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五分钟入门文本处理三剑客grep awk sed

pattern] [file1,file2] 如查找show.txt里面包含content的 grep content show.txt 第二种形式 command | grep [option] [...使用grep -E 可以支持扩展正则表达式 使用egrep可以支持扩展正则表达式,与grep -E等价 awk 使用一般有如下两种形式 第一种形式 awk 'BEGIN{}pattern{commands...不指定默认以空格或者Tab分割 RS(Row Separator) 输入行分割符。默认回车\n OFS(Output Field Sepatator) 输出字段分割符。...需要指定分隔符: # $2为第二列内容 awk 'BEGIN{FS=":"}{print $2}' /etc/passwd x x x 不需要指定分割符,默认空格,tab,多个也可以分隔(如一个空格...+一个tab) cat show.txt # 空格分隔 python java php # tab分隔 flink hadoop storm 输出第一列内容 awk '{print $1}' show.txt

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Linux系统入门系列之四:工具命令

⑴选取命令:cut,grep 选取命令可以基于关键字按搜索,将含有关键字的选取出来。...可以将tab转换为空格使用规则如下: tr -ds ‘要删除的内容’ ‘要替换的内容’ 命令tr可以处理来自标准输出的内容,其中-d为删除,-s为替换,例如将“:”替换为“;”方法示例如下: 将所有的小写字母替换为大写字母并保存...: col -x 命令col可以处理标准输出的内容,其中-x将tab转换为对等的空格。...使用示例如下: expand -t 命令expand可以处理标准输出内容,其中-t后面跟数字,一般一个tab可以用8个空格替换。...,默认为首,-2也即第二个文件以一的第几个字段为关键字。

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linux18-详说linux文本处理(一)

其语法形如: sed -options script files 选项如下: -n # 只显示经过sed 处理后的; -f # 文件获取sed 执行代码; -r # sed 匹配加入正则功能;...第二开始,间隔三取一 2,+4 # 第二到第六(二加四) /pattern/ # 匹配上pattern 字段的 [!]...我曾经写过:[[13-正则表达式简明学习指南]] grep 有以下好用的选项: -w # 精确查找 -c # 统计成功匹配的行数 -v # 反向匹配,输出未匹配到的内容 -f # 指定文件匹配 -i...# 忽略匹配的大小写 -n # 显示匹配成功的行号 -r # 指定目录的全部文本文件匹配 test.txt 的第3: ❯ grep -n -w 3 -r ./ ....,亦即 A-Z, a-z [:blank:] 代表空白与 [Tab] 按键两者 [:cntrl:] 代表键盘上面的控制按键,亦即包括 CR, LF, Tab, Del..

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常用 linux 命令集锦

options可选参数: -i :忽略大小写 -c :打印匹配的行数 -l :多个文件查找包含匹配项 -v :查找不包含匹配项的 -n:打印包含匹配项的标 正则表达式参数...: \ 忽略正则表达式特殊字符的原有含义 ^ 匹配正则表达式的开始行 $ 匹配正则表达式的结束 \< 匹配正则表达式的开始 \>; 到匹配正则表达式的结束...'查找以"Aug"开始的词汇 grep [0-9] /var/log/messages 选择 '/var/log/messages' 文件中所有包含数字的 grep Aug -R /...oldstring/newstring/g" `grep oldstring -rl yourdir` 7. sed处理过的输出是直接输出到屏幕上的,使用参数"i"直接在文件替换。...关系表达式:可以用下面运算符表的关系运算符进行操作,可以是字符串或数字的比较,如$2>%1选择第二个字段比第一个字段长的。 模式匹配表达式:用运算符~(匹配)和~!(不匹配)。

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unix grep命令_grep命令实例

在调用变量时,也应该使用双引号,诸如: grep“$ MYVAR”文件名,如果不这样,将没有返回结果。 常用的grep选项有: -c 只输出匹配的计数。 -i 不区分大小写(只适用于单字符)。...开始讨论之前,先生成一个文件,插入一段文本,并在每列后加入grep命令示例绝大多数将以此为例,其命名为data.f。生成一个文件,data.f的记录结构如下: 第1列:城市位置编号。...“ sort it” $ grep “sort it” * 2、 匹配 1)显示包含“4 8”字符串的文本: $ grep “48”data.f 2)输出匹配的总数 $ grep -c “48”data.f...假定现在精确抽取4 8,方法如下: $grep “48\>” data.f 另一种方法我试过,好像不行: 注意在每个匹配模式抽取字符串后有一个,所以应操作如下: 表示点击tab...grep命令,因为其输入信息来自于第一个grep命令的输出 4、匹配任意字符 如果抽取以K开头,以D结尾的所有代码,可使用下述方法,因为已知代码长度为5个字符: $ grep ‘K…D’ data.f

