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Nat. Biotechnol. | 通过迁移学习将单细胞数据映射到参考图谱

通过调整现有的参考构建方法,将它们作为“基础模型”合并到scArches包中。在scArches中构建参考模型可以通过Zenodo上传到模型存储库。...重要是,适配器是可共享,允许用户通过下载参考图谱、为该参考选择一组可用适配器最终通过训练查询适配器合并用户自己数据来定制共享参考模型(图1b)。...这一观察结果适用于其他基本模型,作者同样观察到了模型鲁棒性(图3d)。 参考映射旨在在共享原始数据且计算资源有限情况下生成整合数据集。...利用scArches totalVI,作者使用两个公开可用PBMC数据集通过构建与参考测序(CITE-seq)相结合转录组和抗原位细胞索引(图4f)。...作者评估整合查询批次到参考中性能。scArches成功地整合来自不同数据集肺泡巨噬细胞保留它们之间生物变异。

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InfluxDB 3.0:系统架构

每个摄取器都会执行以下主要步骤:识别数据:与许多其他数据库不同,用户在将数据加载到 InfluxDB 之前不需要定义其模式。它们将被摄取者发现隐式添加。...摄取器为重复数据删除作业构建高效排序合并计划。...更新目录:然后,摄取器会更新有关新创建文件是否存在目录。这是一个信号,让其他两个组件(查询器和压缩器)知道新数据已到达。...在Compactor:数据库性能隐藏引擎一文中,我们描述了compactor详细任务:它如何构建合并数据文件优化重复数据删除计划、有助于重复数据删除不同文件排序顺序、使用压缩级别以实现非重叠文件...与摄取器和查询器设计一样,压缩器使用 DataFusion 和 Arrow 来构建和执行自定义查询计划。实际上,所有三个组件共享相同压缩子计划,涵盖重复数据删除和合并

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直观地解释和可视化每个复杂DataFrame操作

可以按照与堆叠相同方式执行堆叠,但是要使用level参数: df.unstack(level = -1)。 Merge 合并两个DataFrame是在共享“键”之间按(水平)组合它们。...此键允许将合并,即使它们排序方式不一样。完成合并DataFrame 默认情况下会将后缀_x 和 _y添加 到value。 ?...合并不是pandas功能,而是附加到DataFrame。始终假定合并所在DataFrame是“左”,在函数中作为参数调用DataFrame是“右”,带有相应键。...为了防止这种情况,请添加一个附加参数join ='inner',该参数 只会串联两个DataFrame共有的。 ? 切记:在列表和字符串中,可以串联其他项。...串联是将附加元素附加到现有主体上,而不是添加新信息(就像逐联接一样)。由于每个索引/行都是一个单独项目,因此串联将其他项目添加到DataFrame中,这可以看作是行列表。

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港大&港中文提出PRoLoRA | 克服同类参数共享方法缺点,拥有更高模型容量可行性广泛适用性,微调更好大模型

然后沿着秩维度执行近乎零成本旋转操作,以区分相同块以获得更高表达性。此外,为进一步精化能力,保留了一个最小秩子集而共享。...由于旋转操作没有引入任何额外参数,RoLoRA 在增加成本情况下增强了CLoRA表达性,同时保留了对可训练参数相同分析。 Partially-Sharing Refinement....尽管RoLoRA成功避免了简单复制,但它仍然容易受到更微妙模式影响。具体来说,如果两个向量同时以特定步长朝同一方向旋转,它们内积保持不变。...具体来说,在将初始矩阵 \mathbf{A} 和 \mathbf{B} 分割成块时,保留特定数量秩,记作 u ,共享。...作者将PRoLoRA与LoRA以及其他现有的参数共享 Baseline 进行了比较。 LoRA 如同第3.1节所提及,在预训练权重旁边添加了可训练低秩矩阵对。

