一、降级安装 在制作macOS的pkg安装包时，一般新发布的程序版本会比旧版本更高。但是有的时候我们也希望在安装的时候，对程序的某些依赖库进行降级安装。...这个时候我们自然会想到需要进行降级安装。我们使用packages来制作降级安装包时，需要勾选downgrade选项。如下所示： ? ...由于旧版本使用的Qt5.10依赖库与外部程序冲突，需要降级到5.8.0来与之兼容。实际操作时发现，在覆盖安装时旧版本的Qt库因为版本较高，无法覆盖成功。开始不知道有这么个选项，是因为UI隐藏比较深。...由于我们的程序是一个Bundle类型的文件，所有的资源和依赖库文件都打包进来了。因此在packages里面选择的时候，它内部的文件结构并没有展开： ? ...二、自定义安装 在使用packages制作安装包时，有时候一个安装包里面包含了多个安装组件，而每一个安装组件需要安装释放到不同的位。
Unity打包安卓安装包时出现CommandInvokationFailure: Gradle build failed....于是我改了一下项目名称为JumpAJump，再次打包，成功。
scanpy是处理单细胞数据的python包，基本复现了seurat的主要功能，我曾经测试过，在处理大数据量的单细胞项目时，scanpy的速度和内存真是比seurat友好太多。...今天再一次翻看了scanpy教程[3]，scanpy堆叠小提琴图的风格和Nature文章里的那个图很像，下面是scanpy教程里的小提琴图，在风格上还真是很像： ?...目前seurat（version 3.1）不支持写入scanpy要求的H5AD文件，所以目前的解决方案是： 1.Seurat对象转换为loom文件2.Scanpy读取loom文件转换为能够操作的anndata...对象 要是实现上面的两个简单的步骤还需要安装一些R和python包，需要安装的有以下几个，如果已经安装了，忽略就好： •R包：seurat[7]•R包：hdf5r[8]•R包：loomR[9]•R包：scater...[10]•python包：scanpy[11]•python包：loompy[12] 安装好以上包之后，在R中执行以下代码 ，实现第一步：Seurat对象转换为loom文件 #读入seurat处理后的rds
基于《python的scanpy库读取几种常见的格式的单细胞数据文件汇总》的文章，不知道有没有细心的小伙伴发现，在使用scanpy读取单细胞数据txt文件或者其他格式文件时，得到的AnnData数据对象有点奇怪...之前没有安装scanpy库，可以进行如下操作进行安装： pip install scanpy -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple 如果之前有安装过了...，就不必在进行安装了!...在使用scanpy的read_text()进行读取txt文件时，要注意了哦！..."填坑" 如果你也使用scanpy的read_text()这个函数来读取txt文件，或使用scanpy别的读文件函数读取别的格式文件，读取后的AnnData也出现上述的这种情况，别慌！
什么是Docker Docker是一个用Go语言实现的开源项目，可以让我们方便的创建和使用容器，docker将程序以及程序所有的依赖都打包到docker container，这样你的程序可以在任何环境都会有一致的表现...因此我们可以看到docker可以屏蔽环境差异，也就是说，只要你的程序打包到了docker中，那么无论运行在什么环境下程序的行为都是一致的，程序员再也无法施展表演才华了，不会再有“在我的环境上可以运行”，...Docker 的安装 Docker作为整个环境可以使用Pull 拉取已经建立好的镜像，也可以使用build 搭建自己的镜像。...# 使用mamba 加速下载 使用pip 安装Python包 RUN pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple scanpy #...，有防报错 conda安装nichenetr中存在包的冲突 可以使用devtools安装 https://zhuanlan.zhihu.com/p/187505981（什么是Docker）
