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R语言基础-数据清洗函数pivot_longer

names_to：一个字符向量，指定要根据存储在 cols 指定的数据的列名中的信息创建一个或多个新列。如果长度为 0，或者如果提供了 NULL，则不会创建任何列。...如果长度为 1，将创建一个包含 cols 指定的列名的列。如果长度>1，将创建多个列。在这种情况下，必须提供 names_sep 或 names_pattern 之一来指定如何拆分列名。...names_sep 采用与单独（）相同的规范，可以是数字向量（指定要中断的位置），也可以是单个字符串（指定要拆分的正则表达式）。...原型（或简称 ptype）是一个零长度向量（如 integer() 或 numeric()），它定义了向量的类型、类和属性。如果您想确认创建的列是您期望的类型，请使用这些参数。...请注意，如果要更改（而不是确认）特定列的类型，则应改用 names_transform 或 values_transform。

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数据处理第2节：将列转换为正确的形状

转换列：基础部分 您可以使用mutate（）函数创建新列。 mutate中的选项几乎是无穷无尽的：你可以对普通向量做任何事情，可以在mutate（）函数内完成。...mutate中的任何内容都可以是新列（通过赋予mutate新的列名），或者可以替换当前列（通过保持相同的列名）。 最简单的选项之一是基于其他列中的值的计算。...如果要添加另一个数据框的信息，可以使用dplyr中的连接函数。...连接本身就是一个章节，但在这种特殊情况下你会做一个left_join（），即保持我的主表（在左边），并从另一个向右添加列。 在by =语句中，您指定哪些列相同，因此连接知道要添加的位置。...在前面的示例中，新列“sleep_measure”是一个字符向量。 如果您要进行总结或后续的绘制，则该列将按字母顺序排序。

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R数据科学整洁之道：使用 tibble 实现简单数据框

多数情况下，我们会交替使用 tibble 和数据框这两个术语。 安装 tibble 包是 tidyverse 的核心包之一，因此安装 tidyverse 就可以了。...tidyverse 中许多函数都可以创建 tibble，因为 tibble 是 tidyverse 的标准功能之一。 可以通过 tibble() 函数使用一个向量来创建新 tibble。...tibble() 会自动重复长度为 1 的输 入，并可以使用刚刚创建的新变量，如下所示： library(tidyverse) tibble( x = 1:5, y = 1, z = x ^ 2...可以在 tibble 中使用在 R 中无效的变量名称（即不符合语法的名称）作为列名称。例如， 列名称可以不以字母开头，也可以包含特殊字符（如空格）。...tribble() 是定制化的，可以对数据按行进行编码：列标题由公式（以 ~ 开头） 定义，数据条目以逗号分隔，这样就可以用易读的方式对少量数据进行布局： tribble( ~x, ~y, ~z,

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16. R编程（二：基本数据类型及其操作之因子、矩阵、数据框和列表）

如找出所有带有rings 的planet。空着的列或行就表示全选。...<- tibble( `序号`=c(1,5,6,9,10,15), `收缩压`=c(145, 110, "未测", 150, "拒绝", 115)) t.bp 我们可以用对数据框的相同操作来处理...如动物的种类：猴子，兔子，老鼠。不同的动物之间不存在高低顺序的关联性。2）An ordinal variable，表示有一个排序关系。如描述程度关系的词：高，中，低。明显有一个内在关系。...列表的提取也可以按照类似数据框的方式提取。、 需要注意的是，列表用一个中括号提取内容，会返回一个列表，列表中包含提取的内容，只有用两个中括号，才会返回该内容本来的格式。...shining_list[3] # 第三个变量 2）检索list中变量名获取。

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R数据科学|3.4内容介绍及习题解答

3.4 使用select()选择列 通过基于变量名的操作，select()函数可以让你生成一个有用的变量子集。...select(flights, year, month, day, year, year) 这种机制非常有用，因为它意味着我们可以使用select()和everything()来轻松地更改列的顺序，...vars <- c( "year", "month", "day", "dep_delay", "arr_delay" ) 解答 one_of()函数的作用是:选择带有字符向量的变量，而不是不带引号的变量名参数...这个函数很有用，因为通过编程生成带有变量名的字符向量比生成不带引号的变量名更容易，后者更容易键入。...如果其中一个变量名不存在all_of()函数将报错，而any_of()将忽略它。如果遇到未知列,one_of()将发出警告。 问题四 以下代码的运行结果是否出乎意料？