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关系数据库如何工作

这是想法:而不是逐行读取两个关系,你一束一束地阅读它们,并在内存中保留 2 束行(来自每个关系),您比较两束内保持匹配行,然后你从磁盘加载新比较它们依此类推,直到没有要加载束。...动态规划这两个词背后想法是许多执行计划非常相似。如果您查看以下计划:图片它们共享相同(A JOIN B)子树。...这个算法问题在于,如果我们保留这个连接添加一个新连接,我们假设在 2 个之间找到最佳连接将为我们提供最佳成本。...并发控制确保隔离、一致性和原子性真正问题是对相同数据写操作(添加、更新和删除):如果所有事务都只是读取数据,它们可以同时工作而无需修改另一个事务行为。...使用共享锁:如果一个事务只需要读取一个数据A,它“共享锁定”数据读取数据如果第二个事务也只需要读取数据 A,它“共享锁定”数据读取数据如果第三个事务需要修改数据 A,它“排他锁”数据,但它必须等到其他

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ClickHouse内置字典和外置字典

可以使用CREATE DICTIONARY语句创建字典,使用storage_policy参数将其与表相关联。Totals: 用于合并数据,并将汇总结果保留中。...MateriedViews: 当查询结果需要频繁重复使用时,可以使用Materialized View进行缓存。这个字典在内部执行各种查询,将查询结果存储在中,根据刷新策略自动更新。...可以通过创建字典使用MATERIALIZED VIEW语句创建物化视图。Layouts: 在查询中使用Layout可以决定数据存储方式。它们指定了行数据在磁盘上存储方式,包括排序和分区布局。...可以通过创建字典使用CREATE LAYOUT语句创建Layout。Dictionaries: 自定义字典用于将某个值映射到其他值。...这些字典在ClickHouse中提供了各种功能,如数据分布、数据合并、数据缓存、数据存储方式和数据转换等。可以根据具体需求选择合适字典,使用相应语句进行定义和关联。

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InnoDB数据锁–第5部分“并发队列”

先前文章中描述更改将这些昂贵操作移到了单独线程上,确保它们在操作时不必闩锁整个锁系统。我们代码库中所有其他操作都涉及一个或两个锁队列。...相反,我们可以尝试将某些内容与“哈希存储区”相关联,这几乎就是我们要做,我们只是添加了一个额外步骤modulo 512以固定“分片”数量,独立于您可以在运行时配置哈希存储区数量。...共有3个哈希:用于记录锁,用于谓词锁和锁,最后一个使用锁定ID进行哈希处理,使用其自己单独512分片进行闩锁) 我已经谈论了很多涉及一个队列操作,但是没有涉及必须在两个队列之间移动锁情况...还有其他这样地方,主要是在报告中,为了给用户一个一致描述情况,我们必须停止整个系统。(我们将来也可能消除它们- -也许对这种情况还有其他实际有用看法,它们并不具有全局一致性。...好奇读者可能会注意到,在提交一个事务并将锁授予另一个事务时,可能会发生低级死锁,当请求另一个事务闩锁时,线程已经在第一个事务”上保留了闩锁。

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Navicat Premium 17太牛了,图形化界面的执行计划显示,非常点赞功能

你可以从一系列预设计模板中选择,根据你偏好进行个性化设置。设置自动化流程以将文档导出为 PDF,通过电子邮件与利益相关者共享。数据字典还可在模型工作区中使用。...点击标题将显示该字段统计信息。这些统计信息显示在两个位置:列名下方和网格下方。 你将发现统计信息类型包括空值与非空值百分比,以及不同值和唯一值数量。甚至还有值分布图!...我们还可以在上面的图像中看到“统计”部分提供全部统计信息范围。它包括其他数字,如重复值数量、最小值和最大值等。...一次配置,轻松切换 配置和保存经常用到筛选、排序顺序和显示不同组合。根据不同用途,你可以保存多个配置并在它们之间轻松切换,而无需每次访问时都重新配置。...合并管理多个连接配置文件,创建基于 URI 连接,进一步优化了效率和用户友好性。