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linux下文本比对sed与awk使用方法

好了,在上节的例题三的最后一个例子,我们要去除空白首为 # 的行列,使用的是:grep -v '^$' regular_express.txt | grep -v '^#'需要使用到管线命令来搜寻两次...tab 或空格进行分隔。...但如前面说的, awk 主要是处理『每一 的字段内的数据』,而默认的『字段的分隔符为 "空格" 或 "[tab]" 』!...字段的分隔则以空格或 [tab] 按键来隔开。 因为不论哪一我都要处理,因此,就不需要有 "条件类型" 的限制!...这是因为我们读入第一的时候,那些变数 $1, $2... 默认还是以空格为分隔的,所以虽然我们定义了 FS=":" 了, 但是却仅能在第二后才开始 生效。那么怎么办呢?

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带有实际示例的Linux Cut命令

cut命令用于Linux和Unix系统文件的每一剪切字节、字符和字段并将这些字节、字符和字段写至标准输出。...在这里,我们使用冒号(:)分隔符文件“ / etc / passwd”中提取第一和第六字段,文件包含字符串“ / bin / bash”: $ grep "/bin/bash" /etc/passwd...在下面的示例命令,将输出'/ etc / passwd'文件第二个字段以外的所有字段: $ grep "/bin/bash" /etc/passwd | cut -d':' --complement...要从名为content.txt的文件的每一输出第一个字符,请使用以下命令: $ cut -c 1 content.txt U M O U F 在下面的示例,我们将显示文件每行的字符1至7(范围):...: cut -c-4 content.txt Ubun Micr OsX Unix Free 如何按照字节剪切 使用-b选项通过用逗号(,)分隔的数字指定字节位置来选择的一部分。

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Linux学习-文件排序和FASTA文件操作

OFS: 输出文件的列分隔符 (output file column separtor);FS为输入文件的列分隔符 (默认为空白字符)。awk的列第1到n列,分别记录为$1, $2 … $n。...grep在前面也提到过,以后还会经常提到,主要用途是匹配文件的字符串,以此为基础,进行一系列的操作。如果会使用正则表达式,将会非常强大。...匹配含有SOX2的 # -A 1 表示输出,包含匹配的下一 (A: after) ct@ehbio:~$ grep -A 1 'SOX2' test.fasta >SOX2 ACGAGGGACGCATCGGACGACTGCAGGACTGTC...TAB,以便隔开名字和序列 # TAB不可见,直接看看不大 # \(\)表示记录匹配的内容,\1则表示()记录的匹配的内容 # 后面我们专门讲sed ct@ehbio:~$ sed 's/^\(>...cat -A 可以显示文件中所有的符号 # ^I 表示tab # $表示行尾 ct@ehbio:~$ sed 's/^\(>.*\)/\1\t/' test.fasta | cat -A >SOX2

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Linux cut 命令详解

cut 命令在Linux和Unix的作用是文件的每一截取出一些部分,并输出到标准输出。我们可以使用 cut 命令从一字符串于以字节,字符,字段(分隔符)等单位截取一部分内容出来。...这里,我们使用冒号(:)分隔符文件 /etc/passwd 包含字符串 /bin/bash 的提取第一和第六个字段。...:x:1000:1000:/home/alvin:/bin/bash 如何补全选择输出 要补全选择输出的字段(即反选),使用 --complement 选项。...在下面这个例子输出 /etc/passwd 文件包含 /bin/bash 的除了第二个字段以外的所有字段: $ grep "/bin/bash" /etc/passwd | cut -d':'...: cut -c-4 content.txt Ubun Micr OsX Unix Free 如何根据字节提取 使用-b选项通过指定字节的位置来选择的某一部分,使用逗号分隔每个指定位置,或用连字符

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Linux学习笔记

cat fil 输入文件名前面几个字符时,按下TAB,shell会自动将其补全为: $ cat filename 如果以已经键入的字符开头的文件不止一个,可以连续按下TAB两次,shell...textA textB textC 查找文件内容 在文件寻找某些信息,可以使用grep命令。...grep含有两个参数,第一个参数是被搜索的关键词,第二个参数是所搜索的文件。 $ grep [options] pattern [file...]...例如,在filename文件寻找包含ex的就可以使用下面的命令: $ grep ex filename text 同时可以指定多个文件进行搜索,如下: $ grep ex filename filename...-b选项只查找二进制可执行文件: $ where -b find find: /usr/bin/find 获取命令简介 whatis命令 whatis命令某个程序的使用手册抽出一简单的介绍文字,帮助用户了解这个程序的大致用途

