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R开发:常用R语言包介绍

stats包 lm函数,实现多元线性回归;glm函数,实现广义线性回归nls函数,实现非线性最小回归;knn函数,k最近邻算法 rpart包 rpart函数,基于CART算法的分类回归树模型...: stats包 glm函数,实现Logistic回归,选择logit连接函数 kknn包 kknn函数,加权的k最近邻算法 rpart包 rpart函数,基于CART算法的分类回归树模型 adabag...包C5.0函数,基于C5.0算法的决策树 e1071包naiveBayes函数,贝叶斯分类器算法 klaR包NaiveBayes函数,贝叶斯分类器算分 MASS包lda函数,线性判别分析;qda函数,次判别分析...统计及预处理: 常用的包 Base R, nlme aov, anova 方差分析 density 密度分析 t.test, prop.test, anova, aov:假设检验 rootSolve非线性求根...数据预处理大杀器 最后剩下常用的就是读入和写出了: RODBC 连接ODBC数据库接口 jsonlite 读写json文件 yaml 读写yaml文件 rmakdown写文档 knitr自动文档生成 一般业务中使用比较多的就是上面这些了

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非线性回归nls探索分析河流阶段性流量数据和评级曲线、流量预测可视化

我们使用非线性最小回归最小化评级曲线参数的残差平方和 (SSE)。残差 SSE 计算如下: 其中:X 是测量值,Y 是预测值。...为了减少局部最小值收敛的可能性, R 提供了在许多不同的起始值上迭代非线性最小优化的功能(Padfield 和 Matheson)....有了可用的短期流量记录,可以使用排水面积比方法评估各种流量仪表的性能。此外,可以使用非线性最小乘法开发 ϕ 的局部值。...一旦确定了评级曲线周期和适当的公式,公式的评级曲线参数 (1)") 和 (2)") 通过非线性最小估计回归使用 R (Padfield )。...本文摘选《R语言非线性回归nls探索分析河流阶段性流量数据和评级曲线、流量预测可视化》

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8种用Python实现线性回归的方法,究竟哪个方法最高效?

方法Stats.linregress( ) 这是一个高度专业化的线性回归函数,可以在SciPy的统计模块中找到。然而因为它仅被用来优化计算两组测量数据的最小回归,所以其灵活性相当受限。...不言而喻,它也适用于多元回归,并返回最小度量最小的函数参数数组以及协方差矩阵。 方法四:numpy.linalg.lstsq 这是通过矩阵分解计算线性方程组的最小解的基本方法。...对于线性回归,可以使用该包的OLS或一般最小函数来获得估计过程的完整的统计信息。 一个需要牢记的小技巧是,必须手动给数据x添加一个常数来计算截距,否则默认情况下只会得到系数。...方法六和七:使用矩阵的逆求解析解 对于条件良好的线性回归问题(其中,至少满足数据点个数>特征数量),系数求解等价于存在一个简单的闭式矩阵解,使得最小最小化。...当然,对于现实世界的问题,它可能被交叉验证和正则化的算法Lasso回归和Ridge回归所取代,而不被过多使用,但是这些高级函数的核心正是这个模型本身。

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【R语言进行数据挖掘】回归分析

然后使用lm()函数建立一个线性回归模型,其中年份和季度为预测因素,CPI为预测目标。...使用函数glm()并设置响应变量(被解释变量)服从项分布(family='binomial,'link='logit')建立Logistic回归模型,更多关于Logistic回归模型的内容可以通过以下链接查阅...- Logit Regression · 《LogisticRegression (with R)》 3、广义线性模型 广义线性模型(generalizedlinear model, GLM)是简单最小回归...4、非线性回归 如果说线性模型是拟合拟合一条最靠近数据点的直线,那么非线性模型就是通过数据拟合一条曲线。在R可以使用函数nls()建立一个非线性回归模型,具体的使用方法可以通过输入'?...nls()'查看该函数的文档。

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Python环境下的8种简单线性回归算法

本文所示,在线性回归模型,「线性」一词指的是回归系数,而不是特征的 degree。...方法 2:stats.linregress( ) 这是 Scipy 的统计模块的一个高度专门化的线性回归函数。其灵活性相当受限,因为它只对计算两组测量值的最小回归进行优化。...通过进行最小极小化,这个来自 scipy.optimize 模块的强大函数可以通过最小乘方法将用户定义的任何函数拟合到数据集上。...对于简单的线性回归任务,我们可以写一个线性函数:mx+c,我们将它称为估计器。它也适用于多变量回归。它会返回一个由函数参数组成的数列,这些参数是使最小最小化的参数,以及相关协方差矩阵的参数。...、特征),回归系数的计算存在一个封闭型的矩阵解(它保证了最小最小化)。

