前面我也给大家简单介绍过 ☞R计算mRNA和lncRNA之间的相关性+散点图 ☞R语言绘图:复杂散点图绘制 相信大家在读paper的时候也见到过下面这种类型的图 这张图在传统的相关性散点图的基础上还多了一个直方图...install.packages("psych") #加载psych包 library(psych) #使用psych包自带的数据集sat.act #查看前6行 head(sat.act) 首先我们用默认参数来画图看看效果...#绘制SATV和SATQ之间的相关性散点图和直方图 with(sat.act,scatter.hist(SATV,SATQ)) 这个是默认参数画出来的图,问题还是比较多的。...2)散点图上有两个椭圆,还有一条平滑曲线 3)没有拟合直线 4)主标题想修改一下 接下俩我们就来通过调节参数来解决这几个问题 scatter.hist(sat.act[5:6],...☞R语言绘图:复杂散点图绘制
>lines(lowess(wt,mpg),col="blue",lwd=2,lty=2)#添加一条平滑曲线 ?...相关性最高的变量对是车重与排量,以及每加仑英里数与车重(标了红色,并且离主对角线最近) 11.1.2 高密度散点图 当数据点重叠很严重时,用散点图来观察变量关系就显得“力不从心”了。...smoothScatter()函数可利用核密度估计生成用颜色密度来表示点分布的散点图,利用光平滑密度估计绘制的散点图。...Scatterplot3d(x,y,z) x被绘制在水平轴上,y被绘制在竖直轴上,z被绘制在透视轴上。...旋转三维散点图 用rgl包中的plot3d()函数创建可交互的三维散点图。你能通过鼠标对图形进 行旋转。函数格式为:plot3d(x,y,z) 其中x、y和z是数值型向量,代表着各个点。
对比Excel与Pyhton,手把手教你绘制高大上的棒棒糖图。 ---- Excel绘制棒棒糖图 首先是数据准备,首先将原始数据复制一列,得到两列一样的数据。...Python绘制棒棒糖图 Bar+Scatter组合法 第一种方法,和Excel思路一样,运用条形图(plt.bar)和散点图(plt.scatter)组合绘制。...将所有y值加上一个固定值v(负数):y = y+v 并且设置y轴的下限为该固定值v :plt.ylim(v, 0.6) 绘制一条横线 通过绘制折线的方法绘制一条基线,并固定 y=0 plt.plot(values.index..., [0]*n) 或直接用直线函数绘制基线,同样设置 y=0 plt.axhline(y=0, xmin=0, xmax=1) 上面两种方法均可以绘制直线图,第二种方法的缺点是在设置直线两个端点时,不太好把控...,如'r-',代表红色的实线。
不管是用Excel,还是R语言的base系统、ggplot系统,做出来的图也都是大同小异。有没有什么图形可以标新立异,用一种完全不同的模式来表达跟柱状图一样的意思的?...今天,我们来看一个不一样的图形,散点图中的“异类“:滑珠图。可能很多人没听过“滑珠图”这样一个概念,我们先来看看图形: ? 上面这个就是滑珠图,一眼看上去,你可能会认为是一个散点图。...可不是么,满屏都是点,不过,细看之下,你会发现在点的旁边都有一条直线,这个直线的长短其实跟我们的柱状图是一个意思,线条越长,代表数值越高。图中的点就像是在线条上滑动的一样,所以称之为“滑珠图”。...但是这样的图形跟我们刚才看到的不太一样,没有直线,所以不能说是完整的滑珠图。 初级调整 怎么绘制真正意义上的滑珠图?很简单,只要添加一个参数就可以了。 ? ?...那么,如何绘制水平的滑珠图呢?绘制水平的滑珠图其实也很简单,也是只要添加一个参数即可。 ? ? 高级调整 上面的图基本上能够满足我们的要求了,但是这么多次教程下来,大家也都知道我们可是力求完美的。
在python中画散点图主要是用matplotlib模块中的scatter函数,先来看一下scatter函数的基本信息。...网址为:点击打开链接 可以看到scatter中有很多参数,经常使用的参数主要有以下几个: c: marker: 数据、代码和绘制的图如下。...数据(取第一列作为x,取第四列作为y)截图: 代码如下: import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np # 定义画散点图的函数 def...') # 画直线图 ax1.plot(x2, y2, c='b', ls='--') # 调整横坐标的上下界 plt.xlim(xmax=5, xmin=0) # 显示 plt.show()...# 主模块 if __name__ == "__main__": # 运行 draw_scatter(n=2000, s=20) 绘制的图如下: 发布者:全栈程序员栈长,转载请注明出处:
相关性 在本节中,我们将开发一种度量,度量散点图紧密聚集在一条直线上的程度。 形式上,这被称为测量线性关联。 hybrid表包含了 1997 年到 2013 年在美国销售的混合动力车的数据。...事实上,我们可以将所有的变量绘制成标准单位,并且绘图看起来是一样的。 这给了我们一个方法,来比较两个散点图中的线性程度。...在图形上,它测量散点图聚集在一条直线上的程度。 相关系数这个术语不容易表述,所以它通常缩写为相关性并用r表示。 以下是一些关于r的数学事实,我们将通过模拟观察。 相关系数r是介于-1和1之间的数字。...r度量了散点图围绕一条直线聚集的程度。 如果散点图是完美的向上倾斜的直线,r = 1,如果散点图是完美的向下倾斜的直线,r = -1。...事实上,它似乎有一点非线性成分。 但是,如果我们坚持用一条直线来做出预测,那么所有直线之中仍然有一条最好的直线。
: 3.2.2 定量分析(直方图、累积曲线) 直方图类似于柱状图,是用柱的高度来指代频数,不同的是其将定量数据划分为若干连续的区间,在这些连续的区间上绘制柱。...当自变量与因变量线性相关时,在散点图中,点近似分布在一条直线上。我们以身高作为自变量,体重作为因变量,讨论身高对体重的影响。...使用Matplotlib绘制散点图的代码如下: from matplotlib import pyplot #绘制散点图 def drawScatter(heights, weights):...Q1所指的蓝框下侧为下四分位数,Q3所指的蓝框上侧为上四分位数,Q3-Q1为四分为差。...上界线和下界线是距离中位数1.5倍四分位差的线,高于上界线或者低于下界线的数据为异常值。
3.2.2 定量分析(直方图、累积曲线) 直方图类似于柱状图,是用柱的高度来指代频数,不同的是其将定量数据划分为若干连续的区间,在这些连续的区间上绘制柱。...3.3 关系分析(散点图) 在散点图中,分别以自变量和因变量作为横纵坐标。当自变量与因变量线性相关时,在散点图中,点近似分布在一条直线上。...使用Matplotlib绘制散点图的代码如下: from matplotlib import pyplot #绘制散点图 def drawScatter(heights, weights):...,包含3种信息: Q2所指的红线为中位数 Q1所指的蓝框下侧为下四分位数,Q3所指的蓝框上侧为上四分位数,Q3-Q1为四分为差。...上界线和下界线是距离中位数1.5倍四分位差的线,高于上界线或者低于下界线的数据为异常值。 ?
hexpins是解决重叠点散点图的一个很好的替代方案。每个点不是在hexbin图中单独绘制的。...在下面的代码中,我们用相同的数据集在“Horsepower” 和“Acceleration”之间绘制一个hexbin。...那些在媒体上跟踪我的人可能已经注意到我经常使用它。在下面的代码中,我们将计算seaborn“mpg”数据集中所有变量之间的成对相关性,并将其绘制为热力图。...当我们延迟绘制一个非随机数据序列时,如下面的代码所示,我们得到了一条平滑的线条。...绘制高维数据集的平行坐标非常有用。每个尺寸用一条垂直线表示。 在平行坐标系中,“N”等距垂直线表示数据集的“N”维度。顶点在第n个轴上的位置对应于该点的第n个坐标。
我们知道如何找到穿过散点图的最佳直线来绘制。在所有直线中它的估计的均方误差最小,从这个角度来看,这条线是最好的。 但是,如果我们的数据是更大总体的样本呢?...一如既往,推断思维起始于仔细检查数据的假设。一组假设被称为模型。大致线性的散点图中的一组随机性的假设称为回归模型。...散点图通过将线上的点垂直移动,或上或下来创建,如下所示: 对于每个x,找到真实直线上的相应点(即信号),然后生成噪声或误差。 误差从误差总体中带放回随机抽取,总体是均值为 0 的正态分布。...估计真实斜率 我们可以多次自举散点图,并绘制穿过每个自举图的回归线。 每条线都有一个斜率。 我们可以简单收集所有的斜率并绘制经验直方图。...一个简单的方法就是,按照我们在本节所做的操作,即绘制两个变量的散点图,看看它看起来是否大致线性,并均匀分布在一条线上。 我们还应该使用残差图,执行我们在前一节中开发的诊断。