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bash和shell的入门下

' 的次数 -i :忽略大小写的不同,所以大小写视为相同 -n :顺便输出行号 -v :反向选择,亦即显示出没有 '搜寻字符串' 内容的那一!...『纯数字』进行排序(默认是以文字型态来排序的); -r :反向排序; -u :就是 uniq ,相同的数据,仅出现一代表; -t :分隔符,预设是用 [tab] 来分隔; -k :以那个区间 (...:我知道使用 last 可以输出登入者,但是 last 最后两并非账号内容,那么请问, # 我该如何以一指令串取得登入系统的总人次?...举例来 说,要将大写改成小写,或者是将数据的 [tab] 按键转成空格?还有,如何将两篇讯息整合成一 篇?...相对于 join 必须要比对两个文件的数据相关性, paste 就直接 『将两贴在一起,且中间以 [tab] 隔开』而已!

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无插件Vim编程技巧

buffer的文件全转成tab的话,你可以使用下面的命令 :bufdo tab split 保存会话 如果你用Tab或Window打开了好些文件的文件,还设置了各种滚屏同步,或是行号……,那么,...然后,你就会看到vim到shell里去执行并找到了相关的文件,按回车返回vim后,别忘了用 【:cw 】把grep输出取回来,于是我们就有下面的样子: ?...然后同上面一样,你可以用 j,k 移动quickfix里的光标到相应的,然后按回车定位文件,或是使用【:cn】或【:cp】来移动到定位。...我们可以看到,光标回到了一开始我输入的位置,然后你可以干两件事,一个是继续输入(这可以帮助过滤关键词),另一个是用“光标”上移或下移来选择下拉列表的关键字,选好后回车,就补全了。 ?...这两个快捷很有用,可以在Tab页和Windows向前和向后trace你的光标,这也方便你跳转光标。

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玩转Linux - 神级工具 sed & awk

-i : 直接修改读取的文件内容,而不是由屏幕输出。 动作说明: [n1],[n2] function n1,n2:不见得会存在,一般代表选择进行动作的行数。...如果你想在第二前面加上字符串,那么你可以这样:nl /etc/passwd | sed ‘2i drink tea’ 注:2a 的 a 是指第二后面,而 2i 的 i 则是指第二的前面。...如前面说的,awk 主要是处理每一的字段内的数据,而默认的字段的分隔符为空格或者[tab]。...last -n 5 | awk '{print $1 "\t" $3}' 上面是 awk 最常使用的动作,通过 print 的功能来讲字段的数据列出来,字段的分割则以空格或者[tab]按键来隔开。...逻辑运算,如果是“等于”的情况,则务必使用两个等号“==”! 格式化处输出时,在 printf 的格式设置当中,务必加上 n ,才能实现分行。

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linux实战(一)

grep 作用 grep命令可以指定文件搜索特定的内容,并将含有这些内容的标准输出。...实例 $ ls -l | grep '^a' 通过管道过滤ls -l输出的内容,只显示以a开头的。 $ grep 'test' d* 显示所有以d开头的文件包含test的。...默认域分隔符是"空白" 或 "[tab]",所以$1表示登录用户,$3表示登录用户ip,以此类推。...设置分隔符 默认域分隔符是"空白" 或 "[tab]",如果想用其它符合作分隔符,参照下例: /etc/passwd是用:分割的 如下: #cat /etc/passwd root:x:0:0:...{print $1 "\t" $7} 输出第一列  tab  和 第7列 使用BEGIN END模块 显示/etc/passwd的账户和账户对应的shell,而账户与shell之间以逗号分割,而且在所有添加列名

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成为 Linux 终端高手的七种武器

如果在当前目录下存在着另一个名为“really very long file name”的文件,你敲击了Tab。Bash 将为所有以“r”开头的文件自动补充“really ”部分。...此时继续敲击Tab,你将得到匹配所有文件名的列表。 2.管道机制 这种机制允许你把一条命令的输出传送到另一条命令。按照 UNIX 哲学,每个程序都足够小,只做一件事并将之做到最好。...(译注:使用通配符时要小心,尤其是你的rm没有-f确认时!) 4.输出重定向 “>”字符可以把一条命令的输出重定向到一个文件或另一条命令。...使用 history 命令打印历史记录,以管道机制 grep 选择性地输出你想要的结果。 ~ . .. “~”,也叫做波浪符,用来表示当前用户的主目录。...在 Bash 你可以通过在命令结尾添加“&”操作符来后台执行程序。 firefox & 7.条件执行 Bash 也可以连续执行两条命令。 第二条命令仅在第一条命令成功执行后才会开始执行。

