积核与所使用后端匹配,不会报任何错误,因为它们shape是完全一致,没有方法能够检测出这种错误。 在使用预训练模型时,一个建议是首先找一些测试样本,看看模型表现是否与预计一致。...,因为Keras不可能知道你数据有没有经过shuffle,保险起见如果你数据是没shuffle过,最好手动shuffle一下 未完待续 如果你在使用Keras中遇到难以察觉陷阱,请发信到moyan_work...@foxmail.com说明~赠人玫瑰,手有余香,前人踩坑,后人沾光,有道是我不入地狱谁入地狱,愿各位Keras使用者积极贡献Keras陷阱。...model.to_json:返回代表模型JSON字符串,仅包含网络结构,包含权值。

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keras自带数据集(横线生成器)

原文地址: A detailed example of how to use data generators with Keras 引言 在使用kears训练model时候,一般会将所有的训练数据加载到内存中...此博客,将介绍如何在多核(多线程)上实时生成数据,并立即送入到模型当中训练。 工具为keras。...接下来将介绍如何一步一步构造数据生成器,此数据生成器也可应用在你自己项目当中;复制下来,并根据自己需求填充空白处。...数据生成器(data generator) 接下来将介绍如何构建数据生成器 DataGenerator ,DataGenerator将实时对训练模型feed数据。 接下来,将先初始化类。...另外,我们使用Keras方法keras.utils.to_categorical对label进行2值化 (比如,对6分类而言,第三个label则相应变成 to [0 0 1 0 0 0]) 。

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Deep learning基于theanokeras学习笔记(1)-Sequential模型

最近在看keras文档,想写博客却真的无从下手(其实就是没咋学会),想想写点笔记过段时间估计会忘得更多,所以还是记录一下吧,感觉学习keras最好方式还是去读示例代码,后期也有想些keras示例代码注释想法...事实上,Keras内部会通过添加一个None将input_shape转化为batch_input_shape 有些2D层,如Dense,支持通过指定其输入维度input_dim来隐含指定输入数据...#kwargs:使用TensorFlow作为后端请忽略该参数,若使用Theano作为后端,kwargs值将会传递给 K.function ---------- #fit fit(self, x...是生成器使用,用以限制在每个epoch结束时用来验证模型验证集样本数,功能类似于samples_per_epoch #max_q_size:生成器队列最大容量 函数返回一个History对象...---------- #evaluate_generator evaluate_generator(self, generator, val_samples, max_q_size=10) 本函数使用一个生成器作为数据源评估模型

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NumPy 秘籍中文第二版:五、音频和图像处理

在以下秘籍中,我们将使用 NumPy 对声音和图像进行有趣操作: 将图像加载到内存映射中 添加图像 图像模糊 重复音频片段 产生声音 设计音频过滤器 使用 Sobel 过滤器进行边界检测 简介 尽管本书中所有章节都很有趣...将图像加载到内存映射中 建议将大文件加载到内存映射中。 内存映射文件仅加载大文件一小部分。 NumPy 内存映射类似于数组。 在此示例中,我们将生成彩色正方形图像并将其加载到内存映射中。...然后使用memmap()函数将图像文件中图像数据加载到内存映射中: img.tofile('random_squares.raw') img_memmap = np.memmap('random_squares.raw...memmap() 给定文件名,此函数从文件创建 NumPy 内存映射。 (可选)您可以指定数组形状。 axis() 该函数是用于配置绘图轴 matplotlib 函数。...另见 第 1 章“使用 IPython”中“安装 matplotlib” NumPy 内存映射文档 合成图像 在此秘籍中,我们将结合著名 Mandelbrot 分形和 Lena 图像。

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