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InnoDB锁(Locking)

级锁类型兼容性汇总在以下矩阵中。可以把看作是其他事务已经被授予锁,行是事务要新请求锁。...在这里还值得注意是,可以通过不同事务将冲突锁保持在间隙上。例如,事务A可以在间隙上保留一个共享间隙锁(间隙S锁),而事务B可以在同一间隙上保留排他间隙锁(间隙X锁)。...允许冲突间隙锁原因是,如果从索引中清除记录,则必须合并由不同事务保留在记录上间隙锁。 间隙锁定InnoDB是“纯粹抑制性”,这意味着它们唯一目的是防止其他事务插入间隙。间隙锁可以共存。...一个事务进行间隙锁定不会阻塞另一事务对相同间隙进行间隙锁定。共享和排他间隙锁之间没有区别。它们彼此冲突,并且执行相同功能。 间隙锁定可以显式禁用。...事务在等待获得排他锁同时获取插入意图锁。

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ClickHouse 引擎 & ClickHouse性能调优 - ClickHouse团队 Alexey Milovidov

引擎最后一个可选参数是版本。连接时,所有具有相同主键值行将减少为一行。如果指定了版本,则保留版本最高行,否则保留最后一行。...它们不会被复制。换句话说,它们属于同一台服务器。CREATE TABLE 查询在运行查询服务器上创建一个新复制表。如果此已存在于其他服务器上,它将添加一个新副本。...如果在目录中发现损坏数据块,则将其移动到“损坏”子目录中,不再使用。 合并机制(不要与 MergeTree 混淆)本身不存储数据,但允许您同时读取任意数量其他。阅读是自动并行。...虚拟和常规区别如下: 它们未列在定义中 无法将数据添加到 INSERT 当使用 INSERT 而指定列表时,虚拟将被忽略 使用星号 (SELECT) 时,它们不会被选中 虚拟不会出现在...如果您需要对从属和缓冲区运行 ALTER,我们建议您先删除缓冲区,在从属上运行 ALTER,然后重新创建缓冲区。如果缓冲集与从属匹配,则在两个中插入列子集。

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ClickHouse引擎介绍(三)

如果填版本字段,默认按照插入顺序保留最后一条。...()中指定列作为汇总数据 ➢ 可以填写多必须数字,如果填,以所有非维度且为数字字段为汇总数据 ➢ 以 order by 列为准,作为维度其他按插入顺序保留第一行 ➢ 不在一个分区数据不会被聚合...这种透明查询是这种方法相对于其他集成方法主要优势之一,比如外部字典或函数,它们需要在每次使用时使用自定义查询方法。...这允许您持续接收来自 RabbitMQ 消息,使用 SELECT 将它们转换为所需格式。一个 RabbitMQ 可以有多个你需要物化视图。...一个 exchange 可以在多个之间共享 - 因为可以使用路由让数据同时进入多个。 Exchange 类型选项: direct - 路由是基于精确匹配键。

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手把手教你做一个“渣”数据师,用Python代替老情人Excel

可以用工作名字,或一个整数值来当作工作index。 ? 4、使用工作列作为索引 除非明确提到,否则索引添加到DataFrame中,默认情况下从0开始。...Python提供了许多不同方法来对DataFrame进行分割,我们将使用它们几个来了解它是如何工作。...11、在Excel中复制自定义筛选器 ? 12、合并两个过滤器计算结果 ? 13、包含Excel中功能 ? 14、从DataFrame获取特定值 ?...有四种合并选项: left——使用左侧DataFrame中共享匹配右侧DataFrame,N/A为NaN; right——使用右侧DataFrame中共享匹配左侧DataFrame,N/A为...NaN; inner——仅显示两个共享重叠数据。

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【22】进大厂必须掌握面试题-30个Informatica面试