Windows下可参考： Windows下安装anconda，可参考 搭建 Python 高效开发环境：Pycharm + Anaconda 通过R里面的reticulate包桥接使用Windows的conda...conda activate infercnv pip install infercnvpy umap-learn 0.5.2版本有一点bug，如果下面的UMAP图像显示异常，可以考虑用pip做一个降级...在Linux环境下利用Jupyter Notebook编译器运行下述python代码： import scanpy as sc import infercnvpy as cnv import matplotlib.pyplot...cnv.pl.chromosome_heatmap(adata, groupby="cell_type") CNV聚类和肿瘤细胞鉴定 为了对细胞进行聚类和注释，inferCNVpy镜像了scanpy...以下函数与它们的scanpy对应函数完全一样，只是它们使用CNV剖面矩阵作为输入。使用这些函数，我们可以执行基于UMAP的聚类，并根据CNV数据生成UMAP图。
京东目前已经有非常成熟的跨平台解决方案 JDReact，如何在 JDReact 与 Flutter 中选择合适的开发方案？...然而当集成到京东客户端时，这些样式并不能满足需求，因此我们提供了适合手机京东（京东 APP）的 UI 组件库（不断完善中）。...4业务集成 目前 Flutter 业务包集成还不支持类似 JDReact 拆分打包--不同的业务自己打自己的，相同的 lib 部分不打进去的分包机制，解决办法是将所有业务都打成一个包，解析原生传递的路由及跳转参数信息...▲开发调试 IDE Flutter 业务开发只需要在手机上安装好我们提供的 apk 安装包，手机连接电脑后，点击“启动 Flutter 调试”绑定手机，修改代码后点击“Reload”按钮即可实现 Flutter...以上3种方法都可以统计出页面数据，方案1可以统计出入口的数据，方案2可以统计出除降级以外的业务数据，方案3可以统计出更精确的业务数据，同时可以提供更详细的其他字段如进入页面时从后台下发的数据。
这两类问题本质上是通过前端的编译工具链(如Babel)及 JS 的基础 Polyfill 库(如corejs)来解决的，不会跟具体的构建工具所绑定。...也就是说，对于这些本质的解决方案，在其它的构建工具(如 Webpack)能使用，在 Vite 当中也完全可以使用。...编译时工具的作用是在代码编译阶段进行语法降级及添加 polyfill 代码的引用语句，如下。...，真正遇到问题时往往会不知所措。...当插件参数中开启了modernPolyfills选项时，Vite 也会自动对 Modern 模式的产物进行 Polyfill 收集，并单独打包成polyfills-modern.js的 chunk，原理和
、持续构建 支持代码分离 支持 Tree-shaking 支持 SourceMap 简单示例： 安装： npm install webpack 编辑配置文件： webpack.config.js const...如何在 Webpack 接入这些工具？...# 解析 JS Babel：一个 JS 的降级化转义器，为了让 ES6 等新语言特性能够兼容尽量多的浏览器，需要将 ES6 等新语言特性装换成 ES5 等兼容性更强的代码 接入 Babel： 安装依赖：...不可到达 代码的执行结果不会被用到 代码只读不写 使用： 只需要配置 mode = "production" 和 optimization.usedExports = true 即可 PS：对工具类库，如...# 理解插件 很多知名工具，如: VS Code、Web Storm、Chrome、Firefox Babel、Webpack、Rollup、Eslint Vue、Redux、Quill、Axios 等等
1写在前面 最近遇到一个大名鼎鼎的包叫Scanpy，用于单细胞测序的分析，不过需要在Python中运行。 于是，我就研究了一下如何在Rstudio中调用这个神包。...这里和大家分享一下如何在Rstudio中调用python吧。...2安装Python 2.1 方法一 你可以选择在官网直接下载安装，地址如下：https://www.python.org/downloads/ , 按照自己的操作系统下载即可。 随后再配置环境。...由于我这里已经安装过了，所以不会提示再次安装。 reticulate::repl_python() ---- 有时候你只是不知道自己的python在哪里，那你可以这样做来获取路径。...Sys.which("python") 3配置Python环境 3.1 安装并加载相关包 接着我们需要安装两个包，来帮助调用Python。