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Python环境下的8种简单线性回归算法

这是一个非常一般的最小多项式拟合函数,它适用于任何 degree 的数据集与多项式函数(具体由用户来指定),其返回值是一个(最小化方差)回归系数的数组。...方法 2:stats.linregress( ) ? 这是 Scipy 的统计模块的一个高度专门化的线性回归函数。其灵活性相当受限,因为它只对计算两组测量值的最小回归进行优化。...通过进行最小极小化,这个来自 scipy.optimize 模块的强大函数可以通过最小乘方法将用户定义的任何函数拟合到数据集上。...这是用矩阵因式分解来计算线性方程组的最小解的根本方法。它来自 numpy 包的线性代数模块。...(至少是对于数据点、特征),回归系数的计算存在一个封闭型的矩阵解(它保证了最小最小化)。

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Python环境下的8种简单线性回归算法

这是一个非常一般的最小多项式拟合函数,它适用于任何 degree 的数据集与多项式函数(具体由用户来指定),其返回值是一个(最小化方差)回归系数的数组。...方法 2:stats.linregress( ) ? 这是 Scipy 的统计模块的一个高度专门化的线性回归函数。其灵活性相当受限,因为它只对计算两组测量值的最小回归进行优化。...通过进行最小极小化,这个来自 scipy.optimize 模块的强大函数可以通过最小乘方法将用户定义的任何函数拟合到数据集上。...这是用矩阵因式分解来计算线性方程组的最小解的根本方法。它来自 numpy 包的线性代数模块。...(至少是对于数据点、特征),回归系数的计算存在一个封闭型的矩阵解(它保证了最小最小化)。

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Python环境下的8种简单线性回归算法

这是一个非常一般的最小多项式拟合函数,它适用于任何 degree 的数据集与多项式函数(具体由用户来指定),其返回值是一个(最小化方差)回归系数的数组。...方法 2:stats.linregress( ) ? 这是 Scipy 的统计模块的一个高度专门化的线性回归函数。其灵活性相当受限,因为它只对计算两组测量值的最小回归进行优化。...通过进行最小极小化,这个来自 scipy.optimize 模块的强大函数可以通过最小乘方法将用户定义的任何函数拟合到数据集上。...这是用矩阵因式分解来计算线性方程组的最小解的根本方法。它来自 numpy 包的线性代数模块。...(至少是对于数据点、特征),回归系数的计算存在一个封闭型的矩阵解(它保证了最小最小化)。

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使用Python进行统计建模

前言 大家好,在之前的文章我们已经讲解了很多Python数据处理的方法比如读取数据、缺失值处理、数据降维等,也介绍了一些数据可视化的方法Matplotlib、pyecharts等,那么在掌握了这些基础技能之后...主要有以下功能: 探索性分析:包含列联表、链式方程多重插补等探索性数据分析方法以及与统计模型结果的可视化图表,例如拟合图、箱线图、相关图、时间序列图等 回归模型:线性回归模型、非线性回归模型、广义线性模型...:普通最小估计 线性模型有普通最小(OLS)广义最小(GLS)、加权最小(WLS)等,Statsmodels对线性模型有较好的支持,来看个最简单的例子:普通最小(OLS) 首先导入相关包...回归系数值、P-value、R-squared等评估回归模型的参数值全部都有,还可以使用dir(results)获得全部变量的值并调取出来 print('Parameters: ', results.params...pandas as pd import statsmodels.formula.api as smf import statsmodels.stats.api as sms import matplotlib.pyplot

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R语言非线性方程数值分析生物降解、植物生长数据:多项式、渐近回归、米氏方程、逻辑曲线、Gompertz、Weibull曲线