1.6K60

R 数据整理（十一： 用purrr包实现更花样的匿名函数使用）

1. map 族 其实map 除了对向量有用，也可以作用于数据框或矩阵类型，相当于把其中的每一列作为一个单独的元素来看，有点像按列的apply： > map(infos, typeof) $family...将无名函数写成“~ 表达式”格式， 表达式就是无名函数定义， 用.表示只有一个自变量时的自变量名， 用.x和.y表示只有两个自变量时的自变量名， 用..1、..2、..3这样的名字表示有多个自变量时的自变量名...除此之外，map 还有其他的变种： modify()，输入一个数据自变量和一个函数， 输出与输入数据同类型的结果； map2()可以输入两个数据自变量和一个函数， 将两个自变量相同下标的元素用函数进行变换...， 输出列表； imap()根据一个下标遍历； walk()输入一个数据自变量和一个函数， 不返回任何结果，仅利用输入的函数的副作用； 输入若干个数据自变量和一个函数， 对数据自变量相同下标的元素用函数进行变换...其他有用的函数 比如keep， 可以专门用来选择数据框各列或列表元素中满足某种条件的子集， 这个条件用一个返回逻辑值的函数来给出。

2.4K30

2023.4生信马拉松day7-R语言综合应用

) library(tibble) 专题1 玩转字符串★★★ stringr包含几十个函数，本节课主要讲以下6个： 图片 1. str_length() 检测字符串长度 str_length()数的是引号里面有多少个字母...-（2）用多次嵌套避免中间变量不直观，且容易出错； ——设置彩虹括号，可以在多层嵌套时看清楚哪个括号和哪个括号是一对： options -- code -- display --use rainbow...str_detect()可以检测样本中是不是含有某个字符，然后返回逻辑值，ifelse()对逻辑值T/F进行替换 samples = c("tumor1","tumor2","tumor3","normal1...转换数据：把表格转换成两列数据 -（1） 第一步：转置 -（2） 第二步：把行名作为一列添加到数据中（因为ggplot2容易把行名丢掉，所以倾向于把行名作为一列） -（3） 第三步：新增一列“group...如何挑出30个数里最大的五个 -（1）排序 -（2）取最后五个 图片 3.向量/列表的隐式循环-lapply() 对列表/向量中的每个元素实施相同的操作 lapply(1:4,rnorm) #批量画图

3.6K80

R数据科学|3.5内容介绍及习题解答

上节我们对选择现有的列进行了介绍与习题解答，现在对数据框添加新列进行介绍，这里使用mutate()函数，注意：mutate()总是将新列添加在数据集的最后。...下面介绍一些比较常用的创建函数： 算术运算符：+、-、*、/、^ 它们都是向量化的，使用所谓的“循环法则”。如果一个参数比另一个参数短，那么前 者会自动扩展到同样的长度。...其他条件相同的情况下，更推荐使用log2()函数，因为很容易对其进行解释：对数标度的数值增加 1 个单位，意味着初始数值加倍；减少 1 个单位，则意味着初始数值减半。...= 如果需要进行一系列复杂的逻辑运算，那么最好将中间结果保存在新变量中，这样就可 以检查是否每一步都符合预期。 排秩 min_rank()可以完成最常用的排秩任务（如第一、第二、第三、第四）。...，R会将较短向量的值，生成与较长向量相同长度的向量。

2.5K50

35. R 数据整理（七：使用tidyr和dplyr处理数据框 2.0）

指定变量名时不是写成字符串形式而是直接写变量名： d.class %>% distinct(sex, age) %>% knitr::kable() 如果希望保留数据框中其它列，可以加选项 keep_all...按列号 select(test,1) select(test,c(1,5)) 按列名 如果想要用向量来存放希望筛选的列名，需要使用函数 one_of 来存放该向量。...，向列号一样的切片操作： d.class %>% select(age:weight) %>% head(n=3) %>% knitr::kable() 参数中前面写负号表示扣除，如： d.class...nest 和 unnest 函数，可以将子数据框保存在 tibble 中，可以将保存在 tibble 中的子数据框合并为一个大数据 框。...实际上，tibble 允许存在数据类型是列表 (list) 的列，子数据框就是以列表数据类型保存在 tibble 的一列中的。

