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R沟通|Rmarkdown教程(3)

默认情况下代码和结果会在输出文件呈现。如果通过参数来控制代码块运行结果输出情况可以在{r }设置。一般包括代码及运行结果输出、图片表格格式定义等。...```{r echo=FALSE} print(1:5) ``` 结果: ## [1] 1 2 3 4 5 collapse选项 一个代码块代码、输出通常被分解多个原样文本块, 如果一个代码块希望所有的代码...out.width和out.height选项指定在输出实际显示宽和高,如果使用"90%"这样百分数单位则可以自动适应输出大小。...pander包pander函数 其pander()函数可以将多种R输出格式转换成knitr需要表格形式。 pander::pander(lmr) ?...注意:上面例子knitr:: kable制定了kable函数来自knitr包,目的是方式和其他包内同名函数冲突。 另一种写法,如果想使用管道函数,需要加载kableExtra

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1.5w字Rmarkdown入门教程汇总

默认情况下代码和结果会在输出文件呈现。如果通过参数来控制代码块运行结果输出情况可以在{r }设置。一般包括代码及运行结果输出、图片表格格式定义等。...```{r echo=FALSE} print(1:5) ``` 结果: ## [1] 1 2 3 4 5 collapse选项一个代码块代码、输出通常被分解多个原样文本块, 如果一个代码块希望所有的代码...out.width和out.height选项指定在输出实际显示宽和高,如果使用"90%"这样百分数单位则可以自动适应输出大小。...注意:上面例子knitr:: kable制定了kable函数来自knitr包,目的是方式和其他包内同名函数冲突。 另一种写法,如果想使用管道函数,需要加载kableExtra。...通过块选项 attr.source =“ .numberLines”将行号添加到源代码块,或者通过attr.output =“ .numberLines”将文本输出添加到文本,例如, ```{r,

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1.5w字Rmarkdown入门教程汇总

默认情况下代码和结果会在输出文件呈现。如果通过参数来控制代码块运行结果输出情况可以在{r }设置。一般包括代码及运行结果输出、图片表格格式定义等。...```{r echo=FALSE} print(1:5) ``` 结果: ## [1] 1 2 3 4 5 collapse选项一个代码块代码、输出通常被分解多个原样文本块, 如果一个代码块希望所有的代码...out.width和out.height选项指定在输出实际显示宽和高,如果使用"90%"这样百分数单位则可以自动适应输出大小。...注意:上面例子knitr:: kable制定了kable函数来自knitr包,目的是方式和其他包内同名函数冲突。 另一种写法,如果想使用管道函数,需要加载kableExtra。...通过块选项 attr.source =“ .numberLines”将行号添加到源代码块,或者通过attr.output =“ .numberLines”将文本输出添加到文本,例如, ```{r,

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老板喊你调研文献?推荐你用R包软件①easyPubMed

1-背景&背景资料 新任务还是来自贴心曾大佬。 考虑到有大量研究生即将开学,可能要面对老板批量文献查阅任务,在此适时大家安利PubMed文件检索利器(提高效率,增加摸鱼时间)。...最后拿consciousness和memory作为关键词,限定2023年条件,获取memory.ids,作为后续函数探索起点和这次R包学习主线。...同时搜索摘要和标题中关键词 在以下这个视频中发现 https://www.zhihu.com/zvideo/1411035118174007296?...custom_grep()文章标题抓取 通过3.3步骤,我们已经获得了一批文献信息 在3.4,通过fetch_pubmed_data() custom_grep()函数可以筛选3.3信息。...() %>% kable_styling(bootstrap_options = 'striped') table_articles_byAuth()输出结果: 嗯,这张表,文献一目了然。

