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桑基图在单细胞数据探索中的应用

什么是桑基图 桑基图(Sankey diagram),即桑基能量分流图,也叫桑基能量平衡图。它是一种特定类型的流程图,图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小,比较适用于用户流量等数据的可视化分析。...因1898年Matthew Henry Phineas Riall Sankey绘制的“蒸汽机的能源效率图”而闻名,此后便以其名字命名为“桑基图”。 用一个故事来介绍一下桑基图: ?...桑基图怎么看 线条的走向 粗细的变化 节点间的比较 绘制属于自己的桑基图 在单细胞数据分析中有一个关键的步骤FindClusters(分群,以启发样本中可能有的细胞类型数量),但是这个目前用的方法是非监督聚类...而且常常带来参数诅咒:如kmeans的K值不同,得到的分群数量不同;Seurat中FindClusters的不同 resolution 参数也会带来不同的分群数量。...有了这个桑基图的框架,其实很多我们想在这个图上展示的metadata信息就变得容易了,比如我们可以看一下某一细胞类型流向或者样本的流向,只需要在metadata中加上一列即可。

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良心教程 | 如何在Typora中设置免费的图床

如何使用Typora配置免费的gitee图床 「痛点」 ❝一直是使用csdn写博客,因为它的编辑器支持markdown,而且图片直接复制上去生成链接文件,公式也支持得很好。...这几天看到网上有介绍Typora设置免费的图床(gitee),而且图片粘贴上去,直接自动上传到图床生成链接,这样将md文件发给别人,再也不用担心图片无法正常显示的问题了。...❞ 「秀技能」 ❝今天同事发给我一个md文件,一如往昔,图片没有显示出来,我说又到了我安利给你图床的时候了,「免费」,「快速」,「粘贴后自动上传」,这三点不香吗。哈哈,秀了一把。。。...这样,在Typora中书写,在markdown nice中渲染,然后复制到知乎和公众号上,非常流畅,多年的梦想终于实现了。闭环的感觉,别提多爽了,哈哈 ❞ 1....无论是免费的图库,还是将项目放上面,还是将电子书放上面,还是将博客放上面,都非常方便。后面我介绍如何在上面使用bookdown写书。 ❞ 2.

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    UML中类图的介绍与使用

    类图 UML(Unified Modeling Language,统一建模语言)中的类图(Class Diagram)是一种静态结构图,它用于展示系统中的类(class)、接口(interface)、协作...画类图的好处 类图是面向对象设计中的重要工具,它的主要优点包括: 提供系统的视觉表示:类图提供了系统的静态视图,可以清晰地展示系统中的类以及它们之间的关系。...辅助软件开发工具:许多现代的软件开发工具,如IDE,都支持从类图生成代码,或者从代码生成类图。这可以帮助开发人员更快地进行开发,并保持代码和设计的一致性。...在学习设计模式的过程中,一定要自己画类图,这样可以更好地理解设计模式的实现原理,并且在实际开发中能够更好地应用设计模式。 类图三元素 类(Class):类是类图的主要元素,通常用一个矩形表示。...在上面的示例中: A 类与 B 类之间有一个使用关系(uses),表示 A 类使用了 B 类的对象。

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    流量结构分布图——桑基图(Sankey)

    不过针对第一个问题,如果你能很好地理解自己所涉及到的业务数据结构及想要表达和呈现的维度信息,那么关键时刻使用桑基图确实会让你的报告锦上添花。...桑基图用于表达流量分布于结构对比,最初的发明者使用它来呈现能量的流动与分布。 百度百科给了桑基图相对完善的解释: 桑基图(Sankey diagram),即桑基能量分流图,也叫桑基能量平衡图。...本文将着重分享使用R语言中的d3network工具包以及PowerBI可视化工具来制作桑基图的大致过程(Tableau的桑基图还是太繁琐,这里不再展示,感兴趣可以自己探索)。...以上两种方式做出来的动态图表(调用了D3的在线图形库,格式是html格式的,如果你需要将HTML嵌入PPT中使用,那么本公众号早前曾经推送过一篇此类文章,讲解如何在PPT中嵌入HTML对象)。...将html格式动态图表网页嵌入ppt中 PowerBI版讲解: 接下来讲解如何在PowerBI中实现以上桑基图效果,因为改图表并未包含在PowerBI的内置基础图表库中,所以我们需要在他的在线社区中下载该图表的可视化插件

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    Python中lambda的使用,与它的三个好基友介绍!

