在NGS的数据分析中,去除PCR重复序列是一个常见的分析步骤,无论是WES/WGS的snp calling,还是chip_seq, ATAC_seq,都需要对原始的bam文件进行过滤,去除其中的PCR重复序列...在samtools中也提供了去除PCR重复的命令markdup, 该命令对输入的bam文件有以下两点要求 必须是经过samtools fixmate命令处理之后的文件 必须是按照比对上染色体坐标位置排序之后的文件...另外,由于fixmate命令要求输入的bam文件为按照read name,即序列名称排序之后的文件,所以在使用markdup命令时,需要以下4步转换过程 # 第一步,按照read name排序bam文件...2. picard MarkDuplicates picard的MarkDuplicates命令称得上是使用的最广泛的去除PCR重复的工具了,要求输入的bam文件为按照比对位置排序之后的文件,用法如下...input.bam # 第二步,运行markdup命令 sambamba markdup positionsort.bam markdup.bam 除了这三种方法之外,还有很多的工具可以去除PCR重复序列
标签:VBA 自Excel 2010发布以来,已经具备删除工作表中重复行的功能,如下图1所示,即功能区“数据”选项卡“数据工具——删除重复值”。...图1 使用VBA,可以自动执行这样的操作,删除工作表所有数据列中的重复行,或者指定列的重复行。 下面的Excel VBA代码,用于删除特定工作表所有列中的所有重复行。...如果只想删除指定列(例如第1、2、3列)中的重复项,那么可以使用下面的代码: Sub DeDupeColSpecific() Cells.RemoveDuplicates Columns:=Array...(1, 2, 3), Header:=xlYes End Sub 可以修改代码中代表列的数字,以删除你想要的列中的重复行。...注:本文学习整理自thesmallman.com,略有修改,供有兴趣的朋友参考。
2、找到keras在tensorflow下的根目录 需要特别注意的是找到keras在tensorflow下的根目录而不是找到keras的根目录。...一般来说,完成tensorflow以及keras的配置后即可在tensorflow目录下的python目录中找到keras目录,以GPU为例keras在tensorflow下的根目录为C:\ProgramData...找到optimizers.py中的adam等优化器类并在后面添加自己的优化器类 以本文来说,我在第718行添加如下代码 @tf_export('keras.optimizers.adamsss') class...# 传入优化器名称: 默认参数将被采用 model.compile(loss=’mean_squared_error’, optimizer=’sgd’) 以上这篇如何在keras中添加自己的优化器...(如adam等)就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考。
导入数据处理的库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多列组合删除数据框中的重复值') #把路径改为数据存放的路径 name = pd.read_csv('name.csv...从结果知,参数keep=False,是把原数据copy一份,在copy数据框中删除全部重复数据,并返回新数据框,不影响原始数据框name。...四、按照多列去重 对多列去重和一列去重类似,只是原来根据一列是否重复删重。现在要根据指定的列判断是否存在重复(顺序也要一致才算重复)删重。...原始数据中只有第二行和最后一行存在重复,默认保留第一条,故删除最后一条得到新数据框。 想要根据更多列数去重,可以在subset中添加列。...但是对于两列中元素顺序相反的数据框去重,drop_duplicates函数无能为力。 如需处理这种类型的数据去重问题,参见本公众号中的文章【Python】基于多列组合删除数据框中的重复值。 -end-