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R包安利 ① easyPubMed—PubMed利器

作者、单位、题目、关键词、摘要、发表时间…… 2.1 包里函数 一共12个: articles_to_list , article_to_df , batch_pubmed_download , custom_grep...以这个包作者例,获取TA所有文章,[AU]-author. query <- "Damiano Fantini[AU]" 用 get_pubmed_ids() 得到一个 list 文件,包含后续操作需要信息...txt……作者示例里输出是: ## [1] "easyPM_example01.xml" "easyPM_example02.xml" 3.1.3 从单独 PubMed 记录里提取信息 custom_grep...如果多个作者有相同单位信息,设置参数 autofill “TRUE”. df2 <- article_to_df(PM_list[13], autofill = TRUE) df2$title <...3.1.4 从 XML PubMed 记录自动提取数据 函数 table_articles_byAuth() 可以迅速从多个 XML 记录获得作者信息和文章发表数据,该函数包含5个参数: pubmed_data

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R语言马尔可夫体制转换模型Markov regime switching

估计参数 在本节,我将使用R软件手动(从头开始)和非手动进行统计分解。在前者,我将演示如何构造似然函数,然后使用约束优化问题来估计参数。我将说明如何在不经历解析推导情况下进行复制。...第一步,我使用样本创建初始参数向量\(\ Theta_0 \) 在第二步,我估算制定了约束 请注意,参数初始向量应满足约束条件 all(A%*%theta0 >= B) ## [1] TRUE 最后...如果我们要忽略过程任何体制转换,我们可以简单地将参数\(\ mu \)和\(\ sigma \)估计 kable(mod_est, "html", booktabs = F,escape = F)...因此,我们添加一个true / false向量来指示正在切换参数。在上面的命令,我们允许两个参数都切换。最后,我们可以指定估计过程是否正在使用并行计算进行。...其次,在输出底部,拟合模型报告过渡概率。

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R语言数据分析有意思小例子:Prince歌词挖掘 — 1

2016年4月21日清晨,流行音乐传奇人物、以多才多艺且多产而闻名美国歌手“王子”(Prince)纳尔逊,在明尼苏达州派斯里园宅邸辞世,享年57岁。 以上内容来自百度百科。...US.Pop 和 US.R.B (peak positions for the US Pop and R&B charts)我理解另外两个排行榜上排名 prince...(charted = ifelse(prince$peak %in% 1:100, "Charted", "Uncharted")) 至此数据预处理就完成了,将结果保存到文件...image.png 从上图可以看出,Prince上榜歌曲绝大部分都排到了前10名。一个比较有意思现象是Prince最高产是在90年代,然而歌曲上榜数量最多是在80年代。...3、看一看在排行榜上排到第一名都是哪些歌 library(knitr) install.packages("kableExtra") library(kableExtra) install.packages

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R语言结合新冠疫情COVID-19股票价格预测:ARIMA,KNN和神经网络时间序列分析

library(kableExtra) 显示表格 library(data.table) 大数据快速聚合 library(DT) 以更好方式显示数据 library(tsfknn) 进行KNN回归预测...因此,在显着性水平0.05情况下,我们无法拒绝原假设,而得出结论是残差遵循白噪声。这意味着该模型很好地拟合了数据。 一旦每个数据集确定了模型,就可以预测未来几天股票价格。...为了预测新数据点值,模型使用“特征相似度”,根据新点与训练集上点相似程度值分配新点。 第一项任务是确定我们KNN模型k值。选择k值一般经验法则是取样本数据点数平方根。...: accuracy accuracy ---- 8.所有模型比较 现在,我们使用参数诸如RMSE(均方根误差),MAE(均值绝对误差)和MAPE(均值绝对百分比误差)对所有三个模型进行分析 。...神经网络 14.7 9.8 1.0 因此,从以上模型性能参数总结,我们可以看到神经网络模型在两个数据集上性能均优于ARIMA和KNN模型

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结合新冠疫情COVID-19股票价格预测:ARIMA,KNN和神经网络时间序列分析

library(kableExtra) 显示表格 library(data.table) 大数据快速聚合 library(DT) 以更好方式显示数据 library(tsfknn) 进行KNN回归预测...因此,在显着性水平0.05情况下,我们无法拒绝原假设,而得出结论是残差遵循白噪声。这意味着该模型很好地拟合了数据。 一旦每个数据集确定了模型,就可以预测未来几天股票价格。 6....为了预测新数据点值,模型使用“特征相似度”,根据新点与训练集上点相似程度值分配新点。 第一项任务是确定我们KNN模型k值。选择k值一般经验法则是取样本数据点数平方根。...: accuracy accuracy ---- 8.所有模型比较 现在,我们使用参数诸如RMSE(均方根误差),MAE(均值绝对误差)和MAPE(均值绝对百分比误差)对所有三个模型进行分析 。...神经网络 14.7 9.8 1.0 因此,从以上模型性能参数总结,我们可以看到神经网络模型在两个数据集上性能均优于ARIMA和KNN模型