非线性回归的一个问题是它以迭代方式工作:我们需要提供模型参数的初始猜测值,算法逐步调整这些值,直到(有希望)收敛到近似最小解。根据我的经验,提供初始猜测可能会很麻烦。...它们简单,并且虽然是曲线状的,但它们在参数上是线性的,并且可以通过使用线性回归来拟合。一个缺点是它们不能描述渐近过程,而这在生物学中非常常见。...在最大值/最小值处,响应为: R 的多项式拟合 在 R ,可以使用线性模型函数 'lm()' 进行多项式拟合。...虽然这不是高效的方法,但在某些情况下,我发现自己需要使用 'nls()' 或 'drm()' 函数进行多项式拟合。 凹/凸曲线 让我们进入非线性领域。...事实上,我们可以看出它的一阶导数是: R D(exesion(a - (a - b) * exp (- c * X)), "X") 即: 我们可以看到生长的相对速率并不是常数(指数模型),而是在

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回归分析详解及matlab实现

8.3 非线性回归分析 8.3.1 非线性最小拟合 线性最小拟合与线性回归中的“线性”并非指与的关系,而是指是系数或的线性函数。...拟合的函数仍然是最小拟合;如果拟合的曲线,对是非线性的,但取对数后对系数是线性的,属于可化为线性回归的类型。下面讨论非线性拟合的情形。...非线性最小拟合问题的提法是:已知模型 , 其中对是非线性的,为了估计参数,收集n个独立观测数据 。记拟合误差,求使误差的平方和 最小。...作为无约束非线性规划的特例,解非线性最小拟合可用MATLAB优化工具箱命令lsqnonlin和lsqcurvefit。...8.3.2 非线性回归模型 非线性回归模型记作 其中对回归系数是非线性的,。求得回归系数的最小估计。

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R中进行nls模型分析

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍如何使用R进行nls分析使用内置的mtcars数据集,整个过程仅参考。希望对各位观众老爷能有所帮助。...一些点位于趋势线之上,而另一些点位于趋势线之下,这表明还有其他因素可能影响 mpg,或wt与mpg之间可能存在非线性关系。...❞ 「nls(非线性最小乘法)拟合指数模型」 使用nls来拟合非线性模型前需要先确定初始值,可通过将非线性模型线性化来估计参数的初始值。...通过对 mpg 取对数并对 wt 进行线性回归,可以将非线性的指数关系转换为线性关系,这样更容易分析和获取初始值。线性模型的斜率和截距转换回指数模型的参数。...(nls_model) # 使用nls函数拟合模型,增加了对迭代次数的控制,设置最大迭代次数为200 nlsFit <- nls(formula = mpg ~ k * exp(b * wt),

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R语言机器学习实战之多项式回归

在简单的线性回归中,使用模型 其中ε是未观察到的随机误差,其以标量 x 为条件,均值为零。在该模型,对于 x 值的每个单位增加,y 的条件期望增加 β1β1个单位。...因此,对于最小分析,多项式回归的计算和推理问题可以使用多元回归技术完全解决,这是通过将 xx、x2x2 等视为多元回归模型的独特自变量来完成的。  ...这可能导致像这样的情况,其中总成本不再是数量的线性函数: 通过多项式回归,我们可以将n阶模型拟合到数据上,并尝试对非线性关系进行建模。 如何拟合多项式回归 这是我们模拟观测数据的图。...---- 参考文献 1.R语言多元Logistic逻辑回归 应用案例 2.面板平滑转移回归(PSTR)分析案例实现 3.matlab的偏最小回归(PLSR)和主成分回归(PCR) 4.R语言泊松...逻辑回归 8.python用线性回归预测股票价格 9.R语言如何在生存分析与Cox回归中计算IDI,NRI指标

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【视频】什么是非线性模型与R语言多项式回归、局部平滑样条、 广义相加GAM分析工资数据|数据分享|附代码数据

这个模型在要估计的参数是线性的,对吧? 因此,这种多项式回归被认为是传统多元线性回归的一个特例。因此,您可以使用与线性回归相同的机制来解决此类问题。因此,多项式回归模型可以使用最小模型进行拟合。...最小乘法是一种通过最小化给定数据集中观察到的因变量与线性函数预测的因变量之间差异的平方和来估计线性回归模型未知参数的方法。 什么是非线性回归?...随着我们增加 多项式的项,多项式回归使我们能够生成非线性的曲线,同时仍使用最小乘法估计系数。 ---- 逐步回归 它经常用于生物统计学和流行病学。...广义加性模型 GAM模型提供了一个通用框架,可通过允许每个变量的非线性函数扩展线性模型,同时保持可加性。 具有平滑样条的GAM并不是那么简单,因为不能使用最小。...点击标题查阅往期内容 MATLAB最小乘法:线性最小、加权线性最小、稳健最小非线性最小与剔除异常值效果比较 数据分享|R语言广义线性模型GLM:线性最小、对数变换、泊松、项式逻辑回归分析冰淇淋销售时间序列数据和模拟