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linux运维的命令梳理(三)

默认域分隔符是"空白" 或 "[tab]",所以$1表示登录用户,$3表示登录用户ip,以此类推。...文件查找匹配模式的 1.作用 Linux系统grep命令是一种强大的文本搜索工具,它能使用正则表达式搜索文本,并把匹 配的打印出来。...如果我执行who|cut -b -3,3-,你觉得会如何呢?答案是输出整行,不会出现连续两个重叠的c的。...第二输出将小写的a-l分别换成A-L,而将小写的l以后的字符都不替换。...『纯数字』进行排序(默认是以文字型态来排序的); -r :反向排序; -u :就是 uniq ,相同的数据,仅出现一代表; -t :分隔符,默认是用 [tab] 来分隔; -k :以那个区间

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生信人的自我修养:Linux 命令速查手册(全文引用)

默认列中间加TAB, -d参数可以改变列之间的分隔符 split - 分割文件 split -d -l 10000 file chunk_ # 按行数分割文件,每个文件最多10000,分割成的文件名为...默认以TAB作为分隔符 grep '^>' test.fa | cut -c 2- # 得到fasta文件的序列名称(去掉了>符号) less, head, tail - 显示文件内容 less file...<< END # 标准输入(键盘)读取数据,直到遇到分界符END时停止(分界符用户可以自定义) command file2 # 将file1作为command的输入,并将处理结果输出到...][文件或目录...] grep pattern files # 搜索文件包含pattern的 grep -v pattern files # 搜索文件不包含pattern的 grep...ln -s file file2# 为file文件创建软链接,名称为file2 exit # 退出登录 Tab自动补全 # Tab可以补全命令或文件路径,输入部分命令或路径时,尝试按Tab补全

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shell脚本中常用命令复习

数据去重: uniq 文本数据合并: paste 数据输出: tee 数据处理: xargs 一、 数据处理命令 1、grep: 负责数据源检索对应的字符串,过滤。...匹配包含mail关键字及其前后5 centos8已经为大家设置了,存放在/etc/profile.d/colorgrep.sh文件,如若大家使用的系统没有设置颜色输出, 可以使用以下方法来自行设置...,不会改动源文件 -d:自定义间隔符,默认是tab,只接受一个字符 -s:将每个文件的所有内容按照一输出,文件TAB间隔。...(stdin)数据转换成命令行参数,也能够文件的输出读取数据。...要求用户名密码和默认shell之间用tab分割 [root@zutuanxue ~]# cut -d ":" -f1,2,7 /etc/passwd|tr ":" "\t"|grep -i "bash

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生信人的自我修养:Linux 命令速查手册

默认列中间加TAB, -d参数可以改变列之间的分隔符 split - 分割文件 split -d -l 10000 file chunk_ # 按行数分割文件,每个文件最多10000,分割成的文件名为...默认以TAB作为分隔符 grep '^>' test.fa | cut -c 2- # 得到fasta文件的序列名称(去掉了>符号) less, head, tail - 显示文件内容 less file...grep pattern files # 搜索文件包含pattern的 grep -v pattern files # 搜索文件不包含pattern的 grep -f pattern.txt...:空格,制表符 sed 's/AA/BB/' file # 将文件的AA替换成BB,只替换一第一次出现的AA,替换后的结果输出到屏幕 sed 's/AA/BB/g' file # 将文件的所有...ln -s file file2# 为file文件创建软链接,名称为file2 exit # 退出登录 Tab自动补全 # Tab可以补全命令或文件路径,输入部分命令或路径时,尝试按Tab补全

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不用Linux也可以的强大文本处理方法

可视化模式:通常用于选择特定的内容。 进入写入模式后,VIM使用起来可以跟记事本一样了。...在写入文字时,可以利用组合CTRL+n和CTRL+p完成写作单词的自动匹配补全,从而加快输入速度,保证输入的前后一致。 正常模式有更强大的快捷编辑功能,把手鼠标上解放出来。...>>: 当前行右缩进一个TAB 3>>: 当前行及后2都向右缩进一个TAB <<: 当前行左缩进一个TAB 3<<: 当前行及后2都向左缩进一个TAB /word: 查找特定单词 u: 撤销上一次操作...*"url":"/](/:题目到url之间的内容替换掉;第一次替换时忘记了第一开头还有引号,结果出现了误操作,后面又退回去,手动删除特殊部分,其它部分继续匹配。....*\)/* [\1](\2)/c: 这个是记忆匹配,记录下匹配的内容用于替换,\(和\)表示记忆匹配的开始和结束,自身不匹配任何字符,只做标记使用左只右, 第一个\(的内容记录为\1, 第二个\

1.4K60
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