如果我们使用线性回归分析其实有些前提要考虑: 1) 自变量与因变量的关系,是否是呈直线,是否是一个变量依存于另个变量的变化程度,如刚才所言,变量之间的地位是不平等的。...其实实际应用中,这些理论的条框我们有时候搞不懂,那么我们可以通过其他办法来看,这就是通过散点图就能把以上条框搞定。 是否呈现直线关系,通过散点图就能看出来,如下图所示,大致呈现直线关系。...对于正态分布可以考察残差的正态概率图,如果正态概率图呈现一条直线表示符合正态分布,当然了也可以通过正态性检验方法来检验一下是否符合正态分布。...我们选取一个月的数据,作为分析数据,首先我们来绘制散点图(这里不具体讲解散点图绘制方法) DAU与PCU 我们绘制散点图,并选择线性趋势线,得到如下的散点图: 之后我们通过回归分析工具进行回归分析结果的汇总来具体解析一下...如下为残差图,基本上是零散的分布。基本上可以说残差独立分布,方程参数估计有效。
如果我们使用线性回归分析其实有些前提要考虑: 1) 自变量与因变量的关系,是否是呈直线,是否是一个变量依存于另个变量的变化程度,如刚才所言,变量之间的地位是不平等的。...其实实际应用中,这些理论的条框我们有时候搞不懂,那么我们可以通过其他办法来看,这就是通过散点图就能把以上条框搞定。 是否呈现直线关系,通过散点图就能看出来,如下图所示,大致呈现直线关系。 ?...对于正态分布可以考察残差的正态概率图,如果正态概率图呈现一条直线表示符合正态分布,当然了也可以通过正态性检验方法来检验一下是否符合正态分布。...我们选取一个月的数据,作为分析数据,首先我们来绘制散点图(这里不具体讲解散点图绘制方法) DAU与PCU 我们绘制散点图,并选择线性趋势线,得到如下的散点图: ?...如下为残差图,基本上是零散的分布。基本上可以说残差独立分布,方程参数估计有效。 ? 此外关于正态分布,可以参考以下的正态概率图来分析: ?
用二维数据描述事物是容易的。正常地,一个有x轴y轴的散点图就是二维的。用三维数据描述事物有一点挑战性但不是不可能的。例如,在matplotlib中可以绘制三维图。...将上述步骤放在一起,以下是生成可视化的完整代码: 如果我们在不同的数据集(例如 MINST 手写数字)上应用相同的方法,散点图将不会显示出明显的边界,因此需要更复杂的模型(例如神经网络)进行分类:...如果我们再次重复相同的过程,这些数据点将进一步散落: 这张图里看起来像一条直线,但实际上不是。...如果我们再重复一遍,所有点会散落成一条直线: 这些点都落在一条直线上,因为我们从数据中删除了三个主成分,而这些数据只有四个特征。因此,我们的数据矩阵变为秩为1的矩阵。...如果我们去掉前两个主分量,剩余的方差只有2.2%,因此在视觉上,去掉两个分量后的图看起来像一条直线。
与直接用plotly.express拟合普通最小二乘回归不同,这是通过散点图和拟合线组合的方式绘制图形,这会更加灵活,除了添加普通线性回归拟合曲线,还可以组合其他线性回归曲线,即将拟合结果很好地可视化出来...即用一条直线或者更复杂的曲线,将两个属性定义的平面分成区域,每个区域包含一个类的大部分对象,则可能基于这对指定的属性构造精确的分类器,如用于二分类的逻辑回归。...多元线性回归可视化 本节介绍用plotly可视化多元线性回归(MLR)的系数。 用一个或两个变量可视化回归是很简单的,因为可以分别用散点图和3D散点图来绘制它们。...单个函数调用来绘制每个图形 第一个图显示了如何在单个分割(使用facet分组)上可视化每个模型参数的分数。 每个大块代表不同数据分割下,不同网格参数的R方和。...此处主要是将模型的预测概率、模型效果可视化,如假正率真正率曲线图、绘制ROC曲线图等。
QQ图是一种散点图,对应于正态分布的QQ图,就是由标准正态分布的分位数为横坐标,样本值为纵坐标的散点图(其他版本[2],有将 (x-m)/std 作为纵坐标,那么正态分布得到的散点图是直线:y=x)。...要利用QQ图鉴别样本数据是否近似于正态分布,只需看QQ图上的点是否近似地在一条直线附近,图形是直线说明是正态分布,而且该直线的斜率为标准差,截距为均值,用QQ图还可获得样本偏度和峰度的粗略信息。...设标准正态分布的概率密度函数为 y= f(n),既然这些值一一对应,则有: (x-m)/std=n 即:x=n*std+m 这是一条斜率为样本标准差,截距为m的直线,就是在q-q图中代表着正态分布的直线...(如下图中左上角的图表所示); 标准正态分布(平均值为 0 标准方差为 1 的高斯分布,如下图的中右上角的图表所示)的绘制过程与此相同; 生成这两个累积分布图后,对与指定分位数相对应的数据值进行配对并绘制在...设置接收空间判别分布 参考:[2] ---- 参考文章: [1] 正态QQ图的原理 [2] QQ图法检验正态分布 [3] 正态 QQ 图和普通 QQ 图 [4] 关于统计学中q-q图为什么正态分布是一条直线