    这些就是lambda叫做匿名函数的原因。实际上,他常常以一种行内进行函数定义的方式使用,或者用作推迟执行一些代码。...通常来说,lambda起到一种函数的速写作用,允许在使用的代码内嵌一个函数的定义,他完全是可选的(是可以使用def代替他们),但是在你仅需要切入一段可执行代码的情况下,它会带来一个更简洁的书写效果。...eg:需要注意一点,map在python3中是一个可迭代对象,引入需要使用列表调用来使它生成所有的结果用于显示,python2不必如此。...))) >>> [1, 2, 3, 4, 5, 6] filter函数 filter通过字面意思,大家就知道它的用处了,用于数据的过滤操作,它也是lambda的一个好基友,举个栗子。...reduce(lambda x, y: x + y, list_show)) >>> 10 print(reduce(lambda x, y: x * y, list_show)) >>> 24 lambda的实用与它的好基友就介绍到这里

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    手把手教你Plotly绘制桑基图!

    第一次接触桑基图的时候,是使用Pyehcarts(以后会专门介绍这个国产的可视化神器)绘制的,本文将介绍如何使用Plotly来实现这个图形。...一、桑基图简介 ‍‍1.1 什么是桑基图 桑基图(Sankey diagram),即桑基能量分流图,也叫做桑基能量平衡图。它描述的是一组值到另一组值的流向,是一种特定类型的流向图。...在1898年的时候,他就使用这种图形来表示蒸汽机的能源效率, 在土木工程师学会会报纪要的一篇关于蒸汽机能源效率的文章中首次推出了第一个能量流动图,此后便以其名字命名为 Sankey 图,中文音译为桑基图...,图形表示的是拿破仑军队进攻和撤退的军队力量对比: 1.2 桑基图特点 桑基图主要的特点: 起始流量和结束流量是相同的,所有主支宽度和所有分出去的分支宽度总和是相等的,保持能量的守恒 在桑基图的内部,...4.2 自定义节点和边的颜色 通过color_mode和color_link参数能够自定义桑基图的节点和边的颜色: 五、桑基图_月度开销 下面通过小明一个月的总开支消费来讲解如何在实际数据中绘制桑基图

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    如何在Spring中优雅的使用单例模式?

    Java使用构造方法去创建对象可以有三种方式: 使用new关键字 使用Class.getInstance(通过反射调用无参构造方法) 使用Constructor.newInstance(实则也是通过反射的方式调用任何构造方法...) 单例模式私有化了构造方法,所以其他类无法使用通过new的方式去创建对象,在其他类使用该类的实例时,只能通过getInstance去获取。...Spring下使用单例模式 最成功的单例并不是双重检验锁,而是枚举,枚举本身就是一种单例,并且无法使用反射攻击,再一个最优雅的是Spring本身实现的单例: 常用Spring中 @Repository、...,因为@Component+@Bean并不是单例,在调用过程中可能会出现多个Bean实例,导致蜜汁错误。...该组件的生命周期就交由Spring容器管理,声明为单例的组件在Spring容器只会实例化一个Bean,多次请求中复用同一个Bean,Spring会先从缓存的Map中查询是否存在该Bean,如果不存在才会创建对象

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    如何在FME中更好的使用Tester转换器

    Tester转换器 过滤规则: 需处理字段: Name与Address(要素只能有Name或Address中的一个字段) 规则: 不能只有半括号(有全括号的可以):(、)、(、) 不能有特殊字符: 英文...、*、# 处理思路: 首先,确定要使用的转换器。既然是过滤,第一个要考虑的就是tester转换器,接下来就要考虑使用什么规则、怎么组合。...规则的组合: 在这里,我使用正则来过滤,表达式的设置截图如图1所示。...特殊字符设置比较简单,只要是要素中要测试字段包含了该字符就算通过了规则,全括号与半括号的规则稍微复杂了一点,需要通过使用两条规则来组合,并且对第三条与第六条规则进行了取反设置。...更多内容可到视频中查看: ?