它类似于电子表格或SQL表或R中的data.frame。最常用的熊猫对象是数据帧。大多数情况下,数据是从其他数据源(如csv,excel,SQL等)导入到pandas数据帧中的。...在本教程中,我们将学习如何创建一个空数据帧,以及如何在 Pandas 中向其追加行和列。...Pandas.Series 方法可用于从列表创建系列。列值也可以作为列表传递,而无需使用 Series 方法。 例 1 在此示例中,我们创建了一个空数据帧。...然后,通过将列名 ['Name', 'Age'] 传递给 DataFrame 构造函数的 columns 参数,我们在数据帧中创建 2 列。...ignore_index参数设置为 True 以在追加行后重置数据帧的索引。 然后,我们将 2 列 [“薪水”、“城市”] 附加到数据帧。“薪水”列值作为系列传递。序列的索引设置为数据帧的索引。
,单个WorkFlow中可以添加多个模块的依赖,使各个模块之间在WorkFlow内产生依赖关系,如果对于一个WorkFlow被其它多个WorkFlow依赖(如:AWorkFlow执行成功后,BWorkFlow...和CWorkFlow依赖AWorkFlow的执行结果),这时不可能将AWorkFLow作为BWorkFlow和CWorkFlow中的一个处理模块来,这样会重复执行AWorkFlow,可能会导致输入BWorkFlow...3.创建测试WorkFlow ---- 这里创建Shell类型的Oozie工作流就不再详细的说明,可以参考Fayson前面的文章《Hue中使用Oozie创建Shell工作流在脚本中切换不同用户》中有介绍如何创建一个...4.创建Coordinator ---- 在Hue中创建Oozie的Coordinator即对应Hue中的功能为Scheduler ?...Coordinator的方式来是实现工作流之间的依赖关系,可以避免被依赖的WorkFlow工作流被重复执行。
最近公司在做关联图谱的项目,想挖掘团伙犯罪。在准备关系数据时需要根据两列组合删除数据框中的重复值,两列中元素的顺序可能是相反的。...本文介绍一句语句解决多列组合删除数据框中重复值的问题。 一、举一个小例子 在Python中有一个包含3列的数据框,希望根据列name1和name2组合(在两行中顺序不一样)消除重复项。...import numpy as np #导入数据处理的库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多列组合删除数据框中的重复值') #把路径改为数据存放的路径 df =...由于原始数据是从hive sql中跑出来,表示商户号之间关系的数据,merchant_r和merchant_l中存在组合重复的现象。现希望根据这两列组合消除重复项。...从上图可以看出用set替换frozense会报不可哈希的错误。 三、把代码推广到多列 解决多列组合删除数据框中重复值的问题,只要把代码中取两列的代码变成多列即可。
在 Linux 系统中,创建文件是进行各种操作的基础。有时候,我们需要创建带有特殊字符的文件,例如包含空格、特殊符号或非ASCII字符的文件。...本文将详细介绍在 Linux 中如何创建带有特殊字符的文件,以便您能够轻松地完成这样的任务。...以下是一些常见的特殊字符和相应的转义序列示例:空格:\换行符:\n制表符:\t反斜杠:\\单引号:\'双引号:\"例如,要创建一个名为 my file.txt 的文件,可以使用以下命令:touch my...步骤二:使用引号创建文件另一种创建带有特殊字符的文件的方法是使用引号。在 Linux 中,可以使用单引号(')或双引号(")将带有特殊字符的文件名括起来。...结论通过本文的指导,您已学会在 Linux 中创建带有特殊字符的文件。
的“条件格式”这个功能来筛选对比两列数据中心的重复值,并将两列数据中的相同、重复的数据按规则进行排序方便选择,甚至是删除。...比如上图的F、G两列数据,我们肉眼观察的话两列数据有好几个相同的数据,如果要将这两列数据中重复的数据筛选出来的话,我们可以进行如下操作: 第一步、选择重复值 1、将这两列数据选中,用鼠标框选即可; 2...,我这里按照默认设置); 4、上一步设置完,点击确定,我们可以看到我们的数据变成如下图所示: 红色显示部分就表示两列数据重复的几个数据。...第二步、将重复值进行排序 经过上面的步骤,我们将两列数据的重复值选出来了,但数据的排列顺序有点乱,我们可以做如下设置: 1、选中F列,然后点击菜单栏的“排序”》“自定义排序”,选择“以当前选定区域排序”...2、选中G列,做上述同样的排序设置,最后排序好的结果如下图: 经过上面的几个步骤,我们可以看到本来杂乱无章的两列数据现在就一目了然了,两列数据中的重复数据进行了颜色区分排列到了上面,不相同的数据也按照一定的顺序进行了排列