这是一种交互式笔记本,在浏览器上运行代码,能直接显示运行结果和图表,详情可见jupyter notebook介绍。 哪些图表可以用matplotlib绘制呢?...柱状图、点线图、直方图、饼图、堆积柱状图、填充直方图、直方散点图、面积图、趋势图、箱型图、小提琴图、数据地图、雷达图、漏斗图、嵌套饼图、各类三维图等等,不胜枚举。...1、打开jupyter notebook,新建python3笔记本,以下界面: 2、导入pyplot模块,使用magic图像函数用来在notebook中显示图表 import matplotlib.pyplot...plot() : 根据给的x和y值绘制直线或标记图 figure() : 创建一个新的图表 legend() : 在图表上放置图例 xlabel() : 设置x轴标签 ylabel() : 设置y轴标签
散点图 1. 简单散点图 在R中有很多方式去绘制散点图,其中最基本的就是是用plot(x, y)函数,往期内容已经进行过详细讲解,这里就不赘述了,下面直接看实例图。...从图中我们可以看出lm()得到的是一条直线,而lowess()得到的则是一条平滑曲线。...R包“car”里提供的scatterplot()是一个高效绘制散点图的函数,它可以用来添加拟合线、绘制边际箱线图等等。...函数pairs()是一个绘制散点图矩阵的基本函数,它的第一个参数就是绘图公式,~mpg+disp+drat+wt表示mpg、disp、drat和wt两两配对绘制散点图,考虑到横纵坐标可以互调,所以共有4...另外感兴趣的小伙伴可以使用“rgl“包里的plot3D(x, y, z)函数来绘制具有交互作用的3D散点图,但这种图在学术上使用并不多。
散点图矩阵 1.1 paris()函数 基础函数paris()函数用于创建散点图矩阵,panel.cor()函数是自定义的面板函数(panel function),用于在矩阵的上三角显示相关度;下三角使用系统预定义的平滑函数...,实际上,该函数是pairs()的封装器,用于产生增强的散点图矩阵,spm是该函数的别名。...reg.line # 默认值是lm,用于制定绘制回归直线的函数 ellipse # 在非对角线绘制数据密度椭圆 groups # 对数据分组 by.groups # 如果设置为TRUE,那么回归直线按照分组来拟合...高密度散点图 2.1 smoothScatter()函数 基础包中的smoothScatter()函数,可以利用核密度估计生成用颜色密度来表示点密度的散点图。...例如,使用hexbin()来绘制高密度散点图,六边形的颜色深度表示散点的密度。
y: y轴上的数据点。...type: 图形类型(默认为 "p"),其中 "p" 表示点(散点图),"l" 表示线(折线图),"b" 表示点和线都有,"h" 表示直方图风格的垂直线,"n" 表示不绘制任何点或线。...: 其他图形参数,如 col(颜色),pch(点的形状),lty(线的类型)等。...# 绘制基础图形plot(x, y, type="b", col="blue")# 在同一个图形上添加额外的点points(x, y/2, col="red", pch=2)# 添加一条垂直线abline...二.设置字体大小设置成11啦三.R语言基本操作1.用Rproject管理工作目录(真的学到了很多)2.dir()=linux里的ls 查看工作目录下的文件3.加减乘除4.赋值 alt+-要用习惯哟~5.
二元散点图和一元直方图 用 sns.jointplot 可以同时看到两个变量的联合分布与单变量的独立分布。...分类散点图 按照不同类别对样本数据进行分布散点图绘制。..., # 也可以设置间距如,jitter = 0.1 edgecolor="gray") # 可以通过hue参数对散点图中的数值进行分类 ?...意思是用一条直线或者更复杂的曲线,将两个属性定义的平面分成区域,每个区域包含一个类的大部分对象,则可能基于这对指定的属性构造精确的分类器。...平行坐标 平行坐标[4]是一种用于绘制多元数据的绘制技术 。平行坐标允许人们查看数据中的聚类,并直观地估计其他统计信息。使用平行坐标点表示为连接的线段。每条垂直线代表一个属性。
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