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    常见的数据分析图表

    常见的数据分析图表 一、常见图表种类 二、各种图表的适用范围和作用(图表来自于网络) 1、饼状图:在想对基本比例进行比较的时候,饼状图比较有用;当扇形快的大小相似时,饼图用处不大。...2、条形图:相比饼状图更精确,对于各个类大小大致相同的情况下,条形图是理想的图形;垂直条形图用横轴表示类,用纵轴表示频数或百分数。...水平条状图用横轴表示频数或百分数,用纵轴表示类,当类名比较长的时候,更方便。如果想同时体现出频数和百分数,可以使用分段条形图。如果想对比频数,可以使用堆积条形图。...直方图的横轴表示数据的范围,高度表示 频数密度= 频数/长方形宽度,直方图用面积表示频数 4、折线图:需要体现趋势时请使用折线图,例如基于时间的趋势。...6、散点图:表达两个数据之间的关系 气泡图:表达三个变量之间的关系 7、树形图:用方块的面积表示所占的比例 8、桑基图:表达数据的流向 9、热力图:通过颜色表达程度

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    如何在CM中启用YARN的使用率报告

    温馨提示:要看高清无码套图,请使用手机打开并单击图片放大查看。...YARN的容器使用情况度量收集 ---- 1.首先在YARN服务中开启容器使用情况度量收集 [gxt0igoa4o.jpeg] [lf2kuu5h3w.jpeg] 对于“容器使用情况MapReduce作业用户...2.这个时候CM会自动在HDFS中创建用于收集YARN容器使用情况的目录,/tmp/cmYarnContainerMetrics,用户属组为cmjobuser:hadoop,权限为770 [povqey0e9g.jpeg...注:Fayson在测试过程中,CM并没有专门指定队列,所以在运行任务的时候默认使用的是第二条放置策略,即:使用池 root.users.username ,如果该池不存在则加以创建。...温馨提示:要看高清无码套图,请使用手机打开并单击图片放大查看。 推荐关注Hadoop实操,第一时间,分享更多Hadoop干货,欢迎转发和分享。

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    使用Python中的folium包创建热力密度图

    最近探索出来一个在Python中创建热力图非常高效的方法,使用folium包来创建热力图,实际效果非常赞,过程简单,代码量少。...folium包基于leaflet在线地图库封装,在R语言中leaflet的接口已经非常完善,如果你对R语言中的leaflet包api接口感兴趣,可以参考这几篇文章。...leaflet地图: 动态地理信息可视化——leaflet在线地图简介 动态地理信息可视化——散点地图系列 动态地理信息可视化——leaflet构造路径图 动态地理信息可视化——leaflet填充地图...来了,从此动态地图又多了一些乐趣~~~ folium包支持多种类型的空间可视化形式,今天这一篇仅就其中的热力密度图进行分享。...以上数据是虚构的,整体效果也没有任何意义,接下来尝试着对全球城市发展报告中中国各个城市的gdp数据进行热力图展示。

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    Python|Plotly数据可视化(代码+应用场景)

    柱形图的高度表示数值的大小,也可以对单一的变量或者多组变量进行比较。 注:在使用条形图和柱形图时x和y的参数传入相反。...(通常用于时间标签的比较) 在plotly中没有直接进行百分比柱形图绘制的方法,因此我们可以先使用pandas算出数据的百分比,然后再将百分比数据用于绘图。...桑基图又称桑基能量分流图,也称桑基能量平衡图,该图形从左到右展示出了初始数据流向。...# 绘制桑基图 import plotly.graph_objects as go fig = go.Figure(data=[go.Sankey( node = dict( pad...饼图 饼图通常用于展示一组数据中各项的大小和总和的比例,每块内容用不同的颜色进行表示。