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【视频】K近邻KNN算法原理与R语言结合新冠疫情对股票价格预测|数据分享|附代码数据

p=24057 最近我们被客户要求撰写关于KNN算法研究报告,包括一些图形和统计输出。...可以计算: 通过计算欧几里得距离,我们得到了最近邻,即 A 类2个最近邻和 B 类3个最近邻。 正如我们所见,3 个最近邻居来自类别B,因此这个新数据点必须属于类别B。...在我们KNN研究之后,我们提出可以将其用于分类和回归问题。为了预测新数据点值,模型使用“特征相似度”,根据新点与训练集上点相似程度值分配新点。 第一项任务是确定我们KNN模型k值。...: accuracy accuracy ---- 8.所有模型比较 现在,我们使用参数诸如RMSE(均方根误差),MAE(均值绝对误差)和MAPE(均值绝对百分比误差)对所有三个模型进行分析 。...因此,从以上模型性能参数总结,我们可以看到神经网络模型在两个数据集上性能均优于ARIMA和KNN模型

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数据分享|用加性多元线性回归、随机森林、弹性网络模型预测鲍鱼年龄和可视化|附代码数据

数据集 背景介绍 这个数据集 ( 查看文末了解数据获取方式 ) 来自一项原始(非机器学习)研究。 从原始数据删除了有缺失值例子(大多数预测值缺失),连续值范围被缩放用于NA(通过除以200)。...如果我们绘制新添加weight.diff变量直方图,我们可以看到,当weight.diff负数时,有一些观察结果。...回想一下,详尽搜索过程表明,当我们所有的预测变量,我们得到最好模型。所以我们决定添加模型交互项和多项式次数 4 所有预测变量。...Length 鲍鱼 Diameter. 以下是 来自加法模型模型系数 变异膨胀因子值。...有趣是,即使存在高度多重共线性,在模型选择过程,我们最终还是选择了具有所有 8 个参数模型。即所有的选择程序都表明当使用模型所有预测变量时,最低 AIC 出现。

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数据分享|用加性多元线性回归、随机森林、弹性网络模型预测鲍鱼年龄和可视化|附代码数据

数据集 背景介绍 这个数据集 ( 查看文末了解数据获取方式 ) 来自一项原始(非机器学习)研究。 从原始数据删除了有缺失值例子(大多数预测值缺失),连续值范围被缩放用于NA(通过除以200)。...如果我们绘制新添加weight.diff变量直方图,我们可以看到,当weight.diff负数时,有一些观察结果。...回想一下,详尽搜索过程表明,当我们所有的预测变量,我们得到最好模型。所以我们决定添加模型交互项和多项式次数 4 所有预测变量。...Length 鲍鱼 Diameter. 以下是 来自加法模型模型系数 变异膨胀因子值。...有趣是,即使存在高度多重共线性,在模型选择过程,我们最终还是选择了具有所有 8 个参数模型。即所有的选择程序都表明当使用模型所有预测变量时,最低 AIC 出现。

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数据分享|用加性多元线性回归、随机森林、弹性网络模型预测鲍鱼年龄和可视化|附代码数据

数据集 背景介绍 这个数据集 ( 查看文末了解数据获取方式 ) 来自一项原始(非机器学习)研究。 从原始数据删除了有缺失值例子(大多数预测值缺失),连续值范围被缩放用于NA(通过除以200)。...如果我们绘制新添加weight.diff变量直方图,我们可以看到,当weight.diff负数时,有一些观察结果。...回想一下,详尽搜索过程表明,当我们所有的预测变量,我们得到最好模型。所以我们决定添加模型交互项和多项式次数 4 所有预测变量。...Length 鲍鱼 Diameter. 以下是 来自加法模型模型系数 变异膨胀因子值。...有趣是,即使存在高度多重共线性,在模型选择过程,我们最终还是选择了具有所有 8 个参数模型。即所有的选择程序都表明当使用模型所有预测变量时,最低 AIC 出现。