我是坚果,如果你迷惘,不妨看看码农的轨迹 Flutter 可用于创建漂亮的 UI。因此,在今天的文章中,我们将看到如何在应用程序中创建不同的渐变 。...开始吧 第 1 步: 创建一个新的 Flutter 应用程序。...第 2 步: 对于渐变,我们必须使用Container小部件,其中我们将拥有 BoxDecoration 属性,这将允许我们为我们的应用程序创建渐变。...Alignment.centerRight, colors: [Colors.deepOrange, Colors.yellow.shade300])), 在 Flutter 中创建渐变的完整示例代码...Flutter 中获得不同类型的渐变。
在编程开发中,内存的占用是我们经常要面对的现实,通常的内存调优的方向就是尽量减少内存的占用。这其中避免创建不必要的对象是一项重要的方面。...因此在我们编程时,需要注意到这一点,正确地声明变量类型,避免因为自动装箱引起的性能问题。 另外,当将原始数据类型的值加入集合中时,也会发生自动装箱,所以这个过程中也是有对象创建的。...关于Java中的自动装箱与拆箱,参考文章Java中的自动装箱与拆箱 谨慎选用容器 Java和Android提供了很多编辑的容器集合来组织对象。...不要过多创建线程 在android中,我们应该尽量避免在主线程中执行耗时的操作,因而需要使用其他线程。...想要深入了解注解,可以阅读详解Java中的注解 选用对象池 在Android中有很多池的概念,如线程池,连接池。包括我们很长用的Handler.Message就是使用了池的技术。
文章背景: 在表缺少主键无法直接创建关系,或者需要借助复杂的计算才能创建主键的情况下,可以利用计算列来设置关系。在基于计算列创建关系时,循环依赖经常发生。...当试图在新创建的PriceRangeKey列的基础上建立PriceRanges表和Sales表之间的关系时,将由于循环依赖关系而导致错误。...由于两个依赖关系没有形成闭环,所以循环依赖消失了,可以创建关系。 3 避免空行依赖 创建可能用于设置关系的计算列时,都需要注意以下细节: 使用DISTINCT 代替VALUES。...延伸阅读: (1)规范化与非规范化 规范化这一术语用于描述以减少重复数据的方式存储的数据。...假设有一个产品表具有一个唯一密钥值列(如产品密钥)和描述产品特征(包括产品名称、类别、颜色和尺寸)的其他列。当销售表仅存储密钥(如产品密钥)时,该表被视为是规范化的。
1.文档编写目的 ---- 前面Fayson讲过《如何使用Hue创建Spark1和Spark2的Oozie工作流》和《如何使用Hue创建Spark2的Oozie工作流(补充)》,在创建Oozie工作流时会遇到需要登录到其它服务器上去执行脚本或命令...本文主要介绍如何创建Ssh Action的Oozie工作流。...4.创建Oozie的Ssh Action测试 ---- 1.登录Hue创建Oozie工作流 [s9iqjjcfpw.jpeg] [0lor6usecc.jpeg] 输入ssh登录信息及执行的指令或脚本...5.总结 ---- 在非Kerberos环境的集群中,ssh actions会以oozie用户执行,因为oozie的服务进程是以oozie的用户起的。...在CDH集群中oozie用户默认是不能登录的,如果需要通过su切换到oozie用户,则需要使用root用户在/etc/pam.d/su文件中增加如下配置: auth [success=ignore
学习Excel技术,关注微信公众号: excelperfect Q:如下图1所示,在工作表列A中有很多数据(为方便表述,示例中只放置了9个数据),这些数据中有很多重复数据,我想得到重复次数最多的数据是那个...,示例中可以看出是“完美Excel”重复的次数最多,如何获得这个数据?...在上面的公式中: MATCH($A$1:$A$9,$A$1:$A$9,0) 在单元格区域A1:A9中依次分别查找A1至A9单元格中的数据,得到这些数据第1次出现时所在的行号,从而形成一个由该区域所有数据第一次出现的行号组组成的数字数组...MODE函数从上面的数组中得到出现最多的1个数字,也就是重复次数最多的数据在单元格区域所在的行。将这个数字作为INDEX函数的参数,得到想应的数据值。...如果将单元格区域命名为MyRange,那么上述数组公式可写为: =INDEX(MyRange,MODE(MATCH(MyRange,MyRange,0))) 但是,如果单元格区域中有几个数据重复次数相同且都出现次数最多
I find from SAP help the prerequisite to create Opportunity based on registered ...