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    令人惊艳的 Claude AI服务:如何在 Slack 中免费使用

    Claude 的前世今生 Claude 在 2021 年诞生,由 OpenAI 前研发副总裁 Dario Amodei 联合原团队成员创建。...功能与最强大的 GPT-4 不相上下,能撰写论文、方案、新闻稿、随笔、视频脚本、创作诗词曲谱、编写代码与算法、处理 Excel 等,一应俱全。...目前此服务仅与 Slack 合作;拥有 Slack账号者,添加 Claude 应用并授权即可,便可在 Slack 中随心所欲使用此 AI 服务,极为便捷。...Claude 就可以对话了 image-20230414134946185 image-20230414134958767 使用 第一个问题 请你解释一下你的工作原理。...首先我想先让你用一个关键词归纳你的解释,作为开始。你会用哪一个关键词呢? 第一次使用会有个 同意的操作,点击 Agree 弹框在点 I Agree image-20230414135049106

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    Python 绘制惊艳的桑基图

    桑基图简介 很多时候,我们需要一种必须可视化数据如何在实体之间流动的情况。例如,以居民如何从一个国家迁移到另一个国家为例。这里演示了有多少居民从英格兰迁移到北爱尔兰、苏格兰和威尔士。...从这个 桑基图 (Sankey)可视化中可以明显看出,从England迁移到Wales的居民多于从Scotland或Northern Ireland迁移的居民。 什么是桑基图?...桑基图可用于表示能量、金钱、成本的流动,以及任何具有流动概念的事物。 米纳尔关于拿破仑入侵俄罗斯的经典图表可能是桑基图表最著名的例子。...这种使用桑基图的可视化非常有效地显示了法国军队在前往俄罗斯和返回的途中是如何进步(或减少?)的。 本文中,我们使用 python 的 plotly 绘制桑基图。 如何绘制桑基图?...本文使用 2021 年奥运会数据集绘制桑基图。该数据集包含有关奖牌总数的详细信息——国家、奖牌总数以及金牌、银牌和铜牌的单项总数。我们通过绘制一个桑基图来了解一个国家赢得的金牌、银牌和铜牌数。

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    前端用JavaScript实现桑基图(Sankey图)

    前端用JavaScript实现桑基图(Sankey图)桑基图(Sankey图),是流图的一种,常用来展示事物的数量、发展方向、数据量大小等,在可视化分析中经常使用。...本文,演示如何在前端用JavaScript绘制桑基图。注:本例使用JShaman数据展示JS代码混淆加密流程。先看效果:因为已有成熟的库可用,比如,可以使用d3引擎,所以sankey的实现较为简单。...众所周知,JShaman是国内知名的JS代码混淆加密平台,我们将用JShaman英文版的混淆返回内容做为数据源,绘制一张JS代码混淆加密流程桑基图。...绘图成功:桑基图效果说明:从图中,可以看到JShaman对JS代码的混淆加密流程:初始的JS代码,先转为AST(抽象语法树),再进行String reverse、Dead Code Insertion、...最后,附上完整代码,如果您也需要绘制桑基图,可以参考此代码:<!

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    教你用pyecharts制作交互式桑基图,赶快学起来吧!

    这次就来说一说,如何用python的第三方库-pyecharts制作交互式桑基图。 示例 1 什么是桑基图? 桑基图是可视化图表的一种,一般用来表示数据流量。...桑基图(Sankey diagram),即桑基能量分流图,也叫桑基能量平衡图。它是一种特定类型的流程图,图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小,比较适用于用户流量等数据的可视化分析。...bar.render("mycharts.html") bar.render() 3 使用pyecharts制作桑基图 前面我们展示了一张生活开支交互式桑基图: 下面就来用pyecharts实现它...桑基图在pyecharts中通过Sankey方法实现,它接受两个外部输入。...python中制作交互式桑基图,希望能给大家的可视化提供帮助!

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