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用加性多元线性回归、随机森林、弹性网络模型预测鲍鱼年龄和可视化

数据集 背景介绍 这个数据集来自一项原始(非机器学习)研究。 从原始数据删除了有缺失值例子(大多数预测值缺失),连续值范围被缩放用于NA(通过除以200)。...如果我们绘制新添加weight.diff变量直方图,我们可以看到,当weight.diff负数时,有一些观察结果。...回想一下,详尽搜索过程表明,当我们所有的预测变量,我们得到最好模型。所以我们决定添加模型交互项和多项式次数 4 所有预测变量。...Length 鲍鱼 Diameter. 以下是 来自加法模型模型系数 变异膨胀因子值。...有趣是,即使存在高度多重共线性,在模型选择过程,我们最终还是选择了具有所有 8 个参数模型。即所有的选择程序都表明当使用模型所有预测变量时,最低 AIC 出现。

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【视频】K近邻KNN算法原理与R语言结合新冠疫情对股票价格预测|数据分享|附代码数据

可以计算: 通过计算欧几里得距离,我们得到了最近邻,即 A 类2个最近邻和 B 类3个最近邻。 正如我们所见,3 个最近邻居来自类别B,因此这个新数据点必须属于类别B。...因此,在显着性水平0.05情况下,我们无法拒绝原假设,而得出结论是残差遵循白噪声。这意味着该模型很好地拟合了数据。 一旦每个数据集确定了模型,就可以预测未来几天股票价格。...在我们KNN研究之后,我们提出可以将其用于分类和回归问题。为了预测新数据点值,模型使用“特征相似度”,根据新点与训练集上点相似程度值分配新点。 第一项任务是确定我们KNN模型k值。...: accuracy accuracy ---- 8.所有模型比较 现在,我们使用参数诸如RMSE(均方根误差),MAE(均值绝对误差)和MAPE(均值绝对百分比误差)对所有三个模型进行分析 。...因此,从以上模型性能参数总结,我们可以看到神经网络模型在两个数据集上性能均优于ARIMA和KNN模型

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马尔可夫区制转移模型Markov regime switching

第一步,我使用样本创建初始参数向量Theta_0 在第二步,我估算设置了约束 请注意,参数初始向量应满足约束条件 all(A%*%theta0 >= B) ## \[1\] TRUE 最后,回想一下...如果我们要忽略过程任何区制转换,我们可以简单地将参数 mu 和 sigma 估计 kable(mod_est, "html", booktabs = F,escape = F) %>%...因此,我们添加一个true / false向量来指示正在转移参数。在上面的命令,我们允许两个参数都转移。最后,我们可以指定估计过程是否正在使用并行计算进行。...首先,系数表报告了每个状态均值和波动。模型1平均值1.71,波动率接近1。模型2平均值-2,波动率约为2。显然,该模型针对数据确定了两种具有不同均值和波动率不同状态。...其次,在输出底部,拟合模型报告了转移概率。 有趣是,就每种状态过滤器而言,我们将从包检索到状态与手动提取状态进行比较。根据定义,可以使用图函数 来了解平滑概率以及确定方案。

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R语言随机森林RandomForest、逻辑回归Logisitc预测心脏病数据和可视化分析|附代码数据

dim(dataset) kable(head(dataset)) str(dataset) ##检查变量摘要 summary(dataset) 2.2 数据集单变量图 生成一个数据集所有单变量图...P值如此之低时,可能关联显著性零。...在这里,还有其他一些技术,留一法交叉验证。 3.1 两个Logistic回归模型实例 # 因为下一步cv.glm()不能处理缺失值。 # 我只保留模型完整案例。...还有stats::step()和bestglm::bestglm()函数来自动进行变量选择过程。...3.4 RandomForest模型 到目前为止,我只做了逻辑回归模型。有更多模型可以用来当前问题建模,而RandomForest是一个受欢迎模型

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