然后，将数据归一化以控制无意义的可变性来源，如测序深度、技术噪声、库大小和批处理效果。然后从归一化数据中选择高度可变基因(hvg)来识别感兴趣的潜在基因并降低数据的维数。...使用默认设置的聚类也会导致输出的差异，即使在调整函数参数和输入SNN图时，Seurat和Scanpy也证明了Louvain聚类的差异，但在Leiden算法的实现中是相同的。...当函数参数像Seurat一样对齐时，几乎所有调整后p值的差异都消失了。...Seurat和Scanpy的比较表明，在某些情况下，程序结果是可以调和的，但并非总是如此。函数之间有三种可能的对齐方式:默认对齐、匹配函数参数时对齐、不兼容对齐。下表显示了每个函数在这些类中的分类。...总结Seurat和Scanpy在使用默认设置执行分析的方式上存在相当大的差异，这些差异只能通过调整函数参数来部分调和。这些差异相当于当降采样读数小于5%或降采样细胞小于20%时引入的可变性。
0、安装包与准备数据 1）安装python包 根据前期探索，不建议直接使用pip安装(存在bug)，而是下载github的最新源码后安装。...marrow_sample_scseq_counts.h5ad Seurat对象转为h5ad格式，参考笔记：https://www.jianshu.com/p/5b26d7bc37b7 1、加载包与环境 import palantir import scanpy...(3) 高变基因 sc.pp.highly_variable_genes(ad, n_top_genes=1500, flavor='cell_ranger') 降维：PCA → UMAP 可以使用scanpy...## (1) scanpy #PCA降维 sc.pp.pca(ad) #UMAP降维 sc.pp.neighbors(ad) sc.tl.umap(ad) ## (2) Seurat seurat_pca...palantir.presults.cluster_gene_trends(trends) palantir.plot.plot_gene_trend_clusters(trends, gene_clusters) note 最后如原文所述
Sentinel 一、熔断、降级、限流 1.熔断 服务熔断的作用类似于我们家用的保险丝，当某服务出现不可用或响应超时的情况时，为了防止整个系统出现雪崩，暂时停止对该服务的调用。...停止是说，当前服务一旦对下游服务进行熔断，当请求到达时，当前服务不再对下游服务进行调用，而是使用设定好的策略(如构建默认值)直接返回。...2.降级 降级是指当自身服务压力增大时，采取一些手段，增强自身服务的处理能力，以保障服务的持续可用。比如，下线非核心服务以保证核心服务的稳定、降低实时性、降低数据一致性。 ...3.限流 限流是指上游服务对本服务请求 QPS 超过阙值时，通过一定的策略(如延迟处理、拒绝处理)对上游服务的请求量进行限制，以保证本服务不被压垮，从而持续提供稳定服务。...控制台（Dashboard）基于 Spring Boot 开发，打包后可以直接运行，不需要额外的 Tomcat 等应用容器。
一、环境需求 1、安装Homebrew Homebrew是OS X的套件(包)管理器，用于安装Node.js和一些其他必须的工具软件。...下载后直接安装即可 3、安装WatchMan WatchMan是由Facebook提供的监视文件系统变更的工具。...安装此工具可以提高开发时的性能（packager可以快速捕捉文件的变化从而实现实时刷新）。...React Native的命令行工具用于执行创建、初始化、更新项目、运行打包服务（packager）等任务。...项目中 4、升级或者降级npm包的版本 只要把上图终端中选择列出的一个版本号复制粘贴到对应位置替换即可，如降级到0.24.1 npm install --save react-native@0.24.1
熔断，其实是对调用链路中某个资源出现不稳定状态时（如：调用超时或异常比例升高），对这个资源的调用进行限制，让请求快速失败，避免影响到其它的资源而导致级联错误。...当资源被降级后，在接下来的降级时间窗口内，对该资源的调用都自动熔断（默认是抛出 BlockException） 目前市面上的熔断框架很多，如：Sentinel、Hystrix、Resilience4j...本文重点讲下 Sentinel 是如何在项目中使用的 Sentinel (分布式系统的流量防卫兵) 是阿里开源的一套用于服务容错的综合性解决方案。...2、控制台（Dashboard）：基于 Spring Boot 开发，打包后可以直接运行。...Sentinel 熔断种类： RT 响应时间 异常数 异常比例 Sentinel 安装 首先，官网下载 sentinel 控制台安装包 下载地址：https://github.com/alibaba/Sentinel