永久缓存 默认情况下,在成功完成各个会话后,将删除查找缓存,但是我们可以配置为保留缓存,以备下次使用。 共享缓存 我们可以在多个转换之间共享查找缓存。我们可以在同一映射中转换之间共享未命名缓存。...如果它们相等,则对这些行执行任何操作;他们被拒绝了。 联合转型 在联合转换中,尽管进入联合行总数与从联合中通过行总数相同,但是行位置没有保留,即输入流1中行号1可能不是行号在输出流中为1。...24.什么是事实?解释各种事实。 星型模式中集中表称为事实。事实通常包含两种类型。包含度量称为事实和它们是维外键。事实主键通常是由维外键组成组合键。...目标装载订单组: 目标加载顺序组是映射中链接源限定符,转换和目标的集合。集成服务同时读取目标加载顺序组,顺序处理目标加载顺序组。下图显示了单个映射中两个目标装载顺序组。 ?...对要重新排序其他源限定符重复步骤3和4。 单击确定。 30.编写“未连接”查找语法以及如何返回多个。 我们只能从“未连接查找”转换中返回一个端口。

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常用表格检测识别方法——表格结构识别方法 (下)

S Raja提出了一种识别表格结构方法,该方法结合了单元格检测和交互模块来定位单元格,根据行和预测它们其他检测到单元格关系。此外,增加了结构限制损失功能单元格识别作为额外差异组件。...每一层产生18个特征映射,使用ReLU激活函数。膨胀卷积,比如池化,增加了网络感受野,但与池化不同是,它们保留了输入空间分辨率。...保留输入空间分辨率在结构提取中很重要,因为许多和行分隔器只有几个像素宽。在[6]中,当调整初始输入大小以使分隔符区域更大时,获得了更好结果。...这两个模块被连接到一个由ResNet-FPN主干生成共享卷积特征图P2上图片基于SepRETR分割模块 在分割模块中,将两个并行分支附加到共享特征映射P2上,分别预测行和分隔符。...这两个模块都连接到一个共享高分辨率特征图上,该特征图是通过在E_{row}^{'}\inR×W×C^{'}中依次添加一个1×1卷积层和一个上采样层而生成。图片1) 参考点检测。

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DDIA 笔记

,处于应用程序代码中对象和,行,数据库模型之间。...有时会在后台运行合并和压缩过程以组合段文件丢弃覆盖或删除值。...存在很多边缘情况,即使读写法定人数满足时也会发生,如 两个写入同时发生 读写同时发生,不清楚哪个先发生.....,那么保留一个对象两个版本就足够了:提交版本和被覆盖但尚未提交版本) 防止丢失更新:两个事务并发写入问题 原子写,如 update A set a = a + 1 显式锁定, 如 select...但是其他几个例子是不同它们检查是否不存在某些满足条件行,写入会添加一个匹配相同条件行。如果步骤1中查询没有返回任何行,则 SELECT FOR UPDATE 锁不了任何东西。

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MySQL Innodb和Myisam

聚集索引中记录就地更新,它们隐藏系统指向撤消日志条目,可以从中重建记录早期版本。与聚集索引记录不同,二级索引记录包含隐藏系统,也不会就地更新。...可以将经常访问数据保留在内存中,而不管操作活动突然激增,这些操作会将大量不常访问数据带入缓冲池。 可以控制如何以及何时执行预读请求以异步地将页预取到缓冲池中,以预期很快就会需要这些页。...可以配置如何InnoDB保留当前缓冲池状态以避免服务器重新启动后长时间预热。 2、更改缓冲区 更改缓冲区是一种特殊数据结构,当二级索引页不在缓冲池中时,它会缓存对二级索引页 更改 。...死锁 死锁是不同事务无法继续进行情况,因为每个事务都持有另一个需要锁。因为两个事务都在等待资源变得可用,所以它们都不会释放它持有的锁。...;一个VARCHAR以存储在一个或两个字节中长度开始。

