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LAScarQS2022——左心房及疤痕定量分割挑战赛

挑战赛提供 200 名受试者,这项挑战的目标是量化或分割来自患有心房颤动的患者的 LGE MRI 的左心房壁的心肌病理(疤痕)。挑战赛提供了在真实临床环境中从患有心房颤动 (AF) 的患者身上采集的 194 (+) 个 LGE MRI。它旨在为各种研究创造一个公开和公平的竞争。AF 是临床实践中观察到的最常见的心律失常,发生率高达 1%,并且随着年龄的增长而迅速上升。使用肺静脉 (PV) 隔离技术的射频导管消融已成为治疗 AF 患者最常用的方法之一。疤痕的位置和范围为 AF 的病理生理学和进展提供了重要信息。晚期钆增强磁共振成像 (LGE MRI) 是一种有前途的技术,可以可视化和量化心房疤痕。许多临床研究主要关注左心房 (LA) 心肌瘢痕形成区域的位置和范围。

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bioRxiv | 破译疾病基因功能的单核跨组织分子参考图谱

本文介绍由麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所的Gokcen Eraslan等人发表于bioRxiv的研究成果:本文作者通过在单细胞水平上使用单核RNA-Seq (snRNA-seq) 技术对来自16个供体的25个样本中的每一个应用四种snRNA-seq方法,生成了209,126个核的跨组织图谱,并将它们与新鲜组织的scRNA-seq进行了基准测试。本文作者使用条件式变换自编码机 (cVAE) 来整合跨组织、个体和实验室方法的图谱。通过该图谱本文作者识别罕见的单基因肌肉疾病的基础细胞类型,对于常见复杂疾病识别了可能构成疾病机制的细胞类型和基因模块。本文描述的实验和分析框架将能够对细胞和分子过程如何在个体和群体之间变化展开大规模研究。

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