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MATLAB偏最小回归(PLSR)和主成分回归(PCR)分析光谱数据|附代码数据

此示例显示如何在matlab应用偏最小回归(PLSR)和主成分回归(PCR),并讨论这两种方法的有效性当存在大量预测变量时,PLSR和PCR都是对因变量建模的方法,并且这些预测变量高度相关或甚至共线性...点击标题查阅往期内容R语言实现偏最小回归法 partial least squares (PLS)回归Matlab的偏最小乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择R语言实现偏最小回归法...回归分析Python用PyMC3实现贝叶斯线性回归模型使用R语言进行多项式回归非线性回归模型曲线拟合R语言中的偏最小回归PLS-DAR语言生态学建模:增强回归树(BRT)预测短鳍鳗生存分布和影响因素...R语言实现偏最小回归法 partial least squares (PLS)回归Matlab的偏最小乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择偏最小回归(PLSR)和主成分回归(PCR)...R语言实现偏最小回归法 partial least squares (PLS)回归Matlab的偏最小乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择偏最小回归(PLSR)和主成分回归(PCR)

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非线性混合效应 NLME模型对抗哮喘药物茶碱动力学研究|附代码数据

让我们计算定义为 ψ 的最小估计 我们首先需要实现PK模型: pk.od <- function(pi, t){   D  <- 320   ka    V     ke    f  <- D*a.../V/(a-k)*(exp(-e*t)-exp(-k*t)) 然后我们可以使用该 nls 函数将此(非线性)模型拟合到数据 nls(neatin ~p.me1(psi, time)) coef(km1...在该模型,ψ 的最小估计定义为 让我们将该nls 函数与来自 12 个受试者的合并数据一起使用 。  ...在该模型,ψi 的最小估计定义为 for (i in (1:N)) {   pkmi <- nls(cocetatn ~ pk.mdl1(psi, time)   pred <- c(prd, ...备注: 由于 f 是 ψi的非线性函数,因此没有 ψ^i的解析表达式。然后应使用牛顿算法来执行此最小化问题。

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R语言实现非标ELISA数据的量化

我们今天给大家介绍一个4 参数的反曲模型如何在R语言中实现,首先看下这个模型的公式: [rcxmsl6clv.jpeg] 其中,f(x)是反应每个x稀释度的吸光系数;a是最大吸光度,d是最小吸光度;b是在...:模型不同的项用+分隔。 :-表示从模型移除某一项,y~x-1表示从模型移除常数项 ::冒号在formula中表示交互项,也就是说两项之间存在相互作用共同决定因果关系。...当然也可以加入运算符号:对某一变量取对数,可以直接写log(y)~log(x),这一表达式的含义就是估计log(y)=a*log(x)+b。如果是加减乘除需要通过I()来添加。...Algorithm 只有LM算法,L-M方法全称Levenberg-Marquardt方法,是非线性回归回归参数最小估计的一种估计方法。 Weights 一个向量来描述LM的加权参数。...: [9eqh7l3m1w.jpeg] [tqer66c3pb.jpeg] 至此我们模型构建完成,后面的扩展以及学术应用就看自己真实数据的使用了。

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最小回归(PLSR)和主成分回归(PCR)分析光谱数据|附代码数据

p=2655此示例显示如何在matlab应用偏最小回归(PLSR)和主成分回归(PCR),并讨论这两种方法的有效性(点击文末“阅读原文”获取完整代码数据)。...点击标题查阅往期内容R语言实现偏最小回归法 partial least squares (PLS)回归Matlab的偏最小乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择R语言实现偏最小回归法...回归分析Python用PyMC3实现贝叶斯线性回归模型使用R语言进行多项式回归非线性回归模型曲线拟合R语言中的偏最小回归PLS-DAR语言生态学建模:增强回归树(BRT)预测短鳍鳗生存分布和影响因素...R语言实现偏最小回归法 partial least squares (PLS)回归Matlab的偏最小乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择偏最小回归(PLSR)和主成分回归(PCR)...R语言实现偏最小回归法 partial least squares (PLS)回归Matlab的偏最小乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择偏最小回归(PLSR)和主成分回归(PCR)

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