10.8K30

R语言入门系列之一

向量可以使用执行组合的函数c()来创建向量，其数据来源可以是数值型、字符型、逻辑型数据（单个向量其数据类型必须相同），也可以来自标量，其参数可以是变量名，具体如下所示： 连续的整数可以使用“:”来表示也即...此外还有grepl()返回匹配逻辑值、sub()替换、gsub()全局替换等length()返回对象的长度也即元素个数mode()查看对象数据类型（也即数值型、字符型等）names()返回向量元素名字order...a, b)求两个向量并集intersect()求两个向量的交集setdiff()setdiff(a, b)求在a中而不在b中的部分setequal()setequal(a, b)检验ab是否完全相同...数据框元素索引有三种方法，第一种为通过列的序号索引，第二种通过列名字索引，第三种通过$变量名索引，如下所示： 可以使用attach()函数来将数据框添加到当前平台，这样就可以直接使用列名字或变量名来调用数据框中的数据...一般情况下，我们把文件都复制到工作路径方便引用，查询当前路径使用getwd()，更改路径使用setwd()，如下所示： 除了read.table()外，还有专门读取逗号分隔的csv文件的read.csv

3.8K30

R数据科学|第七章内容介绍

通过tibble()函数使用一个向量来创建新 tibble。tibble() 会自动重复长度为 1 的输入，并可以使用刚刚创建的新变量。...1 2 #> 2 2 1 5 #> 3 3 1 10 #> 4 4 1 17 #> 5 5 1 26 可以在 tibble 中使用在 R 中不符合语法的名称作为列名称。...例如，列名称可以不以字母开头，也可以包含特殊字符（如空格）。要想引用这样的变量，需要使用反引号将它们括起来。...（以 ~ 开头）定义，数据条目以逗号分隔，这样就可以用易读的方式对少量数据进行布局。...取子集 提取方式相同，但tibble 更严格：它不能进行部分匹配，如果想要访问的列不存在，它会生成一条警告信息。 [[ 可以按名称或位置提取变量；$ 只能按名称提取变量。

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《高效R语言编程》6--高效数据木匠

将你的数据整理好是一个可敬的、某些情况下是至关重要的技能，所以作者使用了数据木匠这个词。...tibble会打印每个变量的类，data.frame不会 stringAsFactors默认不转换 输出时，只输出前10行 使用tidyr与正则表达式整理数据 整理数据包括数据清理和数据重构，前者是重定格式与标记脏数据...正则表达式 R与stringr分别使用grepl()和str_detect()来进行，我比较喜欢基础R的，不知你喜欢安装包还是用基本的。...unlist()函数的作用，就是将list结构的数据，变成非list的数据，即将list数据变成字符串向量或者数字向量的形式。...RODBC是一个资深包，提供R与SQL server的接口。DBI包提供了通用接口与驱动程序的类集，如RSQLITE，是访问数据库的统一框架，允许其他驱动程序以模块包添加。

1.9K20

基于 mlr 包的逻辑回归算法介绍与实践（上）

2.2.3 特征选择（feature selection） 这是另一个非常重要的机器学习任务：保留增加预测价值的变量，删除没有增加预测价值的变量。...female 14 30.1 1 # ... with 881 more rows 2.3 绘制数据 首先，使用 gather() 函数将数据转化为 untidy 形式：每个预测变量名保存在一列中...，它们的值保存在另一列中。...当缺失值的情况与完整情况的比例非常小时，第一种选择可能是有效的。在这种情况下，省略带有缺失值的实例不太可能对模型的性能产生很大的影响。...第二种选择是使用一些算法来估计那些缺失值，用这些估计值替换 NA，并使用这个新数据集来训练模型。估计缺失值的方法有很多种，例如均值插补，也就是取缺失数据变量的均值，用它来替换缺失值。

2.2K20

「R」用purrr实现迭代

，因此复制粘贴了col_mean()，并使用相应的median()和sd()函数替换了mean()函数： col_median = function(df) { output = vector(...哎呀，我们又复制粘贴了2次代码，因此是不是该思考下如何扩展一个代码让它同时发挥几个函数的功能呢？这段代码的大部分是一个for循环，而且如果不仔细很难看出3个函数有什么差别。...）作为输入，并对向量的每个元素应用一个函数，然后返回和输入向量同样长度的一个新向量。...因为长度都相同，所以将各个参数保存在一个数据框中： params = tibble::tribble( ~mean, ~sd, ~n, 5, 1, 1, 10, 5, 3,...keep()和discard()函数可以分别保留输入中预测值为TRUE和FALSE的元素（在数据框中就是指列）： iris %>% keep(is.factor) %>% str()