一、环境准备： 搭建 Python 高效开发环境： Pycharm + Anaconda 二、安装 scanpy pip install scanpy 三、AnnData 1、AnnData 介绍与结构...AnnData 是用于存储数据的对象，一般作为 scanpy 的数据存储格式。...换句话说就是，我们每次操作 AnnoData 时，并不是再新建一个 AnnoData 来存储数据，而是直接找到已经之前初始化好的 AnnoData 的内存地址，通过内存地址来直接改变 AnnoData...其实我们在调用 .[] 时，AnnoData已经在内部实现了该操作，也就是说该 view 会成为保存数据的 AnnoData 对象。.../write/my_results_csvs', ) 6、读取数据 import scanpy as sc import pandas as pd # 初始化数据 adata = sc.read(filename
Spring Cloud Sentinel 为微服务提供流量控制、熔断降级和系统负载保护，有效预防服务雪崩。...熔断降级当服务表现不稳定时，Sentinel 自动执行降级策略，如暂时关闭部分功能，保证核心服务的持续运行。3....实战演示：构建和配置 Sentinel环境配置安装 Sentinel 控制台：从 Sentinel GitHub 下载并启动。...动态调整限流和降级规则，测试不同配置的影响。结论Spring Cloud Sentinel 提供了必要的工具来保护和优化微服务架构的性能和稳定性。...通过实现流量控制和熔断降级，Sentinel 确保在高需求或潜在的故障情况下，系统能够稳定运行。这篇博客的示例和说明帮助您理解如何在实际项目中应用 Sentinel，提高微服务的健壮性和可靠性。
文章目录 一、安装 二、使用 1、准备工作 2、预处理 过滤低质量细胞样本 3、检测特异性基因 4、主成分分析（Principal component analysis） 5、领域图，聚类图（Neighborhood...graph） 6、检索标记基因 7、保存数据 8、番外 一、安装 如果没有conda 基础，参考： Conda 安装使用图文详解（2021版） pip install scanpy conda install...Wilcoxon rank-sum Wilcoxon rank-sum (Mann-Whitney-U) 检验的结果非常相似，还可以使用其他的差异分析包，如 MAST、limma、DESeq2 和 diffxpy...在做 UMAP 时，可以看到一些类群间的联系和轨迹。 ? 做 TSNE时，可以看到类群间比较干净利索，整体比较“饱满”。 ?...其他 Scanpy 的使用教程： scanpy 单细胞分析包图文详解 01 | 深入理解 AnnData 数据结构
基本概念 10X空间转录组Visium || 空间位置校准 Seurat 新版教程：分析空间转录组数据（上） Seurat 新版教程：分析空间转录组数据（下） 今天我们就以10X-Visium，我们来看看在scanpy...要运行一套教程前提是要有相应的软件和示例数据，这里我们已经下载安装好了。就直接开始了。...import scanpy as sc import numpy as np import scipy as sp import pandas as pd import matplotlib.pyplot...空间高变基因 空间转录组学允许研究人员调查基因表达趋势如何在空间上变化，从而确定基因表达的空间模式。...预期的应用是空间解析的rna测序，如空间转录组学，或原位基因表达测量，如SeqFISH或MERFISH。
1环境准备 搭建 Python 高效开发环境： Pycharm + Anaconda 2安装 scanpy pip install scanpy 3AnnData 1AnnData 介绍与结构 在做单细胞分析之前...它一般作为 scanpy 单细胞分析包的数据存储格式。...换句话说就是，我们每次操作 AnnoData 时，并不是再新建一个 AnnoData 来存储数据，而是直接找到已经之前初始化好的 AnnoData 的内存地址，通过内存地址来直接改变 AnnoData...设置 'A' 列的头三个元素 adata[:3, 'A'].X = [0, 0, 0] # 查看 'A' 列的头五个元素 print(adata[:5, 'A'].X) 其实我们在调用 .[] 时，...5读取数据 import scanpy as sc import pandas as pd # 初始化数据 adata = sc.read(filename) # 加入数据 anno = pd.read_csv
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
ICP备案
实时音视频
即时通信 IM
对象存储