有兴趣了解Google,Bing或Yahoo的工作方式吗?想知道抓取网络需要什么,以及简单的网络抓取工具是什么样的?在不到50行的Python(版本3)代码中,这是一个简单的Web爬虫!...我们先来谈谈网络爬虫的目的是什么。如维基百科页面所述,网络爬虫是一种以有条不紊的方式浏览万维网以收集信息的程序。网络爬虫收集哪些信息?...如果在页面上的文本中找不到该单词,则机器人将获取其集合中的下一个链接并重复该过程,再次收集下一页上的文本和链接集。...一次又一次地重复这个过程,直到机器人找到了这个单词或者已经进入了你在spider()函数中输入的限制。 这是谷歌的工作方式吗? 有点。...索引意味着您解析(浏览和分析)网页内容并创建一个易于访问且可快速检索 *的大型集合(思考数据库或表)信息。
DevExpress控件中的gridcontrol表格控件,如何在属性中设置某一列显示为图片(图片按钮)?效果如下图: ? 通过属性设置,而不用写代码。...由于此控件的属性太多了,就连设置背景图片的属性都有好几个地方可以设置。本人最近要移植别人开发的项目,找了好久才发现这个属性的位置。之前一直达不到这种效果。...然后点击Columns添加列,点击所添加的列再按照如下步骤设置属性: 在属性中找到ColumnEdit,把ColumnEdit的TextEditStyle属性设置为HideTextEditor; 展开...ColumnEdit,把ColumnEdit中的Buttons展开,将其Kind属性设置为Glyph; 找到其中的Buttons,展开,找到其中的0-Glyph,展开,找到其中的ImageOptions...注:本人用的控件是17.2.7版本,其他版本的不知道是否一样,仅作参考。
原文地址:How to Create a Secure Node.js GraphQL API 作者:Marcos 本文的目的是提供一份快速指南 -- 《如何快速在如何在 Node.js 中创建安全的...实际上,在这些场景中,你都会发现有些 API 你并不需要详细了解它。比如,你不需要知道他们是如何构建的,也不需要在自己的系统中使用和它们一样的技术。...初始化项目 我们先创建一个名为 node-graphql 的文件夹。然后我们打开一个终端或者 git 控制台,并使用 npm init 来初始化。...下一步是配置 TypeScript 的编译模式,我们在项目根目录下创建一个 tsconfig.json,并输入以下内容: { "compilerOptions": { "target": "...; 创建模块 (Module) 的基本方法; 测试我们的 GraphQL API; 为了将内容侧重于开发使用,本文忽略了开发中一些重要的内容,简单总结如下: 新增内容时需要校验 对服务中的错误进行正确处理
Spartacus 中的页面基于使用相关 API 从 SAP Commerce 后端获取的 CMS 页面。来自 SAP Commerce 端的数据定义了元数据,如 url、标题等,以及页面的结构。...创建这些实例的 Impex 始终具有相同的结构,并且可以重复用于创建新的 CMS 页面。只需根据您的需要修改内容。它也可以在后台手动完成,但我建议使用 impex 并将其导入 HAC。...在此用例中,不需要本文的第二步。 第一步,创建所有必需的 CMS 实例,我们从 Commerce 端获取具有结构的页面。...在第二步中,我们定义 Spartacus 端的哪个组件是 CMS 组件的对应部分。 这很简单,可以通过配置来完成。只需创建一个新组件并将此配置添加到模块文件中即可。...将此添加到配置后,组件的内容将显示在新创建的页面上。 SAP 电商云中的目录同步机制 我们知道在 Hybris 中,一个目录可以有一个目录版本(catalog version )列表。
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云