4.8K20

FreeMarker与JSP 2.0 + JSTL组合进行比较

在某些应用程序中，您可能希望显示不完整/损坏的页面，而不是错误页面。在这种情况下，您可以使用另一个错误处理程序。...FreeMarker的有关于变量名中使用的字符，也不会就变量名的长度没有限制，但为方便起见尽量选择可以用简单的变量引用表达式中使用的变量名（看到这里）。...那么FreeMarker会知道你并不是用相同的符号表示运算符。这可以在您指定非引号标识符的地方，如宏和函数名称，参数名称以及所有类型的变量引用。（请注意，这些转义仅适用于标识符，而不是字符串文字。）...16.如何在FreeMarker模板中修改序列（列表）和哈希（映射）？ 首先，您可能不想修改序列/散列，只需连接（添加）两个或更多的，这将导致新的序列/散列，而不是修改现有的序列/散列。...这是因为您要打印的字符不能用输出流使用的字符集（编码）来表示，所以Java平台（而不是FreeMarker）用问号替换有问题的字符。

5.4K40

Day07 生信马拉松-数据整理中的R

(x," ")) x2 = str_split(x," ")[[1]];x2 #向量长度仅为1，因此用[[1]] x2为字符型向量 ################################...(x2,"T") #判断x2中T开头的字符串,输出逻辑向量 str_ends(x2,"e") #判断x2中e结尾的字符串,输出逻辑向量 1.5 字符串替换 x2 str_replace(x2,"o",..., new = Sepal.Length * Sepal.Width) #R中的修改必须要赋值，不赋值=没发生 test 2.4 连续步骤的不同方法 2.4.1 多次赋值，产生多个中间的变量 x1...} par(mfrow = c(2,2)) apply(iris[,1:4], 2, jimmy) 4.2 lapply(list, FUN, …)函数--参数与自定义函数相似 4.2.1 对列表/向量中的每个元素实施相同的操作...### ggplot2 分面相关设置（facet）详解 7.一些实操中的便捷函数 7.1 match() 函数 load("matchtest.Rdata") x y ## 把y的列名正确替换为x里面的

21800

R语言函数的含义与用法，实现过程解读

同一个表达式中的向量并不需要具有相同的长度。如果它们的长度不同,表达式的结果是一个与表达式中最长向量有相同长度的向量。...x==NA是一个与x具有相同长度而其所有元素都是NA的向量。 NaN(Not a Number): 由数值运算产生，如0/0, Inf-Inf.     ...如果参数中包含数字的话，数字将被强制转化为字符串。在默认情况下，参数中的各字符串是被一个空格分隔的，不过通过参数sep=string 用户可以把它更改为其他字符串，包括空字符串。...这种情况下一个由名称组成的子向量起到了和正整数的索引向量相同的效果。...用包含两个元素x，y的一个列表或一个两列的矩阵作为一个参数（第二种形式那样的）也能达成相同的效果。

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R语言函数的含义与用法，实现过程解读

同一个表达式中的向量并不需要具有相同的长度。如果它们的长度不同,表达式的结果是一个与表达式中最长向量有相同长度的向量。...x==NA是一个与x具有相同长度而其所有元素都是NA的向量。 NaN(Not a Number): 由数值运算产生，如0/0, Inf-Inf.     ...如果参数中包含数字的话，数字将被强制转化为字符串。在默认情况下，参数中的各字符串是被一个空格分隔的，不过通过参数sep=string 用户可以把它更改为其他字符串，包括空字符串。...这种情况下一个由名称组成的子向量起到了和正整数的索引向量相同的效果。...用包含两个元素x，y的一个列表或一个两列的矩阵作为一个参数（第二种形式那样的）也能达成相同的效果。

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生信入门马拉松之R语言基础-脚本项目管理、条件循环、表达矩阵和一丢丢数据挖掘(Day 7)

复习R包stringr字符串操作的几个函数-长度、拆分、提取、字符检测、替换和删除。...,代码运行凡是带有{}的代码，均可以被折叠下载数据的代码，保留但不反复运行，用if(F){...},可以控制其不运行但保留。...2.1.3 为什么用Rdata而不是表格文件来衔接？变量，自带变量名称，不需要再次赋值，也没有参数。undefined表格文件需要赋值，读取参数不同导致读取结果不同，不能在后续代码中同等处理。..., sum)#对test每一行求和向量/列表的隐式循环-lapply,批量操作### 2.lapply(list, FUN, …) # 对列表/向量中的每个元素实施相同的操作lapply(1:4,rnorm...7.5.3 箱线图的应用单个基因在两组之间表达量的差异可视化。分组信息：是一个有重复值的离散型的向量，分组向量的元素和表达矩阵的列是一一对应的。

14100
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