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Linux KSM合并内存介绍

页面都是相同。假如操作系统和应用程序代码以及常量数据在 VMs 之间相同,那么这个特点就很有用。当页面惟一时,它们可以被合并,从而释放内存,供其他应用程序使用。...图 2 演示了内存共享展示了在内容相同 VMs 之间共享页面时更多可用闲置内存好处。 [图片上传失败...(image-ced926-1551320042109)] 图 2....下面,我们将探索这种 Linux 内存共享方法,以及如何使用该方法提高服务器内存密度,从而增加其托管其他应用程序或 VMs 能力。...其他技术支持 存储技术中一个称为去耦合(de-duplication)最新进展是 Linux 和其他系统管理程序中内存共享先驱。...稳定树中孤立页面将在稍后被删除(除非该页面的两个或更多用户存在,表明该页面还在被共享)。 如前所述,KSM 使用 “红-黑” 树来管理页面,以支持快速查询。

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《数据密集型应用系统设计》读书笔记(三)

然后,在这些片段上进行「压缩」(compaction),丢弃日志中重复键,只保留每个键最近更新,如下图所示: 此外,由于压缩往往使得片段变得更小,也可以在执行压缩同时将多个片段合并在一起,如下图所示...当 SSTable 写入磁盘同时,写入可以继续添加到一个新内存实例。 为了处理读取请求,首先会尝试在内存中查找键,然后是最新磁盘片段,接下来是次新磁盘片段,以此类推,直到找到目标。...后台进程会周期性地执行合并与压缩过程,以合并多个片段文件,丢弃那些已被覆盖或删除值,同时节省磁盘空间。...事实部分列是属性,例如产品销售价格,供应商成本等,而其他可能会引用其他外键,称为「维度」(dimension tables),维度通常代表事件对象(who)、内容(what)、地点(...内存中存储可以是面向行或面向(不重要),当积累了足够写入时,它们将与磁盘上文件合并批量写入新文件。

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POSTGRESQL PG VS SQL SERVER 到底哪家强? (译) 应该是目前最全面的比较

尽管它们共享一些核心特征,但它们之间存在某些差异。在本文中,我们提供详细 PostgreSQL 和 SQL Server 之间相似和不同概述。...合并复制,用于服务器到客户端环境或可能发生冲突情况下,数据可以在发布服务器或订阅服务器上更改跟踪,之后进行同步; 快照复制,用于数据更新频繁或不需要以增量方式更改情况,将数据完全复制,就像它在特定时刻一样...标准版仅支持两个节点群集; 需要升级到企业版才能添加更多节点。...当生成被标记为STORED时,它们可以被物理存储;否则,它们不会被存储,被称为虚拟(virtual)。 生成不能具有标识定义,也不能成为分区键一部分;它们只能引用当前行,不能使用子查询。...这种方式可以方便地存储和读取嵌套数据结构。 在 SQL Server 中,当两个包含定义关系且其中一个项可以与另一个项相关联时,可以创建嵌套。这可以是两个共享唯一标识符。

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Citus 分布式 PostgreSQL 集群 - SQL Reference(创建和修改分布式 DDL)

例如,假设一个多租户电子商务网站需要为其任何商店交易计算销售税。税务信息并非特定于任何租户。将其合并共享中是有意义。...此外,它还会删除工作节点上分片清理它们元数据。...其他 DDL 语句需要手动传播,并且禁止某些其他语句,例如那些会修改分布语句。尝试运行不符合自动传播条件 DDL 将引发错误使协调节点上保持不变。 以下是传播 DDL 语句类别的参考。...但是,不能更改分布数据类型。此列确定数据如何在 Citus 集群中分布,修改其数据类型将需要移动数据。...将它们添加到非分布将产生错误(请参阅无法创建唯一性约束)。

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